KCNA3 en OTOP2 gecombineerde detectiekit voor genmethylering (fluorescente PCR-methode)
Methyleringsdetectie van KCNA3- en OTOP2-genen in plasma voor de hulpdiagnose van slokdarmkanker/precancereuze laesies: een klinisch onderzoek
Het doel van deze observationele studie is het testen van de klinische werkzaamheid van "KCNA3 en OTOP2 genmethylatie gecombineerde detectiekit (fluorescentie PCR-methode)" bij slokdarmkanker en hoogwaardige slokdarmneoplasie als hulpdiagnose. De belangrijkste vragen die het wil beantwoorden zijn:
- Hoe consistent zijn de testresultaten van de kit met de klinische referentie diagnostische criteria?
- Sanger-sequencing kan visueel laten zien of elk monster methyleringsplaatsen bevat, dus in deze klinische proef werden de resultaten van de kit vergeleken met Sanger-sequencing-resultaten om de nauwkeurigheid van het reagens bij het detecteren van KCNA3- en OTOP2-genmethylering te analyseren.
Elke deelnemer moet niet minder dan 10 ml bloed verstrekken om de kittest te voltooien.
Studie Overzicht
Toestand
Conditie
Gedetailleerde beschrijving
Slokdarmcarcinoom wordt veroorzaakt door abnormale hyperplasie van het plaveisel- of glandulaire epitheel, de belangrijkste pathologische typen zijn plaveiselcelcarcinoom en adenocarcinoom. Wereldwijd heeft slokdarmkanker de zevende hoogste incidentie en de zesde belangrijkste doodsoorzaak door kanker. Statistieken toonden aan dat er in 2020 604.000 nieuwe gevallen van slokdarmkanker en 54,4 sterfgevallen waren.
De overlevingspercentages na 5 jaar waren significant verschillend bij slokdarmcarcinomen van verschillende stadia, het is bijvoorbeeld 84,9% voor stadium Ia, 70,9% voor stadium Ib, 56,2% voor stadium IIa, 43,3% voor stadium IIb, 37,9% voor stadium IIIa, 23,3% voor stadium IIIb, 12,9% voor stadium IIIc en 3,4% voor stadium IV. Daarom is vroege diagnose en behandeling de meest effectieve strategie om de incidentie en mortaliteit van slokdarmkanker te verminderen.
Endoscopie en pathologische biopsie zijn momenteel de "gouden standaard" voor het diagnosticeren van slokdarmkanker, maar beperkt door medische middelen, tolerantie en andere problemen is bevolkingsonderzoek door middel van endoscopie niet kosteneffectief en niet toepasbaar. Er is geen erkende en effectieve serologische marker voor de detectie van vroeg slokdarmcarcinoom en precancereuze laesies, het effect van gecombineerde detectie van meerdere serologische markers is beter dan dat van enkele markers, en de nauwkeurigheid was 74% ~ 85%, maar het is nog steeds suboptimaal .
Methylering van het tumorsuppressorgen-promotergebied CpG-eiland is de meest voorkomende verandering tijdens het ontstaan van tumoren. Studies hebben aangetoond dat methyleringsgebeurtenissen kunnen optreden in de vroege stadia van slokdarmkanker.
Circulerend tumor-DNA (ctDNA) is afgeleid van DNA-fragmenten geproduceerd door apoptose, necrose of secretie van tumorcellen, wat een onderdeel is van circulerend vrij (cfDNA). CtDNA bevat dezelfde gendefecten als het brontumor-DNA, zoals puntmutatie, herschikking, amplificatie, microsatellietverandering, epigenetische modificatie, enz.
KCNA3 is een lid van de eiwitfamilie die codeert voor kaliumkanalen en voornamelijk de celviscositeit beïnvloedt. OTOP2 is een lid van de eiwitfamilie die codeert voor protontransportkanalen. Sommige onderzoeken hebben aangetoond dat de methyleringsniveaus van twee genen in weefsels van slokdarmkanker significant hoger waren dan die in aangrenzende weefsels, en ze kunnen worden gebruikt als een potentiële marker voor de diagnose van slokdarmkanker.
