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Caractérisation totale de l'infectome des infections oculaires

Caractérisation totale de l'infectome des infections oculaires : une étude observationnelle basée sur le séquençage métagénomique

Plusieurs agents pathogènes peuvent provoquer une infection oculaire. Ces dernières années, les infections virales émergentes et résurgentes représentent un problème de santé publique important. De nombreux virus émergents provoquent des maladies infectieuses impliquant des manifestations ophtalmiques, notamment le virus Mpox, Zika, Ebola et le SRAS-CoV-2. Une surveillance large et impartiale des agents pathogènes est essentielle, c'est pourquoi nous concevons cette étude impartiale basée sur le séquençage métagénomique pour étudier l'infectome total des infections oculaires. L’étude est de conception historique et prospective.

Aperçu de l'étude

Statut

Recrutement

Description détaillée

Il s'agit d'une étude observationnelle initiée par un chercheur visant à décrire l'infectome total des infections oculaires à l'aide du séquençage métagénomique. Les infections oculaires, notamment la conjonctivite aiguë, la kératite, l'uvéite et l'endophtalmie, sont diagnostiquées par des ophtalmologistes expérimentés selon des examens cliniques de routine.

Pour la collecte d'échantillons biologiques supplémentaires en dehors du processus de diagnostic et de traitement, un consentement éclairé écrit est requis de la part des sujets éligibles ou de leurs tuteurs légaux au moment du recrutement. La demande d’exemption du consentement éclairé a été déposée pour l’utilisation d’échantillons cliniques excédentaires. Après avoir obtenu leur consentement éclairé, les sujets seront échantillonnés et leurs informations cliniques seront collectées.

Des échantillons biologiques, y compris des écouvillons de sac conjonctival (1 écouvillon pour chaque œil impliquant) ou du liquide intraoculaire (plus de 100 μl), seront collectés pour le séquençage métagénomique à l'aide de la plateforme Illumina NovaSeq X Plus.

Les informations cliniques des participants seront rassemblées à partir du système d'information des dossiers médicaux électroniques, y compris (1) caractéristiques démographiques : âge, sexe, comorbidités ; (2) examen de laboratoire : analyse sanguine de routine, facteurs immunitaires inflammatoires, examen de microbiologie clinique (PCR, examen sérologique, culture, etc.) ; (3) examen d'imagerie : photographie du segment antérieur, examen des cellules endothéliales cornéennes, microscopie confocale cornéenne, photographie du fond d'œil.

Une analyse méta-transcriptomique des échantillons oculaires sera effectuée pour identifier les virus, bactéries, champignons et parasites. L'abondance des agents pathogènes est indiquée par le RPKM (c'est-à-dire Lectures par million divisé par la longueur du génome de référence, mesurée en kilobases).

Les participants éligibles seront recrutés consécutivement entre août 2024 et décembre 2026 au service d'ophtalmologie de l'hôpital général de Shanghai. La durée totale de l'étude devrait être de deux ans à partir du premier sujet inscrit jusqu'à l'analyse finale.

Type d'étude

Observationnel

Inscription (Estimé)

200

Contacts et emplacements

Cette section fournit les coordonnées de ceux qui mènent l'étude et des informations sur le lieu où cette étude est menée.

Coordonnées de l'étude

  • Nom: Mei Kang, MPH
  • Numéro de téléphone: 021-36126064
  • E-mail: mei.kang@shgh.cn

Lieux d'étude

    • Shanghai
      • Shanghai, Shanghai, Chine, 200030
        • Recrutement
        • Shanghai General Hospital
        • Contact:

Critères de participation

Les chercheurs recherchent des personnes qui correspondent à une certaine description, appelée critères d'éligibilité. Certains exemples de ces critères sont l'état de santé général d'une personne ou des traitements antérieurs.

Critère d'éligibilité

Âges éligibles pour étudier

  • Enfant
  • Adulte
  • Adulte plus âgé

Accepte les volontaires sains

Non

Méthode d'échantillonnage

Échantillon non probabiliste

Population étudiée

Patients diagnostiqués avec un ou plusieurs types d'infections oculaires (y compris conjonctivite aiguë, kératite, uvéite et endophtalmie).

