まれな筋肉疾患の患者の誤診を終わらせるためのトランスクリプトーム分析 (ARNseq-Musc)
2017年以来、Timone Enfant病院のMolecular Genetics Laboratoryで実施された250を超える分析により、まれな遺伝的筋肉疾患の患者で否定的な結果が得られています。 研究者は、これらの誤診された患者の一部が、DNAシーケンスによって特定されなかった病原性RNA（転写産物）破壊バリアントを運ぶと仮定しています。 実際、DNAシーケンス分析は、RNAのスプライシングまたは発現を破壊し、遺伝的疾患を引き起こす病原性変異体が存在するにもかかわらず、陰性になる可能性があります。 このため、RNAシーケンスは、DNAシーケンスによって診断されていない患者の診断を提供することができ、したがって、診断のさまよいを終わらせることができます。 したがって、記述的有病率研究として、目的は、最初に、まだ診断されていない筋肉疾患の患者におけるRNASEQアプローチによって行われた陽性診断の割合を決定し、次に患者で特定された病原性変異体のゲノム特性を特定することです。将来の患者におけるこのタイプのバリアントの特定を促進するために、RNaseQ分析によって。
50人の患者が2年間この研究に含まれます。
調査の概要
研究の種類
入学 (推定)
段階
- 適用できない
連絡先と場所
研究連絡先
- 名前：Svetlana GOROKHOVA Dr
- 電話番号：+33491381927
- メール：promotion.interne@ap-hm.fr
研究場所
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-
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Marseille、フランス、13005
- 募集
- Hôpital Timone
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コンタクト：
- Svetlana GOROKHOVA Dr
- 電話番号：+33491381927
- メール：promotion.interne@ap-hm.fr
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参加基準
適格基準
就学可能な年齢
- 子
- 大人
- 高齢者
健康ボランティアの受け入れ
説明
包含基準：
- 高スループットシーケンス分析の恩恵を受けたまれな遺伝的筋肉疾患の患者（フィルネムスレア神経筋疾患ネットワークによって定義された200個の遺伝子のパネル）は、2017年以来、ティモネエンファント病院の医学遺伝学部門の分子遺伝学研究所で実施されました。
この基準は、分子遺伝学研究所によって分析されたすべての患者の中で、分析を筋肉疾患の患者に限定するために必要です。
- この遺伝分析では、患者の表現型を説明する病原性の変異体を特定しませんでした。この基準は、診断誤差に患者のみを含めるために必要です。
- 患者の筋肉生検は、AP-HMの生物資源センター（CRB）で利用できます。
除外基準：
- CRBで利用可能な筋肉生検を持たない患者。
- 確立された分子診断の患者。
- 筋肉生検サンプルからのRNA抽出が十分な品質（INR> 7）のRNAを生成しなかった患者は、研究から除外されます。 最大2つの抽出試行が実行されます。
研究計画
研究はどのように設計されていますか？
デザインの詳細
- 主な目的：診断
- 割り当て：なし
- 介入モデル：単一グループの割り当て
- マスキング：なし（オープンラベル）
武器と介入
参加者グループ / アーム |
介入・治療 |
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実験的：RNASEQライブラリのシーケンス
参加者からの訪問はありませんので、生物学的資源センター（CRB）ですでにサンプルを使用します。 RNAは、治療の一部として採取された筋肉生検から抽出されます。 RNASEQライブラリは、Marseille Medical Genetics（MMG、U1251、AMU）のゲノミクスおよびバイオインフォマティクスプラットフォーム（GBIM）によってシーケンスされます。 シーケンスは、イルミナのnovaseq 6000システム（サンプルあたり5,000万クラスター、100 mペアの末端読み取り）でペアエンド（2*100 bp）で実行され、バイオインフォマティクスによって分析されます。 |
参加者からの訪問はありませんので、生物学的資源センター（CRB）ですでにサンプルを使用します。 RNAは、治療の一部として採取された筋肉生検から抽出されます。 RNASEQライブラリは、Marseille Medical Genetics（MMG、U1251、AMU）のゲノミクスおよびバイオインフォマティクスプラットフォーム（GBIM）によってシーケンスされます。 シーケンスは、イルミナのnovaseq 6000システム（サンプルあたり5,000万クラスター、100 mペアの末端読み取り）でペアエンド（2*100 bp）で実行され、バイオインフォマティクスによって分析されます。 |
この研究は何を測定していますか？
主要な結果の測定
結果測定 |
メジャーの説明 |
時間枠 |
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RNASEQアプローチを使用した陽性診断の割合
時間枠：登録から24か月での研究終了まで
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まだ診断されていない筋肉疾患患者のRNASEQアプローチを使用して行われた陽性診断の割合を決定する。
筋肉疾患の原因となる200の遺伝子のDNA配列決定が患者の表現型の原因となる病原性変異体を特定していない場合、患者は診断範囲にあると見なされます。
研究者は、革新的なバイオインフォマティクスツールと組み合わせてトランスクリプトーム分析（RNAシーケンス）を使用して、診断されていない筋肉疾患患者のRNAレベルで有害な効果を持つバリアントを特定します。
これにより、分子診断を確立し、多くの患者の誤診が終了することが可能になります。
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登録から24か月での研究終了まで
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二次結果の測定
結果測定 |
メジャーの説明 |
時間枠 |
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ゲノム特性の識別
時間枠：24か月での登録から研究の終わりまで
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RNaseQアプローチによって特定された病原性変異体のゲノム特性を特定します。
この分析は、このタイプのバリアントに固有の特定の特性を発見する可能性があり、将来の他の診断されていない患者に存在することを示唆することが可能になります。
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24か月での登録から研究の終わりまで
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協力者と研究者
研究記録日
主要日程の研究
研究開始 (推定)
一次修了 (推定)
研究の完了 (推定)
試験登録日
最初に提出
QC基準を満たした最初の提出物
最初の投稿 (実際)
学習記録の更新
投稿された最後の更新 (実際)
QC基準を満たした最後の更新が送信されました
最終確認日
詳しくは
本研究に関する用語
追加の関連 MeSH 用語
その他の研究ID番号
- RCAPHM22_0420
- 2024-A01079-38 (その他の識別子：RCB)
医薬品およびデバイス情報、研究文書
米国FDA規制医薬品の研究
米国FDA規制機器製品の研究
この情報は、Web サイト clinicaltrials.gov から変更なしで直接取得したものです。研究の詳細を変更、削除、または更新するリクエストがある場合は、register@clinicaltrials.gov。 までご連絡ください。 clinicaltrials.gov に変更が加えられるとすぐに、ウェブサイトでも自動的に更新されます。