Høy dybde eksomsekvensering på DNA fra en spyttprøve ved munnskraping. (SEPASA)

Til tross for teknologiske fremskritt, har en genetisk etiologi blitt identifisert i kun omtrent 50 % til 60 % av pasienter med nevro-utviklingsforstyrrelser (NDD-er), med en høyere diagnostisk utbytte i de syndromale NDD- og IDD-undergruppene. Imidlertid er det avgjørende å identifisere en presis etiologisk diagnose for å optimalisere pasientomsorgen, avklare prognosen, vurdere målrettede terapier, henvise familier til passende ressurser og støtte, samt gi genetisk veiledning til slektninger. Testene som typisk tilbys som en del av den etiologiske vurderingen av syndromale NDD-er og IDD inkluderer DNA-mikromatriseanalyse, testing for skjør X-syndrom og genomsekvensering fra en blodprøve. Når denne vurderingen forblir negativ, forblir årsaken vanligvis ukjent.

Mosaikke genomiske unormaliteter (eller post-zygotiske variasjoner) er en vanlig årsak til negative resultater i nåværende diagnostiske genetiske tester og representerer et forskningsfelt som ennå ikke er fullt utforsket utenfor hudlidelser. Å identifisere mosaikke genomiske unormaliteter forblir teknisk komplekst på grunn av vanskeligheten med å oppdage lave nivåer av mosaikkisme og begrenset tilgang til det aktuelle vevet når variasjonen er fraværende i blodvev.

Høy-dybde eksomsekvensering er teknikken som foretrekkes for å oppdage lave nivåer av mosaikkisme. Ved NDD-er, siden det berørte vevet ikke er tilgjengelig, er bukkalepitelet et interessant alternativ til blod, da det er lett tilgjengelig og billig.

Målet med vår studie er å evaluere den diagnostiske utbyttet av høy-dybde eksomsekvenseringsteknologi på DNA ekstrahert fra en bukkaleplet i den etiologiske vurderingen av pasienter med IDD eller syndromale NDD hvis referanseanalyse (genomsekvensering på blod) viste seg ukonklusiv.