Séquençage exomique à haute profondeur sur l'ADN provenant d'un échantillon salivaire par frottis buccal. (SEPASA)

Malgré les progrès technologiques, une étiologie génétique n'a été identifiée que chez environ 50 % à 60 % des patients atteints de troubles du neurodéveloppement (TND), avec un rendement diagnostique plus élevé dans les sous-groupes de TND syndromiques et de déficience intellectuelle et du développement (DID). Cependant, identifier un diagnostic étiologique précis est essentiel pour optimiser la prise en charge des patients, clarifier leur pronostic, envisager des thérapies ciblées, orienter les familles vers des ressources et un soutien appropriés, et fournir un conseil génétique aux apparentés. Les tests généralement proposés dans le cadre de l'évaluation étiologique des TND syndromiques et de la DID incluent l'analyse par puce à ADN, le test du syndrome de l'X fragile et le séquençage du génome à partir d'un échantillon sanguin. Lorsque cette évaluation reste négative, la cause demeure généralement inconnue.

Les anomalies génomiques en mosaïque (ou variations post-zygotiques) sont une cause fréquente de résultats négatifs dans les tests génétiques diagnostiques actuels et représentent un champ de recherche qui reste encore à explorer pleinement en dehors des pathologies cutanées. L'identification des anomalies génomiques en mosaïque demeure techniquement complexe en raison de la difficulté à détecter de faibles niveaux de mosaïcisme et de l'accès limité au tissu d'intérêt lorsque la variation est absente du tissu sanguin.

Le séquençage de l'exome à haute profondeur est la technique de choix pour détecter de faibles niveaux de mosaïcisme. Dans le cas des TND, comme le tissu affecté n'est pas disponible, l'épithélium buccal est une alternative intéressante au sang, car il est facilement accessible et peu coûteux.

L'objectif de notre étude est d'évaluer le rendement diagnostique de la technologie de séquençage de l'exome à haute profondeur sur un ADN extrait d'un écouvillon buccal dans l'évaluation étiologique des patients atteints de DID ou de TND syndromique dont l'analyse de référence (séquençage du génome sur sang) s'est avérée non concluante.