Sequenciamento Exómico de Alta Profundidade em DNA de uma Amostra Salivar por Esfregaço Bucal. (SEPASA)

Apesar dos avanços tecnológicos, uma etiologia genética foi identificada em apenas cerca de 50% a 60% dos pacientes com perturbações do neurodesenvolvimento (PND), com um rendimento diagnóstico superior nos subgrupos de PND sindrómica e DDI. No entanto, identificar um diagnóstico etiológico preciso é essencial para otimizar os cuidados ao paciente, esclarecer o seu prognóstico, considerar terapias direcionadas, encaminhar as famílias para recursos e apoios adequados e fornecer aconselhamento genético aos familiares. Os testes normalmente oferecidos como parte da avaliação etiológica das PND sindrómicas e DDI incluem análise de microarray de DNA, teste para a síndrome do X frágil e sequenciação do genoma a partir de uma amostra de sangue. Quando esta avaliação permanece negativa, a causa geralmente permanece desconhecida.

Anomalias genómicas em mosaico (ou variações pós-zigóticas) são uma causa comum de resultados negativos nos testes genéticos de diagnóstico atuais e representam um campo de investigação que ainda não foi totalmente explorado fora das doenças de pele. Identificar anomalias genómicas em mosaico permanece tecnicamente complexo devido à dificuldade de detetar baixos níveis de mosaicismo e ao acesso limitado ao tecido de interesse quando a variação está ausente no tecido sanguíneo.

A sequenciação do exoma de alta profundidade é a técnica de eleição para detetar baixos níveis de mosaicismo. No caso das PND, como o tecido afetado não está disponível, o epitélio bucal é uma alternativa interessante ao sangue, uma vez que é de fácil acesso e de baixo custo.

O objetivo do nosso estudo é avaliar o rendimento diagnóstico da tecnologia de sequenciação do exoma de alta profundidade num ADN extraído de uma zaragatoa bucal na avaliação etiológica de pacientes com DDI ou PND sindrómica cuja análise de referência (sequenciação do genoma no sangue) se mostrou inconclusiva.