KCNA3 og OTOP2 genmetylering kombinert deteksjonssett (fluorescerende PCR-metode)
Metyleringsdeteksjon av KCNA3- og OTOP2-gener i plasma for hjelpediagnose av esophageal cancer/precancerøse lesjoner: en klinisk studie
Målet med denne observasjonsstudien er å teste den kliniske effekten av "KCNA3- og OTOP2-genmetylering kombinert deteksjonssett (fluorescens-PCR-metode)" i esophageal cancer og høygradig esophageal neoplasia hjelpediagnose. Hovedspørsmålene den tar sikte på å besvare er:
- Hvor konsistente er testresultatene til settet med de kliniske referansediagnostiske kriteriene?
- Sanger-sekvensering kan visuelt vise om hver prøve inneholder metyleringssteder, så i denne kliniske studien ble settresultatene sammenlignet med Sanger-sekvenseringsresultater for å analysere reagensens nøyaktighet ved påvisning av KCNA3- og OTOP2-genmetylering.
Hver deltaker er pålagt å gi ikke mindre enn 10 ml blod for å fullføre kittesten.
Studieoversikt
Status
Forhold
Intervensjon / Behandling
Detaljert beskrivelse
Esophageal karsinom er forårsaket av unormal hyperplasi av plateepitel eller kjertelepitel, de viktigste patologiske typene er plateepitelkarsinom og adenokarsinom. Globalt har spiserørskreft den syvende høyeste forekomsten og den sjette ledende årsaken til kreftdød. Statistikk viste at i 2020 var det 604 000 nye tilfeller av spiserørskreft og 54,4 dødsfall.
5-års overlevelsesraten var signifikant forskjellig i spiserørskarsinomer i forskjellige stadier, for eksempel er den 84,9% for stadium Ia, 70,9% for stadium Ib, 56,2% for stadium IIa, 43,3% for stadium IIb, 37,9% for stadium IIIa, 23,3 % for stadium IIIb, 12,9 % for stadium IIIc og 3,4 % for stadium IV. Derfor er tidlig diagnose og behandling den mest effektive strategien for å redusere forekomsten og dødeligheten av spiserørskreft.
Endoskopi og patologisk biopsi er for tiden den "gyldne standarden" for å diagnostisere spiserørskreft, men begrenset av medisinske ressurser, toleranse og andre problemer, er befolkningsscreening ved endoskopi ikke kostnadseffektiv og anvendelig. Det er ingen anerkjent og effektiv serologisk markør for påvisning av tidlig esophageal karsinom og precancerøse lesjoner, effekten av flere serologiske markører kombinert påvisning er bedre enn for enkeltmarkører, og nøyaktigheten var 74%~85%, men den er fortsatt suboptimal .
Metylering av tumorsuppressorgenpromotorregionen CpG-øya er den vanligste endringen under tumorgenese, studier viste at metyleringshendelser kan oppstå i de tidlige stadiene av spiserørskreft.
Sirkulerende tumor-DNA (ctDNA) er avledet fra DNA-fragmenter produsert ved apoptose, nekrose eller sekresjon av tumorceller, som er en del av sirkulerende fritt (cfDNA). CtDNA inneholder de samme genfeilene som kilden til tumor-DNA, slik som punktmutasjon, omorganisering, amplifikasjon, mikrosatellittforandring, epigenetisk modifikasjon, etc.
KCNA3 er et medlem av proteinfamilien som koder for kaliumkanaler og hovedsakelig påvirker celleviskositeten. OTOP2 er medlem av proteinfamilien som koder for protontransportkanaler, noen studier har vist at metyleringsnivåene til to gener i kreftvev i spiserøret var betydelig høyere enn i tilstøtende vev, og de kan brukes som en potensiell markør for diagnostisering av kreft i spiserøret.
