Kit de détection combinée de méthylation des gènes KCNA3 et OTOP2 (méthode PCR fluorescente)
Détection de la méthylation des gènes KCNA3 et OTOP2 dans le plasma pour le diagnostic auxiliaire du cancer de l'œsophage/lésions précancéreuses : un essai clinique
L'objectif de cette étude observationnelle est de tester l'efficacité clinique du "kit de détection combiné de méthylation des gènes KCNA3 et OTOP2 (méthode PCR de fluorescence)" dans le diagnostic auxiliaire du cancer de l'œsophage et de la néoplasie œsophagienne de haut grade. Les principales questions auxquelles il vise à répondre sont :
- Dans quelle mesure les résultats des tests du kit sont-ils cohérents avec les critères diagnostiques cliniques de référence ?
- Le séquençage Sanger peut montrer visuellement si chaque échantillon contient des sites de méthylation. Ainsi, dans cet essai clinique, les résultats du kit ont été comparés aux résultats du séquençage Sanger pour analyser la précision du réactif dans la détection de la méthylation des gènes KCNA3 et OTOP2.
Chaque participant est tenu de fournir au moins 10 ml de sang pour compléter le test du kit.
Aperçu de l'étude
Statut
Les conditions
Description détaillée
Le carcinome de l'œsophage est causé par une hyperplasie anormale de l'épithélium squameux ou glandulaire, les principaux types pathologiques sont le carcinome épidermoïde et l'adénocarcinome. À l'échelle mondiale, le cancer de l'œsophage a la septième incidence la plus élevée et la sixième cause de décès par cancer. Les statistiques ont montré qu'en 2020, il y avait 604 000 nouveaux cas de cancer de l'œsophage et 54,4 décès.
Les taux de survie à 5 ans étaient significativement différents dans les carcinomes de l'œsophage de différents stades, par exemple, c'est 84,9 % pour le stade Ia, 70,9 % pour le stade Ib, 56,2 % pour le stade IIa, 43,3 % pour le stade IIb, 37,9 % pour le stade IIIa, 23,3 % pour le stade IIIb, 12,9 % pour le stade IIIc et 3,4 % pour le stade IV. Par conséquent, un diagnostic et un traitement précoces constituent la stratégie la plus efficace pour réduire l'incidence et la mortalité du cancer de l'œsophage.
L'endoscopie et la biopsie pathologique sont actuellement le "gold standard" pour diagnostiquer le cancer de l'œsophage, cependant, limité par les ressources médicales, la tolérance et d'autres problèmes, le dépistage de la population par endoscopie n'est ni rentable ni applicable. Il n'y a pas de marqueur sérologique reconnu et efficace pour la détection du carcinome œsophagien précoce et des lésions précancéreuses, l'effet de la détection combinée de plusieurs marqueurs sérologiques est meilleur que celui des marqueurs uniques, et la précision était de 74 % à 85 %, mais il est encore sous-optimal .
La méthylation de l'îlot CpG de la région du promoteur du gène suppresseur de tumeur est le changement le plus courant au cours de la tumorogenèse, des études ont montré que des événements de méthylation pouvaient survenir aux premiers stades du cancer de l'œsophage.
L'ADN tumoral circulant (ctDNA) est dérivé de fragments d'ADN produits par apoptose, nécrose ou sécrétion de cellules tumorales, qui fait partie de l'ADN libre circulant (cfDNA). L'ADNct contient les mêmes défauts génétiques que son ADN tumoral source, tels qu'une mutation ponctuelle, un réarrangement, une amplification, un changement de microsatellite, une modification épigénétique, etc.
KCNA3 fait partie de la famille des protéines qui codent les canaux potassiques et affectent principalement la viscosité cellulaire. OTOP2 est un membre de la famille des protéines codant pour les canaux de transport de protons, certaines études ont montré que les niveaux de méthylation de deux gènes dans les tissus cancéreux de l'œsophage étaient significativement plus élevés que ceux des tissus adjacents, et ils peuvent être utilisés comme marqueur potentiel pour le diagnostic de cancer de l'oesophage.
Ce kit est basé sur la technologie PCR de fluorescence en temps réel pour réaliser la détection qualitative de la méthylation de KCNA3 et OTOP2 dans des échantillons de plasma. Avant l'amplification par PCR, le cfDNA a été transformé par du bisulfite et le gène ACTB (β-Actin) est utilisé comme référence interne.
