Total infektionskarakterisering af øjeninfektioner
Total infektionskarakterisering af øjeninfektioner: en metagenomisk sekventeringsbaseret observationsundersøgelse
Studieoversigt
Status
Betingelser
Detaljeret beskrivelse
Dette er en investigator-initieret observationel undersøgelse for at beskrive det samlede infektionsomfang af øjeninfektioner ved hjælp af metagenomisk sekventering. Øjeninfektioner, herunder akut conjunctivitis, keratitis, uveitis og endophthalmitis, diagnosticeres af erfarne øjenlæger i henhold til rutinemæssige kliniske undersøgelser.
For indsamling af yderligere biologiske prøver udover diagnose- og behandlingsprocessen kræves skriftligt informeret samtykke fra de berettigede forsøgspersoner eller deres juridiske værger på rekrutteringstidspunktet. Ansøgningen om dispensation for informeret samtykke er indgivet for anvendelse af kliniske overskudsprøver. Efter at have udfyldt informeret samtykke, vil forsøgspersoner blive udtaget, og deres kliniske oplysninger vil blive indsamlet.
Bioprøver, inklusive podninger fra konjunktivale sække (1 podning for hvert involverende øje) eller intraokulær væske (mere end 100 μl), vil blive indsamlet til metagenomisk sekventering ved hjælp af Illumina NovaSeq X Plus-platformen.
Deltagernes kliniske oplysninger vil blive indsamlet fra elektroniske journalinformationssystem, herunder (1) demografiske karakteristika: alder, køn, komorbiditeter; (2) laboratorieundersøgelse: rutinemæssig blodprøve, immuninflammatoriske faktorer, klinisk mikrobiologisk undersøgelse (PCR, serologisk undersøgelse, dyrkning osv.); (3) billeddiagnostisk undersøgelse: forreste segmentfotografi, corneal endothelcelleundersøgelse, corneal konfokalmikroskopi, fundusfotografi.
Meta-transkriptomisk analyse af øjenprøverne vil blive udført for at identificere vira, bakterier, svampe og parasitter. Overfloden af patogener er angivet som RPKM (dvs. Læser pr. million divideret med længden af referencegenomet, målt i kilobaser).
Kvalificerede deltagere vil blive rekrutteret fortløbende mellem august 2024 og december 2026 i Oftalmologisk afdeling, Shanghai General Hospital. Den samlede studievarighed forventes at være to år fra det første emne tilmeldes til den endelige analyse.
Undersøgelsestype
Tilmelding (Anslået)
Kontakter og lokationer
Studiekontakt
- Navn: Mei Kang, MPH
- Telefonnummer: 021-36126064
- E-mail: mei.kang@shgh.cn
Studiesteder
-
-
Shanghai
-
Shanghai, Shanghai, Kina, 200030
- Rekruttering
- Shanghai General Hospital
-
Kontakt:
- Mei Kang, MPH
- Telefonnummer: 02136126064
- E-mail: mei.kang@shgh.cn
-
-
Deltagelseskriterier
Berettigelseskriterier
Aldre berettiget til at studere
- Barn
- Voksen
- Ældre voksen
Tager imod sunde frivillige
Prøveudtagningsmetode
Studiebefolkning
Beskrivelse
Inklusionskriterier:
- Patienter med en klinisk diagnose af en eller flere typer øjeninfektioner (herunder akut conjunctivitis, keratitis, uveitis og endophthalmitis).
- Biologiske prøver er blevet indsamlet til klinisk mikrobiologisk undersøgelse eller givet samtykke til at deltage i denne undersøgelse.
Ekskluderingskriterier:
1. Patienter, der ikke har nogen historisk klinisk overskudsprøver.
Studieplan
Hvordan er undersøgelsen tilrettelagt?
Design detaljer
Kohorter og interventioner
Gruppe / kohorte |
|---|
|
Øjeninfektionskohorte
Patienter diagnosticeret med en eller flere typer øjeninfektioner (inklusive akut conjunctivitis, keratitis, uveitis og endophthalmitis).
|
Hvad måler undersøgelsen?
