- ICH GCP
- Реестр клинических исследований США
- Клиническое испытание NCT07396883
Развивающиеся и эпилептические энцефалопатии, диагностированные с помощью секвенирования генома длинными ридами (EEPILOG)
Развивающиеся и эпилептические энцефалопатии, диагностированные с помощью секвенирования генома длинными чтениями - EEPILOG
Это исследование сосредоточено на детях с развивающейся и эпилептической энцефалопатией (DEE), тяжелой формой эпилепсии, часто имеющей генетическое происхождение. В настоящее время стандартные диагностические инструменты, известные как секвенирование генома короткими чтениями, не позволяют поставить диагноз более чем 50% пораженных пациентов, поскольку они не могут обнаружить определенные сложные аномалии ДНК.
Цель данного исследования — оценить эффективность более новой и продвинутой технологии, называемой секвенированием генома длинными чтениями (lrWGS). В отличие от традиционных методов, эта технология анализирует очень длинные фрагменты ДНК, позволяя исследователям выявлять генетические ошибки, которые ранее были «невидимыми».
Исследование направлено на то, чтобы ответить, может ли секвенирование длинными чтениями успешно определить генетическую причину эпилепсии у пациентов, которые уже получили отрицательный результат стандартного тестирования. Найдя эти недостающие ответы, исследование стремится обеспечить персонализированное медицинское лечение, улучшить генетическое консультирование для семей и углубить наше понимание того, как развиваются эти сложные неврологические состояния.
Обзор исследования
Статус
Вмешательство/лечение
Подробное описание
В данном исследовании оценивается клиническая полезность секвенирования полного генома методом длинных чтений (lrWGS) в качестве дополнительного диагностического инструмента для нарушений развития и эпилептических энцефалопатий (DEEs). Стандартное секвенирование методом коротких чтений (srWGS), хотя и эффективно для выявления небольших генетических мутаций, часто не позволяет обнаружить сложные структурные изменения, оставляя более 50% пациентов без диагноза.
Технически, lrWGS преодолевает эти ограничения, анализируя фрагменты ДНК длиной в тысячи нуклеотидов. Это позволяет исследователям картировать «тёмные области» генома и идентифицировать структурные варианты (SVs), такие как крупные вставки, делеции или экспансии повторов, которые часто являются скрытыми причинами тяжёлой эпилепсии.
Выявляя эти неуловимые генетические драйверы, исследование стремится выйти за рамки простой диагностики в сторону прецизионной медицины. Чёткий молекулярный результат может напрямую влиять на клинические решения, такие как выбор таргетных препаратов, избегание противопоказанных лекарств или определение пригодности для новых генетических терапий. Кроме того, проект оценивает возможность интеграции этой технологии в рутинную клиническую практику, анализируя биоинформатическую сложность и сроки постановки диагноза.
Тип исследования
Регистрация (Оцененный)
Контакты и местонахождение
Контакты исследования
- Имя: Sarah BAER
- Номер телефона: +33 +333.88.12.84.98
- Электронная почта: sarah.baer@chru-strasbourg.fr
Места учебы
-
-
-
Besançon, Франция, 25000
- Chu Jean Minjoz
-
Контакт:
- Joanna BELLEVILLE
- Номер телефона: +33 +333.81.21.81.46
- Электронная почта: jgoffeney@chu-besancon.fr
-
Reims, Франция, 51092
- American Memorial Hospital
-
Контакт:
- Mélanie JENNESON
- Номер телефона: +33 +333.26.78.78.99
- Электронная почта: Mjennesson-lyver@chu-reims.fr
-
Strasbourg, Франция, 67098
- Hopitaux Universitaires de Strasbourg
-
Контакт:
- Sarah BAER
- Номер телефона: +33 +333.88.12.84.98
- Электронная почта: sarah.baer@chru-strasbourg.fr
-
Vandœuvre-lès-Nancy, Франция, 54511
- CHU de Nancy - hôpital d'enfant
-
Контакт:
- Mathieu KUCHENBUCH
- Номер телефона: +33 +333.83.15.50.85
- Электронная почта: m.kuchenbuch@chru-nancy.fr
-
-
Критерии участия
Критерии приемлемости
Возраст, подходящий для обучения
- Ребенок
- Взрослый
Принимает здоровых добровольцев
Метод выборки
Исследуемая популяция
Исследуемая популяция формируется из специализированных отделений детской неврологии и генетики в рамках сети университетских больниц Франции (CHU).
Участники набираются конкретно из существующей базы пациентов платформы AURAGEN, одного из двух национальных центров секвенирования, созданных в рамках Французского плана геномной медицины 2025 (PFMG 2025). Эти лица представляют собой тщательно отобранную субпопуляцию детей по всей Франции, которые уже прошли обширное клиническое фенотипирование и «первичный» геномный скрининг, но остаются без молекулярного диагноза.
Набор участников происходит преимущественно в Университетской больнице Страсбурга (Hôpitaux Universitaires de Strasbourg) и в сотрудничающих клинических центрах. Эти центры служат региональными и национальными референтными точками для редких и рефрактерных детских эпилепсий, гарантируя, что исследуемая популяция включает в себя наиболее сложные и трудные для диагностики случаи нарушений развития и эпилептических энцефалопатий (DEE) в стране.
