Kehitys- ja epileptiset enkefalopatiat pitkän luku-genomisekvensoinnin avulla diagnosoituna (EEPILOG)
Kehitys- ja epileptiset enkefalopatiat, jotka on diagnosoitu pitkänlukuisella genomin sekvensoinnilla - EEPILOG
Tämä tutkimus keskittyy lapsiin, joilla on kehityksellinen ja epileptinen enkefalopatia (DEE), joka on vakava epilepsian muoto, jolla on usein geneettinen alkuperä. Tällä hetkellä vakiintuneet diagnostiset työkalut – lyhyen lukemisen genomin sekvensointi – eivät pysty antamaan diagnoosia yli 50 %:lle potilaista, koska ne eivät pysty havaitsemaan tiettyjä monimutkaisia DNA-poikkeavuuksia.
Tämän tutkimuksen tarkoituksena on arvioida uudemman, kehittyneemmän teknologian, pitkän lukemisen genomin sekvensoinnin (lrWGS), tehokkuutta. Toisin kuin perinteiset menetelmät, tämä teknologia analysoi erittäin pitkiä DNA-fragmenteja, mikä mahdollistaa tutkijoiden tunnistaa aiemmin "näkymättömiä" geneettisiä virheitä.
Tutkimuksen tavoitteena on selvittää, voiko pitkän lukemisen sekvensointi onnistuneesti tunnistaa epilepsian geneettisen syyn potilaille, jotka ovat jo saaneet negatiivisen tuloksen vakiintuneesta testauksesta. Löytämällä nämä puuttuvat vastaukset tutkimus pyrkii mahdollistamaan henkilökohtaiset lääketieteelliset hoidot, parantamaan geneettistä neuvontaa perheille ja edistämään ymmärrystämme siitä, miten nämä monimutkaiset neurologiset sairaudet kehittyvät.
Tutkimuksen yleiskatsaus
Tila
Interventio / Hoito
Yksityiskohtainen kuvaus
Tämä tutkimus arvioi pitkälukuisen kokogenomisekvensoinnin (lrWGS) kliinistä hyödyllisyyttä kehityksen ja epilepsian enkefalopatioiden (DEE) toissijaisena diagnoosityökaluna. Nykyinen standardihoito, "lyhyen lukemisen" sekvensointi (srWGS), on tehokas pienten geneettisten mutaatioiden tunnistamisessa, mutta se usein epäonnistuu monimutkaisten rakenteellisten muutosten havaitsemisessa, jolloin yli 50 % potilaista jää ilman diagnoosia.
Teknisesti lrWGS voittaa nämä rajoitukset analysoimalla tuhansia emäspareja pitkiä DNA-fragmenteja. Tämä mahdollistaa tutkijoiden kartoittaa genomin "pimeitä alueita" ja tunnistaa rakenteellisia variaatioita (SVs), kuten suuria lisäyksiä, poistoja tai toistojen laajenemisia, jotka usein ovat vakavan epilepsian piileviä syitä.
Tunnistamalla nämä vaikeasti havaittavat geneettiset ajurit tutkimus pyrkii siirtymään yksinkertaisesta diagnoosista kohti tarkkamediisinia. Selkeä molekyylitason tulos voi suoraan vaikuttaa kliinisiin päätöksiin, kuten kohdennettujen lääkkeiden valintaan, kontra-indikoitujen lääkkeiden välttämiseen tai soveltuvuuden määrittämiseen kehittyville geeniterapioille. Lisäksi projekti arvioi tämän teknologian integroinnin toteutettavuutta rutiinikliiniseen käytäntöön arvioimalla bioinformatiikan monimutkaisuutta ja diagnoosin valmistumisaikoja.
