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- 미국 임상 시험 레지스트리
- 임상시험 NCT05793515
전체 게놈 시퀀싱과 체외 및 생체 내 모델을 사용한 유전성 망막 이영양증의 기전
"전체 게놈 시퀀싱과 시험관 내 및 생체 내 모델을 사용하여 유전성 망막 이영양증의 유전적 결손 변이성과 병원성 메커니즘 이해"
이질적이고 희귀한 장애의 큰 그룹인 유전성 망막 이영양증(IRD)은 돌이킬 수 없는 양측 시력 상실 및 실명을 초래할 수 있습니다. IRD의 유전적 기초를 특성화하면 망막 손상 발생의 원인이 되는 병인을 이해하는 데 도움이 됩니다. 질병을 일으키는 유전자의 분자 식별의 발전에도 불구하고 미해결 IRD는 전체 사례의 약 40%를 차지합니다.
이 연구의 목표는 분자 진단 없이 임상적으로 특성이 잘 알려진 환자에서 유전적 원인을 식별하기 위해 전체 게놈 시퀀싱(WGS)을 사용하여 IRD에서 누락된 유전성을 해결하는 것입니다.
망막 기능의 발달 또는 유지에 역할을 하는 새로운 유전자의 확인은 새로운 치료 접근법의 개발로 이어질 것이며 보다 신속한 진단 및 환자 관리 개선을 선호할 것입니다.
연구 개요
상세 설명
IRD는 같은 가족의 영향을 받는 구성원 사이에서도 광범위한 표현이 있는 드문 신경퇴행성 및 유전적으로 이질적인 상태입니다. 이러한 장애는 크게 3개의 주요 그룹으로 나눌 수 있는 상당한 중복이 있는 광범위한 표현형을 나타냅니다. '황반' 또는 '중추' 이영양증으로 알려진 황반을 주로 포함하는 것; 원추-막대 또는 간상-원뿔 이영양증에서 볼 수 있는 중심과 주변부 모두에 영향을 미치는 것. 총체적으로 IRD는 1:2000의 발생률을 가지며 약 영향을 미칩니다. 전 세계적으로 200만 명의 환자와 점진적인 시각 장애가 있습니다. 영향을 받은 개인은 시력 측정, 시야 평가, 망막전위도 기록(ERG), 자가형광을 사용한 구조 영상, 스펙트럼 영역 광간섭 단층촬영(OCT) 및 OCT 혈관조영술을 통해 후속 조치를 취할 수 있습니다. 이러한 혁신적이고 비침습적인 도구로 정확한 임상 진단에 도달할 수 있지만 특정 표현형을 확인하기 위해 유전자 검사가 필요하며 분리 분석을 통해 유전 패턴을 해결할 수 있습니다. 유전자 발견 접근법은 눈 발달, 광수용체 생존, 광전도 메커니즘, 레티노이드 주기, 망막 효소 기능 또는 세포 구조와 관련된 약 280개의 서로 다른 유전자의 돌연변이가 이러한 퇴행성 질환의 원인이라는 것을 명확히 했습니다(RetNet. 이용 가능: https://sph.uth.edu/retnet/) 유전 패턴은 상염색체 우성, 열성 또는 X-연관일 수 있습니다.
유전자/유전체 진단의 성공률을 높이기 위해 다중 유전자 패널에 초점을 맞춘 표적 시퀀싱을 시작으로 WES(Whole Exome Sequencing), WGS(Whole Genome) 시퀀싱에 이르기까지 새로운 시퀀싱 기술을 모색하고 있습니다. IRD의 유전적 이질성으로 인해 임상 및 분자 진단의 일치는 표현형을 정확하게 특성화하고 치료적으로 유익한 전략의 가능성을 높이는 데 필요한 목표입니다.
주요 과제는 질병을 암호화하는 새로운 유전자를 식별하는 것입니다. 이러한 극단적인 유전적 이질성은 분자 진단의 검출 실패의 약 30%를 차지한다. WES 또는 WGS 조사 가능성으로 인해 유전자 발견을 위한 더 넓은 창이 열립니다.
연구 유형
등록 (실제)
연락처 및 위치
연구 장소
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Rome, 이탈리아, 00161
- Istituto Superiore di Sanità-Dpt. Oncology and Molecular Medicine
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참여기준
자격 기준
공부할 수 있는 나이
건강한 자원 봉사자를 받아들입니다
샘플링 방법
연구 인구
설명
포함 기준:
- 유전성이 의심되는 망막 및 시신경 이영양증 환자.
- 최소 12개월의 임상적 후속 조치가 있는 프로밴드.
- 현재까지 진단된 병리학에 대해 알려진 유전자에 대한 분자 유전학적 검사를 통해 결정적이지 않은 분자 진단을 받은 환자.
