Encefalopatías del Desarrollo y Epilépticas Diagnosticadas Mediante Secuenciación Genómica de Lectura Larga (EEPILOG)
Encefalopatías del Desarrollo y Epilepsia Diagnosticadas Mediante Secuenciación Genómica de Lectura Larga - EEPILOG
Este estudio se centra en niños con Encefalopatía del Desarrollo y Epilepsia (DEE), una forma grave de epilepsia que a menudo tiene un origen genético. Actualmente, las herramientas de diagnóstico estándar, conocidas como secuenciación del genoma de lectura corta, no logran proporcionar un diagnóstico para más del 50% de los pacientes afectados porque no pueden detectar ciertas anomalías complejas del ADN.
El propósito de este estudio es evaluar la efectividad de una tecnología más nueva y avanzada llamada Secuenciación del Genoma de Lectura Larga (lrWGS). A diferencia de los métodos tradicionales, esta tecnología analiza fragmentos de ADN muy largos, lo que permite a los investigadores identificar errores genéticos que antes eran "invisibles".
El estudio tiene como objetivo responder si la Secuenciación de Lectura Larga puede identificar con éxito la causa genética de la epilepsia en pacientes que ya han recibido un resultado negativo en las pruebas estándar. Al encontrar estas respuestas faltantes, la investigación busca permitir tratamientos médicos personalizados, mejorar el asesoramiento genético para las familias y avanzar en nuestra comprensión de cómo se desarrollan estas complejas afecciones neurológicas.
Descripción general del estudio
Estado
Intervención / Tratamiento
Descripción detallada
Este estudio evalúa la utilidad clínica de la Secuenciación del Genoma Completo de Lectura Larga (lrWGS) como herramienta diagnóstica secundaria para las Encefalopatías del Desarrollo y Epilépticas (DEEs). Mientras que la secuenciación estándar de "lectura corta" (srWGS) es eficaz para identificar pequeñas mutaciones genéticas, a menudo no logra detectar cambios estructurales complejos, dejando a más del 50% de los pacientes sin diagnóstico.
Técnicamente, la lrWGS supera estas limitaciones analizando fragmentos de ADN de miles de bases de longitud. Esto permite a los investigadores mapear "regiones oscuras" del genoma e identificar Variantes Estructurales (SVs), como grandes inserciones, deleciones o expansiones de repeticiones, que a menudo son las causas ocultas de la epilepsia grave.
Al identificar estos esquivos factores genéticos, el estudio busca ir más allá de un simple diagnóstico hacia la medicina de precisión. Un resultado molecular claro puede influir directamente en las decisiones clínicas, como seleccionar medicamentos dirigidos, evitar fármacos contraindicados o determinar la elegibilidad para terapias génicas emergentes. Además, el proyecto evalúa la viabilidad de integrar esta tecnología en la práctica clínica rutinaria mediante la evaluación de la complejidad bioinformática y los tiempos de respuesta diagnóstica.
Tipo de estudio
Inscripción (Estimado)
Contactos y Ubicaciones
Estudio Contacto
- Nombre: Sarah BAER
- Número de teléfono: +33 +333.88.12.84.98
- Correo electrónico: sarah.baer@chru-strasbourg.fr
Ubicaciones de estudio
-
-
-
Besançon, Francia, 25000
- CHU Jean Minjoz
-
Contacto:
- Joanna BELLEVILLE
- Número de teléfono: +33 +333.81.21.81.46
- Correo electrónico: jgoffeney@chu-besancon.fr
-
Reims, Francia, 51092
- American Memorial Hospital
-
Contacto:
- Mélanie JENNESON
- Número de teléfono: +33 +333.26.78.78.99
- Correo electrónico: Mjennesson-lyver@chu-reims.fr
-
Strasbourg, Francia, 67098
- Hôpitaux universitaires de Strasbourg
-
Contacto:
- Sarah BAER
- Número de teléfono: +33 +333.88.12.84.98
- Correo electrónico: sarah.baer@chru-strasbourg.fr
-
Vandœuvre-lès-Nancy, Francia, 54511
- CHU de Nancy - hôpital d'enfant
-
Contacto:
- Mathieu KUCHENBUCH
- Número de teléfono: +33 +333.83.15.50.85
- Correo electrónico: m.kuchenbuch@chru-nancy.fr
-
-
Criterios de participación
Criterio de elegibilidad
Edades elegibles para estudiar
- Niño
- Adulto
Acepta Voluntarios Saludables
Método de muestreo
Población de estudio
La población del estudio se extrae de departamentos especializados de neurología pediátrica y genética dentro de la red de hospitales universitarios franceses (CHU).
Los participantes se obtienen específicamente de la base de pacientes existente de la plataforma AURAGEN, uno de los dos centros nacionales de secuenciación establecidos bajo el Plan Francés de Medicina Genómica 2025 (PFMG 2025). Estos individuos representan una subpoblación altamente seleccionada de niños en toda Francia que ya han sido sometidos a una fenotipificación clínica extensa y a un cribado genómico de "primera línea", pero que permanecen sin un diagnóstico molecular.
El reclutamiento ocurre principalmente en el Hospital Universitario de Estrasburgo (Hôpitaux Universitaires de Strasbourg) y en sitios clínicos colaboradores. Estos centros sirven como puntos de referencia regionales y nacionales para epilepsias infantiles raras y refractarias, asegurando que la población del estudio incluya los casos más complejos y desafiantes desde el punto de vista diagnóstico de Encefalopatía del Desarrollo y Epiléptica (DEE) en el país.
