Ontwikkelings- en Epileptische Encefalopathieën Gediagnosticeerd Via Long-read Genoomsequencing (EEPILOG)
Ontwikkelings- en Epileptische Encefalopathieën Gediagnosticeerd via Long-read Genoomsequencing - EEPILOG
Deze studie richt zich op kinderen met Developmental and Epileptic Encephalopathy (DEE), een ernstige vorm van epilepsie die vaak een genetische oorsprong heeft. Momenteel slagen standaard diagnostische hulpmiddelen - bekend als short-read genoomsequencing - er niet in om voor meer dan 50% van de getroffen patiënten een diagnose te stellen, omdat ze bepaalde complexe DNA-afwijkingen niet kunnen detecteren.
Het doel van deze studie is om de effectiviteit te evalueren van een nieuwere, geavanceerdere technologie genaamd Long-read Genome Sequencing (lrWGS). In tegenstelling tot traditionele methoden analyseert deze technologie zeer lange DNA-fragmenten, waardoor onderzoekers genetische fouten kunnen identificeren die eerder "onzichtbaar" waren.
De studie heeft tot doel te beantwoorden of Long-read Sequencing met succes de genetische oorzaak van epilepsie kan identificeren bij patiënten die al een negatief resultaat hebben gekregen van standaardtesten. Door deze ontbrekende antwoorden te vinden, tracht het onderzoek gepersonaliseerde medische behandelingen mogelijk te maken, de genetische counseling voor families te verbeteren en ons begrip van hoe deze complexe neurologische aandoeningen zich ontwikkelen te bevorderen.
Studie Overzicht
Toestand
Interventie / Behandeling
Gedetailleerde beschrijving
Deze studie evalueert de klinische bruikbaarheid van Long-read Whole Genome Sequencing (lrWGS) als secundair diagnostisch hulpmiddel voor Developmental and Epileptic Encephalopathies (DEEs). Hoewel de huidige standaardzorg "short-read" sequencing (srWGS) effectief is in het identificeren van kleine genetische mutaties, slaagt het vaak niet in het detecteren van complexe structurele veranderingen, waardoor meer dan 50% van de patiënten zonder diagnose blijft.
Technisch gezien overkomt lrWGS deze beperkingen door DNA-fragmenten te analyseren die duizenden basen lang zijn. Dit stelt onderzoekers in staat om "donkere gebieden" van het genoom in kaart te brengen en Structurele Varianten (SVs) te identificeren, zoals grote inserties, deleties of herhalingsexpansies, die vaak de verborgen oorzaken zijn van ernstige epilepsie.
Door deze ongrijpbare genetische drijvers te identificeren, streeft de studie ernaar om verder te gaan dan een simpele diagnose naar precisiegeneeskunde. Een duidelijk moleculair resultaat kan klinische beslissingen direct beïnvloeden, zoals het selecteren van gerichte medicatie, het vermijden van gecontra-indiceerde medicijnen of het bepalen van geschiktheid voor opkomende gentherapieën. Daarnaast beoordeelt het project de haalbaarheid van het integreren van deze technologie in de routinematige klinische praktijk door de bio-informatica complexiteit en diagnostische doorlooptijden te evalueren.
