Rozwojowe i padaczkowe encefalopatie diagnozowane za pomocą sekwencjonowania genomu długimi odczytami (EEPILOG)
Rozwojowe i padaczkowe encefalopatie zdiagnozowane za pomocą długo-odczytowego sekwencjonowania genomu - EEPILOG
Badanie to skupia się na dzieciach z rozwojową i padaczkową encefalopatią (DEE), ciężką postacią padaczki, która często ma podłoże genetyczne. Obecnie standardowe narzędzia diagnostyczne, znane jako sekwencjonowanie genomu metodą krótkich odczytów, nie pozwalają na postawienie diagnozy u ponad 50% dotkniętych pacjentów, ponieważ nie wykrywają pewnych złożonych nieprawidłowości DNA.
Celem tego badania jest ocena skuteczności nowszej, bardziej zaawansowanej technologii zwanej sekwencjonowaniem genomu metodą długich odczytów (lrWGS). W przeciwieństwie do tradycyjnych metod, ta technologia analizuje bardzo długie fragmenty DNA, umożliwiając badaczom identyfikację błędów genetycznych, które wcześniej były "niewidoczne".
Badanie ma na celu odpowiedzieć na pytanie, czy sekwencjonowanie metodą długich odczytów może skutecznie zidentyfikować genetyczną przyczynę padaczki u pacjentów, którzy już otrzymali negatywny wynik w standardowych testach. Znajdując te brakujące odpowiedzi, badania dążą do umożliwienia spersonalizowanego leczenia medycznego, poprawy poradnictwa genetycznego dla rodzin oraz poszerzenia naszej wiedzy na temat rozwoju tych złożonych schorzeń neurologicznych.
Przegląd badań
Status
Interwencja / Leczenie
Szczegółowy opis
To badanie ocenia użyteczność kliniczną sekwencjonowania całego genomu metodą długich odczytów (lrWGS) jako narzędzia diagnostycznego drugiego rzutu w przypadku rozwojowych i padaczkowych encefalopatii (DEE). Obecnie standardowa metoda sekwencjonowania „krótkich odczytów” (srWGS) skutecznie identyfikuje małe mutacje genetyczne, ale często nie wykrywa złożonych zmian strukturalnych, przez co ponad 50% pacjentów pozostaje bez diagnozy.
Technicznie rzecz biorąc, lrWGS przezwycięża te ograniczenia poprzez analizę fragmentów DNA o długości tysięcy par zasad. Pozwala to naukowcom mapować „ciemne regiony” genomu i identyfikować warianty strukturalne (SV), takie jak duże insercje, delecje lub ekspansje powtórzeń, które często są ukrytymi przyczynami ciężkiej padaczki.
Identyfikując te trudne do wykrycia czynniki genetyczne, badanie ma na celu wykroczenie poza prostą diagnozę w kierunku medycyny precyzyjnej. Jasny wynik molekularny może bezpośrednio wpływać na decyzje kliniczne, takie jak wybór ukierunkowanych leków, unikanie leków przeciwwskazanych lub ustalanie kwalifikacji do nowo powstających terapii genowych. Dodatkowo projekt ocenia wykonalność wdrożenia tej technologii do rutynowej praktyki klinicznej poprzez analizę złożoności bioinformatycznej i czasu realizacji diagnostyki.
