Sekwencjonowanie eksomu o wysokiej głębokości na DNA z próbki śliny pobranej wymazem z jamy ustnej. (SEPASA)

Pomimo postępu technologicznego, etiologia genetyczna została zidentyfikowana jedynie u około 50% do 60% pacjentów z zaburzeniami neurorozwojowymi (NDD), z wyższym odsetkiem diagnostycznym w podgrupach zespołowych NDD i IDD. Jednakże ustalenie precyzyjnej diagnozy etiologicznej jest niezbędne, aby zoptymalizować opiekę nad pacjentem, wyjaśnić jego rokowanie, rozważyć ukierunkowane terapie, skierować rodziny do odpowiednich zasobów i wsparcia oraz zapewnić poradnictwo genetyczne krewnym. Testy zazwyczaj oferowane w ramach oceny etiologicznej zespołowych NDD i IDD obejmują analizę mikromacierzy DNA, testy na zespół łamliwego chromosomu X i sekwencjonowanie genomu z próbki krwi. Gdy ta ocena pozostaje negatywna, przyczyna zwykle pozostaje nieznana.

Mozaikowe nieprawidłowości genomowe (lub wariacje postzygotyczne) są częstą przyczyną negatywnych wyników w obecnych diagnostycznych testach genetycznych i stanowią obszar badań, który jeszcze nie został w pełni zbadany poza zaburzeniami skóry. Identyfikacja mozaikowych nieprawidłowości genomowych pozostaje technicznie złożona ze względu na trudność wykrywania niskich poziomów mozaicyzmu i ograniczony dostęp do tkanki zainteresowania, gdy wariacja nie występuje w tkance krwi.

Sekwencjonowanie eksomu o wysokiej głębokości jest techniką z wyboru do wykrywania niskich poziomów mozaicyzmu. W przypadku NDD, ponieważ dotknięta tkanka nie jest dostępna, nabłonek policzkowy jest interesującą alternatywą dla krwi, ponieważ jest łatwo dostępny i niedrogi.

Celem naszego badania jest ocena wydajności diagnostycznej technologii sekwencjonowania eksomu o wysokiej głębokości na DNA ekstrahowanym z wymazu z policzka w ocenie etiologicznej pacjentów z IDD lub zespołowym NDD, u których analiza referencyjna (sekwencjonowanie genomu z krwi) okazała się niejednoznaczna.