- ICH GCP
- Registro de ensaios clínicos dos EUA
- Ensaio Clínico NCT06833489
Análise transcriptômica para pôr fim ao diagnóstico incorreto em pacientes com doenças musculares raras (ARNseq-Musc)
Desde 2017, mais de 250 análises realizadas no Laboratório de Genética Molecular do Hospital Timone Enfant produziram resultados negativos em pacientes com doenças musculares genéticas raras. Os pesquisadores levantam a hipótese de que alguns desses pacientes diagnosticados incorretamente carregam RNA patogênico (transcrição) que interrompem as variantes que não foram identificadas pelo sequenciamento de DNA. De fato, as análises de sequenciamento de DNA podem ser negativas, apesar da presença de uma variante patogênica que interrompe a emenda ou expressão do RNA, causando uma doença genética. Por esse motivo, o sequenciamento de RNA pode fornecer um diagnóstico em pacientes que não foram diagnosticados pelo sequenciamento de DNA, colocando o fim para o diagnóstico de vagação. Assim, como um estudo descritivo de prevalência, os objetivos são os primeiros a determinar a taxa de diagnósticos positivos feitos pela abordagem RNASEQ em pacientes com doenças musculares que ainda não foram diagnosticadas e, em seguida, identificar as características genômicas das variantes patogênicas identificadas em pacientes pela análise RNASEQ, a fim de facilitar a identificação desse tipo de variante em futuros pacientes.
50 pacientes serão incluídos neste estudo durante 2 anos.
Visão geral do estudo
Status
Condições
Intervenção / Tratamento
Tipo de estudo
Inscrição (Estimado)
Estágio
- Não aplicável
Contactos e Locais
Contato de estudo
- Nome: Svetlana GOROKHOVA Dr
- Número de telefone: +33491381927
- E-mail: promotion.interne@ap-hm.fr
Locais de estudo
-
-
-
Marseille, França, 13005
- Recrutamento
- Hôpital Timone
-
Contato:
- Svetlana GOROKHOVA Dr
- Número de telefone: +33491381927
- E-mail: promotion.interne@ap-hm.fr
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Critérios de participação
Critérios de elegibilidade
Idades elegíveis para estudo
- Filho
- Adulto
- Adulto mais velho
Aceita Voluntários Saudáveis
Descrição
Critérios de inclusão:
- Pacientes com doenças musculares genéticas raras que se beneficiaram da análise de sequenciamento de alto rendimento (painel de 200 genes definidos pela rede de doenças neuromusculares raras de Filnemus) realizada no Laboratório de Genética Molecular, Departamento de Genética Médica, Hospital Timone Enfant desde 2017.
Esse critério é necessário para limitar a análise a pacientes com doenças musculares entre todos os pacientes analisados pelo Laboratório de Genética Molecular.
- Essa análise genética não identificou variantes patogênicas explicando o fenótipo do paciente que esse critério é necessário para incluir apenas pacientes em erro de diagnóstico.
- Uma biópsia muscular do paciente está disponível no Centro de Recursos Biológicos (CRB) no AP-HM.
Critérios de exclusão:
- Pacientes sem biópsia muscular disponíveis no CRB.
- Pacientes com um diagnóstico molecular estabelecido.
- Os pacientes para os quais a extração de RNA de uma amostra de biópsia muscular não produziram RNA de qualidade suficiente (INR> 7) serão excluídos do estudo. Um máximo de duas tentativas de extração será realizado.
Plano de estudo
Como o estudo é projetado?