Dette settet er basert på sanntids fluorescens PCR-teknologi for å oppnå kvalitativ deteksjon av KCNA3- og OTOP2-metylering i plasmaprøver. Før PCR-amplifisering ble cfDNA transformert av bisulfitt og ACTB (β-Actin)-genet er brukt som den interne referansen.
Studietype
Registrering (Faktiske)
Kontakter og plasseringer
Studiesteder
-
-
-
Shanghai, Kina
- The First Affiliated Hospital of Naval Military Medical University
-
-
Deltakelseskriterier
Kvalifikasjonskriterier
Alder som er kvalifisert for studier
Tar imot friske frivillige
Prøvetakingsmetode
Studiepopulasjon
- Spiserørskreftpasienter, antall ≥ 300, som inneholder forskjellige TNM-stadier.
- Esofagus pasienter med høy grad av intraepitelial neoplasi, antall ≥70.
- Pasienter med godartede sykdommer i fordøyelsessystemet inkludert øsofagitt, gastritt, enteritt, blindtarmbetennelse, magepolypper, kolorektale polypper, etc., antall ≥200.
- Pasienter med andre ondartede sykdommer i fordøyelsessystemet (inkludert magekreft, tykktarmskreft, leverkreft, kreft i bukspyttkjertelen, kreft i galleveier, etc.) og pasienter med kreft i ikke-fordøyelsessystemet (inkludert kreft i skjoldbruskkjertelen, lunge plateepitelkreft, livmorhalskreft, endometriekreft , brystkreft, prostatakreft, etc.), nummer ≥350.
- Alle påmeldte deltakere bør være ≥1000.
Beskrivelse
Inklusjonskriterier:
- esophageal carcinoma-pasienter bekreftet eller sterkt mistenkt ved endoskopi, bildeundersøkelse eller patologisk biopsi, og høygradig intraepitelial neoplasi av esophaguspasienter hovedsakelig registrert fra individer som planla å gjennomgå radikal øsofagektomi av esophageal cancer, endoskopisk submukosal radioterapi eller primær submukosal radioterapi.
- pasienter med godartede sykdommer i fordøyelsessystemet som har gjennomgått endoskopi (inkludert øsofagitt, gastritt, enteritt, blindtarmbetennelse, magepolypper, kolorektale polypper, etc.).
- Ubehandlede pasienter med andre ondartede sykdommer i fordøyelsessystemet (inkludert magekreft, tykktarmskreft, leverkreft, kreft i bukspyttkjertelen, galleveiskreft, etc.) og pasienter med ondartede sykdommer i ikke-fordøyelsessystemet (inkludert kreft i skjoldbruskkjertelen, lunge plateepitelkarsinom, livmorhalskreft, endometrie) kreft, brystkreft, prostatakreft, etc.) bekreftet av kliniske referansediagnostiske kriterier.
Ekskluderingskriterier:
- pasienter som har mottatt antitumorterapi som strålebehandling/kjemoterapi;
- Esofaguskarsinom og høygradige intraepiteliale neoplasipasienter som også led av andre ondartede svulster;
- Prøver som ikke oppbevares som nødvendig eller prøver av hemolyse;
- Prøvevolumet oppfyller ikke deteksjonskravene;
- Esofaguskarsinompasienter med fjernmetastaser.
Studieplan
Hvordan er studiet utformet?
Designdetaljer
- Observasjonsmodeller: Case-Control
- Tidsperspektiver: Tverrsnitt
Kohorter og intervensjoner
Gruppe / Kohort |
Intervensjon / Behandling |
|---|---|
|
Positiv gruppe
Esofaguskarsinom og høygradige intraepiteliale neoplasipasienter.
|
Blodprøver fra deltakere i begge grupper ble samlet inn og metyleringstester ble utført i henhold til instruksjonene for settet.
|
|
Negativ gruppe
Pasienter med andre fordøyelseskrefter (inkludert magekreft, tykktarmskreft, leverkreft, bukspyttkjertelkreft, kolangiokarsinom, etc.) og pasienter med ikke-fordøyelseskreft ondartede svulster (inkludert kreft i skjoldbruskkjertelen, lunge plateepitelkreft, livmorhalskreft, endometriekreft, brystkreft , prostatakreft, etc.), Pasienter med godartede fordøyelsessykdommer (inkludert øsofagitt, gastritt, enteritt, blindtarmbetennelse, magepolypper, kolorektale polypper, etc.).
|
Blodprøver fra deltakere i begge grupper ble samlet inn og metyleringstester ble utført i henhold til instruksjonene for settet.
|
Hva måler studien?
