Tato stránka byla automaticky přeložena a přesnost překladu není zaručena. Podívejte se prosím na anglická verze pro zdrojový text.

Identifikace molekulárního markeru koaguláza-negativních stafylokoků pro diagnostiku infekcí protetických kloubů

3. prosince 2020 aktualizováno: Istituto Ortopedico Galeazzi

Molekulární znaky koaguláza-negativních stafylokoků: Směrem k identifikaci biomarkerů pro rychlou diagnostiku subklinických periprotetických infekcí kloubů

Jednou z hlavních příčin selhání protetických kloubů je infekce. Nedávno byly koaguláza-negativní stafylokoky (CoNS) identifikovány jako emergentní nozokomiální patogeny podílející se na subklinických protetických kloubních infekcích (PJI). Diagnostika PJI zprostředkovaná CoNS je složitá a náročná vzhledem k absenci jasných klinických příznaků odvozených od reakce imunitního systému hostitele. V tomto scénáři je klíčem k úspěšné chirurgické léčbě schopnost rozlišit mezi aseptickým uvolněním implantátu a septickým selháním. Ústřední hypotézou této studie tedy je, že proteomická analýza sekretomu klinických izolátů CoNS spojených s charakterizací synoviálních tekutin pacienta odhalí panel domnělých biomarkerů těsně spojených s PJI. Potvrzení přítomnosti bakteriálních biomarkerů PJI v synoviálních tekutinách infikovaných pacientů připraví cestu pro vývoj nového spolehlivého testu schopného pomoci při diagnostice subklinických PJI.

Přehled studie

Detailní popis

Úkol 1.1: Synoviální tekutiny budou odebrány od 60 pacientů odeslaných do IRCCS Galeazzi Ortopedic Institute k revizi septické protézy a od 40 pacientů podstupujících revizi z důvodu aseptického selhání. Odebrané synoviální tekutiny budou až do analýzy skladovány při -80 °C.

Podle pokynů MSIS bude měření hladin CRP a ESR, počtu synoviálních WBC a mikrobiologické kultivace explantovaného zařízení a periprotetické tkáně prováděno podle rutinních protokolů. Pouze synoviální tekutina odebraná pacientům z infikované skupiny s diagnostikovanou PJI zprostředkovanou CoNS bude způsobilá pro následné proteomické analýzy. Úkol 1.2: Bude charakterizován sekretom alespoň 10 izolátů získaných druhů CoNS. Zejména klinické izoláty CoNS budou kultivovány v kapacím průtokovém reaktoru, aby se indukovala produkce biofilmu a sekretom analyzován pro provedení první selekce sledovaných proteinů.

Úkol 2.1: Proteiny extrahované ze synoviálních tekutin pacientů s nebo bez PJI budou karbamidomethylovány a štěpeny trypsinem. Poté budou směsi peptidů analyzovány nano kapalinovou chromatografií spojenou s tandemovou hmotnostní spektrometrií (nano LC-MS/MS). K hodnocení hladin proteinů exprimovaných bakteriemi a vylučovaných v synoviálních tekutinách pacienta budou použity kvantifikace bez označení (LFQ).

Úkol 2.2: Použití proteomického softwaru (tj. MaxQuant, Perseus, atd.), bude provedena bioinformatická analýza za účelem stanovení souboru zájmových proteinů přítomných pouze ve vzorcích patřících do infikované skupiny pacientů, které by úzce souvisely s přítomností bakterií.

Úkol 3.1: Zájmové proteiny identifikované v úloze 1.2 a úloze 2.2 jako domnělé biomarkery související s PJI zprostředkovanými CoNS budou vybrány pro cílené proteomické analýzy pomocí dalších bioinformatických analýz.

Úkol 3.2: Pro potvrzení přítomnosti domnělých biomarkerů definovaných v úloze 3.1 v synoviální tekutině zařazených pacientů bude provedena cílená proteomická analýza všech infikovaných/neinfikovaných vzorků odebraných v úloze 1.1. Prototypové peptidy pro každý předpokládaný biomarker vybere software Skyline. Bude studováno ionizační a fragmentační chování všech kandidátních peptidů.

Úkol 3.3: Nakonec budou informace z cílené proteomické analýzy korelovány s výsledky diagnózy formulované podle pokynů MSIS za účelem vyhodnocení diagnostické hodnoty každého vybraného biomarkeru.

Typ studie

Pozorovací

Zápis (Očekávaný)

100

Kontakty a umístění

Tato část poskytuje kontaktní údaje pro ty, kteří studii provádějí, a informace o tom, kde se tato studie provádí.

Studijní kontakt

Studijní místa

      • Milan, Itálie, 20161
        • Nábor
        • IRCCS Istituto Ortopedico Galeazzi
        • Kontakt:
        • Dílčí vyšetřovatel:
          • Marta Bottagisio, Ph.D.

Kritéria účasti

Výzkumníci hledají lidi, kteří odpovídají určitému popisu, kterému se říká kritéria způsobilosti. Některé příklady těchto kritérií jsou celkový zdravotní stav osoby nebo předchozí léčba.