Primære resultatmål
Resultatmål |
Foranstaltningsbeskrivelse |
Tidsramme |
|---|---|---|
|
Patogenprofilen
Tidsramme: gennem studieafslutning, i gennemsnit 2 år
|
Bakterier, svampe, vira og parasitter identificeret gennem metagenomiske teknikker i øjenprøver.
|
gennem studieafslutning, i gennemsnit 2 år
|
Sekundære resultatmål
Resultatmål |
Foranstaltningsbeskrivelse |
Tidsramme |
|---|---|---|
|
Mikrobiel overflod
Tidsramme: gennem studieafslutning, i gennemsnit 2 år
|
Patogenoverfloden måles ved RPKM (dvs.
Læser pr. million divideret med længden af referencegenomet, målt i kilobaser).
|
gennem studieafslutning, i gennemsnit 2 år
|
Samarbejdspartnere og efterforskere
Samarbejdspartnere
Efterforskere
- Studieleder: Shuo Su, PhD, Fudan University
Publikationer og nyttige links
Generelle publikationer
- Burton MJ, Ramke J, Marques AP, Bourne RRA, Congdon N, Jones I, Ah Tong BAM, Arunga S, Bachani D, Bascaran C, Bastawrous A, Blanchet K, Braithwaite T, Buchan JC, Cairns J, Cama A, Chagunda M, Chuluunkhuu C, Cooper A, Crofts-Lawrence J, Dean WH, Denniston AK, Ehrlich JR, Emerson PM, Evans JR, Frick KD, Friedman DS, Furtado JM, Gichangi MM, Gichuhi S, Gilbert SS, Gurung R, Habtamu E, Holland P, Jonas JB, Keane PA, Keay L, Khanna RC, Khaw PT, Kuper H, Kyari F, Lansingh VC, Mactaggart I, Mafwiri MM, Mathenge W, McCormick I, Morjaria P, Mowatt L, Muirhead D, Murthy GVS, Mwangi N, Patel DB, Peto T, Qureshi BM, Salomao SR, Sarah V, Shilio BR, Solomon AW, Swenor BK, Taylor HR, Wang N, Webson A, West SK, Wong TY, Wormald R, Yasmin S, Yusufu M, Silva JC, Resnikoff S, Ravilla T, Gilbert CE, Foster A, Faal HB. The Lancet Global Health Commission on Global Eye Health: vision beyond 2020. Lancet Glob Health. 2021 Apr;9(4):e489-e551. doi: 10.1016/S2214-109X(20)30488-5. Epub 2021 Feb 16. No abstract available.
- Chiu CY, Miller SA. Clinical metagenomics. Nat Rev Genet. 2019 Jun;20(6):341-355. doi: 10.1038/s41576-019-0113-7.
- Vasquez-Perez A, Magan T, Volpe G, Osborne SF, McFaul K, Vahdani K. Necrotizing Blepharoconjunctivitis and Keratitis in Human Monkeypox. JAMA Ophthalmol. 2023 Mar 1;141(3):285-288. doi: 10.1001/jamaophthalmol.2022.6253.
- Rose-Nussbaumer J, Doan T. Role of Ophthalmology in Emerging Infectious Diseases. JAMA Ophthalmol. 2022 Oct 1;140(10):935. doi: 10.1001/jamaophthalmol.2022.4017.
- Barshak MB, Durand ML, Gupta A, Mohareb AM, Dohlman TH, Papaliodis GN. State-of-the-Art Review: Ocular Infections. Clin Infect Dis. 2024 Nov 22;79(5):e48-e64. doi: 10.1093/cid/ciae433.
- Durand ML, Barshak MB, Sobrin L. Eye Infections. N Engl J Med. 2023 Dec 21;389(25):2363-2375. doi: 10.1056/NEJMra2216081. No abstract available.
- Ranjan R, Ranjan S. Ocular Pathology: Role of Emerging Viruses in the Asia-Pacific Region-A Review. Asia Pac J Ophthalmol (Phila). 2014 Sep-Oct;3(5):299-307. doi: 10.1097/APO.0000000000000021.
- Tsui E, Sella R, Tham V, Kong AW, McClean E, Goren L, Bahar I, Cherian N, Ramirez J, Hughes RE Jr, Privratsky JK, Onclinx T, Feit-Leichman R, Cheng A, Molina I, Kim P, Yu C, Ruder K, Tan A, Chen C, Liu Y, Abraham T, Hinterwirth A, Zhong L, Porco TC, Lietman TM, Seitzman GD, Doan T; SCORPIO Study Group. Pathogen Surveillance for Acute Infectious Conjunctivitis. JAMA Ophthalmol. 2023 Dec 1;141(12):1140-1144. doi: 10.1001/jamaophthalmol.2023.4785.
