KCNA3 und OTOP2 Gene Methylation Combined Detection Kit (Fluoreszenz-PCR-Methode)
Methylierungsnachweis von KCNA3- und OTOP2-Genen im Plasma zur Hilfsdiagnose von Speiseröhrenkrebs/Präkanzerosen: eine klinische Studie
Das Ziel dieser Beobachtungsstudie ist es, die klinische Wirksamkeit des "KCNA3- und OTOP2-Genmethylierungs-Kombinations-Nachweiskits (Fluoreszenz-PCR-Methode)" bei Speiseröhrenkrebs und hochgradiger Ösophagusneoplasie-Hilfsdiagnose zu testen. Die wichtigsten Fragen, die beantwortet werden sollen, sind:
- Wie konsistent sind die Testergebnisse des Kits mit den diagnostischen Kriterien der klinischen Referenz?
- Die Sanger-Sequenzierung kann visuell zeigen, ob jede Probe Methylierungsstellen enthält, daher wurden in dieser klinischen Studie die Kit-Ergebnisse mit den Sanger-Sequenzierungsergebnissen verglichen, um die Genauigkeit des Reagens beim Nachweis der KCNA3- und OTOP2-Genmethylierung zu analysieren.
Jeder Teilnehmer muss mindestens 10 ml Blut zur Verfügung stellen, um den Kit-Test abzuschließen.
Studienübersicht
Status
Bedingungen
Intervention / Behandlung
Detaillierte Beschreibung
Ösophaguskarzinom wird durch abnormale Hyperplasie des Plattenepithels oder Drüsenepithels verursacht, die wichtigsten pathologischen Typen sind Plattenepithelkarzinome und Adenokarzinome. Weltweit hat Speiseröhrenkrebs die siebthöchste Inzidenz und die sechsthäufigste Krebstodesursache. Statistiken zeigten, dass es im Jahr 2020 604.000 neue Fälle von Speiseröhrenkrebs und 54,4 Todesfälle gab.
Die 5-Jahres-Überlebensraten waren bei Ösophaguskarzinomen verschiedener Stadien signifikant unterschiedlich, zum Beispiel 84,9 % für Stadium Ia, 70,9 % für Stadium Ib, 56,2 % für Stadium IIa, 43,3 % für Stadium IIb, 37,9 % für Stadium IIIa, 23,3 % für Stadium IIIb, 12,9 % für Stadium IIIc und 3,4 % für Stadium IV. Daher ist eine frühzeitige Diagnose und Behandlung die effektivste Strategie, um die Inzidenz und Mortalität von Speiseröhrenkrebs zu reduzieren.
Endoskopie und pathologische Biopsie sind derzeit der "goldene Standard" für die Diagnose von Speiseröhrenkrebs, jedoch ist das Bevölkerungsscreening durch Endoskopie aufgrund der Einschränkungen durch medizinische Ressourcen, Verträglichkeit und andere Probleme nicht kosteneffektiv und anwendbar. Es gibt keinen anerkannten und wirksamen serologischen Marker für den Nachweis von Ösophaguskarzinomen im Frühstadium und präkanzerösen Läsionen, die Wirkung des kombinierten Nachweises mehrerer serologischer Marker ist besser als die von Einzelmarkern, und die Genauigkeit betrug 74 % bis 85 %, ist aber immer noch suboptimal .
Die Methylierung der CpG-Insel der Tumorsuppressorgen-Promotorregion ist die häufigste Veränderung während der Tumorentstehung. Studien zeigten, dass Methylierungsereignisse in den frühen Stadien von Speiseröhrenkrebs auftreten können.
Zirkulierende Tumor-DNA (ctDNA) wird von DNA-Fragmenten abgeleitet, die durch Apoptose, Nekrose oder Sekretion von Tumorzellen produziert werden, die ein Teil von zirkulierender freier (cfDNA) ist. CtDNA enthält dieselben Gendefekte wie ihre Ursprungstumor-DNA, wie z. B. Punktmutation, Umlagerung, Amplifikation, Mikrosatellitenveränderung, epigenetische Modifikation usw.
