唾液サンプルによる口腔塗抹からのDNAを用いた高深度エクソームシーケンス。 (SEPASA)
血液でのゲノム配列決定が決定的でなかった、症候性神経発達障害または知的発達障害を有する患者の病因評価における、口腔スメアによる唾液サンプルからのDNAを用いた高深度エクソームシーケンスの診断性能の評価
技術が進歩しているにもかかわらず、神経発達障害(NDD)の患者の約50%から60%にしか遺伝的病因が特定されておらず、症候性NDDおよびIDDサブグループでは診断率が高くなっています。 しかし、正確な病因診断を特定することは、患者ケアを最適化し、予後を明確にし、標的治療を検討し、家族を適切なリソースやサポートに紹介し、親族に遺伝カウンセリングを提供するために不可欠です。 症候性NDDおよびIDDの病因評価の一部として通常提供される検査には、DNAマイクロアレイ分析、脆弱X症候群の検査、血液サンプルからのゲノムシーケンシングが含まれます。 この評価が陰性である場合、原因は通常不明のままです。
モザイクゲノム異常(または接合体後変異)は、現在の診断遺伝子検査で陰性結果の一般的な原因であり、皮膚疾患以外ではまだ完全に探求されていない研究分野です。 モザイクゲノム異常を特定することは、低レベルのモザイク性を検出する難しさや、血液組織に変異が存在しない場合に関心のある組織へのアクセスが限られているため、技術的に複雑なままです。
高深度エクソームシーケンシングは、低レベルのモザイク性を検出するための選択される技術です。 NNDの場合、影響を受けた組織は利用できないため、口腔上皮は血液の興味深い代替手段であり、容易にアクセスでき、安価です。
私たちの研究の目的は、参照分析(血液のゲノムシーケンシング)が決定的でなかったIDDまたは症候性NDDの患者の病因評価において、口腔スワブから抽出したDNAに対する高深度エクソームシーケンシング技術の診断率を評価することです。
調査の概要
研究の種類
入学 (推定)
連絡先と場所
研究連絡先
- 名前:Juliette PIARD, Pr
- 電話番号:33381218187
- メール:jpiard@chu-besancon.fr
参加基準
適格基準
就学可能な年齢
- 子
- 大人
- 高齢者
健康ボランティアの受け入れ
サンプリング方法
調査対象母集団
説明
適格基準:
- 症候群性神経発達障害(NDD)または知的発達障害(IDD)を有する患者
- 血液によるトリオゲノムシーケンシングで決定的な結果が得られなかった
- 男性および女性
- 全年齢
- 本研究への参加に異議がない
- フランスの社会保障制度に加入している、またはその制度の受益者である
除外基準:
- 妊娠中または授乳中の女性
- 司法または行政決定により自由を奪われた者;強制的な精神科治療を受けている者;研究以外の目的で医療・社会福祉施設に入所している者
- 他の研究の除外期間中にある被験者、または「全国ボランティア登録簿」に登録されている被験者
- 予備的病因評価で遺伝的原因が特定された
- フェノコピー:TNDの他の可能性が高い非遺伝的原因(周産期無酸素症、感染症、外傷など)
- 健康保険に加入していない患者
- 研究への協力が見込めない患者、および/または研究者による協力度の低さが予想される患者
研究計画
研究はどのように設計されていますか?
デザインの詳細
この研究は何を測定していますか?
主要な結果の測定
結果測定 |
時間枠 |
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患者の症状を説明するACMG分類に基づくクラス4(おそらく病原性)またはクラス5(病原性)の少なくとも1つの変異を実証することにより、明確な遺伝的原因を特定する。
時間枠:2年
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2年
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協力者と研究者
研究記録日
主要日程の研究
研究開始 (推定)
一次修了 (推定)
研究の完了 (推定)
試験登録日
最初に提出
QC基準を満たした最初の提出物
最初の投稿 (実際)
学習記録の更新
投稿された最後の更新 (実際)
QC基準を満たした最後の更新が送信されました
最終確認日
詳しくは
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