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- Registre américain des essais cliniques
- Essai clinique NCT06775808
Caractérisation totale de l'infectome des infections oculaires
Caractérisation totale de l'infectome des infections oculaires : une étude observationnelle basée sur le séquençage métagénomique
Aperçu de l'étude
Statut
Les conditions
Description détaillée
Il s'agit d'une étude observationnelle initiée par un chercheur visant à décrire l'infectome total des infections oculaires à l'aide du séquençage métagénomique. Les infections oculaires, notamment la conjonctivite aiguë, la kératite, l'uvéite et l'endophtalmie, sont diagnostiquées par des ophtalmologistes expérimentés selon des examens cliniques de routine.
Pour la collecte d'échantillons biologiques supplémentaires en dehors du processus de diagnostic et de traitement, un consentement éclairé écrit est requis de la part des sujets éligibles ou de leurs tuteurs légaux au moment du recrutement. La demande d’exemption du consentement éclairé a été déposée pour l’utilisation d’échantillons cliniques excédentaires. Après avoir obtenu leur consentement éclairé, les sujets seront échantillonnés et leurs informations cliniques seront collectées.
Des échantillons biologiques, y compris des écouvillons de sac conjonctival (1 écouvillon pour chaque œil impliquant) ou du liquide intraoculaire (plus de 100 μl), seront collectés pour le séquençage métagénomique à l'aide de la plateforme Illumina NovaSeq X Plus.
Les informations cliniques des participants seront rassemblées à partir du système d'information des dossiers médicaux électroniques, y compris (1) caractéristiques démographiques : âge, sexe, comorbidités ; (2) examen de laboratoire : analyse sanguine de routine, facteurs immunitaires inflammatoires, examen de microbiologie clinique (PCR, examen sérologique, culture, etc.) ; (3) examen d'imagerie : photographie du segment antérieur, examen des cellules endothéliales cornéennes, microscopie confocale cornéenne, photographie du fond d'œil.
Une analyse méta-transcriptomique des échantillons oculaires sera effectuée pour identifier les virus, bactéries, champignons et parasites. L'abondance des agents pathogènes est indiquée par le RPKM (c'est-à-dire Lectures par million divisé par la longueur du génome de référence, mesurée en kilobases).
Les participants éligibles seront recrutés consécutivement entre août 2024 et décembre 2026 au service d'ophtalmologie de l'hôpital général de Shanghai. La durée totale de l'étude devrait être de deux ans à partir du premier sujet inscrit jusqu'à l'analyse finale.
Type d'étude
Inscription (Estimé)
Contacts et emplacements
Coordonnées de l'étude
- Nom: Mei Kang, MPH
- Numéro de téléphone: 021-36126064
- E-mail: mei.kang@shgh.cn
Lieux d'étude
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Shanghai
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Shanghai, Shanghai, Chine, 200030
- Recrutement
- Shanghai General Hospital
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Contact:
- Mei Kang, MPH
- Numéro de téléphone: 02136126064
- E-mail: mei.kang@shgh.cn
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Critères de participation
Critère d'éligibilité
Âges éligibles pour étudier
- Enfant
- Adulte
- Adulte plus âgé
Accepte les volontaires sains
Méthode d'échantillonnage
Population étudiée
La description
Critères d'intégration :
- Patients présentant un diagnostic clinique d'un ou plusieurs types d'infections oculaires (y compris la conjonctivite aiguë, la kératite, l'uvéite et l'endophtalmie).
- Des échantillons biologiques ont été collectés pour un examen microbiologique clinique ou ont consenti à participer à cette étude.
Critères d'exclusion :
1. Patients qui n’ont historiquement aucun surplus d’échantillons cliniques.
Plan d'étude
Comment l'étude est-elle conçue ?
Détails de conception
Cohortes et interventions
Groupe / Cohorte |
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Cohorte des infections oculaires
Patients diagnostiqués avec un ou plusieurs types d'infections oculaires (y compris la conjonctivite aiguë, la kératite, l'uvéite et l'endophtalmie).
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Que mesure l'étude ?
Principaux critères de jugement
Mesure des résultats |
Description de la mesure |
Délai |
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Le profil pathogène
Délai: jusqu'à la fin des études, une moyenne de 2 ans
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Les bactéries, champignons, virus et parasites identifiés grâce à des techniques métagénomiques dans des échantillons oculaires.
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jusqu'à la fin des études, une moyenne de 2 ans
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Mesures de résultats secondaires
Mesure des résultats |
Description de la mesure |
Délai |
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Abondance microbienne
Délai: jusqu'à la fin des études, une moyenne de 2 ans
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L'abondance du pathogène est mesurée par le RPKM (c'est-à-dire
Lectures par million divisé par la longueur du génome de référence, mesurée en kilobases).
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jusqu'à la fin des études, une moyenne de 2 ans
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Collaborateurs et enquêteurs
Collaborateurs
Les enquêteurs
- Directeur d'études: Shuo Su, PhD, Fudan University
Publications et liens utiles
Publications générales
- Burton MJ, Ramke J, Marques AP, Bourne RRA, Congdon N, Jones I, Ah Tong BAM, Arunga S, Bachani D, Bascaran C, Bastawrous A, Blanchet K, Braithwaite T, Buchan JC, Cairns J, Cama A, Chagunda M, Chuluunkhuu C, Cooper A, Crofts-Lawrence J, Dean WH, Denniston AK, Ehrlich JR, Emerson PM, Evans JR, Frick KD, Friedman DS, Furtado JM, Gichangi MM, Gichuhi S, Gilbert SS, Gurung R, Habtamu E, Holland P, Jonas JB, Keane PA, Keay L, Khanna RC, Khaw PT, Kuper H, Kyari F, Lansingh VC, Mactaggart I, Mafwiri MM, Mathenge W, McCormick I, Morjaria P, Mowatt L, Muirhead D, Murthy GVS, Mwangi N, Patel DB, Peto T, Qureshi BM, Salomao SR, Sarah V, Shilio BR, Solomon AW, Swenor BK, Taylor HR, Wang N, Webson A, West SK, Wong TY, Wormald R, Yasmin S, Yusufu M, Silva JC, Resnikoff S, Ravilla T, Gilbert CE, Foster A, Faal HB. The Lancet Global Health Commission on Global Eye Health: vision beyond 2020. Lancet Glob Health. 2021 Apr;9(4):e489-e551. doi: 10.1016/S2214-109X(20)30488-5. Epub 2021 Feb 16. No abstract available.
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Dates d'enregistrement des études
Dates principales de l'étude
Début de l'étude (Réel)
Achèvement primaire (Estimé)
Achèvement de l'étude (Estimé)
Dates d'inscription aux études
Première soumission
Première soumission répondant aux critères de contrôle qualité
Première publication (Réel)
Mises à jour des dossiers d'étude
Dernière mise à jour publiée (Réel)
Dernière mise à jour soumise répondant aux critères de contrôle qualité
Dernière vérification
Plus d'information
Termes liés à cette étude
Mots clés
Termes MeSH pertinents supplémentaires
Autres numéros d'identification d'étude
- SHGH-CRU-2024516
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