早期発症結腸直腸癌：観察レトロスペクティブおよび前向き多施設研究 (HEBE)

臨床病理学的特徴、および生存データは、各参加センターによって専用のRedCapデータベースを介して擬似され、収集されます。

コリバクチン評価-FFPEサンプルは、エンドポイントPCRを使用してコリバクチン陽性と陰性のサンプル間で層別化されます。 機能毒素13を生成するには完全に無傷のシーケンスが必要であるため、コリバクチンゲノム島の複数の領域に隣接するプライマーを使用します（特に、5'ENDのCLBO、中央のCLBI、3'ENDのCLBB）。 アンプリコンは、プラズマ由来DNAのフラグメントサイズに基づいて、長さ約100bp（最大150bp）であり、PCRはタッチダウンプロトコルに続いて実行されます。 2番目のアプローチでは、定量的ポリメラーゼ連鎖反応（QPCR）が実行され、コリバクチンと臨床的に関連する患者の転帰との間のより定量的相関が提供されます。 上記のエンドポイントPCRに使用される同じ領域のアンプリコンを増幅し、細菌16Sシーケンスに隣接するプライマーを使用して、血漿中の細菌DNA含有量を推定します。

プロテオゲノミクス評価 - 50 VEO-CRCと50 SO-CRCの初期サブセットは、質量分析と全ゲノムシーケンス（WGS）によって完全なプロテオーム評価を受けます。 患者のこの最初のサブセットに関する潜在的な所見は、免疫組織化学、ポリメラーゼ連鎖反応（PCR）、次世代シーケンス（NGS）または現場（ISH）によって検証されます。 これらの翻訳分析は、このプロジェクトの前臨床パートナーとなるミラノとフォムエッツのトゥリノ大学、トリノ大学、トリノ大学、トリノ大学のグランデオスペデールメトロポリタノニガルダで実行されます。

ミラノのメトロポリタン地域のアジエンダ・テリトリアル・サニタリア（ATS）とのコラボレーションのおかげで、VEO CRCの実際の発生率に関する疫学データにアクセスできます。

固体組織からのタンパク質ゲノミクス所見の液体生検の検証 - 可能であれば、液体生検を介して遡及的に収集され、参加センターに保存された4 mLの血漿が照会され、ゲノムの変化が血液中で識別できるかどうかを評価します。

主な目的：

1. 60年以降に診断された標準発症（SO-CRC）患者の等しいコホートと比較して、散発性Veo-CRCのコホート（n = 300）の臨床病理学的特徴を分析するため。
2. 60年以降に診断された標準発症（SO-CRC）患者の等しいコホートと比較して、散発性VEO-CRCのコホート（n = 300）のコホート（n = 300）の全生存と標準治療に対する反応を分析するため。

二次目標：

1. 60年以降に診断された標準発症（SO-CRC）患者の等しいコホートと比較して、散発性Veo-CRCのコホート（n = 300）のコホートにおけるコリバクチンの有病率を評価する。
2. 60年以降に診断された標準発症（SO-CRC）患者の等しいコホートと比較して、散発性Veo-CRC（n = 300）のコホートのプロテオ遺伝子特性評価を実行する。

探索的目的：

1. VEO-CRCのコリバクチンと潜在的なタンパク質ゲノム特徴を液体生検を介して血漿上でも捕捉できるかどうかを評価する。