Kit di rilevamento combinato per metilazione genica KCNA3 e OTOP2 (metodo PCR fluorescente)

Il carcinoma esofageo è causato da iperplasia anormale dell'epitelio squamoso o ghiandolare, i principali tipi patologici sono il carcinoma a cellule squamose e l'adenocarcinoma. A livello globale, il cancro esofageo ha la settima incidenza più alta e la sesta causa principale di morte per cancro. Le statistiche hanno mostrato che nel 2020 ci sono stati 604.000 nuovi casi di cancro esofageo e 54,4 decessi.

I tassi di sopravvivenza a 5 anni erano significativamente diversi nei carcinomi esofagei di diversi stadi, ad esempio, è dell'84,9% per lo stadio Ia, del 70,9% per lo stadio Ib, del 56,2% per lo stadio IIa, del 43,3% per lo stadio IIb, del 37,9% per lo stadio IIIa, 23,3% per lo stadio IIIb, 12,9% per lo stadio IIIc e 3,4% per lo stadio IV. Pertanto, la diagnosi precoce e il trattamento sono la strategia più efficace per ridurre l'incidenza e la mortalità del cancro esofageo.

L'endoscopia e la biopsia patologica sono attualmente il "gold standard" per la diagnosi del cancro esofageo, tuttavia, limitata da risorse mediche, tolleranza e altri problemi, lo screening della popolazione mediante endoscopia non è conveniente e applicabile. Non esiste un marcatore sierologico riconosciuto ed efficace per il rilevamento del carcinoma esofageo precoce e delle lesioni precancerose, l'effetto del rilevamento combinato di più marcatori sierologici è migliore di quello dei singoli marcatori e l'accuratezza era del 74% ~ 85%, ma è ancora subottimale .

La metilazione dell'isola CpG della regione del promotore del gene soppressore tumorale è il cambiamento più comune durante la tumorigenesi, gli studi hanno dimostrato che gli eventi di metilazione potrebbero verificarsi nelle prime fasi del cancro esofageo.

Il DNA tumorale circolante (ctDNA) è derivato da frammenti di DNA prodotti dall'apoptosi, dalla necrosi o dalla secrezione di cellule tumorali, che fa parte del DNA circolante libero (cfDNA). Il CtDNA contiene gli stessi difetti genetici del DNA tumorale di origine, come mutazione puntiforme, riarrangiamento, amplificazione, cambiamento dei microsatelliti, modificazione epigenetica, ecc.

KCNA3 è un membro della famiglia delle proteine ​​che codifica per i canali del potassio e influenza principalmente la viscosità cellulare. OTOP2 è un membro della famiglia di proteine ​​che codifica per i canali di trasporto dei protoni, alcuni studi hanno dimostrato che i livelli di metilazione di due geni nei tessuti tumorali esofagei erano significativamente più alti di quelli nei tessuti adiacenti e possono essere utilizzati come potenziale marcatore per la diagnosi di cancro esofageo.

Questo kit si basa sulla tecnologia PCR in fluorescenza in tempo reale per ottenere il rilevamento qualitativo della metilazione di KCNA3 e OTOP2 nei campioni di plasma. Prima dell'amplificazione PCR, il cfDNA è stato trasformato dal bisolfito e il gene ACTB (β-actina) è utilizzato come riferimento interno.