장기 리드 유전체 시퀀싱을 통해 진단된 발달 및 간질성 뇌병증 (EEPILOG)
장기 판독 유전체 시퀀싱을 통한 발달 및 간질성 뇌병증 진단 - EEPILOG
본 연구는 발달 및 간질성 뇌병증(DEE)을 가진 어린이를 대상으로 하며, 이는 종종 유전적 기원을 가진 심각한 형태의 간질입니다. 현재 표준 진단 도구인 단일 판독 유전체 시퀀싱은 특정 복잡한 DNA 이상을 감지할 수 없기 때문에 영향을 받은 환자의 50% 이상에서 진단을 제공하지 못하고 있습니다.
이 연구의 목적은 장거리 판독 유전체 시퀀싱(lrWGS)이라는 더 새롭고 진보된 기술의 효과를 평가하는 것입니다. 기존 방법과 달리, 이 기술은 매우 긴 DNA 단편을 분석하여 연구자들이 이전에 '보이지 않았던' 유전적 오류를 식별할 수 있도록 합니다.
본 연구는 장거리 판독 시퀀싱이 표준 검사에서 이미 음성 결과를 받은 환자들의 간질 유전적 원인을 성공적으로 식별할 수 있는지 답하고자 합니다. 이러한 누락된 답변을 찾음으로써, 이 연구는 맞춤형 의료 치료를 가능하게 하고, 가족들을 위한 유전 상담을 개선하며, 이러한 복잡한 신경학적 상태가 어떻게 발달하는지에 대한 우리의 이해를 진전시키고자 합니다.
연구 개요
상세 설명
이 연구는 발달 및 간질성 뇌병증(DEEs)에 대한 2차 진단 도구로서 장독서 전체 게놈 시퀀싱(lrWGS)의 임상적 유용성을 평가합니다. 현재 표준 치료인 "단독서" 시퀀싱(srWGS)은 작은 유전자 변이를 식별하는 데 효과적이지만, 복잡한 구조적 변화를 감지하지 못하는 경우가 많아 50% 이상의 환자가 진단을 받지 못하고 있습니다.
기술적으로 lrWGS는 수천 개의 염기로 구성된 DNA 단편을 분석함으로써 이러한 한계를 극복합니다. 이는 연구자들이 게놈의 "암흑 영역"을 매핑하고, 심각한 간질의 숨은 원인인 대규모 삽입, 결실 또는 반복 확장과 같은 구조적 변이(SVs)를 식별할 수 있게 합니다.
이러한 파악하기 어려운 유전적 원인을 식별함으로써, 이 연구는 단순한 진단을 넘어 정밀의학으로 나아가는 것을 목표로 합니다. 명확한 분자적 결과는 표적 약물 선택, 금기 약물 회피, 또는 신흥 유전자 치료 적격성 결정과 같은 임상적 결정에 직접적으로 영향을 미칠 수 있습니다. 또한, 이 프로젝트는 생물정보학적 복잡성과 진단 소요 시간을 평가함으로써 이 기술을 일상적인 임상 실무에 통합하는 타당성을 평가합니다.
연구 유형
등록 (추정된)
연락처 및 위치
연구 연락처
- 이름: Sarah BAER
- 전화번호: +33 +333.88.12.84.98
- 이메일: sarah.baer@chru-strasbourg.fr
연구 장소
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Besançon, 프랑스, 25000
- CHU Jean Minjoz
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연락하다:
- Joanna BELLEVILLE
- 전화번호: +33 +333.81.21.81.46
- 이메일: jgoffeney@chu-besancon.fr
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Reims, 프랑스, 51092
- American Memorial Hospital
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연락하다:
- Mélanie JENNESON
- 전화번호: +33 +333.26.78.78.99
- 이메일: Mjennesson-lyver@chu-reims.fr
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Strasbourg, 프랑스, 67098
- Hopitaux Universitaires de Strasbourg
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연락하다:
- Sarah BAER
- 전화번호: +33 +333.88.12.84.98
- 이메일: sarah.baer@chru-strasbourg.fr
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Vandœuvre-lès-Nancy, 프랑스, 54511
- CHU de Nancy - hôpital d'enfant
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연락하다:
- Mathieu KUCHENBUCH
- 전화번호: +33 +333.83.15.50.85
- 이메일: m.kuchenbuch@chru-nancy.fr
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참여기준
자격 기준
공부할 수 있는 나이
- 어린이
- 성인
건강한 자원 봉사자를 받아들입니다
샘플링 방법
연구 인구
연구 대상 인구는 프랑스 대학 병원 네트워크(CHU) 내의 전문 소아 신경학 및 유전학 부서에서 선정되었습니다.
참가자는 프랑스 게놈 의학 계획 2025(PFMG 2025) 하에 설립된 두 개의 국가 시퀀싱 허브 중 하나인 AURAGEN 플랫폼의 기존 환자 데이터베이스에서 특별히 선정됩니다. 이 개인들은 이미 광범위한 임상 표현형 분석 및 '1차' 게놈 스크리닝을 거쳤지만 분자 진단이 이루어지지 않은 프랑스 전역의 고도로 선별된 아동 하위 인구를 대표합니다.