Deze kit is gebaseerd op real-time fluorescentie-PCR-technologie om de kwalitatieve detectie van KCNA3- en OTOP2-methylatie in plasmamonsters te bereiken. Vóór PCR-amplificatie werd cfDNA getransformeerd door bisulfiet en werd het ACTB-gen (β-actine) gebruikt als interne referentie.
Studietype
Inschrijving (Werkelijk)
Contacten en locaties
Studie Locaties
-
-
-
Shanghai, China
- The First Affiliated Hospital of Naval Military Medical University
-
-
Deelname Criteria
Geschiktheidscriteria
Leeftijden die in aanmerking komen voor studie
Accepteert gezonde vrijwilligers
Bemonsteringsmethode
Studie Bevolking
- Patiënten met slokdarmkanker, aantal ≥ 300, met verschillende TNM-stadia.
- Patiënten met hooggradige intra-epitheliale neoplase van de slokdarm, aantal ≥70.
- Patiënten met goedaardige ziekten van het spijsverteringsstelsel, waaronder oesofagitis, gastritis, enteritis, appendicitis, maagpoliepen, colorectale poliepen, enz. , aantal ≥200.
- Patiënten met andere maligniteiten van het spijsverteringsstelsel (waaronder maagkanker, colorectale kanker, leverkanker, pancreaskanker, galwegkanker, enz.) , borstkanker, prostaatkanker, etc.), aantal ≥350.
- Alle ingeschreven deelnemers moeten ≥1000 zijn.
Beschrijving
Inclusiecriteria:
- slokdarmcarcinoompatiënten bevestigd of sterk vermoed door endoscopie, beeldvormend onderzoek of pathologische biopsie, en hoogwaardige intra-epitheliale neoplasie van de slokdarmpatiënten die voornamelijk werden ingeschreven van personen die van plan waren een radicale slokdarmresectie van slokdarmkanker, endoscopische submucosale dissectie of primaire chemoradiotherapie te ondergaan.
- patiënten met goedaardige ziekten van het spijsverteringsstelsel die endoscopie hebben ondergaan (waaronder oesofagitis, gastritis, enteritis, appendicitis, maagpoliepen, colorectale poliepen, enz.).
- Onbehandelde patiënten met andere maligniteiten van het spijsverteringsstelsel (waaronder maagkanker, colorectale kanker, leverkanker, alvleesklierkanker, galwegkanker, enz.) kanker, borstkanker, prostaatkanker, enz.) bevestigd door klinische referentiediagnostische criteria.
Uitsluitingscriteria:
- patiënten die antitumortherapie hebben gekregen, zoals radiotherapie/chemotherapie;
- Patiënten met slokdarmcarcinoom en hooggradige intra-epitheliale neoplasie die ook aan andere kwaadaardige tumoren leden;
- Monsters die niet zijn bewaard zoals vereist of monsters van hemolyse;
- Het monstervolume voldoet niet aan de detectie-eisen;
- Patiënten met slokdarmcarcinoom met metastasen op afstand.
Studie plan
Hoe is de studie opgezet?
Ontwerpdetails
- Observatiemodellen: Case-control
- Tijdsperspectieven: Dwarsdoorsnede
Cohorten en interventies
Groep / Cohort |
Interventie / Behandeling |
|---|---|
|
Positieve groep
Patiënten met slokdarmcarcinoom en hoogwaardige intra-epitheliale neoplasie.
|
Bloedmonsters van deelnemers in beide groepen werden verzameld en methylatietests werden uitgevoerd volgens de instructies van de kit.
|
|
Negatieve groep
Patiënten met andere maligniteiten van het spijsverteringsstelsel (waaronder maagkanker, colorectale kanker, leverkanker, alvleesklierkanker, cholangiocarcinoom, enz.) , prostaatkanker, enz.), Patiënten met goedaardige spijsverteringsstoornissen (waaronder oesofagitis, gastritis, enteritis, appendicitis, maagpoliepen, colorectale poliepen, enz.).
|
Bloedmonsters van deelnemers in beide groepen werden verzameld en methylatietests werden uitgevoerd volgens de instructies van de kit.
|
Wat meet het onderzoek?