Descripción
Criterios de inclusión:
Participantes pediátricos:
- Edad < 18 años.
- Diagnóstico de encefalopatía epiléptica y del desarrollo (DEE) según los criterios de la ILAE de 2022 (epilepsia grave, EEG encefalopático, múltiples crisis farmacorresistentes y trastorno del neurodesarrollo).
- Resonancia magnética cerebral sin marcadores de anoxia perinatal.
- Diagnóstico molecular negativo tras secuenciación completa del genoma de lectura corta (srWGS) a través del Plan de Medicina Genómica Francés 2025 (AURAGEN).
- ADN almacenado disponible en un centro participante.
Padres/Tutores legales:
- Edad ≥ 18 años.
- Capaz de comprender los objetivos y riesgos del estudio.
- Consentimiento informado firmado y fechado.
- Afiliado o beneficiario de un régimen de seguridad social.
Criterios de exclusión:
Participantes pediátricos:
- Hallazgos en la resonancia magnética cerebral a favor de anoxia cerebral perinatal.
- Enfermedades intercurrentes que impidan la realización de las exploraciones del protocolo.
- Sujeto actualmente en período de exclusión de otro estudio.
Padres/Tutores legales:
- Incapacidad para recibir o comprender la información del consentimiento informado (por ejemplo, emergencia vital).
- Sujeto bajo protección judicial, tutela o curatela.
- Barreras lingüísticas cuando no haya disponible un intérprete oficial.
Plan de estudios
¿Cómo está diseñado el estudio?
Detalles de diseño
Cohortes e Intervenciones
Grupo / Cohorte |
Intervención / Tratamiento |
|---|---|
|
DEE Long-read
Esta cohorte está compuesta por pacientes pediátricos (menores de 18 años) con Encefalopatía del Desarrollo y Epilepsia (DEE) según los criterios de la ILAE de 2022. El grupo se caracteriza específicamente por un diagnóstico molecular negativo previo a pesar del análisis mediante Secuenciación del Genoma Completo de lectura corta (srWGS) a través del Plan de Medicina Genómica Francés 2025 (plataforma AURAGEN). La selección sigue una estrategia de priorización clínica: mientras el estudio incluye a todos los pacientes con DEE elegibles sin respuesta genética, se da prioridad a aquellos con formas de inicio temprano, casos familiares o impasse terapéutico actual (pacientes para los que los tratamientos estándar han fallado). El estudio excluye los casos en los que se identifica una causa no genética clara, como una lesión cerebral perinatal, centrando la cohorte en etiologías genéticas "ocultas" de alta probabilidad. |
Secuenciación del Genoma Completo de Lectura Larga (lrWGS) utilizando ADN de alto peso molecular previamente extraído y almacenado durante la evaluación clínica inicial del paciente.
|
¿Qué mide el estudio?
Medidas de resultado primarias
Medida de resultado |
Medida Descripción |
Periodo de tiempo |
|---|---|---|
|
Número de variantes genéticas patogénicas y probablemente patogénicas identificadas mediante secuenciación del genoma completo de lectura larga (lrWGS)
Periodo de tiempo: En la visita de entrega de resultados (Visita 1), hasta 15 meses después de la inscripción.
|
Evaluar la eficacia de la secuenciación del genoma completo de lectura larga (lrWGS) en la identificación de causas genéticas en pacientes con encefalopatía epiléptica del desarrollo que no obtuvieron un diagnóstico molecular a pesar de un análisis previo de secuenciación del genoma completo de lectura corta (srWGS) en el marco del Plan de Medicina Genómica Francés 2025 (PFMG 2025).
|
En la visita de entrega de resultados (Visita 1), hasta 15 meses después de la inscripción.
|
Colaboradores e Investigadores
Fechas de registro del estudio
Fechas importantes del estudio
Inicio del estudio (Estimado)
Finalización primaria (Estimado)
Finalización del estudio (Estimado)
Fechas de registro del estudio
Enviado por primera vez
Primero enviado que cumplió con los criterios de control de calidad
Publicado por primera vez (Actual)
Actualizaciones de registros de estudio
Última actualización publicada (Actual)
Última actualización enviada que cumplió con los criterios de control de calidad
Última verificación
Más información
Términos relacionados con este estudio
Palabras clave
- Secuenciación de nucleótidos de alto rendimiento
- Epilepsia resistente a los medicamentos
- Secuenciación de lectura larga
- Encefalopatía del Desarrollo y Epiléptica (DEE)
- Secuenciación del Genoma Completo de Lectura Larga (lrWGS)
- Secuenciación de Lectura Corta Negativa
- Diagnóstico Genético
- Neurología Pediátrica
- Epilepsia de Inicio Temprano
- Epilepsia Genética
Términos MeSH relevantes adicionales
Otros números de identificación del estudio
- 9964
Plan de datos de participantes individuales (IPD)
¿Planea compartir datos de participantes individuales (IPD)?
Información sobre medicamentos y dispositivos, documentos del estudio
Estudia un producto farmacéutico regulado por la FDA de EE. UU.
Estudia un producto de dispositivo regulado por la FDA de EE. UU.
Esta información se obtuvo directamente del sitio web clinicaltrials.gov sin cambios. Si tiene alguna solicitud para cambiar, eliminar o actualizar los detalles de su estudio, comuníquese con register@clinicaltrials.gov. Tan pronto como se implemente un cambio en clinicaltrials.gov, también se actualizará automáticamente en nuestro sitio web. .