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Identification du marqueur moléculaire des staphylocoques à coagulase négative pour le diagnostic des infections des prothèses articulaires

3 décembre 2020 mis à jour par: Istituto Ortopedico Galeazzi

Marqueurs moléculaires des staphylocoques à coagulase négative : vers l'identification de biomarqueurs pour le diagnostic rapide des infections articulaires périprothétiques subcliniques

L'infection est l'une des principales causes d'échec des prothèses articulaires. Récemment, les staphylocoques à coagulase négative (CoNS) ont été identifiés comme des pathogènes nosocomiaux émergents impliqués dans les infections subcliniques des prothèses articulaires (PJI). Le diagnostic des PJI médiés par le CoNS est complexe et exigeant en raison de l'absence de signes cliniques clairs dérivés de la réponse du système immunitaire de l'hôte. Dans ce scénario, la clé d'un traitement chirurgical réussi est la capacité à faire la différence entre le descellement aseptique de l'implant et l'échec septique. Par conséquent, l'hypothèse centrale de cette étude est que l'analyse protéomique du sécrétome des isolats cliniques de CoNS associée à la caractérisation des liquides synoviaux des patients révélera un panel de biomarqueurs putatifs étroitement liés aux PJI. La confirmation de la présence de biomarqueurs bactériens PJI dans les liquides synoviaux de patients infectés ouvrira la voie au développement d'un nouveau test fiable capable d'aider au diagnostic des PJI subcliniques.

Aperçu de l'étude

Statut

Recrutement

Les conditions

Intervention / Traitement

Description détaillée

Tâche 1.1 : Les liquides synoviaux seront prélevés chez 60 patients référés à l'Institut orthopédique IRCCS Galeazzi pour la révision d'une prothèse septique et chez 40 patients subissant une révision en raison d'une défaillance aseptique. Les liquides synoviaux collectés seront conservés à -80°C jusqu'à l'analyse.

Selon les directives du MSIS, la mesure des niveaux de CRP et de VS, le nombre de globules blancs synoviaux et la culture microbiologique du dispositif explanté et du tissu périprothétique seront effectués selon des protocoles de routine. Seul le liquide synovial prélevé sur les patients du groupe infecté diagnostiqué avec une PJI médiée par CoNS sera éligible pour des analyses protéomiques ultérieures. Tâche 1.2 : Le sécrétome d'au moins 10 isolats des espèces de CoNS récupérées sera caractérisé. En particulier, les isolats cliniques de CoNS seront cultivés dans un réacteur goutte à goutte pour induire la production de biofilm et le sécrétome analysé pour effectuer la première sélection des protéines d'intérêt.

Tâche 2.1 : Les protéines extraites des liquides synoviaux de patients avec ou sans PJI seront carbamidométhylées et digérées par la trypsine. Par la suite, les mélanges de peptides seront analysés par nano chromatographie liquide couplée à la spectrométrie de masse en tandem (nano LC-MS/MS). Des quantifications sans étiquette (LFQ) seront appliquées pour évaluer les niveaux de protéines exprimées par les bactéries et sécrétées dans les liquides synoviaux des patients.

Tâche 2.2 : Utiliser un logiciel de protéomique (c. MaxQuant, Perseus, etc.), l'analyse bioinformatique sera réalisée pour déterminer un pool de protéines d'intérêt présent uniquement dans les échantillons appartenant au groupe de patients infectés qui serait étroitement lié à la présence de bactéries.

Tâche 3.1 : Les protéines d'intérêt identifiées dans les tâches 1.2 et 2.2 en tant que biomarqueurs putatifs liés aux PJI médiés par la CoNS seront sélectionnées pour des analyses protéomiques ciblées au moyen d'analyses bioinformatiques supplémentaires.

Tâche 3.2 : Pour confirmer la présence de biomarqueurs putatifs définis dans la tâche 3.1 dans le liquide synovial des patients inscrits, une analyse protéomique ciblée sera effectuée sur tous les échantillons infectés/non infectés collectés dans la tâche 1.1. Des peptides prototypes pour chaque biomarqueur putatif seront sélectionnés par le logiciel Skyline. Les comportements d'ionisation et de fragmentation de tous les peptides candidats seront étudiés.

Tâche 3.3 : Enfin, les informations issues de l'analyse protéomique ciblée seront corrélées aux résultats du diagnostic formulé conformément aux directives du MSIS afin d'évaluer la valeur diagnostique de chaque biomarqueur sélectionné.

Type d'étude

Observationnel

Inscription (Anticipé)

100

Contacts et emplacements

Cette section fournit les coordonnées de ceux qui mènent l'étude et des informations sur le lieu où cette étude est menée.

Coordonnées de l'étude

Lieux d'étude

  • Italie
      • Milan, Italie, 20161
        • Recrutement
        • IRCCS Istituto Ortopedico Galeazzi
        • Contact:
        • Sous-enquêteur:
          • Marta Bottagisio, Ph.D.

Critères de participation

Les chercheurs recherchent des personnes qui correspondent à une certaine description, appelée critères d'éligibilité. Certains exemples de ces critères sont l'état de santé général d'une personne ou des traitements antérieurs.

