ロングリードゲノムシーケンシングにより診断された発達性およびてんかん性脳症 (EEPILOG)
ロングリードゲノムシーケンシングによる発達性およびてんかん性脳症の診断 - EEPILOG
本研究は、発達性およびてんかん性脳症（DEE）の小児に焦点を当てています。DEEは、しばしば遺伝的起源を持つ重度のてんかんの一形態です。 現在、標準的な診断ツールであるショートリードゲノムシーケンシングは、特定の複雑なDNA異常を検出できないため、影響を受ける患者の50％以上に対して診断を提供できていません。
この研究の目的は、ロングリードゲノムシーケンシング（lrWGS）と呼ばれる、より新しい先進的な技術の有効性を評価することです。 従来の方法とは異なり、この技術は非常に長いDNA断片を分析し、研究者が以前は「見えなかった」遺伝的エラーを特定することを可能にします。
本研究は、ロングリードシーケンシングが、標準的な検査で陰性結果を得た患者において、てんかんの遺伝的原因を成功裏に特定できるかどうかを明らかにすることを目指しています。 これらの見落とされていた答えを見つけることにより、個別化医療治療の実現、家族への遺伝カウンセリングの改善、およびこれらの複雑な神経疾患がどのように発症するかに関する理解の向上を目指します。
調査の概要
詳細な説明
本研究は、発達性てんかん性脳症（DEE）の二次診断ツールとして、ロングリード全ゲノムシーケンシング（lrWGS）の臨床的有用性を評価します。現在の標準的な「ショートリード」シーケンシング（srWGS）は小さな遺伝子変異の特定に有効ですが、複雑な構造変化の検出にはしばしば失敗し、50％以上の患者が診断を受けられずにいます。
技術的には、lrWGSは数千塩基対の長さを持つDNA断片を分析することでこれらの制限を克服します。これにより、研究者はゲノムの「暗黒領域」をマッピングし、大規模な挿入、欠失、または反復配列の拡大などの構造的変異（SV）を特定できます。これらの変異は、しばしば重症てんかんの隠れた原因となります。
これらの捉えにくい遺伝的要因を特定することで、本研究は単純な診断を超えて精密医療に向けて進むことを目指しています。明確な分子結果は、標的薬剤の選択、禁忌薬剤の回避、または新規遺伝子治療の適格性の決定など、臨床判断に直接影響を与える可能性があります。さらに、このプロジェクトは、バイオインフォマティクスの複雑さと診断の回転時間を評価することで、この技術を日常的な臨床実践に統合する可能性を評価します。
研究の種類
入学 (推定)
連絡先と場所
研究連絡先
- 名前：Sarah BAER
- 電話番号：+33 +333.88.12.84.98
- メール：sarah.baer@chru-strasbourg.fr
研究場所
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Besançon、フランス、25000
- Chu Jean Minjoz
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コンタクト：
- Joanna BELLEVILLE
- 電話番号：+33 +333.81.21.81.46
- メール：jgoffeney@chu-besancon.fr
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Reims、フランス、51092
- American Memorial Hospital
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コンタクト：
- Mélanie JENNESON
- 電話番号：+33 +333.26.78.78.99
- メール：Mjennesson-lyver@chu-reims.fr
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Strasbourg、フランス、67098
- Hopitaux Universitaires de Strasbourg
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コンタクト：
- Sarah BAER
- 電話番号：+33 +333.88.12.84.98
- メール：sarah.baer@chru-strasbourg.fr
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Vandœuvre-lès-Nancy、フランス、54511
- CHU de Nancy - hôpital d'enfant
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コンタクト：
- Mathieu KUCHENBUCH
- 電話番号：+33 +333.83.15.50.85
- メール：m.kuchenbuch@chru-nancy.fr
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参加基準
適格基準
就学可能な年齢
- 子
- 大人
健康ボランティアの受け入れ
サンプリング方法
調査対象母集団