제외 기준:
- 입증된 유전적 기원이 없는 임상 진단을 받은 환자.
- 부모 또는 2차 친족의 검체가 없는 환자.
- 환자 자신 및/또는 그의 가족을 위해 임상적으로 관련되고 검증되고 실행 가능한 부수적인 유전 결과를 포함하여 얻은 유전적 결과에 대한 정보를 거부하는 환자.
공부 계획
연구는 어떻게 설계됩니까?
디자인 세부사항
코호트 및 개입
그룹/코호트 |
개입 / 치료 |
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FB_001
IRD에 의해 영향을 받는 발단자 및 분자 진단 없이 영향을 받는 및/또는 영향을 받지 않는 친척.
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전체 게놈 시퀀싱은 표적 재시퀀싱 및/또는 임상적 엑솜 시퀀싱에 대해 음성인 테스트를 받은 환자에서 수행됩니다.
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FB_002
IRD에 의해 영향을 받는 발단자 및 분자 진단 없이 영향을 받는 및/또는 영향을 받지 않는 친척.
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전체 게놈 시퀀싱은 표적 재시퀀싱 및/또는 임상적 엑솜 시퀀싱에 대해 음성인 테스트를 받은 환자에서 수행됩니다.
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FB_003
IRD에 의해 영향을 받는 발단자 및 분자 진단 없이 영향을 받는 및/또는 영향을 받지 않는 친척.
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전체 게놈 시퀀싱은 표적 재시퀀싱 및/또는 임상적 엑솜 시퀀싱에 대해 음성인 테스트를 받은 환자에서 수행됩니다.
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FB_004
IRD에 의해 영향을 받는 발단자 및 분자 진단 없이 영향을 받는 및/또는 영향을 받지 않는 친척.
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전체 게놈 시퀀싱은 표적 재시퀀싱 및/또는 임상적 엑솜 시퀀싱에 대해 음성인 테스트를 받은 환자에서 수행됩니다.
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IRD에 의해 영향을 받는 발단자 및 분자 진단 없이 영향을 받는 및/또는 영향을 받지 않는 친척.
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전체 게놈 시퀀싱은 표적 재시퀀싱 및/또는 임상적 엑솜 시퀀싱에 대해 음성인 테스트를 받은 환자에서 수행됩니다.
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IRD에 의해 영향을 받는 발단자 및 분자 진단 없이 영향을 받는 및/또는 영향을 받지 않는 친척.
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전체 게놈 시퀀싱은 표적 재시퀀싱 및/또는 임상적 엑솜 시퀀싱에 대해 음성인 테스트를 받은 환자에서 수행됩니다.
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FB_007
IRD에 의해 영향을 받는 발단자 및 분자 진단 없이 영향을 받는 및/또는 영향을 받지 않는 친척.
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전체 게놈 시퀀싱은 표적 재시퀀싱 및/또는 임상적 엑솜 시퀀싱에 대해 음성인 테스트를 받은 환자에서 수행됩니다.
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IRD에 의해 영향을 받는 발단자 및 분자 진단 없이 영향을 받는 및/또는 영향을 받지 않는 친척.
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전체 게놈 시퀀싱은 표적 재시퀀싱 및/또는 임상적 엑솜 시퀀싱에 대해 음성인 테스트를 받은 환자에서 수행됩니다.
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FB_009
IRD에 의해 영향을 받는 발단자 및 분자 진단 없이 영향을 받는 및/또는 영향을 받지 않는 친척.
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전체 게놈 시퀀싱은 표적 재시퀀싱 및/또는 임상적 엑솜 시퀀싱에 대해 음성인 테스트를 받은 환자에서 수행됩니다.
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FB_0010
IRD에 의해 영향을 받는 발단자 및 분자 진단 없이 영향을 받는 및/또는 영향을 받지 않는 친척.
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전체 게놈 시퀀싱은 표적 재시퀀싱 및/또는 임상적 엑솜 시퀀싱에 대해 음성인 테스트를 받은 환자에서 수행됩니다.
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IRD에 의해 영향을 받는 발단자 및 분자 진단 없이 영향을 받는 및/또는 영향을 받지 않는 친척.
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전체 게놈 시퀀싱은 표적 재시퀀싱 및/또는 임상적 엑솜 시퀀싱에 대해 음성인 테스트를 받은 환자에서 수행됩니다.
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IRD에 의해 영향을 받는 발단자 및 분자 진단 없이 영향을 받는 및/또는 영향을 받지 않는 친척.
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전체 게놈 시퀀싱은 표적 재시퀀싱 및/또는 임상적 엑솜 시퀀싱에 대해 음성인 테스트를 받은 환자에서 수행됩니다.
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IRD에 의해 영향을 받는 발단자 및 분자 진단 없이 영향을 받는 및/또는 영향을 받지 않는 친척.
