KCNA3 및 OTOP2 유전자 메틸화 복합 검출 키트(Fluorescent PCR Method)
식도암/전암성 병변의 보조진단을 위한 혈장 내 KCNA3 및 OTOP2 유전자의 메틸화 검출: 임상시험
본 관찰연구의 목적은 식도암 및 고도식도종양 보조진단에서 "KCNA3 및 OTOP2 유전자 메틸화 복합 검출키트(형광 PCR법)"의 임상적 효능을 시험하는 것이다. 주요 질문은 다음과 같다.
- 키트의 테스트 결과가 임상 참조 진단 기준과 얼마나 일치합니까?
- Sanger sequencing은 각 샘플에 메틸화 부위가 있는지 여부를 시각적으로 확인할 수 있어 이번 임상시험에서는 키트 결과와 Sanger sequencing 결과를 비교하여 시약의 KCNA3 및 OTOP2 유전자 메틸화 검출 정확도를 분석하였다.
각 참가자는 키트 테스트를 완료하기 위해 10ml 이상의 혈액을 제공해야 합니다.
연구 개요
상세 설명
식도암은 편평상피 또는 선상피의 비정상적 과형성에 의해 발생하며, 주요 병리학적 유형은 편평세포암종과 선암종이다. 전 세계적으로 식도암은 발병률이 7번째로 높고 암 사망의 6번째 주요 원인입니다. 통계에 따르면 2020년에는 604,000명의 새로운 식도암 환자가 발생했고 54.4명이 사망했습니다.
식도암의 5년 생존율은 병기에 따라 크게 달랐는데, 예를 들어 Ia기 84.9%, Ib기 70.9%, IIa기 56.2%, IIb기 43.3%, IIIa기 37.9%, IIIb기의 경우 23.3%, IIIc기의 경우 12.9%, IV기의 경우 3.4%. 따라서 식도암의 발생률과 사망률을 낮추기 위해서는 조기진단과 치료가 가장 효과적인 전략이다.
내시경 검사와 병리학적 생검은 현재 식도암 진단을 위한 "황금 표준"이지만 의료 자원, 내성 및 기타 문제로 인해 내시경 검사에 의한 인구 선별 검사는 비용 효율적이지 않고 적용할 수 없습니다. 조기 식도암 및 전암성 병변의 검출에 대해 인지되고 효과적인 혈청학적 마커가 없으며, 다중 혈청학적 마커를 조합한 검출의 효과가 단일 마커보다 우수하고 정확도는 74%~85%이지만 여전히 차선책입니다. .
종양 억제 유전자 프로모터 영역 CpG 섬의 메틸화는 종양 형성 동안 가장 흔한 변화이며, 연구에 따르면 식도암의 초기 단계에서 메틸화 현상이 발생할 수 있습니다.
순환 종양 DNA(ctDNA)는 종양 세포의 세포 사멸, 괴사 또는 분비에 의해 생성된 DNA 단편에서 파생되며, 이는 순환 자유(cfDNA)의 일부입니다. CtDNA는 점 돌연변이, 재배열, 증폭, 미소부수체 변화, 후생유전학적 변형 등과 같은 소스 종양 DNA와 동일한 유전자 결함을 포함합니다.
KCNA3는 칼륨 채널을 암호화하고 주로 세포 점도에 영향을 미치는 단백질 계열의 구성원입니다. OTOP2는 양성자 수송 채널을 암호화하는 단백질 계열의 구성원이며, 일부 연구에서는 식도암 조직에서 두 유전자의 메틸화 수준이 인접 조직보다 훨씬 더 높으며, 식도암 진단을 위한 잠재적 마커로 사용할 수 있음을 보여주었습니다. 식도암.
이 키트는 실시간 형광 PCR 기술을 기반으로 혈장 시료에서 KCNA3 및 OTOP2 메틸화를 정성적으로 검출합니다. PCR 증폭 전, cfDNA는 bisulfite로 형질전환하였고 ACTB(β-Actin) 유전자를 내부 참조로 사용하였다.
연구 유형
등록 (실제)
연락처 및 위치
연구 장소
-
-
-
Shanghai, 중국
- The First Affiliated Hospital of Naval Military Medical University
-
-
참여기준
자격 기준
공부할 수 있는 나이
건강한 자원 봉사자를 받아들입니다
샘플링 방법
연구 인구
- 다른 TNM 단계를 포함하는 300명 이상의 식도암 환자.
- 식도 고급 상피내 종양 환자, 번호 ≥70.
- 식도염, 위염, 장염, 맹장염, 위용종, 대장용종 등의 양성 소화기 질환 환자 200명 이상
- 기타 소화기계 악성종양(위암, 대장암, 간암, 췌장암, 담관암 등 포함) 및 비소화기 악성종양(갑상선암, 폐편평세포암종, 자궁경부암, 자궁내막암 포함) 환자 , 유방암, 전립선암 등), 수 ≥350.