Primaire uitkomstmaten
Uitkomstmaat |
Maatregel Beschrijving |
Tijdsspanne |
|---|---|---|
|
Geldigheid
Tijdsspanne: Meteen na de procedure
|
In deze studie geeft validiteit de consistentie aan van de methyleringstest met de gouden diagnostische standaarden, inclusief gevoeligheid en specificiteit.
Gevoeligheid geeft het aandeel methylering-positieve monsters in monsters van slokdarmkanker/hooggradige neoplasie aan.
Specificiteit geeft het aandeel methylatie-negatieve monsters aan bij niet-slokdarmkanker/hooggradige neoplasie.
|
Meteen na de procedure
|
Secundaire uitkomstmaten
Uitkomstmaat |
Maatregel Beschrijving |
Tijdsspanne |
|---|---|---|
|
betrouwbaarheid
Tijdsspanne: Meteen na de procedure
|
In deze studie omvatte de betrouwbaarheidsevaluatie twee indicatoren, namelijk het overeenstemmingspercentage van methylatiedetectie met Sanger-sequencing, en de Kappa-waarde van de twee methoden
|
Meteen na de procedure
|
Medewerkers en onderzoekers
Medewerkers
Onderzoekers
- Hoofdonderzoeker: Luowei Wang, MD, Changhai Hospital
Publicaties en nuttige links
Algemene publicaties
- Sung H, Ferlay J, Siegel RL, Laversanne M, Soerjomataram I, Jemal A, Bray F. Global Cancer Statistics 2020: GLOBOCAN Estimates of Incidence and Mortality Worldwide for 36 Cancers in 185 Countries. CA Cancer J Clin. 2021 May;71(3):209-249. doi: 10.3322/caac.21660. Epub 2021 Feb 4.
- Wang GQ, Abnet CC, Shen Q, Lewin KJ, Sun XD, Roth MJ, Qiao YL, Mark SD, Dong ZW, Taylor PR, Dawsey SM. Histological precursors of oesophageal squamous cell carcinoma: results from a 13 year prospective follow up study in a high risk population. Gut. 2005 Feb;54(2):187-92. doi: 10.1136/gut.2004.046631.
- di Pietro M, Canto MI, Fitzgerald RC. Endoscopic Management of Early Adenocarcinoma and Squamous Cell Carcinoma of the Esophagus: Screening, Diagnosis, and Therapy. Gastroenterology. 2018 Jan;154(2):421-436. doi: 10.1053/j.gastro.2017.07.041. Epub 2017 Aug 2.
- Wang J, Wu N, Zheng QF, Yan S, Lv C, Li SL, Yang Y. Evaluation of the 7th edition of the TNM classification in patients with resected esophageal squamous cell carcinoma. World J Gastroenterol. 2014 Dec 28;20(48):18397-403. doi: 10.3748/wjg.v20.i48.18397.
- Talukdar FR, Soares Lima SC, Khoueiry R, Laskar RS, Cuenin C, Sorroche BP, Boisson AC, Abedi-Ardekani B, Carreira C, Menya D, Dzamalala CP, Assefa M, Aseffa A, Miranda-Goncalves V, Jeronimo C, Henrique RM, Shakeri R, Malekzadeh R, Gasmelseed N, Ellaithi M, Gangane N, Middleton DRS, Le Calvez-Kelm F, Ghantous A, Roux ML, Schuz J, McCormack V, Parker MI, Pinto LFR, Herceg Z. Genome-Wide DNA Methylation Profiling of Esophageal Squamous Cell Carcinoma from Global High-Incidence Regions Identifies Crucial Genes and Potential Cancer Markers. Cancer Res. 2021 May 15;81(10):2612-2624. doi: 10.1158/0008-5472.CAN-20-3445. Epub 2021 Mar 19.
