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通过 HIV-1 基因组的超灵敏焦磷酸测序检测抗逆转录病毒耐药性和抗逆转录病毒救援治疗的病毒学反应

本研究旨在分析通过超深度测序 (UDS) 进行的耐药突变基线检测与挽救性抗逆转录病毒治疗的病毒学结果之间的关联,并与传统的基因型耐药检测进行比较。 根据本研究中产生的数据,将开发新的耐药性解释工具和算法,以改进抗逆转录病毒治疗结果的预测。 该研究的最终目的是通过在临床实践中结合改进的新抗逆转录病毒耐药性测试来改善 HIV-1 感染患者的临床护理。

研究概览

地位

完全的

详细说明

抗逆转录病毒耐药性检测是人类免疫缺陷病毒 (HIV-1) 感染者临床管理和社区 HIV 监测的重要工具。 在缺乏适当治疗的情况下,HIV-1 感染会导致免疫系统崩溃和大多数 HIV-1 感染者死亡。 适当的抗逆转录病毒治疗通常可以逆转这一过程。 然而,HIV-1 很容易通过其基因组中突变的积累产生治疗耐药性。 这会导致治疗失败,并需要越来越复杂、有毒且昂贵的治疗方法。 耐药病毒可以传染给其他人。 在西班牙,超过 10% 的 HIV-1 阳性者感染了已经对至少一种抗逆转录病毒药物产生耐药性的病毒。 根据耐药性信息设计的抗逆转录病毒治疗方案更加有效、有效和高效。

然而,尽管它们具有临床相关性,但传统的耐药性测试不敏感并且低估了抗逆转录病毒耐药性。 通过新的超灵敏耐药性测试,有可能在少数群体中检测到常规基因型测试未检测到的耐药病毒。 因此,超敏耐药性测试使检测到抗逆转录病毒耐药性的患者数量增加一倍或三倍。 重要的是要强调,在未接受过抗逆转录病毒治疗的患者中检测到少数耐药突变体会使病毒学失败的风险增加三倍以上。 在经历过治疗但治疗失败的患者中检测少数耐药变异体的临床影响仍然未知。

最近开发的数千个扩增子克隆的平行乳液测序技术(超深度测序(UDS),Roche Diagnostics/454 Life Sciences)提高了检测高度可变基因组(如 HIV-1)中多态性和突变的灵敏度几个数量级. 此外,该技术允许在每个患者和随访点的数千个 HIV-1 克隆序列中建立此类突变和多态性的遗传联系。 这产生了一个前所未有的机会来深入描述 HIV-1 变异的性质和抗逆转录病毒耐药性的病理生理学。 超敏耐药性检测有望改善 HIV-1 血清阳性患者的临床管理,避免不必要的毒性,提高抗逆转录病毒耐药性的流行病学估计,提高对 HIV-1 感染和抗逆转录病毒耐药性发病机制的认识,并提高成本效益HIV 相关的药物费用。

本研究旨在分析通过 UDS 检测耐药突变的基线与挽救性抗逆转录病毒治疗的病毒学结果之间的关联,并与传统的基因型耐药检测进行比较。 根据本研究中产生的数据,将开发新的耐药性解释工具和算法,以改进抗逆转录病毒治疗结果的预测。 该研究的最终目的是通过在临床实践中结合改进的新抗逆转录病毒耐药性测试来改善 HIV-1 感染患者的临床护理。

研究类型

观察性的

注册 (实际的)

143

联系人和位置

本节提供了进行研究的人员的详细联系信息,以及有关进行该研究的地点的信息。

学习地点

      • Granada、西班牙、28012
        • Hospital Universitario San Cecilio
      • Madrid、西班牙、08041
        • Hospital 12 de Octubre
    • Barcelona
      • Badalona、Barcelona、西班牙、08916
        • Laboratorio de Retrovirología irsiCaixa
      • Terrassa、Barcelona、西班牙、08227
        • Mútua de Terrassa

参与标准

研究人员寻找符合特定描述的人,称为资格标准。这些标准的一些例子是一个人的一般健康状况或先前的治疗。

资格标准

适合学习的年龄

18年 至 65年 (成人、年长者)

