초기 발병 대장 암 : 관찰 후 향적 및 전향 적 다기관 연구 (HEBE)

임상 병리학 적 특징 및 생존 데이터는 유사 익명화되어 각 참여 센터에서 전용 REDCAP 데이터베이스를 통해 수집됩니다.

콜리 박틴 평가 -FFPE 샘플은 종말점 ​​PCR을 사용하여 콜리 박틴 양성과 음성 사이에서 계층화 될 것이다. 우리는 기능적 독소 13을 생성하기 위해 완전히 온전한 서열이 필요하기 때문에 콜라이 박틴 게놈 섬의 여러 영역 (특히 5'-end, 중간의 CLBI 및 3'-End의 CLBI)의 옆에있는 프라이머를 사용합니다. 혈장 유래 DNA의 단편 크기에 기초하여 앰플 리콘은 길이가 약 100bp (최대 150bp 최대)이며, 터치 다운 프로토콜에 따라 PCR이 수행 될 것이다. 두 번째 접근법에서, 콜리 박틴과 임상 적으로 관련된 환자 결과 사이에보다 정량적 인 상관 관계를 제공하기 위해 정량적 중합 효소 연쇄 반응 (QPCR)이 수행 될 것이다. 우리는 위에서 설명한 종말점 PCR에 사용 된 것과 동일한 영역에서 앰플 리콘을 증폭시킬 것이며, 혈장에서 박테리아 DNA 함량을 추정하기 위해 박테리아 16S 서열을 사용하여 프라이머를 사용합니다.

Proteogenomic Assessment- 50 VEO-CRC 및 50 SO-CRC의 초기 서브 세트는 질량 분석법 및 전체 게놈 시퀀싱 (WGS)에 의해 완전한 단백질 학적 평가를받을 것입니다. 이 초기 환자에 대한 잠재적 결과는 면역 조직 화학, 중합 효소 연쇄 반응 (PCR), 차세대 시퀀싱 (NGS) 또는 현시내 Ibridization (ISH)에 의해 검증 될 것이다. 이 번역 분석은 밀라노 안드도 주 (Istituto Nazionale di Genetica Medica),이 프로젝트의 전임상 파트너가 될 밀라노 나치 오레일 디 Genetica Medica (INGM)의 Grande Ospedale Metropolitano Niguarda에서 수행 될 것입니다.

밀라노의 메트로폴리탄 지역의 AZIENDA Territoriale Sanitaria (ATS)와의 협력 덕분에 우리는 시간이 지남에 따라 VEO CRC의 실제 발생률에 관한 역학 데이터에 접근 할 것입니다.

고체 조직으로부터의 단백질 생성 소견의 액체 생검 검증 - 이용 가능한 경우, 액체 생검을 통해 후 향적으로 수집되고 참여 센터에 저장된 4 ml의 혈장이 혈액에서 유전체 또는 단백질 변화가 확인 될 수 있는지 평가할 것이다.

주요 목표 :

1. 60 년 이후 진단 된 표준 발병 (SO-CRC) 환자의 동등한 코호트와 비교하여 산발적 VEO-CRC 코호트의 임상 병리학 적 특징을 분석하기 위해;
2. 60 년 이후 진단 된 표준 발병 (SO-CRC) 환자의 동일한 코호트와 비교하여 산발적 VEO-CRC (n = 300)의 코호트의 표준 치료 치료에 대한 전반적인 생존 및 반응을 분석합니다.

보조 목표 :

1. 60 년 이후 진단 된 표준 발병 (SO-CRC) 환자의 동일한 코호트와 비교하여 산발적 VEO-CRC (n = 300)의 코호트에서 콜리 박틴의 유병률을 평가하기 위해;
2. 60 년 이후 진단 된 표준 발병 (SO-CRC) 환자의 동등한 코호트와 비교하여 산발적 VEO-CRC (n = 300)의 코호트의 단백질-게놈 특성을 수행하기 위해.

탐색 적 목표 :

1. VEO-CRC의 콜리 박틴 및 잠재적 인 단백질-게놈 특징이 액체 생검을 통해 혈장에 포획 될 수 있는지 평가한다.