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전체 게놈 시퀀싱은 표적 재시퀀싱 및/또는 임상적 엑솜 시퀀싱에 대해 음성인 테스트를 받은 환자에서 수행됩니다.
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IRD에 의해 영향을 받는 발단자 및 분자 진단 없이 영향을 받는 및/또는 영향을 받지 않는 친척.
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전체 게놈 시퀀싱은 표적 재시퀀싱 및/또는 임상적 엑솜 시퀀싱에 대해 음성인 테스트를 받은 환자에서 수행됩니다.
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FB_0015
IRD에 의해 영향을 받는 발단자 및 분자 진단 없이 영향을 받는 및/또는 영향을 받지 않는 친척.
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전체 게놈 시퀀싱은 표적 재시퀀싱 및/또는 임상적 엑솜 시퀀싱에 대해 음성인 테스트를 받은 환자에서 수행됩니다.
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IRD에 의해 영향을 받는 발단자 및 분자 진단 없이 영향을 받는 및/또는 영향을 받지 않는 친척.
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전체 게놈 시퀀싱은 표적 재시퀀싱 및/또는 임상적 엑솜 시퀀싱에 대해 음성인 테스트를 받은 환자에서 수행됩니다.
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IRD에 의해 영향을 받는 발단자 및 분자 진단 없이 영향을 받는 및/또는 영향을 받지 않는 친척.
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전체 게놈 시퀀싱은 표적 재시퀀싱 및/또는 임상적 엑솜 시퀀싱에 대해 음성인 테스트를 받은 환자에서 수행됩니다.
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IRD에 의해 영향을 받는 발단자 및 분자 진단 없이 영향을 받는 및/또는 영향을 받지 않는 친척.
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전체 게놈 시퀀싱은 표적 재시퀀싱 및/또는 임상적 엑솜 시퀀싱에 대해 음성인 테스트를 받은 환자에서 수행됩니다.
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FB_0019
IRD에 의해 영향을 받는 발단자 및 분자 진단 없이 영향을 받는 및/또는 영향을 받지 않는 친척.
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전체 게놈 시퀀싱은 표적 재시퀀싱 및/또는 임상적 엑솜 시퀀싱에 대해 음성인 테스트를 받은 환자에서 수행됩니다.
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FB_0020
IRD에 의해 영향을 받는 발단자 및 분자 진단 없이 영향을 받는 및/또는 영향을 받지 않는 친척.
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전체 게놈 시퀀싱은 표적 재시퀀싱 및/또는 임상적 엑솜 시퀀싱에 대해 음성인 테스트를 받은 환자에서 수행됩니다.
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IRD에 의해 영향을 받는 발단자 및 분자 진단 없이 영향을 받는 및/또는 영향을 받지 않는 친척.
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전체 게놈 시퀀싱은 표적 재시퀀싱 및/또는 임상적 엑솜 시퀀싱에 대해 음성인 테스트를 받은 환자에서 수행됩니다.
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IRD에 의해 영향을 받는 발단자 및 분자 진단 없이 영향을 받는 및/또는 영향을 받지 않는 친척.
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전체 게놈 시퀀싱은 표적 재시퀀싱 및/또는 임상적 엑솜 시퀀싱에 대해 음성인 테스트를 받은 환자에서 수행됩니다.
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FB_0023
IRD에 의해 영향을 받는 발단자 및 분자 진단 없이 영향을 받는 및/또는 영향을 받지 않는 친척.
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전체 게놈 시퀀싱은 표적 재시퀀싱 및/또는 임상적 엑솜 시퀀싱에 대해 음성인 테스트를 받은 환자에서 수행됩니다.
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IRD에 의해 영향을 받는 발단자 및 분자 진단 없이 영향을 받는 및/또는 영향을 받지 않는 친척.
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전체 게놈 시퀀싱은 표적 재시퀀싱 및/또는 임상적 엑솜 시퀀싱에 대해 음성인 테스트를 받은 환자에서 수행됩니다.
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IRD에 의해 영향을 받는 발단자 및 분자 진단 없이 영향을 받는 및/또는 영향을 받지 않는 친척.
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전체 게놈 시퀀싱은 표적 재시퀀싱 및/또는 임상적 엑솜 시퀀싱에 대해 음성인 테스트를 받은 환자에서 수행됩니다.
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IRD에 의해 영향을 받는 발단자 및 분자 진단 없이 영향을 받는 및/또는 영향을 받지 않는 친척.
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전체 게놈 시퀀싱은 표적 재시퀀싱 및/또는 임상적 엑솜 시퀀싱에 대해 음성인 테스트를 받은 환자에서 수행됩니다.
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FB_0027
IRD에 의해 영향을 받는 발단자 및 분자 진단 없이 영향을 받는 및/또는 영향을 받지 않는 친척.