La description

Critères d'intégration :

  1. Patients présentant un diagnostic clinique d'un ou plusieurs types d'infections oculaires (y compris la conjonctivite aiguë, la kératite, l'uvéite et l'endophtalmie).
  2. Des échantillons biologiques ont été collectés pour un examen microbiologique clinique ou ont consenti à participer à cette étude.

Critères d'exclusion :

1. Patients qui n’ont historiquement aucun surplus d’échantillons cliniques.

Plan d'étude

Cette section fournit des détails sur le plan d'étude, y compris la façon dont l'étude est conçue et ce que l'étude mesure.

Comment l'étude est-elle conçue ?

Détails de conception

Cohortes et interventions

Groupe / Cohorte
Cohorte des infections oculaires
Patients diagnostiqués avec un ou plusieurs types d'infections oculaires (y compris la conjonctivite aiguë, la kératite, l'uvéite et l'endophtalmie).

Que mesure l'étude ?

Principaux critères de jugement

Mesure des résultats
Description de la mesure
Délai
Le profil pathogène
Délai: jusqu'à la fin des études, une moyenne de 2 ans
Les bactéries, champignons, virus et parasites identifiés grâce à des techniques métagénomiques dans des échantillons oculaires.
jusqu'à la fin des études, une moyenne de 2 ans

Mesures de résultats secondaires

Mesure des résultats
Description de la mesure
Délai
Abondance microbienne
Délai: jusqu'à la fin des études, une moyenne de 2 ans
L'abondance du pathogène est mesurée par le RPKM (c'est-à-dire Lectures par million divisé par la longueur du génome de référence, mesurée en kilobases).
jusqu'à la fin des études, une moyenne de 2 ans

Collaborateurs et enquêteurs

C'est ici que vous trouverez les personnes et les organisations impliquées dans cette étude.

Publications et liens utiles

La personne responsable de la saisie des informations sur l'étude fournit volontairement ces publications. Il peut s'agir de tout ce qui concerne l'étude.

Publications générales

Dates d'enregistrement des études

Ces dates suivent la progression des dossiers d'étude et des soumissions de résultats sommaires à ClinicalTrials.gov. Les dossiers d'étude et les résultats rapportés sont examinés par la Bibliothèque nationale de médecine (NLM) pour s'assurer qu'ils répondent à des normes de contrôle de qualité spécifiques avant d'être publiés sur le site Web public.

Dates principales de l'étude

Début de l'étude (Réel)

25 décembre 2024

Achèvement primaire (Estimé)

30 octobre 2026

Achèvement de l'étude (Estimé)

31 décembre 2026

Dates d'inscription aux études

Première soumission

6 janvier 2025

Première soumission répondant aux critères de contrôle qualité

9 janvier 2025

Première publication (Réel)

15 janvier 2025

Mises à jour des dossiers d'étude

Dernière mise à jour publiée (Réel)

17 juillet 2025

Dernière mise à jour soumise répondant aux critères de contrôle qualité

14 juillet 2025

Dernière vérification

1 juillet 2025

Plus d'information

Termes liés à cette étude

Autres numéros d'identification d'étude

  • SHGH-CRU-2024516

Plan pour les données individuelles des participants (IPD)

Prévoyez-vous de partager les données individuelles des participants (DPI) ?

NON

Description du régime IPD

L'IPD pourrait être disponible sur demande auprès des enquêteurs principaux.

Informations sur les médicaments et les dispositifs, documents d'étude

Étudie un produit pharmaceutique réglementé par la FDA américaine

Non

Étudie un produit d'appareil réglementé par la FDA américaine

Non

produit fabriqué et exporté des États-Unis.

Non

Ces informations ont été extraites directement du site Web clinicaltrials.gov sans aucune modification. Si vous avez des demandes de modification, de suppression ou de mise à jour des détails de votre étude, veuillez contacter register@clinicaltrials.gov. Dès qu'un changement est mis en œuvre sur clinicaltrials.gov, il sera également mis à jour automatiquement sur notre site Web .

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