Denna sida har översatts automatiskt och översättningens korrekthet kan inte garanteras. Vänligen se engelsk version för en källtext.

Transkriptomisk analys för att få slut på feldiagnos hos patienter med sällsynta muskelsjukdomar (ARNseq-Musc)

17 februari 2025 uppdaterad av: Assistance Publique Hopitaux De Marseille

Sedan 2017 har mer än 250 analyser utförda vid Molecular Genetics Laboratory på Timone Enfant Hospital gett negativa resultat hos patienter med sällsynta genetiska muskelsjukdomar. Forskarna antar att vissa av dessa feldiagnostiserade patienter har patogent RNA (transkript) som störde varianter som inte identifierades genom DNA -sekvensering. I själva verket kan DNA -sekvenseringsanalyser vara negativa trots närvaron av en patogen variant som stör RNA -skarvning eller uttryck, vilket orsakar en genetisk sjukdom. Av denna anledning kan RNA -sekvensering ge en diagnos hos patienter som inte har diagnostiserats genom DNA -sekvensering och därmed sätta stopp för diagnostisk vandring. Således, som en beskrivande prevalensstudie, är målen först att bestämma hastigheten för positiva diagnoser som gjorts av RNASEQ -metoden hos patienter med muskelsjukdomar som ännu inte har diagnostiserats och sedan identifiera de genomiska egenskaperna hos de patogena varianterna som identifierats hos patienter Genom RNASEQ -analys, för att underlätta identifiering av denna typ av variant hos framtida patienter.

50 patienter kommer att inkluderas i denna studie under två år.

Studieöversikt

Status

Rekrytering

Betingelser

Intervention / Behandling

Studietyp

Interventionell

Inskrivning (Beräknad)

50

Fas

  • Inte tillämpbar

Kontakter och platser

Det här avsnittet innehåller kontaktuppgifter för dem som genomför studien och information om var denna studie genomförs.

Studiekontakt

Studieorter

Deltagandekriterier

Forskare letar efter personer som passar en viss beskrivning, så kallade behörighetskriterier. Några exempel på dessa kriterier är en persons allmänna hälsotillstånd eller tidigare behandlingar.

Urvalskriterier

Åldrar som är berättigade till studier

  • Barn
  • Vuxen
  • Äldre vuxen

Tar emot friska volontärer

Nej

Beskrivning

Inkluderingskriterier:

  • Patienter med sällsynta genetiska muskelsjukdomar som har gynnats av sekvenseringsanalys med hög kapacitet (panel med 200 gener definierade av Filnemus Rare Neuromuskular Disease Network) genomfördes vid Molecular Genetics Laboratory, Medical Genetics Department, Timone Enfant Hospital sedan 2017.

Detta kriterium är nödvändigt för att begränsa analysen till patienter med muskulära sjukdomar bland alla patienter som analyserats av Molecular Genetics Laboratory.

  • Denna genetiska analys identifierade inte patogena varianter som förklarar patientens fenotyp Detta kriterium är nödvändig för att endast inkludera patienter i diagnostiskt fel.
  • En muskelbiopsi av patienten finns tillgänglig i Biologiska resurscentret (CRB) vid AP-HM.

Uteslutningskriterier:

  • Patienter utan muskelbiopsi finns i CRB.
  • Patienter med en etablerad molekyldiagnos.
  • Patienter för vilka RNA -extraktion från ett muskelbiopsiprov inte gav RNA av tillräcklig kvalitet (INR> 7) kommer att uteslutas från studien. Högst två extraktionsförsök kommer att utföras.

Studieplan

Det här avsnittet ger detaljer om studieplanen, inklusive hur studien är utformad och vad studien mäter.

Hur är studien utformad?

Designdetaljer

  • Primärt syfte: Diagnostisk
  • Tilldelning: N/A
  • Interventionsmodell: Enskild gruppuppgift
  • Maskning: Ingen (Open Label)

Vapen och interventioner

Deltagargrupp / Arm
Intervention / Behandling
Experimentell: Sekvensering av RNaseq -bibliotek

Det kommer inte att finnas några besök från deltagarna, så vi kommer att använda prover redan i Biologiska resurscentret (CRB).