Описание
Критерии включения:
Детские участники:
- Возраст < 18 лет.
- Диагноз развития и эпилептической энцефалопатии (DEE) согласно критериям ILAE 2022 года (тяжелая эпилепсия, энцефалопатическая ЭЭГ, множественные лекарственно-устойчивые приступы и нарушение нейроразвития).
- МРТ головного мозга без маркеров перинатальной аноксии.
- Отрицательный молекулярный диагноз после секвенирования полного генома короткими чтениями (srWGS) через французский план геномной медицины 2025 года (AURAGEN).
- Наличие заготовленной ДНК в участвующем центре.
Родители/Законные представители:
- Возраст ≥ 18 лет.
- Способность понимать цели и риски исследования.
- Подписанное и датированное информированное согласие.
- Прикрепление к системе социального обеспечения или получение пособий по ней.
Критерии исключения:
Детские участники:
- Результаты МРТ головного мозга, указывающие на перинатальную церебральную аноксию.
- Интеркуррентные заболевания, препятствующие выполнению обследований по протоколу.
- Участник в настоящее время находится в периоде исключения из другого исследования.
Родители/Законные представители:
- Невозможность получения или понимания информированных сведений (например, угрожающая жизни чрезвычайная ситуация).
- Участник под судебной защитой, опекой или попечительством.
- Языковой барьер при отсутствии официального переводчика.
Учебный план
Как устроено исследование?
Детали дизайна
Когорты и вмешательства
Группа / когорта |
Вмешательство/лечение |
|---|---|
|
DEE Длинное чтение
Эта когорта состоит из пациентов детского возраста (младше 18 лет) с развивающейся и эпилептической энцефалопатией (DEE) в соответствии с критериями ILAE 2022 года. Группа специально характеризуется предшествующим отрицательным молекулярным диагнозом, несмотря на анализ с помощью секвенирования всего генома короткими чтениями (srWGS) в рамках французского плана геномной медицины 2025 года (платформа AURAGEN). Отбор следует стратегии клинического приоритизации: хотя исследование включает всех подходящих пациентов с DEE без генетического ответа, приоритет отдается тем, у кого ранние формы, семейные случаи или текущий терапевтический тупик (пациенты, для которых стандартное лечение не дало результата). Исследование исключает случаи, когда выявлена явная негенетическая причина, такая как перинатальное повреждение головного мозга, фокусируя когорту на высоковероятных «скрытых» генетических этиологиях. |
Секвенирование полного генома с помощью длинных ридов (lrWGS) с использованием высокомолекулярной ДНК, ранее выделенной и сохраненной во время первичного клинического обследования пациента.
|
Что измеряет исследование?
Первичные показатели результатов
Мера результата |
Мера Описание |
Временное ограничение |
|---|---|---|
|
Количество патогенных и вероятно патогенных генетических вариантов, идентифицированных с помощью полногеномного секвенирования длинными ридами (lrWGS)
Временное ограничение: На визите предоставления результатов (Визит 1), до 15 месяцев после включения в исследование.
|
Оценить эффективность полногеномного секвенирования методом длинных прочтений (lrWGS) в выявлении генетических причин у пациентов с эпилептической энцефалопатией и нарушениями развития, которые не получили молекулярного диагноза, несмотря на предыдущий анализ полногеномного секвенирования методом коротких прочтений (srWGS) в рамках французского плана геномной медицины 2025 (PFMG 2025).
|
На визите предоставления результатов (Визит 1), до 15 месяцев после включения в исследование.
|
Соавторы и исследователи
Даты записи исследования
Изучение основных дат
Начало исследования (Оцененный)
Первичное завершение (Оцененный)
Завершение исследования (Оцененный)
Даты регистрации исследования
Первый отправленный
Впервые представлено, что соответствует критериям контроля качества
Первый опубликованный (Действительный)
Обновления учебных записей
Последнее опубликованное обновление (Действительный)
Последнее отправленное обновление, отвечающее критериям контроля качества
Последняя проверка
Дополнительная информация
Термины, связанные с этим исследованием
Ключевые слова
- Высокопроизводительное секвенирование нуклеотидов
- Лекарственно-резистентная эпилепсия
- Длинное чтение секвенирования
- Дизонтогенетическая и эпилептическая энцефалопатия (DEE)
- Секвенирование полного генома длинными ридами (lrWGS)
- Отрицательное секвенирование коротких ридов
- Генетическая диагностика
- Педиатрическая неврология
- Ранняя эпилепсия
- Генетическая эпилепсия
Дополнительные соответствующие термины MeSH
Другие идентификационные номера исследования
- 9964
Планирование данных отдельных участников (IPD)
Планируете делиться данными об отдельных участниках (IPD)?
Информация о лекарствах и устройствах, исследовательские документы
Изучает лекарственный продукт, регулируемый FDA США.
Изучает продукт устройства, регулируемый Управлением по санитарному надзору за качеством пищевых продуктов и медикаментов США.
Эта информация была получена непосредственно с веб-сайта clinicaltrials.gov без каких-либо изменений. Если у вас есть запросы на изменение, удаление или обновление сведений об исследовании, обращайтесь по адресу register@clinicaltrials.gov. Как только изменение будет реализовано на clinicaltrials.gov, оно будет автоматически обновлено и на нашем веб-сайте. .