KCNA3 ist ein Mitglied der Proteinfamilie, die für Kaliumkanäle kodiert und hauptsächlich die Zellviskosität beeinflusst. OTOP2 ist ein Mitglied der Proteinfamilie, die für Protonentransportkanäle kodiert. Einige Studien haben gezeigt, dass die Methylierungsgrade von zwei Genen in Geweben von Speiseröhrenkrebs signifikant höher waren als in angrenzenden Geweben, und sie können als potenzieller Marker für die Diagnose verwendet werden Speiseröhrenkrebs.
Dieses Kit basiert auf der Echtzeit-Fluoreszenz-PCR-Technologie zum qualitativen Nachweis der KCNA3- und OTOP2-Methylierung in Plasmaproben. Vor der PCR-Amplifikation wurde die cfDNA durch Bisulfit transformiert und das ACTB (β-Actin)-Gen wird als interne Referenz verwendet.
Studientyp
Einschreibung (Tatsächlich)
Kontakte und Standorte
Studienorte
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Shanghai, China
- The First Affiliated Hospital of Naval Military Medical University
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Teilnahmekriterien
Zulassungskriterien
Studienberechtigtes Alter
Akzeptiert gesunde Freiwillige
Probenahmeverfahren
Studienpopulation
- Patienten mit Speiseröhrenkrebs, Anzahl ≥ 300, mit unterschiedlichen TNM-Stadien.
- Patienten mit hochgradiger intraepithelialer Neoplasie des Ösophagus, Anzahl ≥70.
- Patienten mit gutartigen Erkrankungen des Verdauungssystems, einschließlich Ösophagitis, Gastritis, Enteritis, Blinddarmentzündung, Magenpolypen, kolorektalen Polypen usw., Anzahl ≥200.
- Patienten mit anderen bösartigen Erkrankungen des Verdauungssystems (einschließlich Magenkrebs, Darmkrebs, Leberkrebs, Bauchspeicheldrüsenkrebs, Gallengangskrebs usw.) und Patienten mit bösartigen Erkrankungen außerhalb des Verdauungssystems (einschließlich Schilddrüsenkrebs, Plattenepithelkarzinom der Lunge, Gebärmutterhalskrebs, Gebärmutterschleimhautkrebs). , Brustkrebs, Prostatakrebs usw.), Anzahl ≥350.
- Alle eingeschriebenen Teilnehmer sollten ≥1000 sein.
Beschreibung
Einschlusskriterien:
- Ösophaguskarzinom-Patienten, die durch Endoskopie, bildgebende Untersuchung oder pathologische Biopsie bestätigt oder hochgradig vermutet wurden, und hochgradige intraepitheliale Neoplasie der Speiseröhre Patienten, die hauptsächlich von Personen eingeschrieben wurden, die eine radikale Ösophagektomie des Ösophaguskarzinoms, eine endoskopische Submukosadissektion oder eine primäre Radiochemotherapie planten.
- Patienten mit gutartigen Erkrankungen des Verdauungssystems, die sich einer Endoskopie unterzogen haben (einschließlich Ösophagitis, Gastritis, Enteritis, Blinddarmentzündung, Magenpolypen, Darmpolypen usw.).
- Unbehandelte Patienten mit anderen bösartigen Erkrankungen des Verdauungssystems (einschließlich Magenkrebs, Darmkrebs, Leberkrebs, Bauchspeicheldrüsenkrebs, Gallengangskrebs usw.) und Patienten mit bösartigen Erkrankungen außerhalb des Verdauungssystems (einschließlich Schilddrüsenkrebs, Plattenepithelkarzinom der Lunge, Gebärmutterhalskrebs, Gebärmutterschleimhautkrebs). Krebs, Brustkrebs, Prostatakrebs usw.), bestätigt durch klinische Referenzdiagnostikkriterien.
