인공관절 감염 진단을 위한 Coagulase-negative Staphylococci의 분자표지자 규명
Coagulase-negative Staphylococci의 분자적 특징: 무증상 관절주위 감염의 신속한 진단을 위한 바이오마커 식별을 위해
연구 개요
상세 설명
작업 1.1: 패혈증 보철물의 교정을 위해 IRCCS Galeazzi 정형외과 연구소에 의뢰된 60명의 환자와 무균 실패로 인해 교정을 받는 40명의 환자로부터 윤활액을 수집합니다. 수집된 활액은 분석할 때까지 -80°C에서 보관됩니다.
MSIS 가이드라인에 따르면, CRP 및 ESR 수치, 활막 백혈구 수, 이식된 장치 및 삽입물 주위 조직의 미생물 배양은 일상적인 프로토콜에 따라 수행됩니다. CoNS에 의해 매개되는 삽입물 삽입물 감염으로 진단된 감염 그룹의 환자로부터 채취한 활액만 후속 단백질체 분석에 적합합니다. 작업 1.2: 검색된 CoNS 종의 적어도 10개의 분리체의 secretome이 특징화될 것이다. 특히, CoNS 임상 분리주를 드립 플로우 반응기에서 배양하여 바이오필름 생성을 유도하고 분석된 분비체를 분석하여 관심 단백질의 1차 선별을 수행할 것입니다.
작업 2.1: 삽입물 주위 관절 감염이 있거나 없는 환자의 활액에서 추출한 단백질은 카르바미도메틸화되고 트립신에 의해 소화됩니다. 그 후, 펩티드 혼합물은 탠덤 질량 분석법(나노 LC-MS/MS)에 결합된 나노 액체 크로마토그래피에 의해 분석될 것입니다. LFQ(label-free quantifications)는 박테리아에 의해 발현되고 환자 활액에서 분비되는 단백질의 수준을 평가하기 위해 적용될 것입니다.
작업 2.2: 프로테옴 소프트웨어 사용(예: MaxQuant, Perseus 등), 세균의 존재와 밀접한 관련이 있는 감염된 환자 그룹에 속하는 샘플에만 존재하는 관심 단백질 풀을 결정하기 위해 생물정보학적 분석이 수행됩니다.
작업 3.1: 작업 1.2 및 작업 2.2에서 CoNS 매개 삽입물 삽입물과 관련된 추정 바이오마커로 식별된 관심 단백질은 추가 생물정보학적 분석을 통해 표적 단백질 분석을 위해 선택됩니다.
작업 3.2: 등록된 환자의 활액에서 작업 3.1에 정의된 추정 바이오마커의 존재를 확인하기 위해 작업 1.1에서 수집된 모든 감염/비감염 샘플에 대해 표적 단백질 분석을 수행합니다. 각 추정 바이오마커에 대한 프로토타입 펩타이드는 Skyline 소프트웨어에 의해 선택됩니다. 모든 후보 펩타이드의 이온화 및 단편화 거동을 연구할 것입니다.
과제 3.3: 마지막으로, 선택된 각 바이오마커의 진단적 가치를 평가하기 위해 표적 단백체 분석의 정보는 MSIS 지침에 따라 공식화된 진단 결과와 상관 관계가 있습니다.
연구 유형
등록 (예상)
연락처 및 위치
연구 연락처
- 이름: Elena Cittera, MSc
- 전화번호: 00390266214057
- 이메일: elena.cittera@grupposandonato.it
연구 장소
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Milan, 이탈리아, 20161
- 모병
- IRCCS Istituto Ortopedico Galeazzi
-
연락하다:
- Elena Cittera, MSc
- 전화번호: 00390266214057
- 이메일: elena.cittera@grupposandonato.it
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부수사관:
- Marta Bottagisio, Ph.D.
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참여기준
자격 기준
공부할 수 있는 나이
건강한 자원 봉사자를 받아들입니다
연구 대상 성별
샘플링 방법
연구 인구
설명
포함 기준:
- ≥ 18세 환자
- CoNS(coagulase-negative Staphylococci)에 의한 세균 감염 또는 임플란트의 무균 실패로 인해 관절 보철물의 재수술을 받은 환자
- 충분한 양의 활액 수집
- 정보에 입각한 동의서에 서명하여 환자 동의
제외 기준:
- 포함 기준을 충족하지 않는 환자
- 용혈 샘플 수집
공부 계획
연구는 어떻게 설계됩니까?
디자인 세부사항
- 관찰 모델: 케이스 컨트롤
- 시간 관점: 유망한
코호트 및 개입
그룹/코호트 |
개입 / 치료 |
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정화조 그룹
패혈증군은 CoNS(Coagulase-negative Staphylococci)에 의해 매개되는 인공 관절 감염 환자로 구성됩니다.
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Coagulase-negative Staphylococci에 의해 매개되는 박테리아 감염의 존재와 엄격하게 관련된 분자 특징의 식별을 위한 감염/무균 활액의 프로테옴 특성화
감염된 보철물에서 분리한 coagulase-negative Staphylococci의 secretome 특성 규명
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무균 그룹
무균군은 감염과 무관한 임플란트 실패 환자들로 구성된다.
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Coagulase-negative Staphylococci에 의해 매개되는 박테리아 감염의 존재와 엄격하게 관련된 분자 특징의 식별을 위한 감염/무균 활액의 프로테옴 특성화
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연구는 무엇을 측정합니까?
주요 결과 측정
결과 측정 |
측정값 설명 |
기간 |
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활액 내 coagulase-negative Staphylococci의 존재와 엄격하게 관련된 분자 특징의 식별
기간: 3 년
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Coaglase-negative Staphylococci의 존재와 엄격하게 관련된 관심 단백질 풀을 식별하기 위한 패혈증/무균 등록 환자의 활액 특성화
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3 년
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2차 결과 측정
결과 측정 |
측정값 설명 |
기간 |
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Coagulase-negative Staphylococci의 단백질 분석
기간: 3 년
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CoNS 임상 분리물의 secretome 특성화 및 패혈증/무균 등록 환자의 활액의 proteome 특성화
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3 년
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공동 작업자 및 조사자
수사관
- 수석 연구원: Marta Bottagisio, Ph.D., IRCCS Istituto Ortopedico Galeazzi
연구 기록 날짜
연구 주요 날짜
연구 시작 (실제)
기본 완료 (예상)
연구 완료 (예상)
연구 등록 날짜
최초 제출
QC 기준을 충족하는 최초 제출
처음 게시됨 (실제)
연구 기록 업데이트
마지막 업데이트 게시됨 (실제)
QC 기준을 충족하는 마지막 업데이트 제출
마지막으로 확인됨
추가 정보
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