Type d'étude
Inscription (Réel)
Contacts et emplacements
Lieux d'étude
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Shanghai, Chine
- The First Affiliated Hospital of Naval Military Medical University
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Critères de participation
Critère d'éligibilité
Âges éligibles pour étudier
Accepte les volontaires sains
Méthode d'échantillonnage
Population étudiée
- Patients atteints d'un cancer de l'œsophage, nombre ≥ 300, contenant différents stades TNM.
- Patients atteints de néoplasie intraépithéliale de haut grade de l'œsophage, nombre ≥ 70.
- Patients atteints de maladies bénignes du système digestif, y compris œsophagite, gastrite, entérite, appendicite, polypes gastriques, polypes colorectaux, etc., nombre ≥200.
- Patients atteints d'autres affections malignes de l'appareil digestif (notamment cancer gastrique, cancer colorectal, cancer du foie, cancer du pancréas, cancer des voies biliaires, etc.) et patients atteints d'affections malignes non digestives (notamment cancer de la thyroïde, carcinome épidermoïde du poumon, cancer du col de l'utérus, cancer de l'endomètre , cancer du sein, cancer de la prostate, etc.), nombre ≥350.
- Tous les participants inscrits doivent être ≥1000.
La description
Critère d'intégration:
- patients atteints de cancer de l'œsophage confirmés ou fortement suspectés par endoscopie, examen d'imagerie ou biopsie pathologique, et néoplasie intraépithéliale de haut grade de l'œsophage patients principalement recrutés parmi des personnes qui envisageaient de subir une œsophagectomie radicale d'un cancer de l'œsophage, une dissection endoscopique sous-muqueuse ou une chimioradiothérapie primaire.
- les patients atteints de maladies bénignes du système digestif qui ont subi une endoscopie (y compris œsophagite, gastrite, entérite, appendicite, polypes gastriques, polypes colorectaux, etc.).
- Patients non traités atteints d'autres affections malignes de l'appareil digestif (notamment cancer gastrique, cancer colorectal, cancer du foie, cancer du pancréas, cancer des voies biliaires, etc.) et patients atteints d'affections malignes non digestives (notamment cancer de la thyroïde, carcinome épidermoïde du poumon, cancer du col de l'utérus, cancer de l'endomètre, etc.) cancer, cancer du sein, cancer de la prostate, etc.) confirmé par des critères diagnostiques cliniques de référence.
Critère d'exclusion:
- les patients qui ont reçu une thérapie anti-tumorale telle que la radiothérapie/chimiothérapie ;
- Patients atteints de carcinome de l'œsophage et de néoplasie intraépithéliale de haut grade qui souffraient également d'autres tumeurs malignes ;
- Échantillons non conservés comme requis ou échantillons d'hémolyse ;
- Le volume d'échantillon ne répond pas aux exigences de détection ;
- Patients atteints de cancer de l'œsophage avec métastases à distance.
Plan d'étude
Comment l'étude est-elle conçue ?
Détails de conception
- Modèles d'observation: Cas-témoins
- Perspectives temporelles: Transversale
Cohortes et interventions
Groupe / Cohorte |
Intervention / Traitement |
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Groupe positif
Patients atteints de carcinome de l'œsophage et de néoplasie intraépithéliale de haut grade.
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Des échantillons de sang des participants des deux groupes ont été prélevés et des tests de méthylation ont été effectués conformément aux instructions du kit.
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Groupe négatif
Patients atteints d'autres tumeurs malignes digestives (y compris cancer gastrique, cancer colorectal, cancer du foie, cancer du pancréas, cholangiocarcinome, etc.) et patients atteints de tumeurs malignes non digestives (y compris cancer de la thyroïde, carcinome épidermoïde du poumon, cancer du col de l'utérus, cancer de l'endomètre, cancer du sein , cancer de la prostate, etc.), Patients atteints de troubles digestifs bénins (dont œsophagite, gastrite, entérite, appendicite, polypes gastriques, polypes colorectaux, etc.).
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Des échantillons de sang des participants des deux groupes ont été prélevés et des tests de méthylation ont été effectués conformément aux instructions du kit.
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Que mesure l'étude ?
Principaux critères de jugement
Mesure des résultats |
Description de la mesure |
Délai |
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validité
Délai: Immédiatement après la procédure
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Dans cette étude, la validité indique la cohérence du test de méthylation avec les normes de diagnostic d'or, y compris la sensibilité et la spécificité.
La sensibilité indique la proportion d'échantillons positifs à la méthylation dans les échantillons de cancer de l'œsophage/néoplasie de haut grade.
