High Depth Exome Sequencing på DNA från ett salivprov via munavstryk. (SEPASA)

Trots tekniska framsteg har en genetisk etiologi identifierats i endast cirka 50 % till 60 % av patienter med neurodevelopmental störningar (NDD), med en högre diagnostisk utbyte i de syndromala NDD- och IDD-undergrupperna. Emellertid är det avgörande att identifiera en exakt etiologisk diagnos för att optimera patientvården, klargöra prognosen, överväga riktade terapier, hänvisa familjer till lämpliga resurser och stöd samt ge genetisk rådgivning till släktingar. Testerna som vanligtvis erbjuds som en del av den etiologiska utredningen av syndromala NDD och IDD inkluderar DNA-mikromatrisanalys, testning för fragilt X-syndrom och genomsekvensering från ett blodprov. När denna utredning förblir negativ förblir orsaken vanligtvis okänd.

Mosaikgenomiska abnormaliteter (eller postzygotiska variationer) är en vanlig orsak till negativa resultat i nuvarande diagnostiska genetiska tester och representerar ett forskningsområde som ännu inte är fullt utforskat utanför hudstörningar. Att identifiera mosaikgenomiska abnormaliteter förblir tekniskt komplext på grund av svårigheten att upptäcka låga nivåer av mosaicism och begränsad tillgång till intressant vävnad när variationen saknas i blodvävnad.

Exomsekvensering med hög täckning är tekniken av val för att upptäcka låga nivåer av mosaicism. I fallet med NND, eftersom den drabbade vävnaden inte är tillgänglig, är bukepitelet ett intressant alternativ till blod, eftersom det är lättillgängligt och billigt.

Syftet med vår studie är att utvärdera den diagnostiska utbytet av exomsekvenseringsteknik med hög täckning på DNA extraherat från ett bukskrapsprov i den etiologiska utredningen av patienter med IDD eller syndromal NDD vars referensanalys (genomsekvensering på blod) visade sig oavgörande.