HIV-1 게놈의 초민감성 파이로시퀀싱에 의한 항레트로바이러스 내성 검출 및 항레트로바이러스 구조 치료에 대한 바이러스학적 반응

항레트로바이러스 저항성 검사는 인간면역결핍바이러스(HIV-1) 감염자의 임상적 관리와 지역사회의 HIV 감시를 위한 필수 도구입니다. 적절한 치료가 없을 경우, HIV-1 감염은 면역 체계의 붕괴와 대부분의 HIV-1 감염자의 사망으로 이어집니다. 적절한 항레트로바이러스 치료는 일반적으로 이 과정을 역전시킵니다. 그럼에도 불구하고 HIV-1은 게놈에 돌연변이가 축적되어 치료 저항성이 쉽게 발생합니다. 이로 인해 치료 실패가 발생하고 점점 더 복잡하고 독성이 있으며 값비싼 치료가 필요합니다. 내성 바이러스는 다른 사람에게 전염될 수 있습니다. 스페인에서 HIV-1 양성인 사람의 10% 이상이 적어도 하나 이상의 항레트로바이러스 약물에 이미 내성이 있는 바이러스에 감염됩니다. 약물 내성 정보를 기반으로 설계된 항레트로바이러스 치료 요법은 보다 효과적이고 효과적이며 효율적입니다.

그러나 임상적 관련성에도 불구하고 기존의 내성 검사는 둔감하고 항레트로바이러스 내성을 과소평가합니다. 새로운 초민감성 저항성 테스트를 통해 기존의 유전자형 테스트에서 탐지되지 않은 소수 집단의 저항성 바이러스를 탐지할 수 있습니다. 따라서 초민감성 내성 검사는 항레트로바이러스 내성이 검출되는 환자의 수를 두 배 또는 세 배로 늘립니다. 항레트로바이러스 치료 경험이 없는 환자에서 소수 내성 돌연변이를 검출하면 바이러스학적 실패 위험이 3배 이상 증가한다는 점을 강조하는 것이 중요합니다. 치료에 실패한 치료 경험이 있는 환자에서 소수 내성 변이체를 검출하는 임상적 영향은 아직 알려지지 않았습니다.

최근에 개발된 수천 개의 앰플리콘 클론의 병렬 에멀젼 시퀀싱 기술(Ultra deep Sequencing(UDS), Roche Diagnostics/454 Life Sciences)은 HIV-1과 같은 매우 가변적인 게놈의 다형성 및 돌연변이를 여러 자릿수로 탐지하는 감도를 증가시킵니다. . 또한, 이 기술은 모든 환자 및 후속 조치 지점에 대해 수천 개의 HIV-1 클론 시퀀스에서 이러한 돌연변이 및 다형성의 유전적 연결을 안정화할 수 있습니다. 이는 HIV-1 가변성의 특성과 항레트로바이러스 내성의 생리병리학을 심층적으로 특성화할 수 있는 전례 없는 기회를 생성합니다. 초민감성 저항 테스트는 HIV-1 혈청 양성 환자의 임상 관리 개선, 불필요한 독성 방지, 항레트로바이러스 저항의 역학적 추정 개선, HIV-1 감염 및 항레트로바이러스 저항의 병인에 대한 지식 개선, 비용 효율성 향상을 약속합니다. HIV 관련 의약품 비용.

본 연구는 UDS를 통한 내성 돌연변이의 기준선 검출과 구제 항레트로바이러스 요법의 바이러스학적 결과 사이의 연관성을 기존의 유전형 내성 검사와 비교하여 분석하는 것을 목표로 합니다. 이 연구에서 생성된 데이터를 기반으로 항레트로바이러스 치료 결과의 예측을 개선하기 위해 새로운 저항 해석 도구와 알고리즘이 개발될 것입니다. 이 연구의 최종 목표는 개선된 새로운 항레트로바이러스 내성 테스트를 임상 실습에 통합하여 HIV-1 감염 환자의 임상 치료를 개선하는 것입니다.