Transzkriptikai elemzés, hogy véget vessen a téves diagnózisnak a ritka izombetegségekben szenvedő betegek esetében (ARNseq-Musc)
2017 óta a Timone Enfant Kórház molekuláris genetikai laboratóriumában végzett több mint 250 elemzés negatív eredményeket hozott a ritka genetikai izombetegségekben szenvedő betegekben. A kutatók feltételezik, hogy ezeknek a tévesen diagnosztizált betegeknek néhány patogén RNS (transzkriptum) megzavarja a variánsokat, amelyeket a DNS -szekvenálással nem azonosítottak. Valójában a DNS -szekvenálási elemzések negatívak lehetnek annak ellenére, hogy olyan patogén variáns jelen van, amely megzavarja az RNS splicing -t vagy expressziót, genetikai betegséget okozva. Ezért az RNS -szekvenálás diagnosztizálást eredményezhet olyan betegekben, akiket nem diagnosztizáltak a DNS -szekvenálással, ezáltal véget vetve a diagnosztikai vándorlásnak. Így, mint egy leíró prevalencia -tanulmány, a célok elsősorban annak meghatározása, hogy az RNASEQ megközelítés pozitív diagnózisok arányát végezzék olyan izombetegségekben szenvedő betegekben, akiket még nem diagnosztizáltak, majd azonosítják a betegekben azonosított patogén variánsok genomikus jellemzőit. Az RNASEQ elemzéssel annak érdekében, hogy megkönnyítsék az ilyen típusú variánsok azonosítását a jövőbeni betegekben.
50 beteget vesznek fel ebbe a vizsgálatba 2 év alatt.
A tanulmány áttekintése
Állapot
Körülmények
Beavatkozás / kezelés
Tanulmány típusa
Beiratkozás (Becsült)
Fázis
- Nem alkalmazható
Kapcsolatok és helyek
Tanulmányi kapcsolat
- Név: Svetlana GOROKHOVA Dr
- Telefonszám: +33491381927
- E-mail: promotion.interne@ap-hm.fr
Tanulmányi helyek
-
-
-
Marseille, Franciaország, 13005
- Toborzás
- Hôpital Timone
-
Kapcsolatba lépni:
- Svetlana GOROKHOVA Dr
- Telefonszám: +33491381927
- E-mail: promotion.interne@ap-hm.fr
-
-
Részvételi kritériumok
Jogosultsági kritériumok
Tanulmányozható életkorok
- Gyermek
- Felnőtt
- Idősebb felnőtt
Egészséges önkénteseket fogad
Leírás
Befogadási kritériumok:
- A ritka genetikai izombetegségekben szenvedő betegek, akiknek a nagy teljesítményű szekvenálási elemzés (a Filnemus ritka neuromuscularis betegséghálózat által definiált 200 génből álló panel) részesültek előnyben, amelyet a Molekuláris Genetikai Laboratóriumban, a Timone Enfant Kórházban, az Orvosi Genetikai Osztályban, 2017 óta végeztek.
Ez a kritérium szükséges ahhoz, hogy az elemzést az izombetegségben szenvedő betegeknél korlátozzák az összes olyan beteg körében, amelyet a molekuláris genetikai laboratóriumban elemeztek.
- Ez a genetikai elemzés nem azonosította a beteg fenotípusát magyarázó patogén variánsokat. Ez a kritérium szükséges ahhoz, hogy csak a betegeket beépítsék a diagnosztikai hibába.
- A beteg izombiopsziája áll rendelkezésre az AP-HM Biológiai Resources Centerben (CRB).
Kizárási kritériumok:
- Azok a betegek, akiknek nincs izom biopsziája a CRB -ben.
- A bevált molekuláris diagnózissal rendelkező betegek.
- Azok a betegek, akiknek az izombiopsziás mintából származó RNS -extrakció nem adtak elegendő minőségű RNS -t (INR> 7), kizárják a vizsgálatból. Legfeljebb két extrahálási kísérletet hajtanak végre.
Tanulási terv
Hogyan készül a tanulmány?
Tervezési részletek
- Elsődleges cél: Diagnosztikai
- Kiosztás: N/A
- Beavatkozó modell: Egyetlen csoportos hozzárendelés
- Maszkolás: Nincs (Open Label)
Fegyverek és beavatkozások
Résztvevő csoport / kar |
Beavatkozás / kezelés |
|---|---|
|
Kísérleti: RNASEQ könyvtárak szekvenálása
A résztvevők nem látogatnak meg, ezért már a Biológiai Resources Centerben (CRB) mintákat fogunk használni. Az RNS -t a kezelés részeként vett izombiopsziákból extrahálják. Az RNASEQ könyvtárakat a Marseille Medical Genetikában (MMG, U1251, AMU) a Genomics és a Bioinformatika platform (GBIM) szekvenálja. A szekvenálást páros végű (2*100 bp) végezzük az Illumina Novaseq 6000 rendszerén (mintán 50 millió klaszter, 100 m páros végzés), majd bioinformatikával elemezzük. |
A résztvevők nem látogatnak meg, ezért már a Biológiai Resources Centerben (CRB) mintákat fogunk használni. Az RNS -t a kezelés részeként vett izombiopsziákból extrahálják. Az RNASEQ könyvtárakat a Marseille Medical Genetikában (MMG, U1251, AMU) a Genomics és a Bioinformatika platform (GBIM) szekvenálja. A szekvenálást páros végű (2*100 bp) végezzük az Illumina Novaseq 6000 rendszerén (mintán 50 millió klaszter, 100 m páros végzés), majd bioinformatikával elemezzük. |
Mit mér a tanulmány?
