Utviklingsmessige og epileptiske encefalopatier diagnostisert via langlesegenomsekvensering (EEPILOG)
Utviklingsmessige og epileptiske encefalopatier diagnostisert via langlesegenomsekvensering - EEPILOG
Denne studien fokuserer på barn med utviklings- og epileptisk encefalopati (DEE), en alvorlig form for epilepsi som ofte har genetisk opprinnelse. Standard diagnostiske verktøy – kjent som kort-lese genomsekvensering – gir for tiden ikke diagnose for over 50 % av berørte pasienter fordi de ikke kan oppdage visse komplekse DNA-avvik.
Formålet med denne studien er å evaluere effektiviteten av en nyere, mer avansert teknologi kalt lang-lese genomsekvensering (lrWGS). I motsetning til tradisjonelle metoder analyserer denne teknologien svært lange DNA-fragmenter, noe som lar forskere identifisere genetiske feil som tidligere var "usynlige".
Studien har som mål å svare på om lang-lese sekvensering kan identifisere den genetiske årsaken til epilepsi hos pasienter som allerede har fått et negativt resultat fra standard testing. Ved å finne disse manglende svarene søker forskningen å muliggjøre personlig tilpasset medisinsk behandling, forbedre genetisk veiledning for familier og fremme vår forståelse av hvordan disse komplekse nevrologiske tilstandene utvikler seg.
Studieoversikt
Status
Intervensjon / Behandling
Detaljert beskrivelse
Denne studien evaluerer den kliniske nytten av helgenomsekvensering med lange leselengder (lrWGS) som et sekundært diagnostisk verktøy for utviklings- og epileptiske encefalopatier (DEEs). Mens dagens standardbehandling med "korte leselengder"-sekvensering (srWGS) er effektiv til å identifisere små genetiske mutasjoner, klarer den ofte ikke å oppdage komplekse strukturelle endringer, noe som etterlater over 50% av pasientene uten en diagnose.
Teknisk sett overvinner lrWGS disse begrensningene ved å analysere DNA-fragmenter som er tusenvis av baser lange. Dette lar forskerne kartlegge "mørke regioner" i genomet og identifisere strukturelle varianter (SVs), som store innsettinger, slettinger eller repetisjonsekspansjoner, som ofte er de skjulte årsakene til alvorlig epilepsi.
Ved å identifisere disse vanskelig påvisbare genetiske drivkreftene, tar studien sikte på å gå utover en enkel diagnose mot presisjonsmedisin. Et klart molekylært resultat kan direkte påvirke kliniske beslutninger, som valg av målrettede medisiner, unngåelse av kontraindicerte legemidler, eller fastsettelse av kvalifikasjon for nye genterapier. I tillegg vurderer prosjektet muligheten for å integrere denne teknologien i rutinemessig klinisk praksis ved å evaluere bioinformatikk-kompleksitet og diagnostisk svarstid.
Studietype
Registrering (Antatt)
Kontakter og plasseringer
Studiekontakt
- Navn: Sarah BAER
- Telefonnummer: +33 +333.88.12.84.98
- E-post: sarah.baer@chru-strasbourg.fr
Studiesteder
-
-
-
Besançon, Frankrike, 25000
- Chu Jean Minjoz
-
Ta kontakt med:
- Joanna BELLEVILLE
- Telefonnummer: +33 +333.81.21.81.46
- E-post: jgoffeney@chu-besancon.fr
-
Reims, Frankrike, 51092
- American Memorial Hospital
-
Ta kontakt med:
- Mélanie JENNESON
- Telefonnummer: +33 +333.26.78.78.99
- E-post: Mjennesson-lyver@chu-reims.fr
-
Strasbourg, Frankrike, 67098
- Hopitaux Universitaires de Strasbourg
-
Ta kontakt med:
- Sarah BAER
- Telefonnummer: +33 +333.88.12.84.98
- E-post: sarah.baer@chru-strasbourg.fr
-
Vandœuvre-lès-Nancy, Frankrike, 54511
- CHU de Nancy - hôpital d'enfant
-
Ta kontakt med:
- Mathieu KUCHENBUCH
- Telefonnummer: +33 +333.83.15.50.85
- E-post: m.kuchenbuch@chru-nancy.fr
-
-
Deltakelseskriterier
Kvalifikasjonskriterier
Alder som er kvalifisert for studier
- Barn
- Voksen
Tar imot friske frivillige
Prøvetakingsmetode
Studiepopulasjon
Studiepopulasjonen er hentet fra spesialiserte barne nevrologi- og genetikkavdelinger innenfor det franske universitetssykehusnettverket (CHU).
Deltakere hentes spesifikt fra den eksisterende pasientbasen til AURAGEN-plattformen, som er en av de to nasjonale sekvenseringssentrene etablert under den franske genomedisinplanen 2025 (PFMG 2025). Disse personene representerer en svært utvalgt undergruppe av barn over hele Frankrike som allerede har gjennomgått omfattende klinisk fenotypering og "førstelinje" genomisk screening, men som fortsatt ikke har fått en molekylær diagnose.
