Udviklings- og epileptiske encefalopatier diagnosticeret via langlæsning af genomsekvensering (EEPILOG)
Udviklings- og epileptiske encefalopatier diagnosticeret via langlæsnings-genomsekventering - EEPILOG
Denne undersøgelse fokuserer på børn med udviklings- og epileptisk encefalopati (DEE), en alvorlig form for epilepsi, der ofte har en genetisk oprindelse. I øjeblikket mislykkes standard diagnostiske værktøjer - kendt som kort-læsning genomsekventering - med at give en diagnose for over 50% af de berørte patienter, fordi de ikke kan opdage visse komplekse DNA-abnormaliteter.
Formålet med denne undersøgelse er at evaluere effektiviteten af en nyere, mere avanceret teknologi kaldet lang-læsning genomsekventering (lrWGS). I modsætning til traditionelle metoder analyserer denne teknologi meget lange DNA-fragmenter, hvilket gør det muligt for forskere at identificere genetiske fejl, der tidligere var "usynlige".
Undersøgelsen har til formål at besvare, om lang-læsning sekventering med succes kan identificere den genetiske årsag til epilepsi hos patienter, der allerede har modtaget et negativt resultat fra standard testning. Ved at finde disse manglende svar søger forskningen at muliggøre personlig medicinsk behandling, forbedre genetisk rådgivning til familier og fremme vores forståelse af, hvordan disse komplekse neurologiske tilstande udvikler sig.
Studieoversigt
Status
Intervention / Behandling
Detaljeret beskrivelse
Denne undersøgelse vurderer den kliniske nytte af Long-read Whole Genome Sequencing (lrWGS) som et sekundært diagnostisk værktøj for udviklings- og epileptiske encefalopatier (DEEs). Mens den nuværende standardbehandling "short-read" sekventering (srWGS) er effektiv til at identificere små genetiske mutationer, mislykkes den ofte med at opdage komplekse strukturelle ændringer, hvilket efterlader over 50% af patienterne uden en diagnose.
Teknisk set overvinder lrWGS disse begrænsninger ved at analysere DNA-fragmenter, der er tusindvis af baser lange. Dette gør det muligt for forskere at kortlægge "mørke regioner" i genomet og identificere strukturelle varianter (SVs), såsom store indsættelser, sletninger eller gentagelsesudvidelser, som ofte er de skjulte årsager til svær epilepsi.
Ved at identificere disse svært tilgængelige genetiske drivere sigter undersøgelsen mod at bevæge sig ud over en simpel diagnose og hen imod præcisionsmedicin. Et klart molekylært resultat kan direkte påvirke kliniske beslutninger, såsom valg af målrettede lægemidler, undgåelse af kontraindicerede lægemidler eller afgørelse af berettigelse til nye genterapier. Derudover vurderer projektet muligheden for at integrere denne teknologi i rutinemæssig klinisk praksis ved at evaluere bioinformatisk kompleksitet og diagnostiske behandlingstider.
Undersøgelsestype
Tilmelding (Anslået)
Kontakter og lokationer
Studiekontakt
- Navn: Sarah BAER
- Telefonnummer: +33 +333.88.12.84.98
- E-mail: sarah.baer@chru-strasbourg.fr
Studiesteder
-
-
-
Besançon, Frankrig, 25000
- Chu Jean Minjoz
-
Kontakt:
- Joanna BELLEVILLE
- Telefonnummer: +33 +333.81.21.81.46
- E-mail: jgoffeney@chu-besancon.fr
-
Reims, Frankrig, 51092
- American Memorial Hospital
-
Kontakt:
- Mélanie JENNESON
- Telefonnummer: +33 +333.26.78.78.99
- E-mail: Mjennesson-lyver@chu-reims.fr
-
Strasbourg, Frankrig, 67098
- Hopitaux universitaires de Strasbourg
-
Kontakt:
- Sarah BAER
- Telefonnummer: +33 +333.88.12.84.98
- E-mail: sarah.baer@chru-strasbourg.fr
-
Vandœuvre-lès-Nancy, Frankrig, 54511
- CHU de Nancy - hôpital d'enfant
-
Kontakt:
- Mathieu KUCHENBUCH
- Telefonnummer: +33 +333.83.15.50.85
- E-mail: m.kuchenbuch@chru-nancy.fr
-
-
Deltagelseskriterier
Berettigelseskriterier
Aldre berettiget til at studere
- Barn
- Voksen
Tager imod sunde frivillige
Prøveudtagningsmetode
Studiebefolkning
Studiepopulationen er trukket fra specialiserede pædiatriske neurologi- og genetikaferinger inden for det franske universitetshospitalnetværk (CHU).
Deltagerne er specifikt hentet fra den eksisterende patientbase på AURAGEN-platformen, en af de to nationale sekventeringscentre etableret under den franske Genomic Medicine Plan 2025 (PFMG 2025). Disse personer repræsenterer en højt udvalgt subpopulation af børn over hele Frankrig, der allerede har gennemgået omfattende klinisk fenotypering og "førstelinje" genomisk screening, men stadig mangler en molekylær diagnose.
Rekrutteringen foregår primært på Strasbourg Universitetshospital (Hôpitaux Universitaires de Strasbourg) og samarbejdende kliniske centre. Disse centre fungerer som regionale og nationale henvisningspunkter for sjældne og refraktære barneepilepsier, hvilket sikrer, at studiepopulationen inkluderer de mest komplekse og diagnostisk udfordrende tilfælde af udviklingsmæssig og epileptisk encefalopati (DEE) i landet.