Studietype
Inschrijving (Geschat)
Contacten en locaties
Studiecontact
- Naam: Sarah BAER
- Telefoonnummer: +33 +333.88.12.84.98
- E-mail: sarah.baer@chru-strasbourg.fr
Studie Locaties
-
-
-
Besançon, Frankrijk, 25000
- Chu Jean Minjoz
-
Contact:
- Joanna BELLEVILLE
- Telefoonnummer: +33 +333.81.21.81.46
- E-mail: jgoffeney@chu-besancon.fr
-
Reims, Frankrijk, 51092
- American Memorial Hospital
-
Contact:
- Mélanie JENNESON
- Telefoonnummer: +33 +333.26.78.78.99
- E-mail: Mjennesson-lyver@chu-reims.fr
-
Strasbourg, Frankrijk, 67098
- Hopitaux Universitaires de Strasbourg
-
Contact:
- Sarah BAER
- Telefoonnummer: +33 +333.88.12.84.98
- E-mail: sarah.baer@chru-strasbourg.fr
-
Vandœuvre-lès-Nancy, Frankrijk, 54511
- CHU de Nancy - hôpital d'enfant
-
Contact:
- Mathieu KUCHENBUCH
- Telefoonnummer: +33 +333.83.15.50.85
- E-mail: m.kuchenbuch@chru-nancy.fr
-
-
Deelname Criteria
Geschiktheidscriteria
Leeftijden die in aanmerking komen voor studie
- Kind
- Volwassen
Accepteert gezonde vrijwilligers
Bemonsteringsmethode
Studie Bevolking
De studiepopulatie wordt geworven uit gespecialiseerde afdelingen voor pediatrische neurologie en genetica binnen het Franse universitaire ziekenhuisnetwerk (CHU).
Deelnemers worden specifiek geworven uit de bestaande patiëntenpopulatie van het AURAGEN-platform, een van de twee nationale sequentiehubs die zijn opgericht onder het Franse Genomic Medicine Plan 2025 (PFMG 2025). Deze personen vertegenwoordigen een zeer geselecteerde subpopulatie van kinderen in heel Frankrijk die al uitgebreide klinische fenotypering en "eerste-lijn" genomische screening hebben ondergaan, maar nog steeds zonder moleculaire diagnose zijn.
De werving vindt voornamelijk plaats in het Universitair Ziekenhuis van Straatsburg (Hôpitaux Universitaires de Strasbourg) en samenwerkende klinische centra. Deze centra dienen als regionale en nationale verwijzingspunten voor zeldzame en therapieresistente epilepsieën bij kinderen, waardoor de studiepopulatie de meest complexe en diagnostisch uitdagende gevallen van ontwikkelings- en epileptische encefalopathie (DEE) in het land omvat.
Beschrijving
Inclusiecriteria:
Pediatrische deelnemers:
- Leeftijd < 18 jaar.
- Diagnose van ontwikkelings- en epileptische encefalopathie (DEE) volgens de ILAE-criteria van 2022 (ernstige epilepsie, encefalopathisch EEG, meervoudige medicatieresistente aanvallen en neurodevelopmentele stoornis).
- Hersen-MRI zonder markers van perinatale anoxie.
- Negatieve moleculaire diagnose na short-read Whole Genome Sequencing (srWGS) via het Franse Genomic Medicine Plan 2025 (AURAGEN).
- Beschikbaar opgeslagen DNA in een deelnemend centrum.
Ouders/wettelijke voogden:
- Leeftijd ≥ 18 jaar.
- In staat om de studieobjectieven en risico's te begrijpen.
- Ondertekende en gedateerde geïnformeerde toestemming.
- Aangesloten bij of gerechtigd tot een sociale zekerheidsregeling.
Exclusiecriteria:
Pediatrische deelnemers:
- Hersen-MRI-bevindingen die wijzen op perinatale cerebrale anoxie.
- Intercurrente ziekten die de voltooiing van protocolonderzoeken verhinderen.
- Deelnemer bevindt zich momenteel in een exclusieperiode van een andere studie.
Ouders/wettelijke voogden:
- Onvermogen om geïnformeerde informatie te ontvangen of te begrijpen (bijv. levensbedreigende noodsituatie).
- Deelnemer onder juridische bescherming, voogdij of curatele.
- Taalbarrières waarbij geen officiële tolk beschikbaar is.
Studie plan
Hoe is de studie opgezet?
