Эта страница была переведена автоматически, точность перевода не гарантируется. Пожалуйста, обратитесь к английской версии для исходного текста.

Идентификация молекулярного маркера коагулазоотрицательных стафилококков для диагностики инфекций протезированных суставов

3 декабря 2020 г. обновлено: Istituto Ortopedico Galeazzi

Молекулярные признаки коагулазоотрицательных стафилококков: на пути к идентификации биомаркеров для экспресс-диагностики субклинических перипротезных инфекций суставов

Одной из основных причин отказа протеза сустава является инфекция. Недавно коагулазонегативные стафилококки (CoNS) были идентифицированы как возникающие внутрибольничные патогены, участвующие в субклинических инфекциях протезных суставов (PJI). Диагностика ППИ, опосредованных CoNS, является сложной и сложной из-за отсутствия четких клинических признаков, связанных с реакцией иммунной системы хозяина. В этом сценарии ключом к успешному хирургическому лечению является способность различать асептическое расшатывание имплантата и септическую недостаточность. Следовательно, центральная гипотеза этого исследования заключается в том, что протеомный анализ секретома клинических изолятов CoNS, связанный с характеристикой синовиальной жидкости пациента, выявит панель предполагаемых биомаркеров, тесно связанных с PJI. Подтверждение наличия бактериальных биомаркеров ППИ в синовиальной жидкости инфицированных пациентов проложит путь к разработке нового надежного теста, способного помочь в диагностике субклинических ППИ.

Обзор исследования

Статус

Рекрутинг

Условия

Вмешательство/лечение

Подробное описание

Задача 1.1: Синовиальные жидкости будут собраны у 60 пациентов, направленных в Ортопедический институт IRCCS Galeazzi для ревизии септического протеза, и у 40 пациентов, подвергающихся ревизии из-за асептической недостаточности. Собранные синовиальные жидкости будут храниться при температуре -80°C до анализа.

В соответствии с рекомендациями MSIS измерение уровней СРБ и СОЭ, количество синовиальных лейкоцитов и микробиологическая культура эксплантированного устройства и перипротезной ткани будут проводиться в соответствии с обычными протоколами. Только синовиальная жидкость, собранная у пациентов из инфицированной группы с диагнозом ППИ, опосредованным CoNS, будет подходить для последующего протеомного анализа. Задача 1.2: Будет охарактеризован секретом не менее 10 изолятов извлеченных видов CoNS. В частности, клинические изоляты CoNS будут культивироваться в реакторе с капельным потоком, чтобы вызвать образование биопленки, а секретом будет проанализирован для проведения первого отбора представляющих интерес белков.

Задача 2.1: Белки, извлеченные из синовиальной жидкости пациентов с ППИ или без него, будут карбамидометилированы и расщеплены трипсином. После этого смеси пептидов будут проанализированы с помощью наножидкостной хроматографии в сочетании с тандемной масс-спектрометрией (нано ЖХ-МС/МС). Для оценки уровней белков, экспрессируемых бактериями и секретируемых в синовиальной жидкости пациента, будет применяться количественная оценка без меток (LFQ).

Задача 2.2: Использование протеомного программного обеспечения (т.е. MaxQuant, Perseus и т. д.) будет проводиться биоинформатический анализ для определения пула представляющих интерес белков, присутствующих только в образцах, принадлежащих инфицированной группе пациентов, которые будут тесно связаны с присутствием бактерий.

Задача 3.1: Белки, представляющие интерес, идентифицированные в Задаче 1.2 и Задаче 2.2 в качестве предполагаемых биомаркеров, связанных с CoNS-опосредованными PJI, будут отобраны для целевого протеомного анализа с помощью дополнительных биоинформатических анализов.

Задача 3.2: Для подтверждения наличия предполагаемых биомаркеров, определенных в Задаче 3.1, в синовиальной жидкости включенных пациентов будет проведен целевой протеомный анализ всех инфицированных/не инфицированных образцов, собранных в Задаче 1.1. Прототипы пептидов для каждого предполагаемого биомаркера будут выбраны с помощью программного обеспечения Skyline. Будут изучены характеристики ионизации и фрагментации всех пептидов-кандидатов.

Задача 3.3: Наконец, информация из целевого протеомного анализа будет сопоставлена ​​с результатами диагностики, сформулированными в соответствии с рекомендациями MSIS, чтобы оценить диагностическую ценность каждого выбранного биомаркера.

Тип исследования

Наблюдательный

Регистрация (Ожидаемый)

100

Контакты и местонахождение

В этом разделе приведены контактные данные лиц, проводящих исследование, и информация о том, где проводится это исследование.

Контакты исследования

Места учебы

  • Италия
      • Milan, Италия, 20161
        • Рекрутинг
        • IRCCS Istituto Ortopedico Galeazzi
        • Контакт:
        • Младший исследователь:
          • Marta Bottagisio, Ph.D.

Критерии участия

Исследователи ищут людей, которые соответствуют определенному описанию, называемому критериям приемлемости. Некоторыми примерами этих критериев являются общее состояние здоровья человека или предшествующее лечение.