Kritéria způsobilosti

Věk způsobilý ke studiu

14 let a starší (Dospělý, Starší dospělý)

Přijímá zdravé dobrovolníky

Ne

Pohlaví způsobilá ke studiu

Všechno

Metoda odběru vzorků

Vzorek nepravděpodobnosti

Studijní populace

Pacienti podrobení revizi kloubní protézy v důsledku bakteriální infekce nebo aseptickému uvolnění implantátu

Popis

Kritéria pro zařazení:

  • pacientů ve věku ≥ 18 let
  • Pacienti podrobení revizi kloubní protézy kvůli bakteriální infekci zprostředkované koaguláza-negativními stafylokoky (CoNS) nebo aseptickému selhání implantátu
  • Odběr dostatečného objemu synoviální tekutiny
  • Souhlas pacienta podepsáním formuláře informovaného souhlasu

Kritéria vyloučení:

  • Pacienti nesplňující kritéria pro zařazení
  • Odběr hemolytického vzorku

Studijní plán

Tato část poskytuje podrobnosti o studijním plánu, včetně toho, jak je studie navržena a co studie měří.

Jak je studie koncipována?

Detaily designu

  • Observační modely: Case-Control
  • Časové perspektivy: Budoucí

Kohorty a intervence

Skupina / kohorta
Intervence / Léčba
Septická skupina
Septická skupina je složena z pacientů s protetickou kloubní infekcí zprostředkovanou koaguláza-negativními stafylokoky (CoNS)
Charakterizace proteomu infikované/aseptické synoviální tekutiny pro identifikaci molekulárních znaků přísně souvisejících s přítomností bakteriální infekce zprostředkované koaguláza-negativními stafylokoky
Charakterizace sekretomu koaguláza-negativních stafylokoků izolovaných z infikovaných protetických implantátů
Aseptická skupina
Aseptická skupina je složena z pacientů se selháním implantátu, které nesouvisí s infekcí.
Charakterizace proteomu infikované/aseptické synoviální tekutiny pro identifikaci molekulárních znaků přísně souvisejících s přítomností bakteriální infekce zprostředkované koaguláza-negativními stafylokoky

Co je měření studie?

Primární výstupní opatření

Měření výsledku
Popis opatření
Časové okno
Identifikace molekulárních znaků přísně souvisejících s přítomností koaguláza-negativních stafylokoků v synoviálních tekutinách
Časové okno: 3 roky
Charakterizace synoviálních tekutin pacientů se septikem/aseptikou za účelem identifikace zájmového souboru proteinů striktně souvisejících s přítomností koagláza-negativních stafylokoků
3 roky

Sekundární výstupní opatření

Měření výsledku
Popis opatření
Časové okno
Proteomická analýza koaguláza-negativních stafylokoků
Časové okno: 3 roky
Charakterizace sekretomu klinického izolátu CoNS a charakterizace proteomu synoviálních tekutin zařazených septických/aseptických pacientů
3 roky

Spolupracovníci a vyšetřovatelé

Zde najdete lidi a organizace zapojené do této studie.

Vyšetřovatelé

  • Vrchní vyšetřovatel: Marta Bottagisio, Ph.D., IRCCS Istituto Ortopedico Galeazzi

Termíny studijních záznamů

Tato data sledují průběh záznamů studie a předkládání souhrnných výsledků na ClinicalTrials.gov. Záznamy ze studií a hlášené výsledky jsou před zveřejněním na veřejné webové stránce přezkoumány Národní lékařskou knihovnou (NLM), aby se ujistily, že splňují specifické standardy kontroly kvality.

Hlavní termíny studia

Začátek studia (Aktuální)

14. října 2020

Primární dokončení (Očekávaný)

14. září 2023

Dokončení studie (Očekávaný)

14. října 2023

Termíny zápisu do studia

První předloženo

3. prosince 2020

První předloženo, které splnilo kritéria kontroly kvality

3. prosince 2020

První zveřejněno (Aktuální)

10. prosince 2020

Aktualizace studijních záznamů

Poslední zveřejněná aktualizace (Aktuální)

10. prosince 2020

Odeslaná poslední aktualizace, která splnila kritéria kontroly kvality

3. prosince 2020

Naposledy ověřeno

1. prosince 2020

Více informací

Termíny související s touto studií

Plán pro data jednotlivých účastníků (IPD)

Plánujete sdílet data jednotlivých účastníků (IPD)?

Nerozhodný

Informace o lécích a zařízeních, studijní dokumenty

Studuje lékový produkt regulovaný americkým FDA

Ne

Studuje produkt zařízení regulovaný americkým úřadem FDA

Ne

Tyto informace byly beze změn načteny přímo z webu clinicaltrials.gov. Máte-li jakékoli požadavky na změnu, odstranění nebo aktualizaci podrobností studie, kontaktujte prosím register@clinicaltrials.gov. Jakmile bude změna implementována na clinicaltrials.gov, bude automaticky aktualizována i na našem webu .

Klinické studie na Infekce protetických kloubů

Předplatit