Ausschlusskriterien:
- Patienten, die eine Antitumortherapie wie Strahlentherapie/Chemotherapie erhalten haben;
- Patienten mit Ösophaguskarzinom und hochgradiger intraepithelialer Neoplasie, die auch an anderen bösartigen Tumoren litten;
- Proben, die nicht wie vorgeschrieben aufbewahrt werden, oder Proben von Hämolyse;
- Das Probenvolumen entspricht nicht den Nachweisanforderungen;
- Ösophaguskarzinom-Patienten mit Fernmetastasen.
Studienplan
Wie ist die Studie aufgebaut?
Designdetails
- Beobachtungsmodelle: Fallkontrolle
- Zeitperspektiven: Querschnitt
Kohorten und Interventionen
Gruppe / Kohorte |
Intervention / Behandlung |
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Positive Gruppe
Ösophaguskarzinom und hochgradige intraepitheliale Neoplasien Patienten.
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Blutproben von Teilnehmern in beiden Gruppen wurden gesammelt und Methylierungstests wurden gemäß den Anweisungen des Kits durchgeführt.
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Negative Gruppe
Patienten mit anderen bösartigen Erkrankungen des Verdauungstrakts (einschließlich Magenkrebs, Darmkrebs, Leberkrebs, Bauchspeicheldrüsenkrebs, Cholangiokarzinom usw.) und Patienten mit bösartigen Tumoren außerhalb des Verdauungstrakts (einschließlich Schilddrüsenkrebs, Plattenepithelkarzinom der Lunge, Gebärmutterhalskrebs, Gebärmutterschleimhautkrebs, Brustkrebs). , Prostatakrebs usw.), Patienten mit gutartigen Verdauungsstörungen (einschließlich Ösophagitis, Gastritis, Enteritis, Blinddarmentzündung, Magenpolypen, Darmpolypen usw.).
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Blutproben von Teilnehmern in beiden Gruppen wurden gesammelt und Methylierungstests wurden gemäß den Anweisungen des Kits durchgeführt.
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Was misst die Studie?
Primäre Ergebnismessungen
Ergebnis Maßnahme |
Maßnahmenbeschreibung |
Zeitfenster |
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Gültigkeit
Zeitfenster: Unmittelbar nach dem Eingriff
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In dieser Studie zeigt die Validität die Übereinstimmung des Methylierungstests mit den goldenen diagnostischen Standards, einschließlich Sensitivität und Spezifität.
Die Sensitivität gibt den Anteil methylierungspositiver Proben in Proben von Speiseröhrenkrebs/hochgradigen Neoplasien an.
Die Spezifität gibt den Anteil methylierungsnegativer Proben bei nicht-ösophagealem Krebs/hochgradigen Neoplasien an.
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Unmittelbar nach dem Eingriff
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Sekundäre Ergebnismessungen
Ergebnis Maßnahme |
Maßnahmenbeschreibung |
Zeitfenster |
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Verlässlichkeit
Zeitfenster: Unmittelbar nach dem Eingriff
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In dieser Studie umfasste die Zuverlässigkeitsbewertung zwei Indikatoren, nämlich die Übereinstimmungsrate des Methylierungsnachweises mit der Sanger-Sequenzierung und den Kappa-Wert der beiden Methoden
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Unmittelbar nach dem Eingriff
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Mitarbeiter und Ermittler
Mitarbeiter
Ermittler
- Hauptermittler: Luowei Wang, MD, Changhai Hospital
Publikationen und hilfreiche Links
Allgemeine Veröffentlichungen
- Sung H, Ferlay J, Siegel RL, Laversanne M, Soerjomataram I, Jemal A, Bray F. Global Cancer Statistics 2020: GLOBOCAN Estimates of Incidence and Mortality Worldwide for 36 Cancers in 185 Countries. CA Cancer J Clin. 2021 May;71(3):209-249. doi: 10.3322/caac.21660. Epub 2021 Feb 4.
