Deze pagina is automatisch vertaald en de nauwkeurigheid van de vertaling kan niet worden gegarandeerd. Raadpleeg de Engelse versie voor een brontekst.

Transcriptomische analyse om een ​​einde te maken aan een verkeerde diagnose bij patiënten met zeldzame spierziekten (ARNseq-Musc)

17 februari 2025 bijgewerkt door: Assistance Publique Hopitaux De Marseille

Sinds 2017 hebben meer dan 250 analyses uitgevoerd in het Molecular Genetics Laboratory van het Timone Enfant Hospital negatieve resultaten opgeleverd bij patiënten met zeldzame genetische spierziekten. De onderzoekers veronderstellen dat sommige van deze verkeerd gediagnosticeerde patiënten pathogene RNA (transcript) die varianten verstoren die niet werden geïdentificeerd door DNA -sequencing. In feite kunnen DNA -sequencing -analyses negatief zijn ondanks de aanwezigheid van een pathogene variant die RNA -splitsing of expressie verstoort, waardoor een genetische ziekte wordt veroorzaakt. Om deze reden kan RNA -sequencing een diagnose stellen bij patiënten bij wie niet is gediagnosticeerd door DNA -sequencing, waardoor een einde wordt gemaakt aan de diagnostische dwalen. Dus als een beschrijvende prevalentiestudie zijn de doelstellingen eerst om de snelheid van positieve diagnoses te bepalen die door de RNaseq -benadering worden gesteld bij patiënten met spierziekten die nog niet zijn gediagnosticeerd, en vervolgens om de genomische kenmerken van de pathogene varianten te identificeren die bij patiënten zijn geïdentificeerd door RNASEQ -analyse, om de identificatie van dit type variant bij toekomstige patiënten te vergemakkelijken.

50 patiënten worden gedurende 2 jaar in dit onderzoek opgenomen.

Studie Overzicht

Toestand

Werving

Conditie

Interventie / Behandeling

Studietype

Ingrijpend

Inschrijving (Geschat)

50

Fase

  • Niet toepasbaar

Contacten en locaties

In dit gedeelte vindt u de contactgegevens van degenen die het onderzoek uitvoeren en informatie over waar dit onderzoek wordt uitgevoerd.

Studiecontact

Studie Locaties

Deelname Criteria

Onderzoekers zoeken naar mensen die aan een bepaalde beschrijving voldoen, de zogenaamde geschiktheidscriteria. Enkele voorbeelden van deze criteria zijn iemands algemene gezondheidstoestand of eerdere behandelingen.

Geschiktheidscriteria

Leeftijden die in aanmerking komen voor studie

  • Kind
  • Volwassen
  • Oudere volwassene

Accepteert gezonde vrijwilligers

Nee

Beschrijving

Inclusiecriteria:

  • Patiënten met zeldzame genetische spierziekten die hebben geprofiteerd van sequencing-analyse met hoge doorvoer (panel van 200 genen gedefinieerd door het Filnemus zeldzame neuromusculaire ziektnetetwerk) uitgevoerd in het Molecular Genetics Laboratory, Medical Genetics Department, Timone Enfant Hospital Sinds 2017.

Dit criterium is noodzakelijk om de analyse te beperken tot patiënten met spierziekten bij alle patiënten die worden geanalyseerd door het moleculaire genetica -laboratorium.

  • Deze genetische analyse identificeerde geen pathogene varianten die het fenotype van de patiënt verklaarden. Dit criterium is noodzakelijk om alleen patiënten in diagnostische fouten op te nemen.
  • Een spierbiopsie van de patiënt is beschikbaar in het Biological Resources Center (CRB) bij de AP-HM.

Uitsluitingscriteria:

  • Patiënten zonder spierbiopsie beschikbaar in de CRB.
  • Patiënten met een vastgestelde moleculaire diagnose.
  • Patiënten voor wie RNA -extractie uit een spierbiopsiemonster geen RNA van voldoende kwaliteit opleverde (INR> 7) zullen worden uitgesloten van de studie. Er zullen maximaal twee extractiepogingen worden uitgevoerd.

Studie plan

Dit gedeelte bevat details van het studieplan, inclusief hoe de studie is opgezet en wat de studie meet.

Hoe is de studie opgezet?

Ontwerpdetails

  • Primair doel: Diagnostisch
  • Toewijzing: NVT
  • Interventioneel model: Opdracht voor een enkele groep
  • Masker: Geen (open label)

Wapens en interventies

Deelnemersgroep / Arm
Interventie / Behandeling
Experimenteel: Sequencing van RNaseq -bibliotheken

Er zullen geen bezoeken van deelnemers zijn, dus we zullen al monsters gebruiken in het Biological Resources Center (CRB).