Opintotyyppi
Ilmoittautuminen (Arvioitu)
Yhteystiedot ja paikat
Opiskeluyhteys
- Nimi: Sarah BAER
- Puhelinnumero: +33 +333.88.12.84.98
- Sähköposti: sarah.baer@chru-strasbourg.fr
Opiskelupaikat
-
-
-
Besançon, Ranska, 25000
- Chu Jean Minjoz
-
Ottaa yhteyttä:
- Joanna BELLEVILLE
- Puhelinnumero: +33 +333.81.21.81.46
- Sähköposti: jgoffeney@chu-besancon.fr
-
Reims, Ranska, 51092
- American Memorial Hospital
-
Ottaa yhteyttä:
- Mélanie JENNESON
- Puhelinnumero: +33 +333.26.78.78.99
- Sähköposti: Mjennesson-lyver@chu-reims.fr
-
Strasbourg, Ranska, 67098
- Hopitaux Universitaires de Strasbourg
-
Ottaa yhteyttä:
- Sarah BAER
- Puhelinnumero: +33 +333.88.12.84.98
- Sähköposti: sarah.baer@chru-strasbourg.fr
-
Vandœuvre-lès-Nancy, Ranska, 54511
- CHU de Nancy - hôpital d'enfant
-
Ottaa yhteyttä:
- Mathieu KUCHENBUCH
- Puhelinnumero: +33 +333.83.15.50.85
- Sähköposti: m.kuchenbuch@chru-nancy.fr
-
-
Osallistumiskriteerit
Kelpoisuusvaatimukset
Opintokelpoiset iät
- Lapsi
- Aikuinen
Hyväksyy terveitä vapaaehtoisia
Näytteenottomenetelmä
Tutkimusväestö
Tutkimusväestö kootaan Ranskan yliopistosairaaloiden (CHU) erikoistuneista lastenneurologian ja genetiikan osastoista.
Osallistujat valitaan erityisesti AURAGEN-alustan nykyisestä potilasaineistosta, joka on yksi kahdesta kansallisesta sekvensointikeskuksesta, jotka on perustettu Ranskan genomisen lääketieteen suunnitelman 2025 (PFMG 2025) puitteissa. Nämä henkilöt edustavat erittäin valikoitunutta lapsien alaryhmää ympäri Ranskaa, jotka ovat jo käyneet läpi laajan kliinisen fenotyypityksen ja "etulinjan" genomisen seulonnan, mutta joilla ei vielä ole molekyylitason diagnoosia.
Rekrytointi tapahtuu ensisijaisesti Strasbourgin yliopistollisessa sairaalassa (Hôpitaux Universitaires de Strasbourg) ja yhteistyökumppaneiden kliinisillä toimipaikoilla. Nämä keskukset toimivat alueellisina ja kansallisina lähetyspaikkoina harvinaisille ja hankalasti hoidettaville lapsuusiän epilepsioille, varmistaen, että tutkimusväestöön sisältyy maan vaikeimmat ja diagnostisesti haastavimmat kehityksellisen ja epileptisen enkefalopatian (DEE) tapaukset.
Kuvaus
Sisällyttämiskriteerit:
Lapsi osallistujat:
- Ikä < 18 vuotta.
- Diagnoosi kehityksellisestä ja epileptisestä enkefalopatiasta (DEE) 2022 ILAE-kriteerien mukaan (vakava epilepsia, enkefalopaattinen EEG, useat lääkkeille vastustuskykyiset kohtaukset ja neurokehityshäiriö).
- Aivojen MRI ilman perinataalisen anoksian merkkejä.
- Negatiivinen molekyylidiagnoosi lyhyiden lukujen kokogenomisekvensoinnin (srWGS) jälkeen Ranskan genomisen lääketieteen suunnitelman 2025 (AURAGEN) kautta.
- Saatavilla oleva pankkitallennettu DNA osallistuvalla keskuksella.
Vanhemmat/Lakiasiamiehet:
- Ikä ≥ 18 vuotta.
- Kyky ymmärtää tutkimuksen tavoitteet ja riskit.
- Allekirjoitettu ja päivätty tietoon perustuva suostumus.
- Sosiaaliturvajärjestelmän piirissä tai sen hyötyjä.
Poissulkemiskriteerit:
Lapsi osallistujat:
- Aivojen MRI-löydökset, jotka viittaavat perinataaliseen aivojen anoksiaan.
- Saman aikaiset sairaudet, jotka estävät protokollatutkimusten suorittamisen.
- Koehenkilö, joka on tällä hetkellä toisen tutkimuksen poissulkemisjakson aikana.
Vanhemmat/Lakiasiamiehet:
- Kyvyttömyys vastaanottaa tai ymmärtää tietoon perustuvaa tietoa (esim. hengenvaarallinen hätätilanne).
- Koehenkilö, joka on oikeudellisen suojelun, holhouksen tai huoltajuuden alaisena.
- Kielimuodot, joissa virallista tulkkiä ei ole saatavilla.
Opintosuunnitelma
Miten tutkimus on suunniteltu?
