임상 감염성 질환의 메타게노믹 시퀀싱

감염성 병원균 진단의 진전은 효과적인 방법의 개발과 적합한 바이오마커의 발견에 달려 있습니다. 현미경 검사, 배양, 혈청학적 진단 또는 분자적 접근 등과 같은 다양한 병원체의 진단에 사용되는 여러 종류의 방법이 있다. 그러나 이들 방법은 유사한 한계, 즉 시약의 단일 검출을 갖는다. 더 중요한 것은 의사가 희귀 병원균 감염을 거의 고려하지 않는다는 것입니다. 최근 개발된 metagenomic next-generation sequencing(mNGS)은 기존 진단 검사의 한계를 극복할 수 있는 능력을 갖추고 있습니다. 이 새로운 기술은 가설이 없고 문화에 독립적인 방식으로 단일 실행으로 샘플에서 직접 모든 병원체를 식별할 수 있습니다. 연구에 따르면 mNGS는 혈류, 호흡기 및 일반 감염과 같은 임상 조건에서 기존 배양 방법보다 더 민감합니다. 더 중요한 것은 편향되지 않은 샘플링으로 인해 mNGS는 이론적으로 알려진 것뿐만 아니라 예상치 못한 병원체를 식별하거나 새로운 유기체를 발견할 수도 있습니다. mNGS에는 인간 게놈 오염 및 환경 미생물 오염 가능성과 같은 몇 가지 제한 사항도 있습니다. mNGS에서 대부분의 읽기는 인간 호스트에서 파생됩니다. 이것은 병원체 검출을 위한 mNGS의 전반적인 분석 감도를 방해할 것입니다. 호스트 고갈 방법 또는 표적 시퀀싱은 이러한 단점을 부분적으로 완화하는 데 도움이 될 수 있습니다. mNGS만으로는 검출된 미생물이 원인균인지 환경미생물인지 정의할 수 없기 때문에 결과 해석을 위해서는 임상의, 미생물학자, 실험실 기술자의 다학제적 논의가 필요하다.