Ontwerpdetails
Cohorten en interventies
Groep / Cohort |
Interventie / Behandeling |
|---|---|
|
DEE Long-read
Deze cohort bestaat uit pediatrische patiënten (onder 18 jaar) met Developmental and Epileptic Encephalopathy (DEE) zoals gedefinieerd door de ILAE-criteria van 2022. De groep wordt specifiek gekenmerkt door een eerder negatieve moleculaire diagnose ondanks analyse via short-read Whole Genome Sequencing (srWGS) via het Franse Genomic Medicine Plan 2025 (AURAGEN-platform). Selectie volgt een klinische prioriteringsstrategie: hoewel de studie alle in aanmerking komende DEE-patiënten zonder een genetisch antwoord omvat, krijgen diegenen met vroeg beginvormen, familiale gevallen of een huidige therapeutische impasse (patiënten bij wie standaardbehandelingen hebben gefaald) prioriteit. De studie sluit gevallen uit waarbij een duidelijke niet-genetische oorzaak is geïdentificeerd, zoals perinatale hersenbeschadiging, waardoor de cohort zich richt op hoogstwaarschijnlijke "verborgen" genetische etiologieën. |
Long-read Whole Genome Sequencing (lrWGS) met behulp van hoogmoleculair DNA dat eerder was geëxtraheerd en opgeslagen tijdens het initiële klinische onderzoek van de patiënt.
|
Wat meet het onderzoek?
Primaire uitkomstmaten
Uitkomstmaat |
Maatregel Beschrijving |
Tijdsspanne |
|---|---|---|
|
Aantal pathogene en waarschijnlijk pathogene genetische varianten geïdentificeerd door long-read whole genome sequencing (lrWGS)
Tijdsspanne: Bij het resultatenoverdrachtsbezoek (Bezoek 1), tot 15 maanden na inschrijving.
|
Evalueer de effectiviteit van long-read whole genome sequencing (lrWGS) bij het identificeren van genetische oorzaken bij patiënten met ontwikkelings- en epileptische encefalopathie die geen moleculaire diagnose hebben gekregen ondanks eerdere short-read whole genome sequencing (srWGS) analyse binnen het kader van het Franse Genomic Medicine Plan 2025 (PFMG 2025).
|
Bij het resultatenoverdrachtsbezoek (Bezoek 1), tot 15 maanden na inschrijving.
|
Medewerkers en onderzoekers
Studie record data
Bestudeer belangrijke data
Studie start (Geschat)
Primaire voltooiing (Geschat)
Studie voltooiing (Geschat)
Studieregistratiedata
Eerst ingediend
Eerst ingediend dat voldeed aan de QC-criteria
Eerst geplaatst (Werkelijk)
Updates van studierecords
Laatste update geplaatst (Werkelijk)
Laatste update ingediend die voldeed aan QC-criteria
Laatst geverifieerd
Meer informatie
Termen gerelateerd aan deze studie
Trefwoorden
- High-Throughput Nucleotide Sequencing
- Geneesmiddelenresistente epilepsie
- Lang gelezen sequencing
- Ontwikkelings- en epileptische encefalopathie (DEE)
- Long-read Whole Genome Sequencing (lrWGS)
- Negatieve Short-read Sequencing
- Genetische Diagnose
- Pediatrische Neurologie
- Vroegbegin epilepsie
- Genetische Epilepsie
Aanvullende relevante MeSH-voorwaarden
Andere studie-ID-nummers
- 9964
Plan Individuele Deelnemersgegevens (IPD)
Bent u van plan om gegevens van individuele deelnemers (IPD) te delen?
Informatie over medicijnen en apparaten, studiedocumenten
Bestudeert een door de Amerikaanse FDA gereguleerd geneesmiddel
Bestudeert een door de Amerikaanse FDA gereguleerd apparaatproduct
Deze informatie is zonder wijzigingen rechtstreeks van de website clinicaltrials.gov gehaald. Als u verzoeken heeft om uw onderzoeksgegevens te wijzigen, te verwijderen of bij te werken, neem dan contact op met register@clinicaltrials.gov. Zodra er een wijziging wordt doorgevoerd op clinicaltrials.gov, wordt deze ook automatisch bijgewerkt op onze website .