La spécificité indique la proportion d'échantillons négatifs à la méthylation dans les cancers non œsophagiens/néoplasies de haut grade.
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Immédiatement après la procédure
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Mesures de résultats secondaires
Mesure des résultats |
Description de la mesure |
Délai |
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fiabilité
Délai: Immédiatement après la procédure
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Dans cette étude, l'évaluation de la fiabilité comprenait deux indicateurs, à savoir le taux de concordance de la détection de la méthylation avec le séquençage Sanger, et la valeur Kappa des deux méthodes
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Immédiatement après la procédure
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Collaborateurs et enquêteurs
Parrainer
Collaborateurs
Les enquêteurs
- Chercheur principal: Luowei Wang, MD, Changhai Hospital
Publications et liens utiles
Publications générales
- Sung H, Ferlay J, Siegel RL, Laversanne M, Soerjomataram I, Jemal A, Bray F. Global Cancer Statistics 2020: GLOBOCAN Estimates of Incidence and Mortality Worldwide for 36 Cancers in 185 Countries. CA Cancer J Clin. 2021 May;71(3):209-249. doi: 10.3322/caac.21660. Epub 2021 Feb 4.
- Wang GQ, Abnet CC, Shen Q, Lewin KJ, Sun XD, Roth MJ, Qiao YL, Mark SD, Dong ZW, Taylor PR, Dawsey SM. Histological precursors of oesophageal squamous cell carcinoma: results from a 13 year prospective follow up study in a high risk population. Gut. 2005 Feb;54(2):187-92. doi: 10.1136/gut.2004.046631.
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- Wang J, Wu N, Zheng QF, Yan S, Lv C, Li SL, Yang Y. Evaluation of the 7th edition of the TNM classification in patients with resected esophageal squamous cell carcinoma. World J Gastroenterol. 2014 Dec 28;20(48):18397-403. doi: 10.3748/wjg.v20.i48.18397.
- Talukdar FR, Soares Lima SC, Khoueiry R, Laskar RS, Cuenin C, Sorroche BP, Boisson AC, Abedi-Ardekani B, Carreira C, Menya D, Dzamalala CP, Assefa M, Aseffa A, Miranda-Goncalves V, Jeronimo C, Henrique RM, Shakeri R, Malekzadeh R, Gasmelseed N, Ellaithi M, Gangane N, Middleton DRS, Le Calvez-Kelm F, Ghantous A, Roux ML, Schuz J, McCormack V, Parker MI, Pinto LFR, Herceg Z. Genome-Wide DNA Methylation Profiling of Esophageal Squamous Cell Carcinoma from Global High-Incidence Regions Identifies Crucial Genes and Potential Cancer Markers. Cancer Res. 2021 May 15;81(10):2612-2624. doi: 10.1158/0008-5472.CAN-20-3445. Epub 2021 Mar 19.
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- Cao W, Lee H, Wu W, Zaman A, McCorkle S, Yan M, Chen J, Xing Q, Sinnott-Armstrong N, Xu H, Sailani MR, Tang W, Cui Y, Liu J, Guan H, Lv P, Sun X, Sun L, Han P, Lou Y, Chang J, Wang J, Gao Y, Guo J, Schenk G, Shain AH, Biddle FG, Collisson E, Snyder M, Bivona TG. Multi-faceted epigenetic dysregulation of gene expression promotes esophageal squamous cell carcinoma. Nat Commun. 2020 Jul 22;11(1):3675. doi: 10.1038/s41467-020-17227-z.
- Tu YH, Cooper AJ, Teng B, Chang RB, Artiga DJ, Turner HN, Mulhall EM, Ye W, Smith AD, Liman ER. An evolutionarily conserved gene family encodes proton-selective ion channels. Science. 2018 Mar 2;359(6379):1047-1050. doi: 10.1126/science.aao3264. Epub 2018 Jan 25.
Dates d'enregistrement des études
Dates principales de l'étude
Début de l'étude (Réel)
Achèvement primaire (Réel)
Achèvement de l'étude (Réel)
Dates d'inscription aux études
Première soumission
Première soumission répondant aux critères de contrôle qualité
Première publication (Réel)
Mises à jour des dossiers d'étude
Dernière mise à jour publiée (Réel)
Dernière mise à jour soumise répondant aux critères de contrôle qualité
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Termes liés à cette étude
Mots clés
Termes MeSH pertinents supplémentaires
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- AD10
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