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Meccanismi delle distrofie retiniche ereditarie utilizzando il sequenziamento dell'intero genoma e modelli in vitro e in vivo

15 aprile 2025 aggiornato da: Viviana Cordeddu, Istituto Superiore di Sanità

"Comprensione della variabilità genetica mancante e dei meccanismi patogenetici delle distrofie retiniche ereditarie utilizzando il sequenziamento dell'intero genoma e modelli in vitro e in vivo"

Le distrofie retiniche ereditarie (IRD), un ampio gruppo di malattie eterogenee e rare, possono causare perdita della vista bilaterale irreversibile e cecità. Caratterizzare le basi genetiche delle IRD aiuterà a comprendere la patogenesi alla base dello sviluppo del danno retinico. Nonostante i progressi nell'identificazione molecolare dei geni che causano la malattia, gli IRD irrisolti costituiscono circa il 40% di tutti i casi.

L'obiettivo di questo studio è risolvere l'ereditarietà mancante nell'IRD utilizzando il sequenziamento dell'intero genoma (WGS) per identificare le cause genetiche in pazienti clinicamente ben caratterizzati senza una diagnosi molecolare.

L'identificazione di nuovi geni che hanno un ruolo nello sviluppo o nel mantenimento della funzione retinica porterà allo sviluppo di nuovi approcci terapeutici e favorirà una diagnosi più tempestiva e il miglioramento della gestione del paziente.

Panoramica dello studio

Descrizione dettagliata

Le IRD sono rare condizioni neurodegenerative e geneticamente eterogenee con un ampio spettro di presentazioni, anche tra i membri affetti della stessa famiglia. Questi disturbi presentano una vasta gamma di fenotipi con sovrapposizione significativa, che possono essere ampiamente suddivisi in tre gruppi principali: quelli che interessano principalmente la periferia come la retinite pigmentosa (RP) e la coroideremia; quelli che coinvolgono principalmente la macula, noti come distrofie "maculari" o "centrali"; e quelli che interessano sia il centro che la periferia come si osserva nelle distrofie cono-bastoncino o bastoncello-cono. Collettivamente, gli IRD hanno un'incidenza di 1:2000, con un impatto di ca. 2 milioni di persone in tutto il mondo e i pazienti sono progressivamente ipovedenti. Gli individui affetti possono essere seguiti da misurazioni dell'acuità visiva, valutazioni del campo visivo, registrazioni elettroretinografiche (ERG), imaging strutturale con autofluorescenza, tomografia a coerenza ottica nel dominio spettrale (OCT) e angiografia OCT. Sebbene questi strumenti innovativi e non invasivi possano raggiungere una diagnosi clinica accurata, è necessario eseguire test genetici per confermare un fenotipo specifico e l'analisi di segregazione può affrontare il modello di ereditarietà. Gli approcci di scoperta genica hanno chiarito che le mutazioni di circa 280 diversi geni coinvolti nello sviluppo degli occhi, nella sopravvivenza dei fotorecettori, nei meccanismi di fototrasduzione, nel ciclo dei retinoidi, nella funzione enzimatica retinica o nella struttura cellulare sono responsabili di queste malattie degenerative (RetNet. Disponibile su: https://sph.uth.edu/retnet/) e il modello di ereditarietà può essere autosomico dominante, recessivo o legato all'X.

Per migliorare il tasso di successo della diagnosi genetica/genomica, sono state esplorate nuove tecnologie di sequenziamento, a partire dal sequenziamento mirato incentrato su pannelli multigenici fino al sequenziamento dell'intero esoma (WES) e al sequenziamento dell'intero genoma (WGS). A causa dell'eterogeneità genetica delle IRD, la congruenza della diagnosi clinica e molecolare è un obiettivo necessario per caratterizzare esattamente il fenotipo e aumentare la possibilità di strategie terapeuticamente vantaggiose.

Una sfida importante consiste nell'identificare nuovi geni che codificano per le malattie. Questa estrema eterogeneità genetica rappresenta circa il 30% del fallimento del rilevamento della diagnosi molecolare. Con la possibilità di studiare WES o WGS, si aprono finestre più ampie per la scoperta dei geni.

Tipo di studio

Osservativo

Iscrizione (Effettivo)

120

Contatti e Sedi

Questa sezione fornisce i recapiti di coloro che conducono lo studio e informazioni su dove viene condotto lo studio.

Luoghi di studio

      • Rome, Italia, 00161
        • Istituto Superiore di Sanità-Dpt. Oncology and Molecular Medicine

Criteri di partecipazione

I ricercatori cercano persone che corrispondano a una certa descrizione, chiamata criteri di ammissibilità. Alcuni esempi di questi criteri sono le condizioni generali di salute di una persona o trattamenti precedenti.