- 등록된 모든 참가자는 ≥1000이어야 합니다.
설명
포함 기준:
- 식도암의 근치적 식도 절제술, 내시경 점막하 절제술 또는 1차 화학방사선 요법을 받을 계획인 개인으로부터 주로 등록된 식도 환자의 내시경, 영상 검사 또는 병리학적 생검 및 고도 상피내 신생물에 의해 확인되거나 매우 의심되는 식도 암종 환자.
- 내시경 검사를 받은 양성 소화기계 질환자(식도염, 위염, 장염, 맹장염, 위용종, 대장용종 등 포함)
- 치료를 받지 않은 다른 소화기계 악성종양(위암, 대장암, 간암, 췌장암, 담도암 등 포함) 및 비소화기 악성종양(갑상선암, 폐편평세포암종, 자궁경부암, 자궁내막암 포함) 환자 암, 유방암, 전립선암 등)을 임상 참조 진단 기준으로 확인하였다.
제외 기준:
- 방사선 요법/화학 요법과 같은 항종양 요법을 받은 환자;
- 다른 악성 종양도 앓고 있는 식도암종 및 고도 상피내 신생물 환자;
- 필요에 따라 보관되지 않은 샘플 또는 용혈 샘플;
- 샘플 볼륨이 감지 요구 사항을 충족하지 못합니다.
- 원격 전이가 있는 식도암 환자.
공부 계획
연구는 어떻게 설계됩니까?
디자인 세부사항
- 관찰 모델: 케이스 컨트롤
- 시간 관점: 단면
코호트 및 개입
그룹/코호트 |
개입 / 치료 |
|---|---|
|
포지티브 그룹
식도 암종 및 고급 상피내 종양 환자.
|
두 그룹의 참가자로부터 혈액 샘플을 수집하고 키트 지침에 따라 메틸화 테스트를 수행했습니다.
|
|
네거티브 그룹
기타 소화기 악성종양(위암, 대장암, 간암, 췌장암, 담관암 등 포함) 및 비소화기 악성종양(갑상선암, 폐편평세포암종, 자궁경부암, 자궁내막암, 유방암 포함) 환자 , 전립선암 등), 양성소화기질환(식도염, 위염, 장염, 맹장염, 위용종, 대장용종 등 포함)
|
두 그룹의 참가자로부터 혈액 샘플을 수집하고 키트 지침에 따라 메틸화 테스트를 수행했습니다.
|
연구는 무엇을 측정합니까?
주요 결과 측정
결과 측정 |
측정값 설명 |
기간 |
|---|---|---|
|
타당성
기간: 시술 직후
|
이 연구에서 타당도는 민감도와 특이도를 포함하여 황금 진단 표준과 메틸화 테스트의 일관성을 나타냅니다.
민감도는 식도암/고등급 종양 샘플에서 메틸화 양성 샘플의 비율을 나타냅니다.
특이성은 비식도암/고등급 신생물에서 메틸화 음성 샘플의 비율을 나타냅니다.
|
시술 직후
|
2차 결과 측정
결과 측정 |
측정값 설명 |
기간 |
|---|---|---|
|
신뢰할 수 있음
기간: 시술 직후
|
본 연구에서 신뢰도 평가는 두 가지 지표 즉, Sanger 시퀀싱과 메틸화 검출의 일치율 및 두 방법의 Kappa 값을 포함하였다.
|
시술 직후
|
공동 작업자 및 조사자
수사관
- 수석 연구원: Luowei Wang, MD, Changhai Hospital
간행물 및 유용한 링크
일반 간행물
- Sung H, Ferlay J, Siegel RL, Laversanne M, Soerjomataram I, Jemal A, Bray F. Global Cancer Statistics 2020: GLOBOCAN Estimates of Incidence and Mortality Worldwide for 36 Cancers in 185 Countries. CA Cancer J Clin. 2021 May;71(3):209-249. doi: 10.3322/caac.21660. Epub 2021 Feb 4.
- Wang GQ, Abnet CC, Shen Q, Lewin KJ, Sun XD, Roth MJ, Qiao YL, Mark SD, Dong ZW, Taylor PR, Dawsey SM. Histological precursors of oesophageal squamous cell carcinoma: results from a 13 year prospective follow up study in a high risk population. Gut. 2005 Feb;54(2):187-92. doi: 10.1136/gut.2004.046631.
- di Pietro M, Canto MI, Fitzgerald RC. Endoscopic Management of Early Adenocarcinoma and Squamous Cell Carcinoma of the Esophagus: Screening, Diagnosis, and Therapy. Gastroenterology. 2018 Jan;154(2):421-436. doi: 10.1053/j.gastro.2017.07.041. Epub 2017 Aug 2.