- Austin A, Lietman T, Rose-Nussbaumer J. Update on the Management of Infectious Keratitis. Ophthalmology. 2017 Nov;124(11):1678-1689. doi: 10.1016/j.ophtha.2017.05.012. Epub 2017 Sep 21.
- Ai JW, Weng SS, Cheng Q, Cui P, Li YJ, Wu HL, Zhu YM, Xu B, Zhang WH. Human Endophthalmitis Caused By Pseudorabies Virus Infection, China, 2017. Emerg Infect Dis. 2018 Jun;24(6):1087-1090. doi: 10.3201/eid2406.171612.
- Wu F, Zhao S, Yu B, Chen YM, Wang W, Song ZG, Hu Y, Tao ZW, Tian JH, Pei YY, Yuan ML, Zhang YL, Dai FH, Liu Y, Wang QM, Zheng JJ, Xu L, Holmes EC, Zhang YZ. A new coronavirus associated with human respiratory disease in China. Nature. 2020 Mar;579(7798):265-269. doi: 10.1038/s41586-020-2008-3. Epub 2020 Feb 3.
Datoer for undersøgelser
Studer store datoer
Studiestart (Faktiske)
Primær færdiggørelse (Anslået)
Studieafslutning (Anslået)
Datoer for studieregistrering
Først indsendt
Først indsendt, der opfyldte QC-kriterier
Først opslået (Faktiske)
Opdateringer af undersøgelsesjournaler
Sidste opdatering sendt (Faktiske)
Sidste opdatering indsendt, der opfyldte kvalitetskontrolkriterier
Sidst verificeret
Mere information
Begreber relateret til denne undersøgelse
Nøgleord
Yderligere relevante MeSH-vilkår
Andre undersøgelses-id-numre
- SHGH-CRU-2024516
Plan for individuelle deltagerdata (IPD)
Planlægger du at dele individuelle deltagerdata (IPD)?
IPD-planbeskrivelse
Lægemiddel- og udstyrsoplysninger, undersøgelsesdokumenter
Studerer et amerikansk FDA-reguleret lægemiddelprodukt
Studerer et amerikansk FDA-reguleret enhedsprodukt
produkt fremstillet i og eksporteret fra U.S.A.
Disse oplysninger blev hentet direkte fra webstedet clinicaltrials.gov uden ændringer. Hvis du har nogen anmodninger om at ændre, fjerne eller opdatere dine undersøgelsesoplysninger, bedes du kontakte register@clinicaltrials.gov. Så snart en ændring er implementeret på clinicaltrials.gov, vil denne også blive opdateret automatisk på vores hjemmeside .
Kliniske forsøg med Øjeninfektioner
-
Stanford UniversityUnited States Department of Defense; Department of Health and Human Services og andre samarbejdspartnereAfsluttet
-
Aydin Adnan Menderes UniversityAfsluttetSygeplejerskeuddannelsen | Simuleringstræning | Eye TrackerKalkun
-
Stanford UniversityUnited States Department of Defense; Department of Health and Human Services og andre samarbejdspartnereAfsluttet
-
Shanghai Zhongshan HospitalIkke rekrutterer endnuICU patienter | Kommunikationsbarrierer | Eye-tracking teknologi
-
Second Affiliated Hospital, School of Medicine,...RekrutteringMedicinsk Uddannelse | Eye-tracking teknologi | Perioperativ ledelse | OpmærksomhedsfordelingKina
-
Hospital St. Joseph, Marseille, FranceUkendtMakuladegeneration Exudative Eye BilateralFrankrig
-
Jianfeng XieRekrutteringCLABSI - Central Line Associated Bloodstream InfectionKina
-
Zhongshan Ophthalmic Center, Sun Yat-sen UniversityIkke rekrutterer endnuAksial forlængelse | Unge og børn | Naked Eye 3D Vision Training | Visuel funktion
-
Fondazione Policlinico Universitario Agostino Gemelli...Lo.Li.Pharma s.r.lIkke rekrutterer endnuHPV - Anogenital Human Papilloma Virus Infection | Infertilitet
-
Centre Hospitalier Universitaire, AmiensIkke rekrutterer endnuAutismespektrumforstyrrelse | Diagnose | Social kognition | Eye-trackingFrankrig