Beskrivelse
Inklusionskriterier:
Børnedeltagere:
- Alder < 18 år.
- Diagnose med Udviklings- og Epileptisk Encefalopati (DEE) ifølge 2022 ILAE-kriterier (svær epilepsi, encefalopatisk EEG, flere lægemiddelresistente anfald og neuroudviklingsforstyrrelse).
- Hjerne-MRI uden markører for perinatal anoxi.
- Negativ molekylær diagnose efter kort-læsning Hele Genom Sekventering (srWGS) via den franske Genomic Medicine Plan 2025 (AURAGEN).
- Tilgængelig banket DNA på et deltagende center.
Forældre/Retmæssige Værger:
- Alder ≥ 18 år.
- I stand til at forstå studieformål og risici.
- Underskrevet og dateret informeret samtykke.
- Tilknyttet eller modtager af en socialsikringsordning.
Eksklusionskriterier:
Børnedeltagere:
- Hjerne-MRI fund der tyder på perinatal cerebral anoxi.
- Samtidige sygdomme der forhindrer gennemførelse af protokoleundersøgelser.
- Person der i øjeblikket er i en eksklusionsperiode fra et andet studie.
Forældre/Retmæssige Værger:
- Manglende evne til at modtage eller forstå informeret information (f.eks. livstruende nødsituation).
- Person under retsligt beskyttelse, formynderskab eller kuratel.
- Sprogbarrierer hvor en officiel tolk ikke er tilgængelig.
Studieplan
Hvordan er undersøgelsen tilrettelagt?
Design detaljer
Kohorter og interventioner
Gruppe / kohorte |
Intervention / Behandling |
|---|---|
|
DEE Long-read
Denne kohorte består af pædiatriske patienter (under 18 år) med Udviklings- og Epileptisk Encefalopati (DEE) som defineret af ILAE-kriterierne fra 2022. Gruppen er specifikt karakteriseret ved en tidligere negativ molekylær diagnose på trods af analyse via short-read Whole Genome Sequencing (srWGS) gennem den franske Genomic Medicine Plan 2025 (AURAGEN-platform). Udvælgelsen følger en klinisk prioriteringsstrategi: mens studiet inkluderer alle kvalificerede DEE-patienter uden et genetisk svar, gives prioritet til dem med tidligt debutformer, familiære tilfælde eller nuværende terapeutisk impasse (patienter for hvem standardbehandlinger har fejlet). Studiet udelukker tilfælde, hvor en klar ikke-genetisk årsag er identificeret, såsom perinatal hjerneskade, hvilket fokuserer kohorten på høj-sandsynlighed "skjulte" genetiske årsager. |
Lang-læsning Hele Genom Sekventering (lrWGS) ved brug af højmolekylærvægt-DNA, der tidligere er ekstraheret og opbevaret under patientens indledende kliniske udredning.
|
Hvad måler undersøgelsen?
Primære resultatmål
Resultatmål |
Foranstaltningsbeskrivelse |
Tidsramme |
|---|---|---|
|
Antallet af patogene og sandsynligvis patogene genetiske varianter identificeret ved langlæsning af hele genomet (lrWGS)
Tidsramme: Ved resultatafleveringsbesøget (Besøg 1), op til 15 måneder efter indskrivning.
|
Vurder effektiviteten af long-read whole genome sequencing (lrWGS) til at identificere genetiske årsager hos patienter med udviklings- og epileptisk encefalopati, som ikke opnåede en molekylær diagnose på trods af tidligere short-read whole genome sequencing (srWGS)-analyse inden for rammerne af den franske Genomic Medicine Plan 2025 (PFMG 2025).
|
Ved resultatafleveringsbesøget (Besøg 1), op til 15 måneder efter indskrivning.
|
Samarbejdspartnere og efterforskere
Datoer for undersøgelser
Studer store datoer
Studiestart (Anslået)
Primær færdiggørelse (Anslået)
Studieafslutning (Anslået)
Datoer for studieregistrering
Først indsendt
Først indsendt, der opfyldte QC-kriterier
Først opslået (Faktiske)
Opdateringer af undersøgelsesjournaler
Sidste opdatering sendt (Faktiske)
Sidste opdatering indsendt, der opfyldte kvalitetskontrolkriterier
Sidst verificeret
Mere information
Begreber relateret til denne undersøgelse
Nøgleord
Yderligere relevante MeSH-vilkår
Andre undersøgelses-id-numre
- 9964
Plan for individuelle deltagerdata (IPD)
Planlægger du at dele individuelle deltagerdata (IPD)?
Lægemiddel- og udstyrsoplysninger, undersøgelsesdokumenter
Studerer et amerikansk FDA-reguleret lægemiddelprodukt
Studerer et amerikansk FDA-reguleret enhedsprodukt
Disse oplysninger blev hentet direkte fra webstedet clinicaltrials.gov uden ændringer. Hvis du har nogen anmodninger om at ændre, fjerne eller opdatere dine undersøgelsesoplysninger, bedes du kontakte register@clinicaltrials.gov. Så snart en ændring er implementeret på clinicaltrials.gov, vil denne også blive opdateret automatisk på vores hjemmeside .