Elsődleges eredményintézkedések
Eredménymérő |
Intézkedés leírása |
Időkeret |
|---|---|---|
|
A pozitív diagnózisok aránya az RNASEQ megközelítés alkalmazásával
Időkeret: A beiratkozástól a tanulmány végéig 24 hónapos
|
Az RNASEQ megközelítés alkalmazásával végzett pozitív diagnózisok sebességének meghatározása olyan izombetegségekben szenvedő betegek esetén, akiket még nem diagnosztizáltak.
A beteget diagnosztikai végtagban tekintik, ha az izombetegségekért felelős 200 gén DNS -szekvenálása nem azonosította a beteg fenotípusáért felelős patogén variánsokat.
A kutatók transzkriptikai elemzést (RNS szekvenálást) fognak használni innovatív bioinformatikai eszközökkel kombinálva, hogy azonosítsák az RNS -szintű káros hatású variánsokat diagnosztizált izombetegségekben szenvedő betegekben.
Ez lehetővé teszi a molekuláris diagnózis létrehozását, és sok betegnél véget vetni a téves diagnosztizálásnak.
|
A beiratkozástól a tanulmány végéig 24 hónapos
|
Másodlagos eredményintézkedések
Eredménymérő |
Intézkedés leírása |
Időkeret |
|---|---|---|
|
A genomi jellemzők azonosítása
Időkeret: A beiratkozástól a tanulmány végéig 24 hónapos
|
Azonosítsa az RNASEQ megközelítés által azonosított patogén variánsok genomi jellemzőit.
Ez az elemzés potenciálisan feltárhatja az ilyen típusú variánsokra jellemző jellemzőket, lehetővé téve a jövőben más nem diagnosztizált betegekben való jelenlétüket.
|
A beiratkozástól a tanulmány végéig 24 hónapos
|
Együttműködők és nyomozók
Tanulmányi rekorddátumok
Tanulmány főbb dátumok
Tanulmány kezdete (Becsült)
Elsődleges befejezés (Becsült)
A tanulmány befejezése (Becsült)
Tanulmányi regisztráció dátumai
Először benyújtva
Először nyújtották be, amely megfelel a minőségbiztosítási kritériumoknak
Első közzététel (Tényleges)
Tanulmányi rekordok frissítései
Utolsó frissítés közzétéve (Tényleges)
Az utolsó frissítés elküldve, amely megfelel a minőségbiztosítási kritériumoknak
Utolsó ellenőrzés
Több információ
A tanulmányhoz kapcsolódó kifejezések
További vonatkozó MeSH feltételek
- Mozgásszervi betegségek
- Agyi betegségek
- Központi idegrendszeri betegségek
- Idegrendszeri betegségek
- Neuromuszkuláris betegségek
- Anyagcsere, veleszületett hibák
- Genetikai betegségek, veleszületett
- Anyagcsere-betegségek
- Genetikai betegségek, X-hez kapcsolódó
- Izombetegségek, atrófiás
- Szénhidrát anyagcsere, veleszületett hibák
- Lizoszómális raktározási betegségek
- Agyi betegségek, anyagcsere, veleszületett
- Agyi betegségek, anyagcsere
- Lizoszómális raktározási betegségek, idegrendszer
- Glikogén tárolási betegség
- Izomdisztrófiák
- Izombetegségek
- Izomdisztrófia, Duchenne
- Glikogén tárolási betegség II
Egyéb vizsgálati azonosító számok
- RCAPHM22_0420
- 2024-A01079-38 (Egyéb azonosító: RCB)
Gyógyszer- és eszközinformációk, tanulmányi dokumentumok
Egy amerikai FDA által szabályozott gyógyszerkészítményt tanulmányoz
Egy amerikai FDA által szabályozott eszközterméket tanulmányoz
Ezt az információt közvetlenül a clinicaltrials.gov webhelyről szereztük be, változtatás nélkül. Ha bármilyen kérése van vizsgálati adatainak módosítására, eltávolítására vagy frissítésére, kérjük, írjon a következő címre: register@clinicaltrials.gov. Amint a változás bevezetésre kerül a clinicaltrials.gov oldalon, ez a webhelyünkön is automatikusan frissül. .