Primære resultatmål
Resultatmål |
Tiltaksbeskrivelse |
Tidsramme |
|---|---|---|
|
gyldighet
Tidsramme: Umiddelbart etter prosedyren
|
I denne studien indikerer validitet konsistensen av metyleringstesten med de gylne diagnostiske standardene, inkludert sensitivitet og spesifisitet.
Sensitivitet indikerer andelen metyleringspositive prøver i esophageal cancer/høygradige neoplasiprøver.
Spesifisitet indikerer andelen metyleringsnegative prøver ved ikke-øsofaguskreft/høygradig neoplasi.
|
Umiddelbart etter prosedyren
|
Sekundære resultatmål
Resultatmål |
Tiltaksbeskrivelse |
Tidsramme |
|---|---|---|
|
pålitelighet
Tidsramme: Umiddelbart etter prosedyren
|
I denne studien inkluderte reliabilitetsevalueringen to indikatorer, nemlig samsvarshastigheten for metyleringsdeteksjon med Sanger-sekvensering, og Kappa-verdien til de to metodene
|
Umiddelbart etter prosedyren
|
Samarbeidspartnere og etterforskere
Samarbeidspartnere
Etterforskere
- Hovedetterforsker: Luowei Wang, MD, Changhai Hospital
Publikasjoner og nyttige lenker
Generelle publikasjoner
- Sung H, Ferlay J, Siegel RL, Laversanne M, Soerjomataram I, Jemal A, Bray F. Global Cancer Statistics 2020: GLOBOCAN Estimates of Incidence and Mortality Worldwide for 36 Cancers in 185 Countries. CA Cancer J Clin. 2021 May;71(3):209-249. doi: 10.3322/caac.21660. Epub 2021 Feb 4.
- Wang GQ, Abnet CC, Shen Q, Lewin KJ, Sun XD, Roth MJ, Qiao YL, Mark SD, Dong ZW, Taylor PR, Dawsey SM. Histological precursors of oesophageal squamous cell carcinoma: results from a 13 year prospective follow up study in a high risk population. Gut. 2005 Feb;54(2):187-92. doi: 10.1136/gut.2004.046631.
- di Pietro M, Canto MI, Fitzgerald RC. Endoscopic Management of Early Adenocarcinoma and Squamous Cell Carcinoma of the Esophagus: Screening, Diagnosis, and Therapy. Gastroenterology. 2018 Jan;154(2):421-436. doi: 10.1053/j.gastro.2017.07.041. Epub 2017 Aug 2.
- Wang J, Wu N, Zheng QF, Yan S, Lv C, Li SL, Yang Y. Evaluation of the 7th edition of the TNM classification in patients with resected esophageal squamous cell carcinoma. World J Gastroenterol. 2014 Dec 28;20(48):18397-403. doi: 10.3748/wjg.v20.i48.18397.
- Talukdar FR, Soares Lima SC, Khoueiry R, Laskar RS, Cuenin C, Sorroche BP, Boisson AC, Abedi-Ardekani B, Carreira C, Menya D, Dzamalala CP, Assefa M, Aseffa A, Miranda-Goncalves V, Jeronimo C, Henrique RM, Shakeri R, Malekzadeh R, Gasmelseed N, Ellaithi M, Gangane N, Middleton DRS, Le Calvez-Kelm F, Ghantous A, Roux ML, Schuz J, McCormack V, Parker MI, Pinto LFR, Herceg Z. Genome-Wide DNA Methylation Profiling of Esophageal Squamous Cell Carcinoma from Global High-Incidence Regions Identifies Crucial Genes and Potential Cancer Markers. Cancer Res. 2021 May 15;81(10):2612-2624. doi: 10.1158/0008-5472.CAN-20-3445. Epub 2021 Mar 19.
