Encefalopatias do Desenvolvimento e Epilépticas Diagnosticadas Através de Sequenciação Genómica de Leitura Longa (EEPILOG)
Encefalopatias do Desenvolvimento e Epilépticas Diagnosticadas por Sequenciação Genómica de Leitura Longa - EEPILOG
Este estudo centra-se em crianças com Encefalopatia Epilética e do Desenvolvimento (DEE), uma forma grave de epilepsia que frequentemente tem uma origem genética. Atualmente, as ferramentas de diagnóstico padrão - conhecidas como sequenciação do genoma de leitura curta - não conseguem fornecer um diagnóstico para mais de 50% dos pacientes afetados porque não conseguem detetar certas anomalias complexas do ADN.
O objetivo deste estudo é avaliar a eficácia de uma tecnologia mais recente e avançada chamada Sequenciação do Genoma de Leitura Longa (lrWGS). Ao contrário dos métodos tradicionais, esta tecnologia analisa fragmentos muito longos de ADN, permitindo aos investigadores identificar erros genéticos que antes eram "invisíveis".
O estudo pretende responder se a Sequenciação de Leitura Longa pode identificar com sucesso a causa genética da epilepsia em pacientes que já receberam um resultado negativo dos testes padrão. Ao encontrar estas respostas em falta, a investigação procura permitir tratamentos médicos personalizados, melhorar o aconselhamento genético para as famílias e avançar na nossa compreensão de como estas condições neurológicas complexas se desenvolvem.
Visão geral do estudo
Status
Intervenção / Tratamento
Descrição detalhada
Este estudo avalia a utilidade clínica do Sequenciamento do Genoma Completo de Leitura Longa (lrWGS) como ferramenta de diagnóstico secundário para Encefalopatias do Desenvolvimento e Epilepsia (DEEs). Embora o sequenciamento padrão de "leitura curta" (srWGS) seja eficaz na identificação de pequenas mutações genéticas, muitas vezes falha na deteção de alterações estruturais complexas, deixando mais de 50% dos pacientes sem diagnóstico.
Tecnicamente, o lrWGS supera estas limitações ao analisar fragmentos de DNA com milhares de bases de comprimento. Isto permite aos investigadores mapear "regiões escuras" do genoma e identificar Variantes Estruturais (VEs), como grandes inserções, deleções ou expansões de repetições, que são frequentemente as causas ocultas de epilepsia grave.
Ao identificar estes fatores genéticos elusivos, o estudo visa ir além de um simples diagnóstico em direção à medicina de precisão. Um resultado molecular claro pode influenciar diretamente decisões clínicas, como a seleção de medicamentos direcionados, evitar fármacos contraindicados ou determinar a elegibilidade para terapias genéticas emergentes. Além disso, o projeto avalia a viabilidade de integrar esta tecnologia na prática clínica de rotina, avaliando a complexidade bioinformática e os tempos de resposta diagnóstica.
Tipo de estudo
Inscrição (Estimado)
Contactos e Locais
Contato de estudo
- Nome: Sarah BAER
- Número de telefone: +33 +333.88.12.84.98
- E-mail: sarah.baer@chru-strasbourg.fr
Locais de estudo
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Besançon, França, 25000
- Chu Jean Minjoz
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Contato:
- Joanna BELLEVILLE
- Número de telefone: +33 +333.81.21.81.46
- E-mail: jgoffeney@chu-besancon.fr
-
Reims, França, 51092
- American Memorial Hospital
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Contato:
- Mélanie JENNESON
- Número de telefone: +33 +333.26.78.78.99
- E-mail: Mjennesson-lyver@chu-reims.fr
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Strasbourg, França, 67098
- Hopitaux Universitaires de Strasbourg
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Contato:
- Sarah BAER
- Número de telefone: +33 +333.88.12.84.98
- E-mail: sarah.baer@chru-strasbourg.fr
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Vandœuvre-lès-Nancy, França, 54511
- CHU de Nancy - hôpital d'enfant
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Contato:
- Mathieu KUCHENBUCH
- Número de telefone: +33 +333.83.15.50.85
- E-mail: m.kuchenbuch@chru-nancy.fr
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Critérios de participação
Critérios de elegibilidade
Idades elegíveis para estudo
- Filho
- Adulto
Aceita Voluntários Saudáveis
Método de amostragem
População do estudo
A população do estudo é recrutada a partir de departamentos especializados de neurologia pediátrica e genética dentro da rede hospitalar universitária francesa (CHU).
Os participantes são especificamente recrutados da base de pacientes existente da plataforma AURAGEN, um dos dois centros nacionais de sequenciação estabelecidos no âmbito do Plano Francês de Medicina Genómica 2025 (PFMG 2025). Estes indivíduos representam uma subpopulação altamente selecionada de crianças em toda a França que já foram submetidas a uma extensa fenotipagem clínica e a um rastreio genómico "de primeira linha", mas que permanecem sem um diagnóstico molecular.
O recrutamento ocorre principalmente no Hospital Universitário de Estrasburgo (Hôpitaux Universitaires de Strasbourg) e em locais clínicos colaboradores. Estes centros servem como pontos de referência regionais e nacionais para epilepsias infantis raras e refractárias, garantindo que a população do estudo inclua os casos mais complexos e desafiantes do ponto de vista diagnóstico de Encefalopatia do Desenvolvimento e Epiléptica (DEE) no país.
