KCNA3- ja OTOP2-geenimetylointiyhdistetty havaitsemispakkaus (fluoresoiva PCR-menetelmä)

Ruokatorven karsinooma johtuu levyepiteelin tai rauhasepiteelin epänormaalista liikakasvusta, pääpatologiset tyypit ovat okasolusyöpä ja adenokarsinooma. Maailmanlaajuisesti ruokatorven syöpä on seitsemänneksi suurin ilmaantuvuus ja kuudenneksi yleisin syöpäkuolemien syy. Tilastot osoittivat, että vuonna 2020 uusia ruokatorven syöpätapauksia oli 604 000 ja kuolemantapauksia 54,4.

Viiden vuoden eloonjäämisluvut olivat merkittävästi erilaisia ​​eri vaiheissa olevissa ruokatorven karsinoomissa, esimerkiksi se on 84,9 % vaiheessa Ia, 70,9 % vaiheessa Ib, 56,2 % vaiheessa IIa, 43,3 % vaiheessa IIb, 37,9 % vaiheessa IIIa, 23,3 % vaiheessa IIIb, 12,9 % vaiheessa IIIc ja 3,4 % vaiheessa IV. Siksi varhainen diagnoosi ja hoito on tehokkain tapa vähentää ruokatorven syövän ilmaantuvuutta ja kuolleisuutta.

Endoskopia ja patologinen biopsia ovat tällä hetkellä "kultainen standardi" ruokatorven syövän diagnosoinnissa, mutta lääketieteellisten resurssien, sietokyvyn ja muiden seikkojen rajoittamana väestöseulonta endoskopialla ei ole kustannustehokasta ja käyttökelpoista. Varhaisen ruokatorven karsinooman ja esisyöpäleesioiden havaitsemiseen ei ole olemassa tunnettua ja tehokasta serologista merkkiainetta, useiden serologisten markkerien yhdistetty havaitseminen on parempi kuin yksittäisten merkkiaineiden, ja tarkkuus oli 74 % ~ 85 %, mutta se on silti epäoptimaalinen. .

Kasvainsuppressorigeenin promoottorialueen CpG-saaren metylaatio on yleisin muutos tuumorin synnyn aikana, tutkimukset osoittivat, että metylaatiotapahtumia voi esiintyä ruokatorven syövän alkuvaiheessa.

Kiertävä kasvain-DNA (ctDNA) on peräisin apoptoosin, nekroosin tai kasvainsolujen erityksen tuottamasta DNA-fragmentista, joka on osa kiertävää vapaata (cfDNA). CtDNA sisältää samoja geenivirheitä kuin sen lähdekasvain-DNA, kuten pistemutaatio, uudelleenjärjestely, monistuminen, mikrosatelliittimuutos, epigeneettinen modifikaatio jne.

KCNA3 on proteiiniperheen jäsen, joka koodaa kaliumkanavia ja vaikuttaa pääasiassa solun viskositeettiin. OTOP2 on protonikuljetuskanavia koodaavan proteiiniperheen jäsen. Jotkut tutkimukset ovat osoittaneet, että kahden geenin metylaatiotasot ruokatorven syöpäkudoksissa olivat merkittävästi korkeammat kuin vierekkäisissä kudoksissa, ja niitä voidaan käyttää mahdollisena merkkiaineena syöpäsairauksien diagnosoinnissa. ruokatorven syöpä.

Tämä sarja perustuu reaaliaikaiseen fluoresenssi-PCR-tekniikkaan KCNA3- ja OTOP2-metylaation kvalitatiivisen havaitsemisen saavuttamiseksi plasmanäytteistä. Ennen PCR-amplifikaatiota cfDNA transformoitiin bisulfiitilla ja sisäisenä referenssinä käytetään ACTB-geeniä (β-Actin).