Silmäinfektioiden kokonaisinfektioiden karakterisointi
Silmäinfektioiden kokonaisinfektioiden karakterisointi: metagenomiseen sekvensointiin perustuva havainnointitutkimus
Tutkimuksen yleiskatsaus
Tila
Ehdot
Yksityiskohtainen kuvaus
Tämä on tutkijan aloittama havaintotutkimus, joka kuvaa silmäinfektioiden kokonaisinfektiota metagenomisen sekvensoinnin avulla. Kokeneet silmälääkärit diagnosoivat silmätulehdukset, mukaan lukien akuutti sidekalvotulehdus, keratiitti, uveiitti ja endoftalmiitti, rutiininomaisten kliinisten tutkimusten mukaisesti.
Ylimääräisten biologisten näytteiden keräämiseen diagnoosi- ja hoitoprosessin lisäksi vaaditaan kirjallinen tietoinen suostumus hakukelpoisilta koehenkilöiltä tai heidän laillisilta huoltajiltansa rekrytointihetkellä. Tietoon perustuvan suostumuksen vapautushakemus on tehty kliinisten ylijäämänäytteiden käytöstä. Kun tietoon perustuva suostumus on annettu, koehenkilöistä otetaan näyte ja heidän kliiniset tiedot kerätään.
Bionäytteitä, mukaan lukien sidekalvopussin vanupuikko (1 vanupuikko jokaista silmää kohti) tai silmänsisäistä nestettä (yli 100 μl), kerätään metagenomista sekvensointia varten Illumina NovaSeq X Plus -alustan avulla.
Osallistujien kliiniset tiedot kerätään sähköisestä sairauskertomustietojärjestelmästä, mukaan lukien (1) demografiset tiedot: ikä, sukupuoli, liitännäissairaudet; (2) laboratoriotutkimus: verikoe, immuunitulehdustekijät, kliininen mikrobiologinen tutkimus (PCR, serologinen tutkimus, viljely jne.); (3) kuvantamistutkimus: etuosan valokuva, sarveiskalvon endoteelisolututkimus, sarveiskalvon konfokaalinen mikroskopia, silmänpohjakuva.
Silmänäytteiden metatranskriptominen analyysi suoritetaan virusten, bakteerien, sienten ja loisten tunnistamiseksi. Patogeenien runsaus on merkitty RPKM:ksi (ts. Lukemat miljoonaa kohden jaettuna vertailugenomin pituudella kiloemäksinä mitattuna).
Tukikelpoiset osallistujat rekrytoidaan peräkkäin elokuun 2024 ja joulukuun 2026 välisenä aikana Shanghain yleissairaalan oftalmologian osastolle. Kokonaistutkimuksen keston odotetaan olevan kaksi vuotta ensimmäisestä ilmoittautuneesta tutkittavasta lopulliseen analyysiin.
Opintotyyppi
Ilmoittautuminen (Arvioitu)
Yhteystiedot ja paikat
Opiskeluyhteys
- Nimi: Mei Kang, MPH
- Puhelinnumero: 021-36126064
- Sähköposti: mei.kang@shgh.cn
Opiskelupaikat
-
-
Shanghai
-
Shanghai, Shanghai, Kiina, 200030
- Rekrytointi
- Shanghai General Hospital
-
Ottaa yhteyttä:
- Mei Kang, MPH
- Puhelinnumero: 02136126064
- Sähköposti: mei.kang@shgh.cn
-
-
Osallistumiskriteerit
Kelpoisuusvaatimukset
Opintokelpoiset iät
- Lapsi
- Aikuinen
- Vanhempi Aikuinen
Hyväksyy terveitä vapaaehtoisia
Näytteenottomenetelmä
Tutkimusväestö
Kuvaus
Sisällön kriteerit:
- Potilaat, joilla on kliininen diagnoosi yksi tai useampi silmätulehdus (mukaan lukien akuutti sidekalvotulehdus, keratiitti, uveiitti ja endoftalmiitti).
- Biologiset näytteet on kerätty kliinistä mikrobiologista tutkimusta varten tai suostuttu osallistumaan tähän tutkimukseen.