Критерии приемлемости

Возраст, подходящий для обучения

14 лет и старше (Взрослый, Пожилой взрослый)

Принимает здоровых добровольцев

Нет

Полы, имеющие право на обучение

Все

Метод выборки

Невероятностная выборка

Исследуемая популяция

Пациенты, подвергшиеся ревизии суставного протеза из-за бактериальной инфекции или асептического расшатывания имплантата.

Описание

Критерии включения:

  • ≥ 18 лет пациенты
  • Пациенты, подвергшиеся ревизии суставного протеза из-за бактериальной инфекции, опосредованной коагулазонегативными стафилококками (CoNS), или из-за асептической несостоятельности имплантата.
  • Сбор достаточного объема синовиальной жидкости
  • Согласие пациента путем подписания формы информированного согласия

Критерий исключения:

  • Пациенты, не соответствующие критериям включения
  • Сбор гемолитического образца

Учебный план

В этом разделе представлена ​​подробная информация о плане исследования, в том числе о том, как планируется исследование и что оно измеряет.

Как устроено исследование?

Детали дизайна

  • Наблюдательные модели: Кейс-контроль
  • Временные перспективы: Перспективный

Когорты и вмешательства

Группа / когорта
Вмешательство/лечение
Септическая группа
Септическую группу составляют пациенты с инфекцией протезированных суставов, опосредованной коагулазонегативными стафилококками (КоНС).
Другой: Протеомный анализ синовиальной жидкости
Характеристика протеома инфицированной/асептической синовиальной жидкости для выявления молекулярных признаков, строго связанных с наличием бактериальной инфекции, опосредованной коагулазонегативными стафилококками.
Другой: Протеомный анализ выделенных коагулазонегативных стафилококков
Характеристика секретома коагулазонегативных стафилококков, выделенных из инфицированных протезных имплантатов
Асептическая группа
Асептическую группу составляют пациенты с отторжением имплантата, не связанным с инфекцией.
Другой: Протеомный анализ синовиальной жидкости
Характеристика протеома инфицированной/асептической синовиальной жидкости для выявления молекулярных признаков, строго связанных с наличием бактериальной инфекции, опосредованной коагулазонегативными стафилококками.

Что измеряет исследование?

Первичные показатели результатов

Мера результата
Мера Описание
Временное ограничение
Идентификация молекулярных признаков, строго связанных с присутствием коагулазонегативных стафилококков в синовиальной жидкости
Временное ограничение: 3 года
Характеристика синовиальной жидкости септических/асептических пациентов для выявления интересующего пула белков, строго связанного с присутствием коаглазоотрицательных стафилококков.
3 года

Вторичные показатели результатов

Мера результата
Мера Описание
Временное ограничение
Протеомный анализ коагулазонегативных стафилококков
Временное ограничение: 3 года
Характеристика секретома клинического изолята CoNS и характеристика протеома синовиальной жидкости включенных в исследование пациентов с сепсисом/асепсией
3 года

Соавторы и исследователи

Здесь вы найдете людей и организации, участвующие в этом исследовании.

Спонсор

Istituto Ortopedico Galeazzi

Следователи

  • Главный следователь: Marta Bottagisio, Ph.D., IRCCS Istituto Ortopedico Galeazzi

Даты записи исследования

Эти даты отслеживают ход отправки отчетов об исследованиях и сводных результатов на сайт ClinicalTrials.gov. Записи исследований и сообщаемые результаты проверяются Национальной медицинской библиотекой (NLM), чтобы убедиться, что они соответствуют определенным стандартам контроля качества, прежде чем публиковать их на общедоступном веб-сайте.

Изучение основных дат

Начало исследования (Действительный)

14 октября 2020 г.

Первичное завершение (Ожидаемый)

14 сентября 2023 г.

Завершение исследования (Ожидаемый)

14 октября 2023 г.

Даты регистрации исследования

Первый отправленный

3 декабря 2020 г.

Впервые представлено, что соответствует критериям контроля качества

3 декабря 2020 г.

Первый опубликованный (Действительный)

10 декабря 2020 г.

Обновления учебных записей

Последнее опубликованное обновление (Действительный)

10 декабря 2020 г.

Последнее отправленное обновление, отвечающее критериям контроля качества

3 декабря 2020 г.

Последняя проверка

1 декабря 2020 г.

Дополнительная информация

Термины, связанные с этим исследованием

Ключевые слова

Дополнительные соответствующие термины MeSH

Другие идентификационные номера исследования

  • SINOVIOMA

Планирование данных отдельных участников (IPD)

Планируете делиться данными об отдельных участниках (IPD)?

Не определился

Информация о лекарствах и устройствах, исследовательские документы

Изучает лекарственный продукт, регулируемый FDA США.

Нет

Изучает продукт устройства, регулируемый Управлением по санитарному надзору за качеством пищевых продуктов и медикаментов США.

Нет

Эта информация была получена непосредственно с веб-сайта clinicaltrials.gov без каких-либо изменений. Если у вас есть запросы на изменение, удаление или обновление сведений об исследовании, обращайтесь по адресу register@clinicaltrials.gov. Как только изменение будет реализовано на clinicaltrials.gov, оно будет автоматически обновлено и на нашем веб-сайте. .

Подписаться