- Wang J, Wu N, Zheng QF, Yan S, Lv C, Li SL, Yang Y. Evaluation of the 7th edition of the TNM classification in patients with resected esophageal squamous cell carcinoma. World J Gastroenterol. 2014 Dec 28;20(48):18397-403. doi: 10.3748/wjg.v20.i48.18397.
- Talukdar FR, Soares Lima SC, Khoueiry R, Laskar RS, Cuenin C, Sorroche BP, Boisson AC, Abedi-Ardekani B, Carreira C, Menya D, Dzamalala CP, Assefa M, Aseffa A, Miranda-Goncalves V, Jeronimo C, Henrique RM, Shakeri R, Malekzadeh R, Gasmelseed N, Ellaithi M, Gangane N, Middleton DRS, Le Calvez-Kelm F, Ghantous A, Roux ML, Schuz J, McCormack V, Parker MI, Pinto LFR, Herceg Z. Genome-Wide DNA Methylation Profiling of Esophageal Squamous Cell Carcinoma from Global High-Incidence Regions Identifies Crucial Genes and Potential Cancer Markers. Cancer Res. 2021 May 15;81(10):2612-2624. doi: 10.1158/0008-5472.CAN-20-3445. Epub 2021 Mar 19.
- Qin Y, Wu CW, Taylor WR, Sawas T, Burger KN, Mahoney DW, Sun Z, Yab TC, Lidgard GP, Allawi HT, Buttar NS, Smyrk TC, Iyer PG, Katzka DA, Ahlquist DA, Kisiel JB. Discovery, Validation, and Application of Novel Methylated DNA Markers for Detection of Esophageal Cancer in Plasma. Clin Cancer Res. 2019 Dec 15;25(24):7396-7404. doi: 10.1158/1078-0432.CCR-19-0740. Epub 2019 Sep 16.
- Cao W, Lee H, Wu W, Zaman A, McCorkle S, Yan M, Chen J, Xing Q, Sinnott-Armstrong N, Xu H, Sailani MR, Tang W, Cui Y, Liu J, Guan H, Lv P, Sun X, Sun L, Han P, Lou Y, Chang J, Wang J, Gao Y, Guo J, Schenk G, Shain AH, Biddle FG, Collisson E, Snyder M, Bivona TG. Multi-faceted epigenetic dysregulation of gene expression promotes esophageal squamous cell carcinoma. Nat Commun. 2020 Jul 22;11(1):3675. doi: 10.1038/s41467-020-17227-z.
- Tu YH, Cooper AJ, Teng B, Chang RB, Artiga DJ, Turner HN, Mulhall EM, Ye W, Smith AD, Liman ER. An evolutionarily conserved gene family encodes proton-selective ion channels. Science. 2018 Mar 2;359(6379):1047-1050. doi: 10.1126/science.aao3264. Epub 2018 Jan 25.
연구 기록 날짜
연구 주요 날짜
연구 시작 (실제)
기본 완료 (실제)
연구 완료 (실제)
연구 등록 날짜
최초 제출
QC 기준을 충족하는 최초 제출
처음 게시됨 (실제)
연구 기록 업데이트
마지막 업데이트 게시됨 (실제)
QC 기준을 충족하는 마지막 업데이트 제출
마지막으로 확인됨
추가 정보
이 연구와 관련된 용어
키워드
기타 연구 ID 번호
- AD10
개별 참가자 데이터(IPD) 계획
개별 참가자 데이터(IPD)를 공유할 계획입니까?
IPD 계획 설명
개별 참가자의 기밀 정보는 연구자 및 임상 시험 기관에서 보유하며, 피험자의 개인 정보는 보고서, 간행물 등에 공개되지 않습니다.
원본 데이터 및 파일에 대한 직접 액세스는 대상의 개인 정보를 공개하지 않고 모니터링, 감사 또는 검사 목적으로만 허용됩니다.
의약품 행정당국은 수집된 데이터의 진위 및 무결성을 확인하기 위해 의료기기 임상시험 기본 문서를 검사할 수 있습니다.
약물 및 장치 정보, 연구 문서
미국 FDA 규제 의약품 연구
미국 FDA 규제 기기 제품 연구
이 정보는 변경 없이 clinicaltrials.gov 웹사이트에서 직접 가져온 것입니다. 귀하의 연구 세부 정보를 변경, 제거 또는 업데이트하도록 요청하는 경우 register@clinicaltrials.gov. 문의하십시오. 변경 사항이 clinicaltrials.gov에 구현되는 즉시 저희 웹사이트에도 자동으로 업데이트됩니다. .