Poissulkemiskriteerit:
1. Potilaat, joilla ei ole historiallisesti kliinisiä ylijäämänäytteitä.
Opintosuunnitelma
Miten tutkimus on suunniteltu?
Suunnittelun yksityiskohdat
Kohortit ja interventiot
Ryhmä/Kohortti |
|---|
|
Silmäinfektioiden kohortti
Potilaat, joilla on diagnosoitu yksi tai useampi silmätulehdus (mukaan lukien akuutti sidekalvotulehdus, keratiitti, uveiitti ja endoftalmiitti).
|
Mitä tutkimuksessa mitataan?
Ensisijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Toimenpiteen kuvaus |
Aikaikkuna |
|---|---|---|
|
Patogeenin profiili
Aikaikkuna: opintojen päätyttyä keskimäärin 2 vuotta
|
Bakteerit, sienet, virukset ja loiset, jotka tunnistetaan metagenomisilla tekniikoilla silmänäytteistä.
|
opintojen päätyttyä keskimäärin 2 vuotta
|
Toissijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Toimenpiteen kuvaus |
Aikaikkuna |
|---|---|---|
|
Mikrobien runsaus
Aikaikkuna: opintojen päätyttyä keskimäärin 2 vuotta
|
Patogeenien runsaus mitataan RPKM:llä (ts.
Lukemat miljoonaa kohden jaettuna vertailugenomin pituudella kiloemäksinä mitattuna).
|
opintojen päätyttyä keskimäärin 2 vuotta
|
Yhteistyökumppanit ja tutkijat
Yhteistyökumppanit
Tutkijat
- Opintojohtaja: Shuo Su, PhD, Fudan University
Julkaisuja ja hyödyllisiä linkkejä
Yleiset julkaisut
- Burton MJ, Ramke J, Marques AP, Bourne RRA, Congdon N, Jones I, Ah Tong BAM, Arunga S, Bachani D, Bascaran C, Bastawrous A, Blanchet K, Braithwaite T, Buchan JC, Cairns J, Cama A, Chagunda M, Chuluunkhuu C, Cooper A, Crofts-Lawrence J, Dean WH, Denniston AK, Ehrlich JR, Emerson PM, Evans JR, Frick KD, Friedman DS, Furtado JM, Gichangi MM, Gichuhi S, Gilbert SS, Gurung R, Habtamu E, Holland P, Jonas JB, Keane PA, Keay L, Khanna RC, Khaw PT, Kuper H, Kyari F, Lansingh VC, Mactaggart I, Mafwiri MM, Mathenge W, McCormick I, Morjaria P, Mowatt L, Muirhead D, Murthy GVS, Mwangi N, Patel DB, Peto T, Qureshi BM, Salomao SR, Sarah V, Shilio BR, Solomon AW, Swenor BK, Taylor HR, Wang N, Webson A, West SK, Wong TY, Wormald R, Yasmin S, Yusufu M, Silva JC, Resnikoff S, Ravilla T, Gilbert CE, Foster A, Faal HB. The Lancet Global Health Commission on Global Eye Health: vision beyond 2020. Lancet Glob Health. 2021 Apr;9(4):e489-e551. doi: 10.1016/S2214-109X(20)30488-5. Epub 2021 Feb 16. No abstract available.
- Chiu CY, Miller SA. Clinical metagenomics. Nat Rev Genet. 2019 Jun;20(6):341-355. doi: 10.1038/s41576-019-0113-7.
- Vasquez-Perez A, Magan T, Volpe G, Osborne SF, McFaul K, Vahdani K. Necrotizing Blepharoconjunctivitis and Keratitis in Human Monkeypox. JAMA Ophthalmol. 2023 Mar 1;141(3):285-288. doi: 10.1001/jamaophthalmol.2022.6253.
- Rose-Nussbaumer J, Doan T. Role of Ophthalmology in Emerging Infectious Diseases. JAMA Ophthalmol. 2022 Oct 1;140(10):935. doi: 10.1001/jamaophthalmol.2022.4017.
