通过长读长基因组测序诊断的发育性和癫痫性脑病 (EEPILOG)
通过长读长基因组测序诊断的发育性和癫痫性脑病 - EEPILOG
本研究聚焦于患有发育性和癫痫性脑病（DEE）的儿童，这是一种通常具有遗传起源的严重癫痫形式。目前，标准诊断工具——即短读长基因组测序——无法为超过50%的受影响患者提供诊断，因为它们无法检测某些复杂的DNA异常。
本研究的目的是评估一种更新、更先进的技术——长读长基因组测序（lrWGS）的有效性。与传统方法不同，该技术分析非常长的DNA片段，使研究人员能够识别以前“看不见”的遗传错误。
该研究旨在回答长读长测序是否能够成功识别已接受标准检测结果为阴性的患者癫痫的遗传原因。通过找到这些缺失的答案，该研究旨在实现个性化医疗，改善家庭的遗传咨询，并增进我们对这些复杂神经系统疾病如何发展的理解。
研究概览
详细说明
本研究评估了长读长全基因组测序（lrWGS）作为发育性和癫痫性脑病（DEEs）二级诊断工具的临床实用性。虽然当前标准护理的“短读长”测序（srWGS）在识别小型基因突变方面有效，但它常常无法检测复杂的结构变化，导致超过50%的患者无法获得诊断。
从技术上讲，lrWGS通过分析长达数千个碱基的DNA片段克服了这些限制。这使得研究人员能够绘制基因组的“暗区域”并识别结构变异（SVs），例如大片段插入、缺失或重复扩增，这些往往是严重癫痫的隐藏原因。
通过识别这些难以捉摸的遗传驱动因素，本研究旨在超越简单诊断，迈向精准医疗。明确的分子结果可以直接影响临床决策，例如选择靶向药物、避免禁忌药物或确定新兴基因疗法的资格。此外，该项目通过评估生物信息学复杂性和诊断周转时间，评估了将该技术整合到常规临床实践中的可行性。
研究类型
注册 (估计的)
联系人和位置
学习联系方式
- 姓名：Sarah BAER
- 电话号码：+33 +333.88.12.84.98
- 邮箱：sarah.baer@chru-strasbourg.fr
学习地点
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Besançon、法国、25000
- Chu Jean Minjoz
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接触：
- Joanna BELLEVILLE
- 电话号码：+33 +333.81.21.81.46
- 邮箱：jgoffeney@chu-besancon.fr
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Reims、法国、51092
- American Memorial Hospital
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接触：
- Mélanie JENNESON
- 电话号码：+33 +333.26.78.78.99
- 邮箱：Mjennesson-lyver@chu-reims.fr
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Strasbourg、法国、67098
- Hopitaux Universitaires de Strasbourg
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接触：
- Sarah BAER
- 电话号码：+33 +333.88.12.84.98
- 邮箱：sarah.baer@chru-strasbourg.fr
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Vandœuvre-lès-Nancy、法国、54511
- CHU de Nancy - hôpital d'enfant
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接触：
- Mathieu KUCHENBUCH
- 电话号码：+33 +333.83.15.50.85
- 邮箱：m.kuchenbuch@chru-nancy.fr
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参与标准
资格标准
适合学习的年龄
- 孩子
- 成人
接受健康志愿者
取样方法
研究人群
研究人群来自法国大学医院网络（CHU）内的专业儿科神经病学和遗传学部门。
参与者专门来自AURAGEN平台的现有患者群体，该平台是法国2025基因组医学计划（PFMG 2025）下建立的两个国家测序中心之一。这些个体代表了法国各地经过严格筛选的儿童亚群，他们已经接受了广泛的临床表型分析和“一线”基因组筛查，但仍未获得分子诊断。
招募主要在斯特拉斯堡大学医院（Hôpitaux Universitaires de Strasbourg）和合作的临床站点进行。这些中心作为罕见和难治性儿童癫痫的区域和国家转诊点，确保研究人群包括该国最复杂和最具诊断挑战性的发育性和癫痫性脑病（DEE）病例。
描述
纳入标准：
儿科参与者：
- 年龄 < 18岁。
- 根据2022年国际抗癫痫联盟（ILAE）标准诊断为发育性和癫痫性脑病（DEE）（严重癫痫、脑病性脑电图、多种药物难治性发作以及神经发育障碍）。
- 脑部MRI无围产期缺氧标志物。
- 通过法国基因组医学计划2025（AURAGEN）进行短读长全基因组测序（srWGS）后分子诊断为阴性。
- 在参与中心有可用的储存DNA。
父母/法定监护人：
- 年龄 ≥ 18岁。
- 能够理解研究目标和风险。
- 签署并注明日期的知情同意书。
- 隶属于或受益于社会保障计划。
排除标准：
儿科参与者：
- 脑部MRI结果支持围产期脑缺氧。
- 妨碍完成方案检查的并发疾病。
- 受试者目前处于另一项研究的排除期。
父母/法定监护人：
- 无法接收或理解知情信息（例如，危及生命的紧急情况）。
- 受试者受司法保护、监护或监管。
- 语言障碍且无官方口译员可用。
学习计划
研究是如何设计的？
设计细节
队列和干预
团体/队列 |
干预/治疗 |
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DEE 长读段
该队列由符合2022年国际抗癫痫联盟（ILAE）标准定义的发育性和癫痫性脑病（DEE）儿科患者（18岁以下）组成。 该组别的特别之处在于，尽管通过法国基因组医学计划2025（AURAGEN平台）进行了短读长全基因组测序（srWGS）分析，但先前分子诊断结果为阴性。 筛选遵循临床优先策略：虽然研究纳入所有符合条件的无遗传学答案的DEE患者，但优先考虑早发型、家族性病例或当前治疗陷入僵局（标准治疗失败的患者）的个体。研究排除了明确非遗传原因（如围产期脑损伤）的病例，将队列聚焦于高概率的“隐藏”遗传病因。 |
利用患者初步临床检查期间先前提取并储存的高分子量DNA进行长读长全基因组测序（lrWGS）。
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研究衡量的是什么？
主要结果指标
结果测量 |
措施说明 |
大体时间 |
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通过长读长全基因组测序（lrWGS）识别的致病性和可能致病性遗传变异数量
大体时间：在结果交付访视（访视1），入组后最多15个月。
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评估长读长全基因组测序（lrWGS）在识别发育性癫痫性脑病患者遗传病因方面的疗效，这些患者尽管先前在法国基因组医学计划2025（PFMG 2025）框架内进行了短读长全基因组测序（srWGS）分析，但未获得分子诊断。
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在结果交付访视（访视1），入组后最多15个月。
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合作者和调查者
研究记录日期
研究主要日期
学习开始 (估计的)
初级完成 (估计的)
研究完成 (估计的)
研究注册日期
首次提交
首先提交符合 QC 标准的
首次发布 (实际的)
研究记录更新
最后更新发布 (实际的)
上次提交的符合 QC 标准的更新
最后验证
更多信息
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