Nachweis antiretroviraler Resistenzen durch hochempfindliche Pyrosequenzierung des HIV-1-Genoms und virologische Reaktion auf eine antiretrovirale Rettungsbehandlung

Antiretrovirale Resistenztests sind ein wesentliches Instrument für die klinische Behandlung von mit dem Humanen Immundefizienzvirus (HIV-1) infizierten Personen und die HIV-Überwachung in der Gemeinde. Ohne geeignete Behandlung führt eine HIV-1-Infektion zum Zusammenbruch des Immunsystems und zum Tod der meisten HIV-1-infizierten Personen. Eine angemessene antiretrovirale Behandlung kehrt diesen Prozess normalerweise um. Dennoch entwickelt HIV-1 durch die Anhäufung von Mutationen in seinem Genom leicht eine Behandlungsresistenz. Dies führt zu Behandlungsversagen und erfordert immer komplexere, toxische und teure Behandlungen. Resistente Viren können auf andere Personen übertragen werden. Mehr als 10 % der HIV-1-positiven Personen in Spanien infizieren sich mit Viren, die bereits gegen mindestens ein antiretrovirales Medikament resistent sind. Antiretrovirale Behandlungsschemata, die auf der Grundlage von Informationen zur Arzneimittelresistenz entwickelt wurden, sind wirksamer, effektiver und effizienter.

Trotz ihrer klinischen Relevanz sind herkömmliche Resistenztests jedoch unempfindlich und unterschätzen die antiretrovirale Resistenz. Mithilfe neuer ultrasensitiver Resistenztests ist es möglich, resistente Viren in Minderheitenpopulationen nachzuweisen, die mit herkömmlichen genotypischen Tests unentdeckt bleiben. Ultrasensitive Resistenztests verdoppeln oder verdreifachen somit die Zahl der Patienten, bei denen eine antiretrovirale Resistenz festgestellt wird. Es ist wichtig zu betonen, dass der Nachweis minderheitsresistenter Mutanten bei antiretroviral naiven Patienten das Risiko eines virologischen Versagens um mehr als das Dreifache erhöht. Die klinischen Auswirkungen der Erkennung minderheitsresistenter Varianten bei behandlungserfahrenen Patienten mit Therapieversagen sind weiterhin unbekannt.

Kürzlich entwickelte Techniken der parallelen Emulsionssequenzierung von Tausenden von Amplikonklonen (Ultra Deep Sequencing (UDS), Roche Diagnostics/454 Life Sciences) erhöhen die Sensitivität zum Nachweis von Polymorphismen und Mutationen in hochvariablen Genomen wie bei HIV-1 um mehrere Größenordnungen . Darüber hinaus ermöglicht diese Technik die Herstellung einer genetischen Verknüpfung solcher Mutationen und Polymorphismen in Tausenden von HIV-1-Klonsequenzen für jeden Patienten und jeden Nachsorgepunkt. Dies bietet eine beispiellose Gelegenheit, die Natur der HIV-1-Variabilität und die Physiopathologie der antiretroviralen Resistenz eingehend zu charakterisieren. Ultrasensitive Resistenztests versprechen, die klinische Behandlung seropositiver HIV-1-Patienten zu verbessern, unnötige Toxizitäten zu vermeiden, epidemiologische Schätzungen der antiretroviralen Resistenz zu verbessern, das Wissen über die Pathogenese der HIV-1-Infektion und der antiretroviralen Resistenz zu verbessern und die Kosteneffizienz zu verbessern der HIV-bedingten Arzneimittelkosten.

Ziel dieser Studie ist es, den Zusammenhang zwischen dem Basisnachweis von Resistenzmutationen durch UDS und dem virologischen Ergebnis einer antiretroviralen Salvage-Therapie im Vergleich zu herkömmlichen genotypischen Resistenztests zu analysieren. Basierend auf den in dieser Studie generierten Daten werden neue Tools und Algorithmen zur Resistenzinterpretation entwickelt, um die Vorhersage antiretroviraler Therapieergebnisse zu verbessern. Das endgültige Ziel der Studie besteht darin, die klinische Versorgung von HIV-1-infizierten Patienten durch die Integration verbesserter neuer antiretroviraler Resistenztests in die klinische Praxis zu verbessern.