Encefalopatie dello Sviluppo ed Epilettiche Diagnosticate Tramite Sequenziamento Genomico a Lettura Lunga (EEPILOG)
Encefalopatie dello Sviluppo ed Epilettiche Diagnosticate Tramite Sequenziamento Genomico a Lettura Lunga - EEPILOG
Questo studio si concentra sui bambini con Encefalopatia Epilettica e dello Sviluppo (DEE), una forma grave di epilessia che spesso ha un'origine genetica. Attualmente, gli strumenti diagnostici standard, noti come sequenziamento genomico a lettura breve, non riescono a fornire una diagnosi per oltre il 50% dei pazienti affetti perché non sono in grado di rilevare alcune anomalie complesse del DNA.
Lo scopo di questo studio è valutare l'efficacia di una tecnologia più recente e avanzata chiamata Sequenziamento Genomico a Lettura Lunga (lrWGS). A differenza dei metodi tradizionali, questa tecnologia analizza frammenti di DNA molto lunghi, consentendo ai ricercatori di identificare errori genetici che in precedenza erano "invisibili".
Lo studio mira a rispondere se il Sequenziamento a Lettura Lunga possa identificare con successo la causa genetica dell'epilessia in pazienti che hanno già ricevuto un risultato negativo dai test standard. Trovando queste risposte mancanti, la ricerca cerca di consentire trattamenti medici personalizzati, migliorare la consulenza genetica per le famiglie e far progredire la nostra comprensione di come si sviluppano queste complesse condizioni neurologiche.
Panoramica dello studio
Stato
Intervento / Trattamento
Descrizione dettagliata
Questo studio valuta l'utilità clinica del sequenziamento dell'intero genoma a lettura lunga (lrWGS) come strumento diagnostico secondario per le encefalopatie epilettiche e dello sviluppo (DEE). Mentre l'attuale standard di cura del sequenziamento a "lettura breve" (srWGS) è efficace nell'identificare piccole mutazioni genetiche, spesso non riesce a rilevare cambiamenti strutturali complessi, lasciando oltre il 50% dei pazienti senza una diagnosi.
Tecnicamente, lrWGS supera queste limitazioni analizzando frammenti di DNA lunghi migliaia di basi. Ciò consente ai ricercatori di mappare le "regioni oscure" del genoma e identificare varianti strutturali (SV), come grandi inserzioni, delezioni o espansioni di ripetizioni, che sono spesso le cause nascoste dell'epilessia grave.
Identificando questi elusivi fattori genetici, lo studio mira a superare la semplice diagnosi verso la medicina di precisione. Un chiaro risultato molecolare può influenzare direttamente le decisioni cliniche, come la selezione di farmaci mirati, l'evitamento di farmaci controindicati o la determinazione dell'idoneità per le terapie geniche emergenti. Inoltre, il progetto valuta la fattibilità di integrare questa tecnologia nella pratica clinica di routine valutando la complessità bioinformatica e i tempi di risposta diagnostica.
Tipo di studio
Iscrizione (Stimato)
Contatti e Sedi
Contatto studio
- Nome: Sarah BAER
- Numero di telefono: +33 +333.88.12.84.98
- Email: sarah.baer@chru-strasbourg.fr
Luoghi di studio
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Besançon, Francia, 25000
- Chu Jean Minjoz
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Contatto:
- Joanna BELLEVILLE
- Numero di telefono: +33 +333.81.21.81.46
- Email: jgoffeney@chu-besancon.fr
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Reims, Francia, 51092
- American Memorial Hospital
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Contatto:
- Mélanie JENNESON
- Numero di telefono: +33 +333.26.78.78.99
- Email: Mjennesson-lyver@chu-reims.fr
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Strasbourg, Francia, 67098
- Hopitaux universitaires de Strasbourg
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Contatto:
- Sarah BAER
- Numero di telefono: +33 +333.88.12.84.98
- Email: sarah.baer@chru-strasbourg.fr
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Vandœuvre-lès-Nancy, Francia, 54511
- CHU de Nancy - hôpital d'enfant
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Contatto:
- Mathieu KUCHENBUCH
- Numero di telefono: +33 +333.83.15.50.85
- Email: m.kuchenbuch@chru-nancy.fr
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Criteri di partecipazione
Criteri di ammissibilità
Età idonea allo studio
- Bambino
- Adulto
Accetta volontari sani
Metodo di campionamento
Popolazione di studio
La popolazione dello studio è tratta dai dipartimenti specializzati di neurologia pediatrica e genetica all'interno della rete ospedaliera universitaria francese (CHU).
I partecipanti sono specificamente selezionati dalla base pazienti esistente della piattaforma AURAGEN, uno dei due hub nazionali di sequenziamento stabiliti nell'ambito del Piano Francese di Medicina Genomica 2025 (PFMG 2025). Questi individui rappresentano una sottopopolazione altamente selezionata di bambini in tutta la Francia che hanno già subito un ampio fenotipaggio clinico e uno screening genomico di "prima linea", ma rimangono senza una diagnosi molecolare.
Il reclutamento avviene principalmente presso l'Ospedale Universitario di Strasburgo (Hôpitaux Universitaires de Strasbourg) e i siti clinici collaboratori. Questi centri fungono da punti di riferimento regionali e nazionali per le epilessie infantili rare e refrattarie, garantendo che la popolazione dello studio includa i casi più complessi e diagnosticamente impegnativi di Encefalopatia dello Sviluppo ed Epilettica (DEE) nel paese.