Suunnittelun yksityiskohdat
Kohortit ja interventiot
Ryhmä/Kohortti |
Interventio / Hoito |
|---|---|
|
DEE Pitkäaikainen lukeminen
Tämä kohortti koostuu alle 18-vuotiaista lapsipotilaista, joilla on kehitys- ja epileptinen enkefalopatia (DEE) määritelmän mukaisesti ILAE:n vuoden 2022 kriteereissä. Ryhmää erityisesti luonnehtii aiempi negatiivinen molekyylidiagnoosi, vaikka analyysi on tehty lyhyenlukuisella kokogenomisekvensoinnilla (srWGS) Ranskan genomisen lääketieteen suunnitelman 2025 kautta (AURAGEN-alusta). Valinta noudattaa kliinistä priorisointistrategiaa: vaikka tutkimus sisältää kaikki kelvolliset DEE-potilaat ilman geneettistä vastausta, etusija annetaan niille, joilla on varhaisia muotoja, perheellisiä tapauksia tai nykyinen terapeuttinen umpikuja (potilaat, joille standardihoidot ovat epäonnistuneet). Tutkimus sulkee pois tapaukset, joissa selkeä ei-geneettinen syy on tunnistettu, kuten synnytysajan aivovamma, keskittyen kohorttiin korkean todennäköisyyden "piileviin" geneettisiin etiologioihin. |
Pitkäluettavainen kokogenomin sekvensointi (lrWGS) käyttäen korkean molekyylipainon DNA:ta, joka on aiemmin eristetty ja arkistoitu potilaan alkuperäisen kliinisen tutkimuksen aikana.
|
Mitä tutkimuksessa mitataan?
Ensisijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Toimenpiteen kuvaus |
Aikaikkuna |
|---|---|---|
|
Patogeenisten ja todennäköisesti patogeenisten geneettisten varianttien määrä, jotka tunnistettiin pitkien lukujen kokogenomisekvensoinnilla (lrWGS)
Aikaikkuna: Tulosten toimituskäynnillä (Käynti 1), enintään 15 kuukautta ilmoittautumisen jälkeen.
|
Arvioi pitkälukuisella kokogenomisekvensoinnilla (lrWGS) saavutettavaa tehoa kehityksellisen ja epileptisen enkefalopatian potilaiden geneettisten syiden tunnistamisessa, joille ei saatu molekyylitason diagnoosia aiemman lyhytlukuisella kokogenomisekvensoinnilla (srWGS) suoritetun analyysin jälkeen Ranskan genomisen lääketieteen suunnitelman 2025 (PFMG 2025) puitteissa.
|
Tulosten toimituskäynnillä (Käynti 1), enintään 15 kuukautta ilmoittautumisen jälkeen.
|
Yhteistyökumppanit ja tutkijat
Opintojen ennätyspäivät
Opi tärkeimmät päivämäärät
Opiskelun aloitus (Arvioitu)
Ensisijainen valmistuminen (Arvioitu)
Opintojen valmistuminen (Arvioitu)
Opintoihin ilmoittautumispäivät
Ensimmäinen lähetetty
Ensimmäinen toimitettu, joka täytti QC-kriteerit
Ensimmäinen Lähetetty (Todellinen)
Tutkimustietojen päivitykset
Viimeisin päivitys julkaistu (Todellinen)
Viimeisin lähetetty päivitys, joka täytti QC-kriteerit
Viimeksi vahvistettu
Lisää tietoa
Tähän tutkimukseen liittyvät termit
Avainsanat
- Korkean suorituskyvyn nukleotidisekvensointi
- Lääkeresistentti epilepsia
- Pitkään luettu sekvensointi
- Kehitys- ja epileptinen enkefalopatia (DEE)
- Pitkien lukumien koko genomin sekvensointi (lrWGS)
- Negatiivinen lyhyiden lukuisten sekvensointi
- Geneettinen diagnoosi
- Lapsenneurologia
- Varhaislapsuuden epilepsia
- Geneettinen epilepsia
Muita asiaankuuluvia MeSH-ehtoja
Muut tutkimustunnusnumerot
- 9964
Yksittäisten osallistujien tietojen suunnitelma (IPD)
Aiotko jakaa yksittäisten osallistujien tietoja (IPD)?
Lääke- ja laitetiedot, tutkimusasiakirjat
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää lääkevalmistetta
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää laitetuotetta
Nämä tiedot haettiin suoraan verkkosivustolta clinicaltrials.gov ilman muutoksia. Jos sinulla on pyyntöjä muuttaa, poistaa tai päivittää tutkimustietojasi, ota yhteyttä register@clinicaltrials.gov. Heti kun muutos on otettu käyttöön osoitteessa clinicaltrials.gov, se päivitetään automaattisesti myös verkkosivustollemme .