Detalhes do projeto
- Finalidade Principal: Diagnóstico
- Alocação: N / D
- Modelo Intervencional: Atribuição de grupo único
- Mascaramento: Nenhum (rótulo aberto)
Armas e Intervenções
Grupo de Participantes / Braço |
Intervenção / Tratamento |
|---|---|
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Experimental: Sequenciamento de bibliotecas RNaseq
Não haverá visitas dos participantes, por isso já usaremos amostras no Centro de Recursos Biológicos (CRB). O RNA será extraído das biópsias musculares tomadas como parte do tratamento. As bibliotecas RNaseQ serão sequenciadas pela plataforma genômica e bioinformática (GBIM) na Marselha Medical Genetics (MMG, U1251, AMU). O seqüenciamento será realizado no parado (2*100 pb) no sistema Novaseq 6000 da Illumina (50 milhões de aglomerados por amostra, leituras de 100 m em parada) e depois analisadas por bioinformática. |
Não haverá visitas dos participantes, por isso já usaremos amostras no Centro de Recursos Biológicos (CRB). O RNA será extraído das biópsias musculares tomadas como parte do tratamento. As bibliotecas RNaseQ serão sequenciadas pela plataforma genômica e bioinformática (GBIM) na Marselha Medical Genetics (MMG, U1251, AMU). O seqüenciamento será realizado no parado (2*100 pb) no sistema Novaseq 6000 da Illumina (50 milhões de aglomerados por amostra, leituras de 100 m em parada) e depois analisadas por bioinformática. |
O que o estudo está medindo?
Medidas de resultados primários
Medida de resultado |
Descrição da medida |
Prazo |
|---|---|---|
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Taxa de diagnóstico positivo usando a abordagem RNASEQ
Prazo: Da inscrição até o final do estudo aos 24 meses
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Para determinar a taxa de diagnósticos positivos feitos usando a abordagem RNaseQ em pacientes com doenças musculares que ainda não foram diagnosticadas.
Um paciente é considerado no limbo diagnóstico se o seqüenciamento de DNA de 200 genes responsáveis por doenças musculares não identificaram variantes patogênicas responsáveis pelo fenótipo do paciente.
Os investigadores usarão análises transcriptômicas (sequenciamento de RNA) em combinação com ferramentas inovadoras de bioinformática para identificar variantes com um efeito deletério no nível do RNA em pacientes com doenças musculares não diagnosticadas.
Isso tornará possível estabelecer um diagnóstico molecular e pôr fim ao diagnóstico incorreto em muitos pacientes.
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Da inscrição até o final do estudo aos 24 meses
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Medidas de resultados secundários
Medida de resultado |
Descrição da medida |
Prazo |
|---|---|---|
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Identificação de características genômicas
Prazo: Da inscrição ao final do estudo aos 24 meses
|
Identifique as características genômicas das variantes patogênicas identificadas pela abordagem RNaseq.
Essa análise pode descobrir certas características específicas para esse tipo de variante, possibilitando sugerir sua presença em outros pacientes não diagnosticados no futuro.
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Da inscrição ao final do estudo aos 24 meses
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Colaboradores e Investigadores
Patrocinador
Datas de registro do estudo
Datas Principais do Estudo
Início do estudo (Estimado)
Conclusão Primária (Estimado)
Conclusão do estudo (Estimado)
Datas de inscrição no estudo
Enviado pela primeira vez
Enviado pela primeira vez que atendeu aos critérios de CQ
Primeira postagem (Real)
Atualizações de registro de estudo
Última Atualização Postada (Real)
Última atualização enviada que atendeu aos critérios de controle de qualidade
Última verificação
Mais Informações
Termos relacionados a este estudo
Termos MeSH relevantes adicionais
- Doenças musculoesqueléticas
- Doenças Cerebrais
- Doenças do Sistema Nervoso Central
- Doenças do Sistema Nervoso
- Doenças Neuromusculares
- Metabolismo, Erros Inatos
- Doenças Genéticas, Congênitas
- Doenças Metabólicas
- Doenças Genéticas, Ligadas ao X
- Distúrbios Musculares Atróficos
- Metabolismo de Carboidratos, Erros Inatos
- Doenças de Armazenamento Lisossomal
- Doenças Cerebrais Metabólicas Inatas
- Doenças Cerebrais Metabólicas
- Doenças do Armazenamento Lisossomal, Sistema Nervoso
- Doença de Armazenamento de Glicogênio
- Distrofias Musculares
- Doenças Musculares
- Distrofia Muscular, Duchenne
- Doença de Armazenamento de Glicogênio Tipo II
Outros números de identificação do estudo
- RCAPHM22_0420
- 2024-A01079-38 (Outro identificador: RCB)
Informações sobre medicamentos e dispositivos, documentos de estudo
Estuda um medicamento regulamentado pela FDA dos EUA
Estuda um produto de dispositivo regulamentado pela FDA dos EUA
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