RNA kommer att extraheras från muskelbiopsier tagna som en del av behandlingen. RNASEQ -bibliotek kommer att sekvenseras av Genomics and Bioinformatics Platform (GBIM) på Marseille Medical Genetics (MMG, U1251, AMU). Sekvensering kommer att utföras i parade-end (2*100 bp) på Illuminas Novaseq 6000-system (50 miljoner kluster per prov, 100 m parade-end-läsningar) och analyseras sedan med bioinformatik.
Övrig: ARN -extraktion från muskelbiopsier

Det kommer inte att finnas några besök från deltagarna, så vi kommer att använda prover redan i Biologiska resurscentret (CRB).

RNA kommer att extraheras från muskelbiopsier tagna som en del av behandlingen. RNASEQ -bibliotek kommer att sekvenseras av Genomics and Bioinformatics Platform (GBIM) på Marseille Medical Genetics (MMG, U1251, AMU). Sekvensering kommer att utföras i parade-end (2*100 bp) på Illuminas Novaseq 6000-system (50 miljoner kluster per prov, 100 m parade-end-läsningar) och analyseras sedan med bioinformatik.

Vad mäter studien?

Primära resultatmått

Resultatmått
Åtgärdsbeskrivning
Tidsram
Hastighet av positiva diagnoser med hjälp av RNASEQ -metoden
Tidsram: Från anmälan till slutet av studien vid 24 månader
För att bestämma hastigheten för positiva diagnoser som gjorts med RNASEQ -metoden hos patienter med muskelsjukdomar som ännu inte har diagnostiserats. En patient anses vara i diagnostisk limbo om DNA -sekvensering av 200 gener som är ansvariga för muskelsjukdomar inte har identifierat patogena varianter som är ansvariga för patientens fenotyp. Utredare kommer att använda transkriptomisk analys (RNA -sekvensering) i kombination med innovativa bioinformatikverktyg för att identifiera varianter med en skadlig effekt vid RNA -nivå hos patienter med odiagnostiserade muskelsjukdomar. Detta kommer att göra det möjligt att fastställa en molekylär diagnos och sätta stopp för feldiagnos hos många patienter.
Från anmälan till slutet av studien vid 24 månader

Sekundära resultatmått

Resultatmått
Åtgärdsbeskrivning
Tidsram
Identifiering av genomiska egenskaper
Tidsram: Från anmälan till slutet av studien vid 24 månader
Identifiera de genomiska egenskaperna hos patogena varianter identifierade med RNASEQ -metoden. Denna analys kan potentiellt avslöja vissa egenskaper som är specifika för denna typ av variant, vilket gör det möjligt att föreslå deras närvaro hos andra odiagnostiserade patienter i framtiden.
Från anmälan till slutet av studien vid 24 månader

Samarbetspartners och utredare

Det är här du hittar personer och organisationer som är involverade i denna studie.

Sponsor

Assistance Publique Hopitaux De Marseille

Studieavstämningsdatum

Dessa datum spårar framstegen för inlämningar av studieposter och sammanfattande resultat till ClinicalTrials.gov. Studieposter och rapporterade resultat granskas av National Library of Medicine (NLM) för att säkerställa att de uppfyller specifika kvalitetskontrollstandarder innan de publiceras på den offentliga webbplatsen.

Studera stora datum

Studiestart (Beräknad)

1 mars 2025

Primärt slutförande (Beräknad)

1 september 2026

Avslutad studie (Beräknad)

1 mars 2027

Studieregistreringsdatum

Först inskickad

13 februari 2025

Först inskickad som uppfyllde QC-kriterierna

17 februari 2025

Första postat (Faktisk)

25 mars 2025

Uppdateringar av studier

Senaste uppdatering publicerad (Faktisk)

25 mars 2025

Senaste inskickade uppdateringen som uppfyllde QC-kriterierna

17 februari 2025

Senast verifierad

1 februari 2025

Mer information

Termer relaterade till denna studie

Ytterligare relevanta MeSH-villkor

Andra studie-ID-nummer

  • RCAPHM22_0420
  • 2024-A01079-38 (Annan identifierare: RCB)

Läkemedels- och apparatinformation, studiedokument

Studerar en amerikansk FDA-reglerad läkemedelsprodukt

Nej

Studerar en amerikansk FDA-reglerad produktprodukt

Nej

Denna information hämtades direkt från webbplatsen clinicaltrials.gov utan några ändringar. Om du har några önskemål om att ändra, ta bort eller uppdatera dina studieuppgifter, vänligen kontakta register@clinicaltrials.gov. Så snart en ändring har implementerats på clinicaltrials.gov, kommer denna att uppdateras automatiskt även på vår webbplats .

Prenumerera