Vývojové a epileptické encefalopatie diagnostikované pomocí dlouhého čtení genomové sekvenace (EEPILOG)
Vývojové a epileptické encefalopatie diagnostikované pomocí dlouhosekvenční genomové sekvenace - EEPILOG
Tato studie se zaměřuje na děti s vývojovou a epileptickou encefalopatií (DEE), což je závažná forma epilepsie, která má často genetický původ. Současné standardní diagnostické nástroje – známé jako sekvenování genomu krátkými čteními – neposkytují diagnózu pro více než 50 % postižených pacientů, protože nedokážou detekovat určité komplexní abnormality DNA.
Účelem této studie je vyhodnotit účinnost novější, pokročilejší technologie zvané sekvenování genomu dlouhými čteními (lrWGS). Na rozdíl od tradičních metod tato technologie analyzuje velmi dlouhé fragmenty DNA, což výzkumníkům umožňuje identifikovat genetické chyby, které byly dříve „neviditelné“.
Studie si klade za cíl odpovědět na otázku, zda může sekvenování dlouhými čteními úspěšně identifikovat genetickou příčinu epilepsie u pacientů, kteří již obdrželi negativní výsledek ze standardního testování. Nalezením těchto chybějících odpovědí si výzkum klade za cíl umožnit personalizovanou lékařskou léčbu, zlepšit genetické poradenství pro rodiny a prohloubit naše porozumění tomu, jak se tyto komplexní neurologické stavy vyvíjejí.
Přehled studie
Postavení
Detailní popis
Tato studie vyhodnocuje klinickou užitečnost dlouhočtené sekvenace celého genomu (lrWGS) jako sekundárního diagnostického nástroje pro vývojové a epileptické encefalopatie (DEEs). Zatímco současná standardní péče „krátkočtené“ sekvenování (srWGS) je účinné při identifikaci malých genetických mutací, často selhává v detekci komplexních strukturálních změn, což ponechává více než 50 % pacientů bez diagnózy.
Technicky lrWGS překonává tato omezení analýzou fragmentů DNA, které jsou tisíce bází dlouhé. To umožňuje výzkumníkům mapovat „temná místa“ genomu a identifikovat strukturální varianty (SVs), jako jsou velké inzerce, delece nebo expanze repetic, které jsou často skrytými příčinami těžké epilepsie.
Identifikací těchto těžko postižitelných genetických spouštěčů si studie klade za cíl posunout se za pouhou diagnózu směrem k precizní medicíně. Jasný molekulární výsledek může přímo ovlivnit klinická rozhodnutí, jako je výběr cílených léků, vyhýbání se kontraindikovaným lékům nebo stanovení způsobilosti pro vznikající genové terapie. Dále projekt posuzuje proveditelnost integrace této technologie do běžné klinické praxe hodnocením bioinformatické složitosti a diagnostických lhůt.
Typ studie
Zápis (Odhadovaný)
Kontakty a umístění
Studijní kontakt
- Jméno: Sarah BAER
- Telefonní číslo: +33 +333.88.12.84.98
- E-mail: sarah.baer@chru-strasbourg.fr
Studijní místa
-
-
-
Besançon, Francie, 25000
- Chu Jean Minjoz
-
Kontakt:
- Joanna BELLEVILLE
- Telefonní číslo: +33 +333.81.21.81.46
- E-mail: jgoffeney@chu-besancon.fr
-
Reims, Francie, 51092
- American Memorial Hospital
-
Kontakt:
- Mélanie JENNESON
- Telefonní číslo: +33 +333.26.78.78.99
- E-mail: Mjennesson-lyver@chu-reims.fr
-
Strasbourg, Francie, 67098
- Hopitaux universitaires de Strasbourg
-
Kontakt:
- Sarah BAER
- Telefonní číslo: +33 +333.88.12.84.98
- E-mail: sarah.baer@chru-strasbourg.fr
-
Vandœuvre-lès-Nancy, Francie, 54511
- CHU de Nancy - hôpital d'enfant
-
Kontakt:
- Mathieu KUCHENBUCH
- Telefonní číslo: +33 +333.83.15.50.85
- E-mail: m.kuchenbuch@chru-nancy.fr
-
-
Kritéria účasti
Kritéria způsobilosti
Věk způsobilý ke studiu
- Dítě
- Dospělý
Přijímá zdravé dobrovolníky
Metoda odběru vzorků
Studijní populace
Studijní populace je vybrána ze specializovaných oddělení dětské neurologie a genetiky v rámci francouzské sítě univerzitních nemocnic (CHU).
Účastníci jsou konkrétně získáváni z existujícího souboru pacientů platformy AURAGEN, jednoho ze dvou národních sekvenačních center zřízených v rámci francouzského plánu genomické medicíny 2025 (PFMG 2025). Tito jedinci představují vysoce vybranou subpopulaci dětí z celé Francie, které již prošly rozsáhlým klinickým fenotypováním a „prvoliniovým“ genomickým screeningem, ale stále nemají molekulární diagnózu.
Nábor probíhá primárně na Univerzitní nemocnici ve Štrasburku (Hôpitaux Universitaires de Strasbourg) a na spolupracujících klinických pracovištích. Tato centra slouží jako regionální a národní referenční místa pro vzácné a refrakterní dětské epilepsie, což zajišťuje, že studijní populace zahrnuje nejkomplexnější a diagnosticky nejnáročnější případy vývojové a epileptické encefalopatie (DEE) v zemi.
