Kit de detección combinado de metilación de genes KCNA3 y OTOP2 (método de PCR fluorescente)
Detección de metilación de genes KCNA3 y OTOP2 en plasma para el diagnóstico auxiliar de cáncer de esófago/lesiones precancerosas: ensayo clínico
El objetivo de este estudio observacional es probar la eficacia clínica del "kit de detección combinado de metilación de genes KCNA3 y OTOP2 (método de PCR de fluorescencia)" en el diagnóstico auxiliar de cáncer de esófago y neoplasia de esófago de alto grado. Las principales preguntas que pretende responder son:
- ¿Qué tan consistentes son los resultados de las pruebas del kit con los criterios de diagnóstico de referencia clínica?
- La secuenciación de Sanger puede mostrar visualmente si cada muestra contiene sitios de metilación, por lo que en este ensayo clínico, los resultados del kit se compararon con los resultados de la secuenciación de Sanger para analizar la precisión del reactivo en la detección de la metilación de los genes KCNA3 y OTOP2.
Cada participante debe proporcionar no menos de 10 ml de sangre para completar la prueba del kit.
Descripción general del estudio
Estado
Condiciones
Descripción detallada
El carcinoma de esófago es causado por una hiperplasia anormal del epitelio escamoso o glandular, los principales tipos patológicos son el carcinoma de células escamosas y el adenocarcinoma. A nivel mundial, el cáncer de esófago tiene la séptima incidencia más alta y la sexta causa principal de muerte por cáncer. Las estadísticas mostraron que en 2020 hubo 604.000 nuevos casos de cáncer de esófago y 54,4 muertes.
Las tasas de supervivencia a 5 años fueron significativamente diferentes en los carcinomas esofágicos de diferentes estadios, por ejemplo, es 84,9 % para el estadio Ia, 70,9 % para el estadio Ib, 56,2 % para el estadio IIa, 43,3 % para el estadio IIb, 37,9 % para el estadio IIIa, 23,3% para estadio IIIb, 12,9% para estadio IIIc y 3,4% para estadio IV. Por lo tanto, el diagnóstico y tratamiento tempranos es la estrategia más efectiva para reducir la incidencia y mortalidad del cáncer de esófago.
La endoscopia y la biopsia patológica son actualmente el "estándar de oro" para diagnosticar el cáncer de esófago; sin embargo, debido a las limitaciones de los recursos médicos, la tolerancia y otros problemas, el cribado poblacional mediante endoscopia no es rentable ni aplicable. No existe un marcador serológico reconocido y efectivo para la detección de carcinoma esofágico temprano y lesiones precancerosas, el efecto de la detección combinada de múltiples marcadores serológicos es mejor que el de los marcadores únicos, y la precisión fue del 74% al 85%, pero aún es subóptima .
La metilación de la isla CpG de la región promotora del gen supresor de tumores es el cambio más común durante la tumorogénesis; los estudios demostraron que los eventos de metilación podrían ocurrir en las primeras etapas del cáncer de esófago.
El ADN tumoral circulante (ctDNA) se deriva de fragmentos de ADN producidos por apoptosis, necrosis o secreción de células tumorales, que forma parte del circulante libre (cfDNA). El ADNct contiene los mismos defectos genéticos que su ADN tumoral de origen, como mutación puntual, reordenamiento, amplificación, cambio de microsatélites, modificación epigenética, etc.
KCNA3 es un miembro de la familia de proteínas que codifica los canales de potasio y afecta principalmente a la viscosidad celular. OTOP2 es un miembro de la familia de proteínas que codifica canales de transporte de protones, algunos estudios han demostrado que los niveles de metilación de dos genes en tejidos de cáncer de esófago eran significativamente más altos que en tejidos adyacentes, y pueden usarse como un marcador potencial para el diagnóstico de cáncer de esófago.
Este kit se basa en la tecnología de PCR de fluorescencia en tiempo real para lograr la detección cualitativa de la metilación de KCNA3 y OTOP2 en muestras de plasma. Antes de la amplificación por PCR, el cfDNA se transformó con bisulfito y el gen ACTB (β-actina) se usó como referencia interna.
Tipo de estudio
Inscripción (Actual)
Contactos y Ubicaciones
Ubicaciones de estudio
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Shanghai, Porcelana
- The First Affiliated Hospital of Naval Military Medical University
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Criterios de participación
Criterio de elegibilidad
Edades elegibles para estudiar
Acepta Voluntarios Saludables
Método de muestreo
Población de estudio
- Pacientes con cáncer de esófago, número ≥ 300, que contienen diferentes estadios TNM.
- Pacientes con neoplasia intraepitelial esofágica de alto grado, número ≥70.