Typ studiów
Zapisy (Szacowany)
Kontakty i lokalizacje
Kontakt w sprawie studiów
- Nazwa: Sarah BAER
- Numer telefonu: +33 +333.88.12.84.98
- E-mail: sarah.baer@chru-strasbourg.fr
Lokalizacje studiów
-
-
-
Besançon, Francja, 25000
- CHU Jean Minjoz
-
Kontakt:
- Joanna BELLEVILLE
- Numer telefonu: +33 +333.81.21.81.46
- E-mail: jgoffeney@chu-besancon.fr
-
Reims, Francja, 51092
- American Memorial Hospital
-
Kontakt:
- Mélanie JENNESON
- Numer telefonu: +33 +333.26.78.78.99
- E-mail: Mjennesson-lyver@chu-reims.fr
-
Strasbourg, Francja, 67098
- Hopitaux Universitaires de Strasbourg
-
Kontakt:
- Sarah BAER
- Numer telefonu: +33 +333.88.12.84.98
- E-mail: sarah.baer@chru-strasbourg.fr
-
Vandœuvre-lès-Nancy, Francja, 54511
- CHU de Nancy - hôpital d'enfant
-
Kontakt:
- Mathieu KUCHENBUCH
- Numer telefonu: +33 +333.83.15.50.85
- E-mail: m.kuchenbuch@chru-nancy.fr
-
-
Kryteria uczestnictwa
Kryteria kwalifikacji
Wiek uprawniający do nauki
- Dziecko
- Dorosły
Akceptuje zdrowych ochotników
Metoda próbkowania
Badana populacja
Populacja badana pochodzi z wyspecjalizowanych oddziałów neurologii dziecięcej i genetyki w ramach francuskiej sieci szpitali uniwersyteckich (CHU).
Uczestnicy są rekrutowani konkretnie z istniejącej bazy pacjentów platformy AURAGEN, jednego z dwóch krajowych ośrodków sekwencjonowania utworzonych w ramach Francuskiego Planu Medycyny Genomowej 2025 (PFMG 2025). Osoby te reprezentują wysoce wyselekcjonowaną subpopulację dzieci z całej Francji, które przeszły już rozległe fenotypowanie kliniczne i „pierwszoliniowe” badania genomowe, ale nadal nie mają diagnozy molekularnej.
Rekrutacja odbywa się głównie w Szpitalu Uniwersyteckim w Strasburgu (Hôpitaux Universitaires de Strasbourg) oraz we współpracujących placówkach klinicznych. Te ośrodki służą jako regionalne i krajowe punkty referencyjne dla rzadkich i opornych padaczek dziecięcych, zapewniając, że populacja badana obejmuje najbardziej złożone i diagnostycznie trudne przypadki Rozwojowej i Padaczkowej Encefalopatii (DEE) w kraju.
Opis
Kryteria włączenia:
Uczestnicy pediatryczni:
- Wiek < 18 lat.
- Rozpoznanie rozwojowej i padaczkowej encefalopatii (DEE) według kryteriów ILAE z 2022 roku (ciężka padaczka, encefalopatyczny EEG, wielolekooporne napady oraz zaburzenia neurorozwojowe).
- Rezonans magnetyczny mózgu bez markerów okołoporodowej anoksji.
- Negatywna diagnoza molekularna po sekwencjonowaniu całego genomu metodą krótkich odczytów (srWGS) w ramach francuskiego Planu Medycyny Genomowej 2025 (AURAGEN).
- Dostępna zdeponowana DNA w ośrodku uczestniczącym.
Rodzice/Opiekunowie prawni:
- Wiek ≥ 18 lat.
- Zdolni do zrozumienia celów i ryzyk badania.
- Podpisana i datowana świadoma zgoda.
- Ubezpieczeni w systemie zabezpieczenia społecznego lub jego beneficjenci.
Kryteria wykluczenia:
Uczestnicy pediatryczni:
- Wyniki rezonansu magnetycznego mózgu wskazujące na okołoporodową anoksję mózgową.
- Choroby współistniejące uniemożliwiające wykonanie badań zgodnie z protokołem.
- Osoba obecnie w okresie wykluczenia z innego badania.
Rodzice/Opiekunowie prawni:
- Niezdolność do otrzymania lub zrozumienia informacji (np. stan zagrożenia życia).
- Osoba pod ochroną sądową, kuratelą lub opieką.
- Bariery językowe, gdy niedostępny jest oficjalny tłumacz.
Plan studiów
Jak projektuje się badanie?