研究対象集団は、フランスの大学病院ネットワーク（CHU）内の専門的な小児神経学および遺伝学部門から選出されます。
参加者は、フランスゲノム医療計画2025（PFMG 2025）の下で設立された2つの全国シーケンシングハブの1つであるAURAGENプラットフォームの既存患者ベースから特に選出されます。 これらの個人は、既に広範な臨床表現型解析および「第一線」のゲノムスクリーニングを受けているが、分子診断が未確定のままである、フランス全国の高度に選別された小児のサブ集団を代表しています。
募集は主にストラスブール大学病院（Hôpitaux Universitaires de Strasbourg）および協力臨床施設で行われます。 これらのセンターは、希少および難治性小児てんかんの地域および全国的な紹介拠点として機能し、研究対象集団には国内で最も複雑で診断が困難な発達性てんかん性脳症（DEE）の症例が含まれることを保証します。
説明
組み入れ基準：
小児参加者：
- 年齢＜18歳。
- 2022年ILAE基準に基づく発達性てんかん性脳症（DEE）の診断（重度てんかん、脳症性脳波、多剤耐性発作、神経発達障害）。
- 周産期低酸素症のマーカーがない脳MRI。
- フランスゲノム医療計画2025（AURAGEN）によるショートリード全ゲノムシーケンシング（srWGS）後の陰性分子診断。
- 参加施設での保存DNAの利用可能性。
親／法定後見人：
- 年齢≧18歳。
- 研究目的とリスクを理解できること。
- 署名・日付入りのインフォームドコンセント。
- 社会保障制度への加入または受給資格。
除外基準：
小児参加者：
- 周産期脳低酸素症を示唆する脳MRI所見。
- プロトコル検査の実施を妨げる併存疾患。
- 他の研究の除外期間中の被験者。
親／法定後見人：
- インフォームドインフォメーションの受領または理解が不可能な場合（例：生命を脅かす緊急事態）。
- 司法保護、後見、または保佐下にある被験者。
- 公式通訳者が利用できない言語障壁。
研究計画
研究はどのように設計されていますか？
デザインの詳細
コホートと介入
グループ/コホート |
介入・治療 |
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DEE ロングリード
このコホートは、2022年ILAE基準で定義される発達性およびてんかん性脳症（DEE）を有する小児患者（18歳未満）で構成されています。 このグループは、フランスゲノム医療計画2025（AURAGENプラットフォーム）を通じたショートリード全ゲノムシーケンシング（srWGS）による解析にもかかわらず、事前に陰性の分子診断が得られたという特徴を有しています。 選択は臨床的優先順位付け戦略に従います：この研究には遺伝学的な回答が得られていない全ての適格なDEE患者が含まれますが、早期発症型、家族性症例、または現在の治療的難局（標準治療が失敗した患者）を有する患者が優先されます。 この研究は、周産期脳損傷など、明確な非遺伝的原因が特定された症例を除外し、コホートを高確率の「隠れた」遺伝的病因に焦点を当てています。 |
患者の初期臨床検査中に抽出・保存された高分子量DNAを用いたロングリード全ゲノムシーケンシング（lrWGS）。
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この研究は何を測定していますか？
主要な結果の測定
結果測定 |
メジャーの説明 |
時間枠 |
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ロングリード全ゲノムシーケンシング（lrWGS）によって同定された病原性および病原性の可能性のある遺伝子変異の数
時間枠：登録後最大15ヶ月後の結果交付訪問（ビジット1）にて。
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フランスゲノム医療計画2025（PFMG 2025）の枠組み内で、従来のショートリード全ゲノムシーケンス（srWGS）解析にもかかわらず分子診断が得られなかった発達性てんかん性脳症患者において、ロングリード全ゲノムシーケンス（lrWGS）による遺伝的原因の特定における有効性を評価する。
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登録後最大15ヶ月後の結果交付訪問（ビジット1）にて。
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協力者と研究者
研究記録日
主要日程の研究
研究開始 (推定)
一次修了 (推定)
研究の完了 (推定)
試験登録日
最初に提出
QC基準を満たした最初の提出物
最初の投稿 (実際)
学習記録の更新
投稿された最後の更新 (実際)
QC基準を満たした最後の更新が送信されました
最終確認日
詳しくは
本研究に関する用語
キーワード
その他の研究ID番号
- 9964
個々の参加者データ (IPD) の計画
個々の参加者データ (IPD) を共有する予定はありますか?
医薬品およびデバイス情報、研究文書
米国FDA規制医薬品の研究
米国FDA規制機器製品の研究
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