- Pacientes con enfermedades benignas del sistema digestivo incluyendo esofagitis, gastritis, enteritis, apendicitis, pólipos gástricos, pólipos colorrectales, etc., número ≥200.
- Pacientes con otras neoplasias malignas del sistema digestivo (incluidos cáncer gástrico, cáncer colorrectal, cáncer de hígado, cáncer de páncreas, cáncer de vías biliares, etc.) y pacientes con neoplasias malignas no digestivas (incluidos cáncer de tiroides, carcinoma de células escamosas de pulmón, cáncer de cuello uterino, cáncer de endometrio , cáncer de mama, cáncer de próstata, etc.), número ≥350.
- Todos los participantes inscritos deben ser ≥1000.
Descripción
Criterios de inclusión:
- pacientes con carcinoma de esófago confirmado o con alta sospecha mediante endoscopia, examen por imágenes o biopsia patológica, y pacientes con neoplasia intraepitelial de esófago de alto grado reclutados principalmente de individuos que planeaban someterse a esofagectomía radical de cáncer de esófago, disección submucosa endoscópica o quimiorradioterapia primaria.
- pacientes con enfermedades benignas del sistema digestivo que han sido sometidos a endoscopia (incluyendo esofagitis, gastritis, enteritis, apendicitis, pólipos gástricos, pólipos colorrectales, etc.).
- Pacientes no tratadas con otras neoplasias malignas del sistema digestivo (incluidos cáncer gástrico, cáncer colorrectal, cáncer de hígado, cáncer de páncreas, cáncer de vías biliares, etc.) y pacientes con neoplasias malignas no digestivas (incluidos cáncer de tiroides, carcinoma de células escamosas de pulmón, cáncer de cuello uterino, cáncer de endometrio). cáncer, cáncer de mama, cáncer de próstata, etc.) confirmado por criterios de diagnóstico de referencia clínica.
Criterio de exclusión:
- pacientes que han recibido terapia antitumoral como radioterapia/quimioterapia;
- Pacientes con carcinoma de esófago y neoplasia intraepitelial de alto grado que también padecían otros tumores malignos;
- Muestras no conservadas según lo requerido o muestras de hemólisis;
- El volumen de la muestra no cumple con los requisitos de detección;
- Pacientes con carcinoma de esófago con metástasis a distancia.
Plan de estudios
¿Cómo está diseñado el estudio?
Detalles de diseño
- Modelos observacionales: Control de caso
- Perspectivas temporales: Transversal
Cohortes e Intervenciones
Grupo / Cohorte |
Intervención / Tratamiento |
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Grupo positivo
Pacientes con carcinoma de esófago y neoplasia intraepitelial de alto grado.
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Se recolectaron muestras de sangre de los participantes en ambos grupos y se realizaron pruebas de metilación de acuerdo con las instrucciones del kit.
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Grupo negativo
Pacientes con otros tumores malignos digestivos (incluidos cáncer gástrico, cáncer colorrectal, cáncer de hígado, cáncer de páncreas, colangiocarcinoma, etc.) y pacientes con tumores malignos no digestivos (incluidos cáncer de tiroides, carcinoma de células escamosas de pulmón, cáncer de cuello uterino, cáncer de endometrio, cáncer de mama , cáncer de próstata, etc.), Pacientes con trastornos digestivos benignos (incluyendo esofagitis, gastritis, enteritis, apendicitis, pólipos gástricos, pólipos colorrectales, etc.).
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Se recolectaron muestras de sangre de los participantes en ambos grupos y se realizaron pruebas de metilación de acuerdo con las instrucciones del kit.
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¿Qué mide el estudio?
Medidas de resultado primarias
Medida de resultado |
Medida Descripción |
Periodo de tiempo |
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validez
Periodo de tiempo: Inmediatamente después del procedimiento
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En este estudio, la validez indica la consistencia de la prueba de metilación con los estándares dorados de diagnóstico, incluidas la sensibilidad y la especificidad.
La sensibilidad indica la proporción de muestras con metilación positiva en muestras de cáncer de esófago/neoplasia de alto grado.
La especificidad indica la proporción de muestras con metilación negativa en cáncer no esofágico/neoplasia de alto grado.
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Inmediatamente después del procedimiento
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Medidas de resultado secundarias
Medida de resultado |
Medida Descripción |
Periodo de tiempo |
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fiabilidad
Periodo de tiempo: Inmediatamente después del procedimiento
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En este estudio, la evaluación de la confiabilidad incluyó dos indicadores, a saber, la tasa de concordancia de la detección de metilación con la secuenciación de Sanger y el valor Kappa de los dos métodos.