Rekrutteringen skjer primært ved Strasbourg universitetssykehus (Hôpitaux Universitaires de Strasbourg) og samarbeidende kliniske steder. Disse sentrene fungerer som regionale og nasjonale henvisningspunkter for sjeldne og refraktære barneepilepsier, noe som sikrer at studiepopulasjonen inkluderer de mest komplekse og diagnostisk utfordrende tilfellene av utviklingsmessig og epileptisk encefalopati (DEE) i landet.
Beskrivelse
Inklusjonskriterier:
Pediatriske deltakere:
- Alder < 18 år.
- Diagnose av utviklings- og epileptisk encefalopati (DEE) i henhold til ILAE-kriterier fra 2022 (alvorlig epilepsi, encefalopatisk EEG, flere medikamentresistente anfall og nevro-utviklingsforstyrrelse).
- Hjerne-MRI uten markører for perinatal anoksi.
- Negativ molekylær diagnose etter kort-lese helgenomsekvensering (srWGS) via den franske genommedisinplanen 2025 (AURAGEN).
- Tilgjengelig banket DNA ved et deltakende senter.
Foreldre/Rettslige foresatte:
- Alder ≥ 18 år.
- I stand til å forstå studiens mål og risikoer.
- Signert og datert informert samtykke.
- Tilknyttet eller begunstiget av et trygdeordning.
Eksklusjonskriterier:
Pediatriske deltakere:
- Hjerne-MGI-funn som taler for perinatal cerebral anoksi.
- Interkurrente sykdommer som hindrer fullføring av protokollundersøkelser.
- Person som for tiden er i en eksklusjonsperiode fra en annen studie.
Foreldre/Rettslige foresatte:
- Manglende evne til å motta eller forstå informert informasjon (f.eks. livstruende nødsituasjon).
- Person under rettslig beskyttelse, vergemål eller kuratelle.
- Språkbarrierer hvor en offisiell tolk ikke er tilgjengelig.
Studieplan
Hvordan er studiet utformet?
Designdetaljer
Kohorter og intervensjoner
Gruppe / Kohort |
Intervensjon / Behandling |
|---|---|
|
DEE Long-read
Denne kohorten består av pediatriske pasienter (under 18 år) med utviklings- og epileptisk encefalopati (DEE) som definert av ILAE-kriteriene fra 2022. Gruppen er spesielt preget av en tidligere negativ molekylær diagnose til tross for analyse via short-read Whole Genome Sequencing (srWGS) gjennom den franske genomiske medisinplanen 2025 (AURAGEN-plattformen). Utvelgelsen følger en klinisk prioriteringsstrategi: mens studien inkluderer alle kvalifiserte DEE-pasienter uten en genetisk svar, prioriteres de med tidlig debutformer, familiære tilfeller eller nåværende terapeutisk impasse (pasienter der standardbehandlinger har feilet). Studien utelukker tilfeller der en klar ikke-genetisk årsak er identifisert, som perinatal hjerneskade, og fokuserer kohorten på høysannsynlige «skjulte» genetiske etiologier. |
Lang-lese hele genomet sekvensering (lrWGS) ved bruk av høymolekylærvekt DNA som tidligere er ekstrahert og banket under pasientens første kliniske utredning.
|
Hva måler studien?
Primære resultatmål
Resultatmål |
Tiltaksbeskrivelse |
Tidsramme |
|---|---|---|
|
Antall patogene og sannsynligvis patogene genetiske varianter identifisert ved lang-lese hele genom sekvensering (lrWGS)
Tidsramme: Ved resultatleveringsbesøket (Besøk 1), opptil 15 måneder etter inkludering.
|
Evaluere effektiviteten av langlese-hele-genom-sekvensering (lrWGS) for å identifisere genetiske årsaker hos pasienter med utviklingsmessig og epileptisk encefalopati som ikke fikk en molekylær diagnose til tross for tidligere kortlese-hele-genom-sekvensering (srWGS)-analyse innenfor rammeverket til den franske genomiske medisinplanen 2025 (PFMG 2025).
|
Ved resultatleveringsbesøket (Besøk 1), opptil 15 måneder etter inkludering.
|
Samarbeidspartnere og etterforskere
Studierekorddatoer
Studer hoveddatoer
Studiestart (Antatt)
Primær fullføring (Antatt)
Studiet fullført (Antatt)
Datoer for studieregistrering
Først innsendt
Først innsendt som oppfylte QC-kriteriene
Først lagt ut (Faktiske)
Oppdateringer av studieposter
Sist oppdatering lagt ut (Faktiske)
Siste oppdatering sendt inn som oppfylte QC-kriteriene
Sist bekreftet
Mer informasjon
Begreper knyttet til denne studien
Nøkkelord
Ytterligere relevante MeSH-vilkår
Andre studie-ID-numre
- 9964
Plan for individuelle deltakerdata (IPD)
Planlegger du å dele individuelle deltakerdata (IPD)?
Legemiddel- og utstyrsinformasjon, studiedokumenter
Studerer et amerikansk FDA-regulert medikamentprodukt
Studerer et amerikansk FDA-regulert enhetsprodukt
Denne informasjonen ble hentet direkte fra nettstedet clinicaltrials.gov uten noen endringer. Hvis du har noen forespørsler om å endre, fjerne eller oppdatere studiedetaljene dine, vennligst kontakt register@clinicaltrials.gov. Så snart en endring er implementert på clinicaltrials.gov, vil denne også bli oppdatert automatisk på nettstedet vårt. .