Descrição
Critérios de Inclusão:
Participantes Pediátricos:
- Idade < 18 anos.
- Diagnóstico de Encefalopatia do Desenvolvimento e Epilepsia (DEE) de acordo com os critérios da ILAE de 2022 (epilepsia grave, EEG encefalopático, crises epiléticas múltiplas resistentes a fármacos e perturbação do neurodesenvolvimento).
- Ressonância Magnética Cerebral sem marcadores de anóxia perinatal.
- Diagnóstico molecular negativo após Sequenciação do Genoma Completo de leitura curta (srWGS) através do Plano de Medicina Genómica Francês 2025 (AURAGEN).
- DNA armazenado disponível num centro participante.
Pais/Tutores Legais:
- Idade ≥ 18 anos.
- Capacidade para compreender os objetivos e riscos do estudo.
- Consentimento informado assinado e datado.
- Afiliação ou beneficiário de um regime de segurança social.
Critérios de Exclusão:
Participantes Pediátricos:
- Achados na Ressonância Magnética Cerebral sugestivos de anóxia cerebral perinatal.
- Doenças intercorrentes que impeçam a realização dos exames do protocolo.
- Sujeito atualmente em período de exclusão de outro estudo.
Pais/Tutores Legais:
- Incapacidade de receber ou compreender informação informada (ex.: emergência com risco de vida).
- Sujeito sob proteção judicial, tutela ou curatela.
- Barreiras linguísticas sem disponibilidade de intérprete oficial.
Plano de estudo
Como o estudo é projetado?
Detalhes do projeto
Coortes e Intervenções
Grupo / Coorte |
Intervenção / Tratamento |
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DEE Long-read
Esta coorte é composta por pacientes pediátricos (menores de 18 anos) com Encefalopatia do Desenvolvimento e Epilepsia (EDE), conforme definido pelos critérios da ILAE de 2022. O grupo é especificamente caracterizado por um diagnóstico molecular negativo prévio, apesar da análise através de Sequenciação do Genoma Completo de leitura curta (srWGS) pelo Plano de Medicina Genómica Francês 2025 (plataforma AURAGEN). A seleção segue uma estratégia de priorização clínica: embora o estudo inclua todos os pacientes elegíveis com EDE sem resposta genética, a prioridade é dada àqueles com formas de início precoce, casos familiares ou impasse terapêutico atual (pacientes para os quais os tratamentos padrão falharam). O estudo exclui casos em que uma causa não genética clara é identificada, como lesão cerebral perinatal, focando a coorte em etiologias genéticas "ocultas" de alta probabilidade. |
Sequenciamento do Genoma Completo por Leitura Longa (lrWGS) utilizando DNA de alto peso molecular previamente extraído e armazenado durante a avaliação clínica inicial do paciente.
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O que o estudo está medindo?
Medidas de resultados primários
Medida de resultado |
Descrição da medida |
Prazo |
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Número de variantes genéticas patogénicas e provavelmente patogénicas identificadas por sequenciação do genoma completo de leitura longa (lrWGS)
Prazo: Na visita de entrega dos resultados (Visita 1), até 15 meses após a inscrição.
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Avaliar a eficácia do sequenciamento do genoma completo de leitura longa (lrWGS) na identificação de causas genéticas em doentes com encefalopatia epilética e do desenvolvimento que não obtiveram um diagnóstico molecular apesar de uma análise prévia de sequenciamento do genoma completo de leitura curta (srWGS) no âmbito do Plano Francês de Medicina Genómica 2025 (PFMG 2025).
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Na visita de entrega dos resultados (Visita 1), até 15 meses após a inscrição.
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Colaboradores e Investigadores
Datas de registro do estudo
Datas Principais do Estudo
Início do estudo (Estimado)
Conclusão Primária (Estimado)
Conclusão do estudo (Estimado)
Datas de inscrição no estudo
Enviado pela primeira vez
Enviado pela primeira vez que atendeu aos critérios de CQ
Primeira postagem (Real)
Atualizações de registro de estudo
Última Atualização Postada (Real)
Última atualização enviada que atendeu aos critérios de controle de qualidade
Última verificação
Mais Informações
Termos relacionados a este estudo
Palavras-chave
- Sequenciamento de nucleotídeos de alto rendimento
- Epilepsia Resistente a Drogas
- Sequenciamento de leitura longa
- Encefalopatia do Desenvolvimento e Epiléptica (DEE)
- Sequenciação de Genoma Completo de Leitura Longa (lrWGS)
- Sequenciação de Leitura Curta Negativa
- Diagnóstico Genético
- Neurologia Pediátrica
- Epilepsia de Início Precoce
- Epilepsia Genética
Termos MeSH relevantes adicionais
Outros números de identificação do estudo
- 9964
Plano para dados de participantes individuais (IPD)
Planeja compartilhar dados de participantes individuais (IPD)?
Informações sobre medicamentos e dispositivos, documentos de estudo
Estuda um medicamento regulamentado pela FDA dos EUA
Estuda um produto de dispositivo regulamentado pela FDA dos EUA
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