Critère d'éligibilité

Âges éligibles pour étudier

14 ans et plus (Adulte, Adulte plus âgé)

Accepte les volontaires sains

Non

Sexes éligibles pour l'étude

Tout

Méthode d'échantillonnage

Échantillon non probabiliste

Population étudiée

Patients soumis à une révision de prothèse articulaire due à une infection bactérienne ou à un descellement aseptique de l'implant

La description

Critère d'intégration:

  • Patients ≥ 18 ans
  • Patients soumis à une révision de prothèse articulaire due à une infection bactérienne médiée par des staphylocoques à coagulase négative (CoNS) ou à une défaillance aseptique de l'implant
  • Collecte d'un volume suffisant de liquide synovial
  • Consentement du patient en signant un formulaire de consentement éclairé

Critère d'exclusion:

  • Patients ne remplissant pas les critères d'inclusion
  • Prélèvement d'un échantillon hémolytique

Plan d'étude

Cette section fournit des détails sur le plan d'étude, y compris la façon dont l'étude est conçue et ce que l'étude mesure.

Comment l'étude est-elle conçue ?

Détails de conception

  • Modèles d'observation: Cas-témoins
  • Perspectives temporelles: Éventuel

Cohortes et interventions

Groupe / Cohorte
Intervention / Traitement
Groupe septique
Le groupe septique est composé de patients présentant une infection de prothèse articulaire médiée par des staphylocoques à coagulase négative (CoNS)
Autre: Analyse protéomique des liquides synoviaux
Caractérisation du protéome du liquide synovial infecté/aseptique pour l'identification de marqueurs moléculaires strictement liés à la présence d'une infection bactérienne médiée par des staphylocoques à coagulase négative
Autre: Analyse protéomique des staphylocoques à coagulase négative isolés
Caractérisation du sécrétome de staphylocoques à coagulase négative isolés d'implants prothétiques infectés
Groupe aseptique
Le groupe aseptique est composé de patients présentant un échec implantaire non lié à une infection.
Autre: Analyse protéomique des liquides synoviaux
Caractérisation du protéome du liquide synovial infecté/aseptique pour l'identification de marqueurs moléculaires strictement liés à la présence d'une infection bactérienne médiée par des staphylocoques à coagulase négative

Que mesure l'étude ?

Principaux critères de jugement

Mesure des résultats
Description de la mesure
Délai
Identification des caractéristiques moléculaires strictement liées à la présence de staphylocoques à coagulase négative dans les liquides synoviaux
Délai: 3 années
Caractérisation des liquides synoviaux de patients septiques/aseptiques inclus pour l'identification d'un pool de protéines d'intérêt strictement lié à la présence de staphylocoques à coaglase négative
3 années

Mesures de résultats secondaires

Mesure des résultats
Description de la mesure
Délai
Analyse protéomique des staphylocoques à coagulase négative
Délai: 3 années
Caractérisation du sécrétome de l'isolat clinique CoNS et caractérisation du protéome des liquides synoviaux des patients septiques/aseptiques inscrits
3 années

Collaborateurs et enquêteurs

C'est ici que vous trouverez les personnes et les organisations impliquées dans cette étude.

Parrainer

Istituto Ortopedico Galeazzi

Les enquêteurs

  • Chercheur principal: Marta Bottagisio, Ph.D., IRCCS Istituto Ortopedico Galeazzi

Dates d'enregistrement des études

Ces dates suivent la progression des dossiers d'étude et des soumissions de résultats sommaires à ClinicalTrials.gov. Les dossiers d'étude et les résultats rapportés sont examinés par la Bibliothèque nationale de médecine (NLM) pour s'assurer qu'ils répondent à des normes de contrôle de qualité spécifiques avant d'être publiés sur le site Web public.

Dates principales de l'étude

Début de l'étude (Réel)

14 octobre 2020

Achèvement primaire (Anticipé)

14 septembre 2023

Achèvement de l'étude (Anticipé)

14 octobre 2023

Dates d'inscription aux études

Première soumission

3 décembre 2020

Première soumission répondant aux critères de contrôle qualité

3 décembre 2020

Première publication (Réel)

10 décembre 2020

Mises à jour des dossiers d'étude

Dernière mise à jour publiée (Réel)

10 décembre 2020

Dernière mise à jour soumise répondant aux critères de contrôle qualité

3 décembre 2020

Dernière vérification

1 décembre 2020

Plus d'information

Termes liés à cette étude

Mots clés

Termes MeSH pertinents supplémentaires

Autres numéros d'identification d'étude

  • SINOVIOMA

Plan pour les données individuelles des participants (IPD)

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Indécis

Informations sur les médicaments et les dispositifs, documents d'étude

Étudie un produit pharmaceutique réglementé par la FDA américaine

Non

Étudie un produit d'appareil réglementé par la FDA américaine

Non

Ces informations ont été extraites directement du site Web clinicaltrials.gov sans aucune modification. Si vous avez des demandes de modification, de suppression ou de mise à jour des détails de votre étude, veuillez contacter register@clinicaltrials.gov. Dès qu'un changement est mis en œuvre sur clinicaltrials.gov, il sera également mis à jour automatiquement sur notre site Web .

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