Caracterização total do Infectome de infecções oculares
Caracterização total do Infectome de infecções oculares: um estudo observacional baseado em sequenciamento metagenômico
Visão geral do estudo
Status
Condições
Descrição detalhada
Este é um estudo observacional iniciado pelo investigador para descrever o infectoma total de infecções oculares usando sequenciamento metagenômico. As infecções oculares, incluindo conjuntivite aguda, ceratite, uveíte e endoftalmite, são diagnosticadas por oftalmologistas experientes de acordo com exames clínicos de rotina.
Para a coleta de amostras biológicas adicionais além do processo de diagnóstico e tratamento, é necessário o consentimento informado por escrito dos sujeitos elegíveis ou de seus responsáveis legais no momento do recrutamento. O pedido de isenção de consentimento informado foi apresentado para utilização de amostras clínicas excedentárias. Após preencher o consentimento informado, os indivíduos serão amostrados e suas informações clínicas serão coletadas.
Bioespécimes, incluindo esfregaços de saco conjuntival (1 esfregaço para cada olho envolvido) ou fluido intraocular (mais de 100μl), serão coletados para sequenciamento metagenômico usando a plataforma Illumina NovaSeq X Plus.
As informações clínicas dos participantes serão coletadas do sistema eletrônico de informações de prontuários médicos, incluindo (1) características demográficas: idade, sexo, comorbidades; (2) exames laboratoriais: exames de sangue de rotina, fatores imunológicos inflamatórios, exame microbiológico clínico (PCR, exame sorológico, cultura, etc.); (3) exame de imagem: fotografia do segmento anterior, exame de células endoteliais da córnea, microscopia confocal da córnea, fotografia do fundo de olho.
Análise meta-transcriptômica das amostras oculares será realizada para identificar vírus, bactérias, fungos e parasitas. A abundância de patógenos é indicada como RPKM (ou seja, Leituras por milhão divididas pelo comprimento do genoma de referência, medido em quilobases).
Os participantes elegíveis serão recrutados consecutivamente entre agosto de 2024 e dezembro de 2026 no Departamento de Oftalmologia do Hospital Geral de Xangai. Espera-se que a duração total do estudo seja de dois anos, desde o primeiro sujeito inscrito até a análise final.
Tipo de estudo
Inscrição (Estimado)
Contactos e Locais
Contato de estudo
- Nome: Mei Kang, MPH
- Número de telefone: 021-36126064
- E-mail: mei.kang@shgh.cn
Locais de estudo
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Shanghai
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Shanghai, Shanghai, China, 200030
- Recrutamento
- Shanghai General Hospital
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Contato:
- Mei Kang, MPH
- Número de telefone: 02136126064
- E-mail: mei.kang@shgh.cn
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Critérios de participação
Critérios de elegibilidade
Idades elegíveis para estudo
- Filho
- Adulto
- Adulto mais velho
Aceita Voluntários Saudáveis
Método de amostragem
População do estudo
Descrição
Critérios de inclusão:
- Pacientes com diagnóstico clínico de um ou mais tipos de infecções oculares (incluindo conjuntivite aguda, ceratite, uveíte e endoftalmite).
- Amostras biológicas foram coletadas para exame microbiológico clínico ou consentiram em participar deste estudo.
Critérios de exclusão:
1. Pacientes que não possuem amostras historicamente excedentes clínicas.
Plano de estudo
Como o estudo é projetado?
Detalhes do projeto
Coortes e Intervenções
Grupo / Coorte |
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Coorte de infecções oculares
Pacientes com diagnóstico de um ou mais tipos de infecções oculares (incluindo conjuntivite aguda, ceratite, uveíte e endoftalmite).
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O que o estudo está medindo?
Medidas de resultados primários
Medida de resultado |
Descrição da medida |
Prazo |
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O perfil do patógeno
Prazo: até a conclusão do estudo, uma média de 2 anos
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As bactérias, fungos, vírus e parasitas identificados através de técnicas metagenômicas em amostras oculares.
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até a conclusão do estudo, uma média de 2 anos
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Medidas de resultados secundários
Medida de resultado |
Descrição da medida |
Prazo |
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Abundância microbiana
Prazo: até a conclusão do estudo, uma média de 2 anos
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A abundância de patógenos é medida pelo RPKM (ou seja,
Leituras por milhão divididas pelo comprimento do genoma de referência, medido em quilobases).
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até a conclusão do estudo, uma média de 2 anos
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Colaboradores e Investigadores
Investigadores
- Diretor de estudo: Shuo Su, PhD, Fudan University
Publicações e links úteis
Publicações Gerais
- Burton MJ, Ramke J, Marques AP, Bourne RRA, Congdon N, Jones I, Ah Tong BAM, Arunga S, Bachani D, Bascaran C, Bastawrous A, Blanchet K, Braithwaite T, Buchan JC, Cairns J, Cama A, Chagunda M, Chuluunkhuu C, Cooper A, Crofts-Lawrence J, Dean WH, Denniston AK, Ehrlich JR, Emerson PM, Evans JR, Frick KD, Friedman DS, Furtado JM, Gichangi MM, Gichuhi S, Gilbert SS, Gurung R, Habtamu E, Holland P, Jonas JB, Keane PA, Keay L, Khanna RC, Khaw PT, Kuper H, Kyari F, Lansingh VC, Mactaggart I, Mafwiri MM, Mathenge W, McCormick I, Morjaria P, Mowatt L, Muirhead D, Murthy GVS, Mwangi N, Patel DB, Peto T, Qureshi BM, Salomao SR, Sarah V, Shilio BR, Solomon AW, Swenor BK, Taylor HR, Wang N, Webson A, West SK, Wong TY, Wormald R, Yasmin S, Yusufu M, Silva JC, Resnikoff S, Ravilla T, Gilbert CE, Foster A, Faal HB. The Lancet Global Health Commission on Global Eye Health: vision beyond 2020. Lancet Glob Health. 2021 Apr;9(4):e489-e551. doi: 10.1016/S2214-109X(20)30488-5. Epub 2021 Feb 16. No abstract available.
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Datas de registro do estudo
Datas Principais do Estudo
Início do estudo (Real)
Conclusão Primária (Estimado)
Conclusão do estudo (Estimado)
Datas de inscrição no estudo
Enviado pela primeira vez
Enviado pela primeira vez que atendeu aos critérios de CQ
Primeira postagem (Real)
Atualizações de registro de estudo
Última Atualização Postada (Real)
Última atualização enviada que atendeu aos critérios de controle de qualidade
Última verificação
Mais Informações
Termos relacionados a este estudo
Palavras-chave
Termos MeSH relevantes adicionais
Outros números de identificação do estudo
- SHGH-CRU-2024516
Plano para dados de participantes individuais (IPD)
Planeja compartilhar dados de participantes individuais (IPD)?
Descrição do plano IPD
Informações sobre medicamentos e dispositivos, documentos de estudo
Estuda um medicamento regulamentado pela FDA dos EUA
Estuda um produto de dispositivo regulamentado pela FDA dos EUA
produto fabricado e exportado dos EUA
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