接受健康志愿者

不

有资格学习的性别

全部

取样方法

非概率样本

研究人群

  • PI 组:包括蛋白酶抑制剂 (PI)(利托那韦增强或不增强)在内的高效抗逆转录病毒疗法 (HAART) 方案的既往病毒学失败,以及第二次连续启动 HAART 方案,包括利托那韦增强 PI + 2 核苷逆转录酶抑制剂 ( NRTI)。 第二次 HAART 方案开始前的 6 个月被视为基线。
  • NNRTI 组:包括 1 种非核苷逆转录酶抑制剂 (NNRTI) 和 2 种 NRTIs 的 HAART 方案后的病毒学失败,并开始,连续或不连续,与依曲韦林联合任何其他药物的挽救 HAART 方案。 开始使用依曲韦林进行挽救 HAART 方案之前的 6 个月被视为基线。
  • II 组:任何先前 HAART 的病毒学失败和救援 HAART 的启动,包括 raltegravir,与任何其他药物组合。 开始使用 raltegravir 进行挽救 HAART 之前的 6 个月被视为基线。

描述

纳入标准:

  1. 18 岁以上的成人,HIV +,分布在以下 3 个治疗组之一:

    • PI 组:HAART 方案的先前病毒学失败,包括 PI(利托那韦增强或不增强),以及第二次连续启动 HAART 方案,包括用利托那韦 + 2 NRTIs 增强的 PI。 第二次 HAART 方案开始前的 6 个月被视为基线。
    • NNRTI 组:包括 1 种 NNRTI 和 2 种 NRTIs 的 HAART 方案后的病毒学失败,以及开始(连续或不连续)与依曲韦林联合任何其他药物的挽救 HAART 方案。 开始使用依曲韦林进行挽救 HAART 方案之前的 6 个月被视为基线。
    • II 组:任何先前 HAART 的病毒学失败和救援 HAART 的启动,包括 raltegravir,与任何其他药物组合。 开始使用 raltegravir 进行挽救 HAART 之前的 6 个月被视为基线。
  2. 在开始救援 HAART 之前,可用于焦磷酸测序的 1 mL 血浆样本。
  3. 获取血浆样本时 HIV-1 的病毒载量 > 5,000 拷贝/mL。
  4. 任何 CD4+ 计数。
  5. 临床随访的可用性、HIV-1 病毒载量和季度 CD4 计数至少在救援 HAART 开始后 48 周。
  6. 治疗依从性好。
  7. 调查期无论如何是在研究开始之前。

排除标准:

  1. HIV-2 感染或 HIV-1 亚型非 B。
  2. 治疗依从性差。
  3. 缺乏足够的临床和实验室随访。
  4. 患者不依从参与研究。

学习计划

本节提供研究计划的详细信息,包括研究的设计方式和研究的衡量标准。

研究是如何设计的?

设计细节

研究衡量的是什么?

主要结果指标

结果测量
大体时间
病毒学失败的时间
大体时间:一年
一年

次要结果测量

结果测量
大体时间
VL <50 和 <200 拷贝的患者比例
大体时间:第 12 周和第 48 周
第 12 周和第 48 周
病毒载量绝对下降
大体时间:第 24 周和第 48 周
第 24 周和第 48 周
病毒载量曲线下面积
大体时间:第 24 周和第 48 周
第 24 周和第 48 周
CD4增加
大体时间:第 24 周和第 48 周
第 24 周和第 48 周
通过 HIV-1 基因组的常规测序和超灵敏焦磷酸测序,比较与基线基因型耐药性检测相关的病毒学失败率。
大体时间:一年
一年
超灵敏焦磷酸测序法检测少数突变体的成本效益分析。
大体时间:第 48 周
第 48 周

合作者和调查者

在这里您可以找到参与这项研究的人员和组织。

出版物和有用的链接

负责输入研究信息的人员自愿提供这些出版物。这些可能与研究有关。

研究记录日期

这些日期跟踪向 ClinicalTrials.gov 提交研究记录和摘要结果的进度。研究记录和报告的结果由国家医学图书馆 (NLM) 审查,以确保它们在发布到公共网站之前符合特定的质量控制标准。

研究主要日期

学习开始

2010年7月1日

初级完成 (实际的)

2012年4月1日

研究完成 (实际的)

2012年4月1日

研究注册日期

首次提交

2011年4月18日

首先提交符合 QC 标准的

2011年5月2日

首次发布 (估计)

2011年5月3日

研究记录更新

最后更新发布 (估计)

2012年10月25日

上次提交的符合 QC 标准的更新

2012年10月24日

最后验证

2012年10月1日

更多信息

与本研究相关的术语

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