Popis
Kritéria zařazení:
Pediatričtí účastníci:
- Věk < 18 let.
- Diagnóza vývojové a epileptické encefalopatie (DEE) podle kritérií ILAE 2022 (závažná epilepsie, encefalopatický EEG, mnohočetné lékové rezistentní záchvaty a neurovývojová porucha).
- Mozková magnetická rezonance bez markerů perinatální anoxie.
- Negativní molekulární diagnóza po sekvenování celého genomu krátkými čteními (srWGS) prostřednictvím francouzského plánu genomické medicíny 2025 (AURAGEN).
- Dostupná bankovaná DNA v zúčastněném centru.
Rodiče/Zákonní zástupci:
- Věk ≥ 18 let.
- Schopni porozumět cílům a rizikům studie.
- Podepsaný a datovaný informovaný souhlas.
- Připojeni k systému sociálního zabezpečení nebo jeho příjemci.
Kritéria vyloučení:
Pediatričtí účastníci:
- Nálezy na magnetické rezonanci mozku svědčící pro perinatální cerebrální anoxii.
- Interkurentní onemocnění znemožňující provedení vyšetření podle protokolu.
- Subjekt se nachází ve vylučovací době jiné studie.
Rodiče/Zákonní zástupci:
- Neschopnost přijmout nebo porozumět informacím (např. život ohrožující stav).
- Subjekt pod soudní ochranou, poručenstvím nebo opatrovnictvím.
- Jazykové bariéry, kdy není k dispozici oficiální tlumočník.
Studijní plán
Jak je studie koncipována?
Detaily designu
Kohorty a intervence
Skupina / kohorta |
Intervence / Léčba |
|---|---|
|
DEE Long-read
Tato kohorta se skládá z dětských pacientů (mladších 18 let) s vývojovou a epileptickou encefalopatií (DEE) podle definice ILAE z roku 2022. Skupina je specificky charakterizována předchozím negativním molekulárním nálezem navzdory analýze pomocí sekvenování celého genomu s krátkými čteními (srWGS) v rámci francouzského plánu genomické medicíny 2025 (platforma AURAGEN). Výběr sleduje strategii klinické prioritizace: zatímco studie zahrnuje všechny způsobilé pacienty s DEE bez genetické odpovědi, přednost mají pacienti s časnými formami onemocnění, familiární případy nebo současný terapeutický pat (pacienti, u kterých standardní léčba selhala). Studie vylučuje případy, kde je identifikována jasná negenetická příčina, jako je perinatální poškození mozku, čímž se kohorta zaměřuje na vysoce pravděpodobné "skryté" genetické etiologie. |
Sekvenování celého genomu s dlouhým čtením (lrWGS) využívající vysokomolekulární DNA, která byla dříve extrahována a uskladněna během počátečního klinického vyšetření pacienta.
|
Co je měření studie?
Primární výstupní opatření
Měření výsledku |
Popis opatření |
Časové okno |
|---|---|---|
|
Počet patogenních a pravděpodobně patogenních genetických variant identifikovaných dlouhým čtením sekvenování celého genomu (lrWGS)
Časové okno: Při návštěvě předání výsledků (Návštěva 1), až 15 měsíců po zařazení do studie.
|
Vyhodnotit účinnost sekvenování celého genomu dlouhými čteními (lrWGS) při identifikaci genetických příčin u pacientů s vývojovou a epileptickou encefalopatií, kteří nezískali molekulární diagnózu navzdory předchozí analýze sekvenování celého genomu krátkými čteními (srWGS) v rámci francouzského plánu genomické medicíny 2025 (PFMG 2025).
|
Při návštěvě předání výsledků (Návštěva 1), až 15 měsíců po zařazení do studie.
|
Spolupracovníci a vyšetřovatelé
Termíny studijních záznamů
Hlavní termíny studia
Začátek studia (Odhadovaný)
Primární dokončení (Odhadovaný)
Dokončení studie (Odhadovaný)
Termíny zápisu do studia
První předloženo
První předloženo, které splnilo kritéria kontroly kvality
První zveřejněno (Aktuální)
Aktualizace studijních záznamů
Poslední zveřejněná aktualizace (Aktuální)
Odeslaná poslední aktualizace, která splnila kritéria kontroly kvality
Naposledy ověřeno
Více informací
Termíny související s touto studií
Klíčová slova
- Vysoce výkonné sekvenování nukleotidů
- Drogově rezistentní epilepsie
- Dlouhodobé sekvenování
- Vývojová a epileptická encefalopatie (DEE)
- Sekvenování celého genomu s dlouhými čteními (lrWGS)
- Negativní sekvenování krátkých čtení
- Genetická Diagnostika
- Pediatrická neurologie
- Raně nástupová epilepsie
- Genetická epilepsie
Další relevantní podmínky MeSH
Další identifikační čísla studie
- 9964
Plán pro data jednotlivých účastníků (IPD)
Plánujete sdílet data jednotlivých účastníků (IPD)?
Informace o lécích a zařízeních, studijní dokumenty
Studuje lékový produkt regulovaný americkým FDA
Studuje produkt zařízení regulovaný americkým úřadem FDA
Tyto informace byly beze změn načteny přímo z webu clinicaltrials.gov. Máte-li jakékoli požadavky na změnu, odstranění nebo aktualizaci podrobností studie, kontaktujte prosím register@clinicaltrials.gov. Jakmile bude změna implementována na clinicaltrials.gov, bude automaticky aktualizována i na našem webu .