Descrizione
Criteri di inclusione:
Partecipanti pediatrici:
- Età < 18 anni.
- Diagnosi di Encefalopatia dello Sviluppo ed Epilettica (DEE) secondo i criteri ILAE 2022 (epilessia grave, EEG encefalopatico, crisi farmacoresistenti multiple e disturbo dello sviluppo neurologico).
- Risonanza magnetica cerebrale senza marcatori di anossia perinatale.
- Diagnosi molecolare negativa dopo sequenziamento dell'intero genoma a lettura breve (srWGS) tramite il Piano di Medicina Genomica Francese 2025 (AURAGEN).
- DNA conservato disponibile presso un centro partecipante.
Genitori/Tutori Legali:
- Età ≥ 18 anni.
- In grado di comprendere gli obiettivi e i rischi dello studio.
- Consenso informato firmato e datato.
- Affiliati o beneficiari di un regime di sicurezza sociale.
Criteri di esclusione:
Partecipanti pediatrici:
- Risultati della risonanza magnetica cerebrale a favore di anossia cerebrale perinatale.
- Malattie intercorrenti che impediscono il completamento degli esami del protocollo.
- Soggetto attualmente in un periodo di esclusione da un altro studio.
Genitori/Tutori Legali:
- Incapacità di ricevere o comprendere le informazioni (es. emergenza pericolosa per la vita).
- Soggetto sotto protezione giudiziaria, tutela o curatela.
- Barriere linguistiche in assenza di un interprete ufficiale.
Piano di studio
Come è strutturato lo studio?
Dettagli di progettazione
Coorti e interventi
Gruppo / Coorte |
Intervento / Trattamento |
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DEE Long-read
Questa coorte è composta da pazienti pediatrici (sotto i 18 anni) con Encefalopatia Epilettica dello Sviluppo (DEE) come definito dai criteri ILAE 2022. Il gruppo è specificamente caratterizzato da una precedente diagnosi molecolare negativa nonostante l'analisi tramite sequenziamento dell'intero genoma a lettura breve (srWGS) attraverso il Piano di Medicina Genomica Francese 2025 (piattaforma AURAGEN). La selezione segue una strategia di priorità clinica: sebbene lo studio includa tutti i pazienti DEE idonei senza una risposta genetica, la priorità è data a quelli con forme a esordio precoce, casi familiari o attuale impasse terapeutico (pazienti per i quali i trattamenti standard hanno fallito). Lo studio esclude i casi in cui è identificata una chiara causa non genetica, come il danno cerebrale perinatale, concentrando la coorte su eziologie genetiche "nascoste" ad alta probabilità. |
Sequenziamento dell'intero genoma con letture lunghe (lrWGS) utilizzando DNA ad alto peso molecolare precedentemente estratto e conservato durante la valutazione clinica iniziale del paziente.
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Cosa sta misurando lo studio?
Misure di risultato primarie
Misura del risultato |
Misura Descrizione |
Lasso di tempo |
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Numero di varianti genetiche patogene e probabilmente patogene identificate mediante sequenziamento dell'intero genoma a lettura lunga (lrWGS)
Lasso di tempo: Alla visita di consegna dei risultati (Visita 1), fino a 15 mesi dopo l'arruolamento.
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Valutare l'efficacia del sequenziamento dell'intero genoma a lettura lunga (lrWGS) nell'identificazione delle cause genetiche in pazienti affetti da encefalopatia epilettica e dello sviluppo che non hanno ottenuto una diagnosi molecolare nonostante precedenti analisi di sequenziamento dell'intero genoma a lettura breve (srWGS) nell'ambito del Piano Francese di Medicina Genomica 2025 (PFMG 2025).
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Alla visita di consegna dei risultati (Visita 1), fino a 15 mesi dopo l'arruolamento.
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Collaboratori e investigatori
Studiare le date dei record
Studia le date principali
Inizio studio (Stimato)
Completamento primario (Stimato)
Completamento dello studio (Stimato)
Date di iscrizione allo studio
Primo inviato
Primo inviato che soddisfa i criteri di controllo qualità
Primo Inserito (Effettivo)
Aggiornamenti dei record di studio
Ultimo aggiornamento pubblicato (Effettivo)
Ultimo aggiornamento inviato che soddisfa i criteri QC
Ultimo verificato
Maggiori informazioni
Termini relativi a questo studio
Parole chiave
- Sequenziamento di nucleotidi ad alto rendimento
- Epilessia farmacoresistente
- Sequenziamento a lettura a lungo
- Encefalopatia Evolutiva ed Epilettica (DEE)
- Sequenziamento dell'intero genoma con letture lunghe (lrWGS)
- Sequenziamento Negative Short-read
- Diagnosi Genetica
- Neurologia Pediatrica
- Epilessia ad Esordio Precoce
- Epilessia Genetica
Termini MeSH pertinenti aggiuntivi
Altri numeri di identificazione dello studio
- 9964
Piano per i dati dei singoli partecipanti (IPD)
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Informazioni su farmaci e dispositivi, documenti di studio
Studia un prodotto farmaceutico regolamentato dalla FDA degli Stati Uniti
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