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Inmediatamente después del procedimiento
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Colaboradores e Investigadores
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Colaboradores
Investigadores
- Investigador principal: Luowei Wang, MD, Changhai Hospital
Publicaciones y enlaces útiles
Publicaciones Generales
- Sung H, Ferlay J, Siegel RL, Laversanne M, Soerjomataram I, Jemal A, Bray F. Global Cancer Statistics 2020: GLOBOCAN Estimates of Incidence and Mortality Worldwide for 36 Cancers in 185 Countries. CA Cancer J Clin. 2021 May;71(3):209-249. doi: 10.3322/caac.21660. Epub 2021 Feb 4.
- Wang GQ, Abnet CC, Shen Q, Lewin KJ, Sun XD, Roth MJ, Qiao YL, Mark SD, Dong ZW, Taylor PR, Dawsey SM. Histological precursors of oesophageal squamous cell carcinoma: results from a 13 year prospective follow up study in a high risk population. Gut. 2005 Feb;54(2):187-92. doi: 10.1136/gut.2004.046631.
- di Pietro M, Canto MI, Fitzgerald RC. Endoscopic Management of Early Adenocarcinoma and Squamous Cell Carcinoma of the Esophagus: Screening, Diagnosis, and Therapy. Gastroenterology. 2018 Jan;154(2):421-436. doi: 10.1053/j.gastro.2017.07.041. Epub 2017 Aug 2.
- Wang J, Wu N, Zheng QF, Yan S, Lv C, Li SL, Yang Y. Evaluation of the 7th edition of the TNM classification in patients with resected esophageal squamous cell carcinoma. World J Gastroenterol. 2014 Dec 28;20(48):18397-403. doi: 10.3748/wjg.v20.i48.18397.
- Talukdar FR, Soares Lima SC, Khoueiry R, Laskar RS, Cuenin C, Sorroche BP, Boisson AC, Abedi-Ardekani B, Carreira C, Menya D, Dzamalala CP, Assefa M, Aseffa A, Miranda-Goncalves V, Jeronimo C, Henrique RM, Shakeri R, Malekzadeh R, Gasmelseed N, Ellaithi M, Gangane N, Middleton DRS, Le Calvez-Kelm F, Ghantous A, Roux ML, Schuz J, McCormack V, Parker MI, Pinto LFR, Herceg Z. Genome-Wide DNA Methylation Profiling of Esophageal Squamous Cell Carcinoma from Global High-Incidence Regions Identifies Crucial Genes and Potential Cancer Markers. Cancer Res. 2021 May 15;81(10):2612-2624. doi: 10.1158/0008-5472.CAN-20-3445. Epub 2021 Mar 19.
- Qin Y, Wu CW, Taylor WR, Sawas T, Burger KN, Mahoney DW, Sun Z, Yab TC, Lidgard GP, Allawi HT, Buttar NS, Smyrk TC, Iyer PG, Katzka DA, Ahlquist DA, Kisiel JB. Discovery, Validation, and Application of Novel Methylated DNA Markers for Detection of Esophageal Cancer in Plasma. Clin Cancer Res. 2019 Dec 15;25(24):7396-7404. doi: 10.1158/1078-0432.CCR-19-0740. Epub 2019 Sep 16.
- Cao W, Lee H, Wu W, Zaman A, McCorkle S, Yan M, Chen J, Xing Q, Sinnott-Armstrong N, Xu H, Sailani MR, Tang W, Cui Y, Liu J, Guan H, Lv P, Sun X, Sun L, Han P, Lou Y, Chang J, Wang J, Gao Y, Guo J, Schenk G, Shain AH, Biddle FG, Collisson E, Snyder M, Bivona TG. Multi-faceted epigenetic dysregulation of gene expression promotes esophageal squamous cell carcinoma. Nat Commun. 2020 Jul 22;11(1):3675. doi: 10.1038/s41467-020-17227-z.
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Fechas de registro del estudio
Fechas importantes del estudio
Inicio del estudio (Actual)
Finalización primaria (Actual)
Finalización del estudio (Actual)
Fechas de registro del estudio
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Términos relacionados con este estudio
Palabras clave
Términos MeSH relevantes adicionales
Otros números de identificación del estudio
- AD10
Plan de datos de participantes individuales (IPD)
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Descripción del plan IPD
La información confidencial del participante individual será retenida por los investigadores y las instituciones de ensayos clínicos, cualquier información personal de los sujetos no se divulgará en informes, publicaciones, etc.
El acceso directo a los datos y archivos de origen solo se permite con fines de seguimiento, auditoría o inspección, sin revelar la privacidad del sujeto.
La administración de productos médicos puede inspeccionar los documentos básicos de los ensayos clínicos de dispositivos médicos para confirmar la autenticidad y la integridad de los datos recopilados.
Información sobre medicamentos y dispositivos, documentos del estudio
Estudia un producto farmacéutico regulado por la FDA de EE. UU.
Estudia un producto de dispositivo regulado por la FDA de EE. UU.
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