- Qin Y, Wu CW, Taylor WR, Sawas T, Burger KN, Mahoney DW, Sun Z, Yab TC, Lidgard GP, Allawi HT, Buttar NS, Smyrk TC, Iyer PG, Katzka DA, Ahlquist DA, Kisiel JB. Discovery, Validation, and Application of Novel Methylated DNA Markers for Detection of Esophageal Cancer in Plasma. Clin Cancer Res. 2019 Dec 15;25(24):7396-7404. doi: 10.1158/1078-0432.CCR-19-0740. Epub 2019 Sep 16.
- Cao W, Lee H, Wu W, Zaman A, McCorkle S, Yan M, Chen J, Xing Q, Sinnott-Armstrong N, Xu H, Sailani MR, Tang W, Cui Y, Liu J, Guan H, Lv P, Sun X, Sun L, Han P, Lou Y, Chang J, Wang J, Gao Y, Guo J, Schenk G, Shain AH, Biddle FG, Collisson E, Snyder M, Bivona TG. Multi-faceted epigenetic dysregulation of gene expression promotes esophageal squamous cell carcinoma. Nat Commun. 2020 Jul 22;11(1):3675. doi: 10.1038/s41467-020-17227-z.
- Tu YH, Cooper AJ, Teng B, Chang RB, Artiga DJ, Turner HN, Mulhall EM, Ye W, Smith AD, Liman ER. An evolutionarily conserved gene family encodes proton-selective ion channels. Science. 2018 Mar 2;359(6379):1047-1050. doi: 10.1126/science.aao3264. Epub 2018 Jan 25.
Studie record data
Bestudeer belangrijke data
Studie start (Werkelijk)
Primaire voltooiing (Werkelijk)
Studie voltooiing (Werkelijk)
Studieregistratiedata
Eerst ingediend
Eerst ingediend dat voldeed aan de QC-criteria
Eerst geplaatst (Werkelijk)
Updates van studierecords
Laatste update geplaatst (Werkelijk)
Laatste update ingediend die voldeed aan QC-criteria
Laatst geverifieerd
Meer informatie
Termen gerelateerd aan deze studie
Trefwoorden
Aanvullende relevante MeSH-voorwaarden
Andere studie-ID-nummers
- AD10
Plan Individuele Deelnemersgegevens (IPD)
Bent u van plan om gegevens van individuele deelnemers (IPD) te delen?
Beschrijving IPD-plan
Vertrouwelijke informatie van de individuele deelnemer zal worden bewaard door onderzoekers en instellingen voor klinische proeven, persoonlijke informatie van proefpersonen zal niet worden bekendgemaakt in rapporten, publicaties, enz.
Rechtstreekse toegang tot brongegevens en -bestanden is alleen toegestaan ten behoeve van monitoring, auditing of inspectie, zonder de privacy van de betrokkene prijs te geven.
De administratie medische producten kan de basisdocumenten van klinische proeven met medische hulpmiddelen inzien om de authenticiteit en de integriteit van de verzamelde gegevens te bevestigen.
Informatie over medicijnen en apparaten, studiedocumenten
Bestudeert een door de Amerikaanse FDA gereguleerd geneesmiddel
Bestudeert een door de Amerikaanse FDA gereguleerd apparaatproduct
Deze informatie is zonder wijzigingen rechtstreeks van de website clinicaltrials.gov gehaald. Als u verzoeken heeft om uw onderzoeksgegevens te wijzigen, te verwijderen of bij te werken, neem dan contact op met register@clinicaltrials.gov. Zodra er een wijziging wordt doorgevoerd op clinicaltrials.gov, wordt deze ook automatisch bijgewerkt op onze website .