- Wang GQ, Abnet CC, Shen Q, Lewin KJ, Sun XD, Roth MJ, Qiao YL, Mark SD, Dong ZW, Taylor PR, Dawsey SM. Histological precursors of oesophageal squamous cell carcinoma: results from a 13 year prospective follow up study in a high risk population. Gut. 2005 Feb;54(2):187-92. doi: 10.1136/gut.2004.046631.
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- Wang J, Wu N, Zheng QF, Yan S, Lv C, Li SL, Yang Y. Evaluation of the 7th edition of the TNM classification in patients with resected esophageal squamous cell carcinoma. World J Gastroenterol. 2014 Dec 28;20(48):18397-403. doi: 10.3748/wjg.v20.i48.18397.
- Talukdar FR, Soares Lima SC, Khoueiry R, Laskar RS, Cuenin C, Sorroche BP, Boisson AC, Abedi-Ardekani B, Carreira C, Menya D, Dzamalala CP, Assefa M, Aseffa A, Miranda-Goncalves V, Jeronimo C, Henrique RM, Shakeri R, Malekzadeh R, Gasmelseed N, Ellaithi M, Gangane N, Middleton DRS, Le Calvez-Kelm F, Ghantous A, Roux ML, Schuz J, McCormack V, Parker MI, Pinto LFR, Herceg Z. Genome-Wide DNA Methylation Profiling of Esophageal Squamous Cell Carcinoma from Global High-Incidence Regions Identifies Crucial Genes and Potential Cancer Markers. Cancer Res. 2021 May 15;81(10):2612-2624. doi: 10.1158/0008-5472.CAN-20-3445. Epub 2021 Mar 19.
- Qin Y, Wu CW, Taylor WR, Sawas T, Burger KN, Mahoney DW, Sun Z, Yab TC, Lidgard GP, Allawi HT, Buttar NS, Smyrk TC, Iyer PG, Katzka DA, Ahlquist DA, Kisiel JB. Discovery, Validation, and Application of Novel Methylated DNA Markers for Detection of Esophageal Cancer in Plasma. Clin Cancer Res. 2019 Dec 15;25(24):7396-7404. doi: 10.1158/1078-0432.CCR-19-0740. Epub 2019 Sep 16.
- Cao W, Lee H, Wu W, Zaman A, McCorkle S, Yan M, Chen J, Xing Q, Sinnott-Armstrong N, Xu H, Sailani MR, Tang W, Cui Y, Liu J, Guan H, Lv P, Sun X, Sun L, Han P, Lou Y, Chang J, Wang J, Gao Y, Guo J, Schenk G, Shain AH, Biddle FG, Collisson E, Snyder M, Bivona TG. Multi-faceted epigenetic dysregulation of gene expression promotes esophageal squamous cell carcinoma. Nat Commun. 2020 Jul 22;11(1):3675. doi: 10.1038/s41467-020-17227-z.
- Tu YH, Cooper AJ, Teng B, Chang RB, Artiga DJ, Turner HN, Mulhall EM, Ye W, Smith AD, Liman ER. An evolutionarily conserved gene family encodes proton-selective ion channels. Science. 2018 Mar 2;359(6379):1047-1050. doi: 10.1126/science.aao3264. Epub 2018 Jan 25.
Studienaufzeichnungsdaten
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Studienbeginn (Tatsächlich)
Primärer Abschluss (Tatsächlich)
Studienabschluss (Tatsächlich)
Studienanmeldedaten
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Zuerst eingereicht, das die QC-Kriterien erfüllt hat
Zuerst gepostet (Tatsächlich)
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Letztes Update gepostet (Tatsächlich)
Letztes eingereichtes Update, das die QC-Kriterien erfüllt
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- AD10
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Arzneimittel- und Geräteinformationen, Studienunterlagen
Studiert ein von der US-amerikanischen FDA reguliertes Arzneimittelprodukt
Studiert ein von der US-amerikanischen FDA reguliertes Geräteprodukt
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