Szczegóły projektu
Kohorty i interwencje
Grupa / Kohorta |
Interwencja / Leczenie |
|---|---|
|
DEE Long-read
Ta kohorta składa się z pacjentów pediatrycznych (poniżej 18 roku życia) z rozwojową i padaczkową encefalopatią (DEE) zgodnie z kryteriami ILAE z 2022 roku. Grupa ta jest szczególnie charakteryzowana przez wcześniejszą negatywną diagnozę molekularną pomimo analizy za pomocą sekwencjonowania całego genomu z krótkimi odczytami (srWGS) w ramach francuskiego planu medycyny genomowej 2025 (platforma AURAGEN). Wybór następuje zgodnie z kliniczną strategią priorytetyzacji: chociaż badanie obejmuje wszystkich kwalifikujących się pacjentów z DEE bez odpowiedzi genetycznej, priorytet mają ci z formami wczesnego początku, przypadkami rodzinnymi lub obecnym impasem terapeutycznym (pacjenci, u których standardowe leczenie zawiodło). Badanie wyklucza przypadki, w których zidentyfikowano wyraźną przyczynę niegenetyczną, taką jak okołoporodowe uszkodzenie mózgu, skupiając kohortę na wysokoprawdopodobnych "ukrytych" etiologiach genetycznych. |
Sekwencjonowanie całego genomu metodą długich odczytów (lrWGS) przy użyciu wysokocząsteczkowego DNA wcześniej wyizolowanego i zdeponowanego podczas wstępnej diagnostyki klinicznej pacjenta.
|
Co mierzy badanie?
Podstawowe miary wyniku
Miara wyniku |
Opis środka |
Ramy czasowe |
|---|---|---|
|
Liczba patogennych i prawdopodobnie patogennych wariantów genetycznych zidentyfikowanych dzięki sekwencjonowaniu całego genomu metodą długich odczytów (lrWGS)
Ramy czasowe: Podczas wizyty dostarczenia wyników (Wizyta 1), do 15 miesięcy po rejestracji.
|
Ocena skuteczności sekwencjonowania całego genomu metodą długich odczytów (lrWGS) w identyfikacji przyczyn genetycznych u pacjentów z rozwojową i padaczkową encefalopatią, u których nie uzyskano diagnozy molekularnej pomimo wcześniejszej analizy sekwencjonowania całego genomu metodą krótkich odczytów (srWGS) w ramach francuskiego planu medycyny genomowej 2025 (PFMG 2025).
|
Podczas wizyty dostarczenia wyników (Wizyta 1), do 15 miesięcy po rejestracji.
|
Współpracownicy i badacze
Daty zapisu na studia
Główne daty studiów
Rozpoczęcie studiów (Szacowany)
Zakończenie podstawowe (Szacowany)
Ukończenie studiów (Szacowany)
Daty rejestracji na studia
Pierwszy przesłany
Pierwszy przesłany, który spełnia kryteria kontroli jakości
Pierwszy wysłany (Rzeczywisty)
Aktualizacje rekordów badań
Ostatnia wysłana aktualizacja (Rzeczywisty)
Ostatnia przesłana aktualizacja, która spełniała kryteria kontroli jakości
Ostatnia weryfikacja
Więcej informacji
Terminy związane z tym badaniem
Słowa kluczowe
- Wysokowydajne sekwencjonowanie nukleotydów
- Padaczka lekooporna
- Sekwencjonowanie długoterminowe
- Rozwojowa i Padaczkowa Encefalopatia (DEE)
- Sekwencjonowanie całego genomu przy użyciu technologii długich odczytów (lrWGS)
- Negatywne sekwencjonowanie krótkich odczytów
- Diagnoza Genetyczna
- Neurologia dziecięca
- Padaczka o wczesnym początku
- Epilepsja genetyczna
Dodatkowe istotne warunki MeSH
Inne numery identyfikacyjne badania
- 9964
Plan dla danych uczestnika indywidualnego (IPD)
Planujesz udostępniać dane poszczególnych uczestników (IPD)?
Informacje o lekach i urządzeniach, dokumenty badawcze
Bada produkt leczniczy regulowany przez amerykańską FDA
Bada produkt urządzenia regulowany przez amerykańską FDA
Te informacje zostały pobrane bezpośrednio ze strony internetowej clinicaltrials.gov bez żadnych zmian. Jeśli chcesz zmienić, usunąć lub zaktualizować dane swojego badania, skontaktuj się z register@clinicaltrials.gov. Gdy tylko zmiana zostanie wprowadzona na stronie clinicaltrials.gov, zostanie ona automatycznie zaktualizowana również na naszej stronie internetowej .