Высокоглубинное экзомное секвенирование ДНК из образца слюны, полученного путем мазка изо рта. (SEPASA)

Несмотря на технологический прогресс, генетическая этиология была выявлена лишь примерно у 50%–60% пациентов с нарушениями нейроразвития (ННР), причём более высокая диагностическая эффективность наблюдается в подгруппах синдромальных ННР и нарушений интеллектуального развития (НИР). Однако установление точного этиологического диагноза крайне важно для оптимизации ухода за пациентом, уточнения прогноза, рассмотрения целевой терапии, направления семей к соответствующим ресурсам и поддержке, а также для предоставления генетического консультирования родственникам. В рамках этиологической оценки синдромальных ННР и НИР обычно предлагаются такие тесты, как анализ ДНК-микрочипов, тестирование на синдром ломкой X-хромосомы и полногеномное секвенирование по образцу крови. Если эта оценка остаётся отрицательной, причина обычно остаётся неизвестной.

Мозаичные геномные аномалии (или постзиготические вариации) являются частой причиной отрицательных результатов в современных диагностических генетических тестах и представляют собой область исследований, которая ещё недостаточно изучена за пределами кожных заболеваний. Выявление мозаичных геномных аномалий остаётся технически сложным из-за трудностей обнаружения низких уровней мозаицизма и ограниченного доступа к интересующей ткани, когда вариация отсутствует в кровяной ткани.

Высокоглубинное секвенирование экзома — это предпочтительная техника для обнаружения низких уровней мозаицизма. В случае ННР, поскольку поражённая ткань недоступна, буккальный эпителий представляет собой интересную альтернативу крови, так как он легко доступен и недорог.

Цель нашего исследования — оценить диагностическую эффективность технологии высокоглубинного секвенирования экзома на ДНК, выделенной из буккального мазка, при этиологической оценке пациентов с НИР или синдромальными ННР, у которых референсный анализ (полногеномное секвенирование по крови) оказался неубедительным.