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전체 게놈 시퀀싱은 표적 재시퀀싱 및/또는 임상적 엑솜 시퀀싱에 대해 음성인 테스트를 받은 환자에서 수행됩니다.
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IRD에 의해 영향을 받는 발단자 및 분자 진단 없이 영향을 받는 및/또는 영향을 받지 않는 친척.
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전체 게놈 시퀀싱은 표적 재시퀀싱 및/또는 임상적 엑솜 시퀀싱에 대해 음성인 테스트를 받은 환자에서 수행됩니다.
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FB_0029
IRD에 의해 영향을 받는 발단자 및 분자 진단 없이 영향을 받는 및/또는 영향을 받지 않는 친척.
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전체 게놈 시퀀싱은 표적 재시퀀싱 및/또는 임상적 엑솜 시퀀싱에 대해 음성인 테스트를 받은 환자에서 수행됩니다.
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FB_0030
IRD에 의해 영향을 받는 발단자 및 분자 진단 없이 영향을 받는 및/또는 영향을 받지 않는 친척.
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전체 게놈 시퀀싱은 표적 재시퀀싱 및/또는 임상적 엑솜 시퀀싱에 대해 음성인 테스트를 받은 환자에서 수행됩니다.
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연구는 무엇을 측정합니까?
주요 결과 측정
결과 측정 |
측정값 설명 |
기간 |
|---|---|---|
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IRD에서 유전적 결손 병인 변이 이해
기간: 이년
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임상적 표현형의 원인이 되는 유전적 변이의 확인
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이년
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2차 결과 측정
결과 측정 |
측정값 설명 |
기간 |
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IRD의 유전자 발견
기간: 이년
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IRD를 담당하는 새로운 질병 유전자의 확인.
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이년
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기타 결과 측정
결과 측정 |
측정값 설명 |
기간 |
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기능적 연구에 의한 새로 식별된 변이체(들)의 병원성 평가.
기간: 삼 년
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생체내 및 시험관내 모델에 의한 새로운 변이체의 기능적 특성 규명
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삼 년
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공동 작업자 및 조사자
수사관
- 수석 연구원: Viviana Cordeddu, PhD, Istituto Superiore di Sanità
간행물 및 유용한 링크
일반 간행물
- Cremers FPM, Boon CJF, Bujakowska K, Zeitz C. Special Issue Introduction: Inherited Retinal Disease: Novel Candidate Genes, Genotype-Phenotype Correlations, and Inheritance Models. Genes (Basel). 2018 Apr 16;9(4):215. doi: 10.3390/genes9040215.
- Ziccardi L, Cordeddu V, Gaddini L, Matteucci A, Parravano M, Malchiodi-Albedi F, Varano M. Gene Therapy in Retinal Dystrophies. Int J Mol Sci. 2019 Nov 14;20(22):5722. doi: 10.3390/ijms20225722.
- Cordeddu V, Redeker B, Stellacci E, Jongejan A, Fragale A, Bradley TE, Anselmi M, Ciolfi A, Cecchetti S, Muto V, Bernardini L, Azage M, Carvalho DR, Espay AJ, Male A, Molin AM, Posmyk R, Battisti C, Casertano A, Melis D, van Kampen A, Baas F, Mannens MM, Bocchinfuso G, Stella L, Tartaglia M, Hennekam RC. Mutations in ZBTB20 cause Primrose syndrome. Nat Genet. 2014 Aug;46(8):815-7. doi: 10.1038/ng.3035. Epub 2014 Jul 13.
- Musacchia F, Ciolfi A, Mutarelli M, Bruselles A, Castello R, Pinelli M, Basu S, Banfi S, Casari G, Tartaglia M, Nigro V; TUDP. VarGenius executes cohort-level DNA-seq variant calling and annotation and allows to manage the resulting data through a PostgreSQL database. BMC Bioinformatics. 2018 Dec 12;19(1):477. doi: 10.1186/s12859-018-2532-4.
연구 기록 날짜
연구 주요 날짜
연구 시작 (실제)
기본 완료 (실제)
연구 완료 (실제)
연구 등록 날짜
최초 제출
QC 기준을 충족하는 최초 제출
처음 게시됨 (실제)
연구 기록 업데이트
마지막 업데이트 게시됨 (실제)
QC 기준을 충족하는 마지막 업데이트 제출
마지막으로 확인됨
추가 정보
이 연구와 관련된 용어
기타 연구 ID 번호
- ISS20-5656c541c257
개별 참가자 데이터(IPD) 계획
개별 참가자 데이터(IPD)를 공유할 계획입니까?
IPD 계획 설명
약물 및 장치 정보, 연구 문서
미국 FDA 규제 의약품 연구
미국 FDA 규제 기기 제품 연구
미국에서 제조되어 미국에서 수출되는 제품
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