鉴定用于诊断假体关节感染的凝固酶阴性葡萄球菌分子标志物
凝固酶阴性葡萄球菌的分子标志：鉴定用于快速诊断亚临床假体周围关节感染的生物标志物
研究概览
详细说明
任务 1.1：将从 60 名转诊至 IRCCS Galeazzi 骨科研究所进行化脓性假体翻修的患者和 40 名因无菌失败而进行翻修的患者中收集滑液。 收集的滑液将储存在 -80°C 直至分析。
根据 MSIS 指南，CRP 和 ESR 水平的测量、滑膜 WBC 计数以及外植装置和假体周围组织的微生物培养将按照常规方案进行。 只有从诊断为 CoNS 介导的 PJI 的感染组患者中收集的滑液才有资格进行后续的蛋白质组学分析。 任务 1.2： 将对至少 10 种回收的 CoNS 物种的分泌物进行表征。 特别是，CoNS 临床分离株将在滴流反应器中培养，以诱导生物膜的产生，并分析分泌蛋白组，以对感兴趣的蛋白质进行初步选择。
任务 2.1：从患有或不患有 PJI 的患者的滑液中提取的蛋白质将被脲甲基化并被胰蛋白酶消化。 此后，肽混合物将通过与串联质谱联用的纳米液相色谱法（纳米 LC-MS/MS）进行分析。 无标记定量 (LFQ) 将用于评估细菌表达的蛋白质水平和患者滑液中分泌的蛋白质水平。
任务 2.2：使用蛋白质组学软件（即 MaxQuant、Perseus 等），将进行生物信息学分析以确定仅存在于属于受感染患者组的样本中的感兴趣的蛋白质库，这些蛋白质与细菌的存在密切相关。
任务 3.1：在任务 1.2 和任务 2.2 中确定的感兴趣的蛋白质作为与 CoNS 介导的 PJI 相关的推定生物标志物将被选择用于通过额外的生物信息学分析进行靶向蛋白质组学分析。
任务 3.2：为了确认入组患者的滑液中是否存在任务 3.1 中定义的推定生物标志物，将对任务 1.1 中收集的所有感染/未感染样本进行靶向蛋白质组学分析。 Skyline 软件将选择每个假定生物标志物的原型肽。 将研究所有候选肽的电离和碎裂行为。
任务 3.3：最后，来自目标蛋白质组学分析的信息将与遵循 MSIS 指南制定的诊断结果相关联，以评估每个选定生物标志物的诊断价值。
研究类型
注册 (预期的)
联系人和位置
学习联系方式
- 姓名：Elena Cittera, MSc
- 电话号码：00390266214057
- 邮箱：elena.cittera@grupposandonato.it
学习地点
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Milan、意大利、20161
- 招聘中
- IRCCS Istituto Ortopedico Galeazzi
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接触：
- Elena Cittera, MSc
- 电话号码：00390266214057
- 邮箱：elena.cittera@grupposandonato.it
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副研究员：
- Marta Bottagisio, Ph.D.
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参与标准
资格标准
适合学习的年龄
接受健康志愿者
有资格学习的性别
取样方法
研究人群
描述
纳入标准：
- ≥18岁患者
- 因凝固酶阴性葡萄球菌 (CoNS) 介导的细菌感染或植入物无菌失效而接受关节假体翻修的患者
- 收集足量的滑液
- 通过签署知情同意书获得患者同意
排除标准：
- 不符合纳入标准的患者
- 溶血样本的收集
学习计划
研究是如何设计的？
设计细节
- 观测模型：病例对照
- 时间观点：预期
队列和干预
团体/队列 |
干预/治疗 |
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化粪池组
脓毒症组由凝固酶阴性葡萄球菌 (CoNS) 介导的假体关节感染患者组成
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感染/无菌滑液的蛋白质组特征，用于鉴定与凝固酶阴性葡萄球菌介导的细菌感染严格相关的分子标志
从受感染的假体植入物中分离出的凝固酶阴性葡萄球菌的分泌组特征
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无菌组
无菌组由与感染无关的种植失败患者组成。
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感染/无菌滑液的蛋白质组特征，用于鉴定与凝固酶阴性葡萄球菌介导的细菌感染严格相关的分子标志
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研究衡量的是什么？
主要结果指标
结果测量 |
措施说明 |
大体时间 |
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鉴定与滑液中凝固酶阴性葡萄球菌的存在严格相关的分子标志
大体时间：3年
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败血症/无菌登记患者的滑液特征，用于鉴定与凝固酶阴性葡萄球菌的存在严格相关的感兴趣的蛋白质库
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3年
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次要结果测量
结果测量 |
措施说明 |
大体时间 |
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凝固酶阴性葡萄球菌的蛋白质组学分析
大体时间：3年
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CoNS 临床分离株的分泌组特征，以及败血症/无菌入组患者滑液蛋白质组的特征
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3年
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合作者和调查者
调查人员
- 首席研究员：Marta Bottagisio, Ph.D.、IRCCS Istituto Ortopedico Galeazzi
研究记录日期
研究主要日期
学习开始 (实际的)
初级完成 (预期的)
研究完成 (预期的)
研究注册日期
首次提交
首先提交符合 QC 标准的
首次发布 (实际的)
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最后更新发布 (实际的)
上次提交的符合 QC 标准的更新
最后验证
更多信息
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