RNA zal worden geëxtraheerd uit spierbiopten die als onderdeel van de behandeling zijn genomen. RNASEQ -bibliotheken zullen worden gesequenced door het Genomics and Bioinformatics Platform (GBIM) bij Marseille Medical Genetics (MMG, U1251, AMU). Sequencing zal worden uitgevoerd in paired-end (2*100 bp) op het Novaseq 6000-systeem van Illumina (50 miljoen clusters per monster, 100 m gepaarde-end leest) en vervolgens geanalyseerd door bioinformatica.
Ander: ARN -extractie van spierbiopsieën

Er zullen geen bezoeken van deelnemers zijn, dus we zullen al monsters gebruiken in het Biological Resources Center (CRB).

RNA zal worden geëxtraheerd uit spierbiopten die als onderdeel van de behandeling zijn genomen. RNASEQ -bibliotheken zullen worden gesequenced door het Genomics and Bioinformatics Platform (GBIM) bij Marseille Medical Genetics (MMG, U1251, AMU). Sequencing zal worden uitgevoerd in paired-end (2*100 bp) op het Novaseq 6000-systeem van Illumina (50 miljoen clusters per monster, 100 m gepaarde-end leest) en vervolgens geanalyseerd door bioinformatica.

Wat meet het onderzoek?

Primaire uitkomstmaten

Uitkomstmaat
Maatregel Beschrijving
Tijdsspanne
Snelheid van positieve diagnoses met behulp van de RNaseq -aanpak
Tijdsspanne: Van de inschrijving tot het einde van de studie na 24 maanden
Om de snelheid van positieve diagnoses te bepalen met behulp van de RNASEQ -benadering bij patiënten met spierziekten die nog niet zijn gediagnosticeerd. Een patiënt wordt beschouwd als in diagnostische limbo als DNA -sequencing van 200 genen die verantwoordelijk zijn voor spierziekten niet heeft geïdentificeerd dat pathogene varianten die verantwoordelijk zijn voor het fenotype van de patiënt hebben geïdentificeerd. Onderzoekers gaan transcriptomische analyse (RNA -sequencing) gebruiken in combinatie met innovatieve bioinformatica -tools om varianten te identificeren met een schadelijk effect op RNA -niveau bij patiënten met niet -gediagnosticeerde spierziekten. Dit zal het mogelijk maken om een ​​moleculaire diagnose te stellen en bij veel patiënten een einde te maken aan een verkeerde diagnose.
Van de inschrijving tot het einde van de studie na 24 maanden

Secundaire uitkomstmaten

Uitkomstmaat
Maatregel Beschrijving
Tijdsspanne
Identificatie van genomische kenmerken
Tijdsspanne: Van de inschrijving tot het einde van de studie na 24 maanden
Identificeer de genomische kenmerken van pathogene varianten die worden geïdentificeerd door de RNASEQ -benadering. Deze analyse zou mogelijk bepaalde kenmerken kunnen ontdekken die specifiek zijn voor dit type variant, waardoor het mogelijk is om hun aanwezigheid bij andere niet -gediagnosticeerde patiënten in de toekomst te suggereren.
Van de inschrijving tot het einde van de studie na 24 maanden

Medewerkers en onderzoekers

Hier vindt u mensen en organisaties die betrokken zijn bij dit onderzoek.

Sponsor

Assistance Publique Hopitaux De Marseille

Studie record data

Deze datums volgen de voortgang van het onderzoeksdossier en de samenvatting van de ingediende resultaten bij ClinicalTrials.gov. Studieverslagen en gerapporteerde resultaten worden beoordeeld door de National Library of Medicine (NLM) om er zeker van te zijn dat ze voldoen aan specifieke kwaliteitscontrolenormen voordat ze op de openbare website worden geplaatst.

Bestudeer belangrijke data

Studie start (Geschat)

1 maart 2025

Primaire voltooiing (Geschat)

1 september 2026

Studie voltooiing (Geschat)

1 maart 2027

Studieregistratiedata

Eerst ingediend

13 februari 2025

Eerst ingediend dat voldeed aan de QC-criteria

17 februari 2025

Eerst geplaatst (Werkelijk)

25 maart 2025

Updates van studierecords

Laatste update geplaatst (Werkelijk)

25 maart 2025

Laatste update ingediend die voldeed aan QC-criteria

17 februari 2025

Laatst geverifieerd

1 februari 2025

Meer informatie

Termen gerelateerd aan deze studie

Aanvullende relevante MeSH-voorwaarden

Andere studie-ID-nummers

  • RCAPHM22_0420
  • 2024-A01079-38 (Andere identificatie: RCB)

Informatie over medicijnen en apparaten, studiedocumenten

Bestudeert een door de Amerikaanse FDA gereguleerd geneesmiddel

Nee

Bestudeert een door de Amerikaanse FDA gereguleerd apparaatproduct

Nee

Deze informatie is zonder wijzigingen rechtstreeks van de website clinicaltrials.gov gehaald. Als u verzoeken heeft om uw onderzoeksgegevens te wijzigen, te verwijderen of bij te werken, neem dan contact op met register@clinicaltrials.gov. Zodra er een wijziging wordt doorgevoerd op clinicaltrials.gov, wordt deze ook automatisch bijgewerkt op onze website .

Abonneren