모집은 주로 스트라스부르 대학 병원(Hôpitaux Universitaires de Strasbourg) 및 협력 임상 현장에서 이루어집니다. 이 센터들은 희귀 및 난치성 소아 간질에 대한 지역 및 국가적 의뢰 지점으로 기능하여, 연구 대상 인구가 국내에서 가장 복잡하고 진단적으로 어려운 발달 및 간질성 뇌병증(DEE) 사례를 포함하도록 보장합니다.
설명
포함 기준:
소아 참가자:
- 나이 < 18세.
- 2022년 ILAE 기준에 따른 발달 및 간질성 뇌병증(DEE) 진단 (심한 간질, 뇌병증성 뇌파, 다제내성 발작 및 신경발달 장애).
- 주산기 저산소증 마커가 없는 뇌 MRI.
- 프랑스 게놈 의학 계획 2025(AURAGEN)를 통한 단일 판독 전체 유전체 시퀀싱(srWGS) 후 음성 분자 진단.
- 참여 센터에 보관된 DNA 샘플 이용 가능.
부모/법적 보호자:
- 나이 ≥ 18세.
- 연구 목적과 위험을 이해할 수 있음.
- 서명 및 날짜가 기재된 동의서.
- 사회 보장 제도 가입자 또는 수혜자.
제외 기준:
소아 참가자:
- 주산기 뇌 저산소증을 지지하는 뇌 MRI 소견.
- 연구 검사 완료를 방해하는 동반 질환.
- 다른 연구의 제외 기간에 있는 참가자.
부모/법적 보호자:
- 정보 제공을 받거나 이해할 수 없는 경우 (예: 생명을 위협하는 응급 상황).
- 사법적 보호, 후견 또는 보조 관리 하에 있는 참가자.
- 공식 통역사가 없는 언어 장벽.
공부 계획
연구는 어떻게 설계됩니까?
디자인 세부사항
코호트 및 개입
그룹/코호트 |
개입 / 치료 |
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DEE 롱 리드
이 코호트는 2022년 국제간질연맹(ILAE) 기준에 따라 정의된 발달 및 간질성 뇌병증(DEE)을 가진 소아 환자(18세 미만)로 구성되어 있습니다. 이 그룹은 프랑스 유전체 의학 계획 2025(AURAGEN 플랫폼)를 통한 단일염기서열 전체 유전체 분석(srWGS)에도 불구하고 이전에 음성 분자 진단 결과를 받은 것으로 특별히 특징지어집니다. 선정은 임상적 우선순위 전략을 따릅니다: 이 연구는 유전적 답변이 없는 모든 적격 DEE 환자를 포함하지만, 조기 발병 형태, 가족력이 있는 사례 또는 현재 치료적 교착 상태(표준 치료가 실패한 환자)를 가진 환자들에게 우선순위가 부여됩니다. 연구는 주산기 뇌손상과 같은 명확한 비유전적 원인이 확인된 사례를 제외하여, 코호트를 높은 확률의 "숨겨진" 유전적 원인에 초점을 맞춥니다. |
환자의 초기 임상 평가 과정에서 추출 및 은행에 보관된 고분자량 DNA를 사용한 롱 리드 전체 유전체 시퀀싱(lrWGS).
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연구는 무엇을 측정합니까?
주요 결과 측정
결과 측정 |
측정값 설명 |
기간 |
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장기간 리드 전체 유전체 시퀀싱(lrWGS)으로 확인된 병원성 및 가능성 있는 병원성 유전자 변이의 수
기간: 등록 후 최대 15개월 후에 진행되는 결과 전달 방문(방문 1)에서.
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프랑스 유전체 의학 계획 2025(PFMG 2025)의 틀 내에서 이전 단일염기서열 유전체 분석(srWGS)에도 불구하고 분자 진단을 얻지 못한 발달 및 간질성 뇌병증 환자에서 유전적 원인을 규명하는 데 있어 장독서 유전체 분석(lrWGS)의 효능을 평가합니다.
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등록 후 최대 15개월 후에 진행되는 결과 전달 방문(방문 1)에서.
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공동 작업자 및 조사자
연구 기록 날짜
연구 주요 날짜
연구 시작 (추정된)
기본 완료 (추정된)
연구 완료 (추정된)
연구 등록 날짜
최초 제출
QC 기준을 충족하는 최초 제출
처음 게시됨 (실제)
연구 기록 업데이트
마지막 업데이트 게시됨 (실제)
QC 기준을 충족하는 마지막 업데이트 제출
마지막으로 확인됨
추가 정보
이 연구와 관련된 용어
키워드
기타 연구 ID 번호
- 9964
개별 참가자 데이터(IPD) 계획
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약물 및 장치 정보, 연구 문서
미국 FDA 규제 의약품 연구
미국 FDA 규제 기기 제품 연구
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