- Barshak MB, Durand ML, Gupta A, Mohareb AM, Dohlman TH, Papaliodis GN. State-of-the-Art Review: Ocular Infections. Clin Infect Dis. 2024 Nov 22;79(5):e48-e64. doi: 10.1093/cid/ciae433.
- Durand ML, Barshak MB, Sobrin L. Eye Infections. N Engl J Med. 2023 Dec 21;389(25):2363-2375. doi: 10.1056/NEJMra2216081. No abstract available.
- Ranjan R, Ranjan S. Ocular Pathology: Role of Emerging Viruses in the Asia-Pacific Region-A Review. Asia Pac J Ophthalmol (Phila). 2014 Sep-Oct;3(5):299-307. doi: 10.1097/APO.0000000000000021.
- Tsui E, Sella R, Tham V, Kong AW, McClean E, Goren L, Bahar I, Cherian N, Ramirez J, Hughes RE Jr, Privratsky JK, Onclinx T, Feit-Leichman R, Cheng A, Molina I, Kim P, Yu C, Ruder K, Tan A, Chen C, Liu Y, Abraham T, Hinterwirth A, Zhong L, Porco TC, Lietman TM, Seitzman GD, Doan T; SCORPIO Study Group. Pathogen Surveillance for Acute Infectious Conjunctivitis. JAMA Ophthalmol. 2023 Dec 1;141(12):1140-1144. doi: 10.1001/jamaophthalmol.2023.4785.
- Austin A, Lietman T, Rose-Nussbaumer J. Update on the Management of Infectious Keratitis. Ophthalmology. 2017 Nov;124(11):1678-1689. doi: 10.1016/j.ophtha.2017.05.012. Epub 2017 Sep 21.
- Ai JW, Weng SS, Cheng Q, Cui P, Li YJ, Wu HL, Zhu YM, Xu B, Zhang WH. Human Endophthalmitis Caused By Pseudorabies Virus Infection, China, 2017. Emerg Infect Dis. 2018 Jun;24(6):1087-1090. doi: 10.3201/eid2406.171612.
- Wu F, Zhao S, Yu B, Chen YM, Wang W, Song ZG, Hu Y, Tao ZW, Tian JH, Pei YY, Yuan ML, Zhang YL, Dai FH, Liu Y, Wang QM, Zheng JJ, Xu L, Holmes EC, Zhang YZ. A new coronavirus associated with human respiratory disease in China. Nature. 2020 Mar;579(7798):265-269. doi: 10.1038/s41586-020-2008-3. Epub 2020 Feb 3.
Opintojen ennätyspäivät
Opi tärkeimmät päivämäärät
Opiskelun aloitus (Todellinen)
Ensisijainen valmistuminen (Arvioitu)
Opintojen valmistuminen (Arvioitu)
Opintoihin ilmoittautumispäivät
Ensimmäinen lähetetty
Ensimmäinen toimitettu, joka täytti QC-kriteerit
Ensimmäinen Lähetetty (Todellinen)
Tutkimustietojen päivitykset
Viimeisin päivitys julkaistu (Todellinen)
Viimeisin lähetetty päivitys, joka täytti QC-kriteerit
Viimeksi vahvistettu
Lisää tietoa
Tähän tutkimukseen liittyvät termit
Avainsanat
Muita asiaankuuluvia MeSH-ehtoja
Muut tutkimustunnusnumerot
- SHGH-CRU-2024516
Yksittäisten osallistujien tietojen suunnitelma (IPD)
Aiotko jakaa yksittäisten osallistujien tietoja (IPD)?
IPD-suunnitelman kuvaus
Lääke- ja laitetiedot, tutkimusasiakirjat
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää lääkevalmistetta
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää laitetuotetta
Yhdysvalloissa valmistettu ja sieltä viety tuote
Nämä tiedot haettiin suoraan verkkosivustolta clinicaltrials.gov ilman muutoksia. Jos sinulla on pyyntöjä muuttaa, poistaa tai päivittää tutkimustietojasi, ota yhteyttä register@clinicaltrials.gov. Heti kun muutos on otettu käyttöön osoitteessa clinicaltrials.gov, se päivitetään automaattisesti myös verkkosivustollemme .