- Qin Y, Wu CW, Taylor WR, Sawas T, Burger KN, Mahoney DW, Sun Z, Yab TC, Lidgard GP, Allawi HT, Buttar NS, Smyrk TC, Iyer PG, Katzka DA, Ahlquist DA, Kisiel JB. Discovery, Validation, and Application of Novel Methylated DNA Markers for Detection of Esophageal Cancer in Plasma. Clin Cancer Res. 2019 Dec 15;25(24):7396-7404. doi: 10.1158/1078-0432.CCR-19-0740. Epub 2019 Sep 16.
- Cao W, Lee H, Wu W, Zaman A, McCorkle S, Yan M, Chen J, Xing Q, Sinnott-Armstrong N, Xu H, Sailani MR, Tang W, Cui Y, Liu J, Guan H, Lv P, Sun X, Sun L, Han P, Lou Y, Chang J, Wang J, Gao Y, Guo J, Schenk G, Shain AH, Biddle FG, Collisson E, Snyder M, Bivona TG. Multi-faceted epigenetic dysregulation of gene expression promotes esophageal squamous cell carcinoma. Nat Commun. 2020 Jul 22;11(1):3675. doi: 10.1038/s41467-020-17227-z.
- Tu YH, Cooper AJ, Teng B, Chang RB, Artiga DJ, Turner HN, Mulhall EM, Ye W, Smith AD, Liman ER. An evolutionarily conserved gene family encodes proton-selective ion channels. Science. 2018 Mar 2;359(6379):1047-1050. doi: 10.1126/science.aao3264. Epub 2018 Jan 25.
Studierekorddatoer
Studer hoveddatoer
Studiestart (Faktiske)
Primær fullføring (Faktiske)
Studiet fullført (Faktiske)
Datoer for studieregistrering
Først innsendt
Først innsendt som oppfylte QC-kriteriene
Først lagt ut (Faktiske)
Oppdateringer av studieposter
Sist oppdatering lagt ut (Faktiske)
Siste oppdatering sendt inn som oppfylte QC-kriteriene
Sist bekreftet
Mer informasjon
Begreper knyttet til denne studien
Nøkkelord
Ytterligere relevante MeSH-vilkår
Andre studie-ID-numre
- AD10
Plan for individuelle deltakerdata (IPD)
Planlegger du å dele individuelle deltakerdata (IPD)?
IPD-planbeskrivelse
Konfidensiell informasjon om den enkelte deltaker vil bli oppbevart av etterforskere og kliniske utprøvingsinstitusjoner, personlig informasjon om forsøkspersoner vil ikke bli avslørt i rapporter, publikasjoner, etc.
Direkte tilgang til kildedata og filer er kun tillatt for overvåking, revisjon eller inspeksjon, uten å avsløre personens personvern.
Administrasjonen for medisinske produkter kan inspisere de grunnleggende dokumentene for kliniske utprøvinger av medisinsk utstyr for å bekrefte ektheten og integriteten til de innsamlede dataene.
Legemiddel- og utstyrsinformasjon, studiedokumenter
Studerer et amerikansk FDA-regulert medikamentprodukt
Studerer et amerikansk FDA-regulert enhetsprodukt
Denne informasjonen ble hentet direkte fra nettstedet clinicaltrials.gov uten noen endringer. Hvis du har noen forespørsler om å endre, fjerne eller oppdatere studiedetaljene dine, vennligst kontakt register@clinicaltrials.gov. Så snart en endring er implementert på clinicaltrials.gov, vil denne også bli oppdatert automatisk på nettstedet vårt. .