Criteri di ammissibilità

Età idonea allo studio

Da 5 anni a 80 anni (Bambino, Adulto, Adulto più anziano)

Accetta volontari sani

No

Metodo di campionamento

Campione non probabilistico

Popolazione di studio

Pazienti di sesso maschile e femminile, di età compresa tra i 5 e gli 80 anni, affetti da degenerazione retinica o del nervo ottico di natura ereditaria. I pazienti saranno reclutati presso l'IRCSS Fondazione Bietti di Roma e sottoposti a visite oculistiche ed esami strumentali. I soggetti candidati sono una coorte clinicamente ben caratterizzata di pazienti con distrofie oculari, inclusi IRD già seguiti clinicamente da almeno 12 mesi e senza una diagnosi molecolare conclusiva.

Descrizione

Criterio di inclusione:

  • Pazienti con distrofia retinica e del nervo ottico di sospetta natura ereditaria.
  • Probandi con follow-up clinico di almeno 12 mesi.
  • Pazienti con diagnosi molecolare inconcludente mediante test genetico-molecolari per i geni ad oggi noti per la patologia diagnosticata.

Criteri di esclusione:

  • Pazienti con diagnosi clinica di origine genetica non provata.
  • Pazienti i cui campioni dei genitori o dei parenti di secondo grado non sono disponibili.
  • Pazienti che rifiutano di essere informati dei risultati genetici ottenuti, compresi gli accessori clinicamente rilevanti, validati e perseguibili per il paziente stesso e/o per la sua famiglia.

Piano di studio

Questa sezione fornisce i dettagli del piano di studio, compreso il modo in cui lo studio è progettato e ciò che lo studio sta misurando.

Come è strutturato lo studio?

Dettagli di progettazione

Coorti e interventi

Gruppo / Coorte
Intervento / Trattamento
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Probando affetto da IRD e parenti affetti e/o non affetti senza diagnosi molecolare.
Il sequenziamento dell'intero genoma verrà eseguito nei pazienti il ​​cui test è risultato negativo per il risequenziamento mirato e/o il sequenziamento clinico dell'esoma.
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Probando affetto da IRD e parenti affetti e/o non affetti senza diagnosi molecolare.
Il sequenziamento dell'intero genoma verrà eseguito nei pazienti il ​​cui test è risultato negativo per il risequenziamento mirato e/o il sequenziamento clinico dell'esoma.
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Probando affetto da IRD e parenti affetti e/o non affetti senza diagnosi molecolare.
Il sequenziamento dell'intero genoma verrà eseguito nei pazienti il ​​cui test è risultato negativo per il risequenziamento mirato e/o il sequenziamento clinico dell'esoma.
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Probando affetto da IRD e parenti affetti e/o non affetti senza diagnosi molecolare.
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Probando affetto da IRD e parenti affetti e/o non affetti senza diagnosi molecolare.
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Probando affetto da IRD e parenti affetti e/o non affetti senza diagnosi molecolare.
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Probando affetto da IRD e parenti affetti e/o non affetti senza diagnosi molecolare.
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Probando affetto da IRD e parenti affetti e/o non affetti senza diagnosi molecolare.
Il sequenziamento dell'intero genoma verrà eseguito nei pazienti il ​​cui test è risultato negativo per il risequenziamento mirato e/o il sequenziamento clinico dell'esoma.
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Probando affetto da IRD e parenti affetti e/o non affetti senza diagnosi molecolare.
Il sequenziamento dell'intero genoma verrà eseguito nei pazienti il ​​cui test è risultato negativo per il risequenziamento mirato e/o il sequenziamento clinico dell'esoma.

Cosa sta misurando lo studio?

Misure di risultato primarie

Misura del risultato
Misura Descrizione
Lasso di tempo
Comprensione delle varianti patogenetiche genetiche mancanti nell'IRD
Lasso di tempo: due anni
Identificazione delle varianti genetiche causative del fenotipo clinico
due anni

Misure di risultato secondarie

Misura del risultato
Misura Descrizione
Lasso di tempo
Scoperta genica nell'IRD
Lasso di tempo: due anni
Identificazione di nuovi geni di malattia responsabili dell'IRD.
due anni

Altre misure di risultato

Misura del risultato
Misura Descrizione
Lasso di tempo
Valutazione della patogenicità delle varianti recentemente identificate mediante studi funzionali.
Lasso di tempo: tre anni
Caratterizzazione funzionale di nuove varianti mediante modelli in vivo e in vitro
tre anni

Collaboratori e investigatori

Qui è dove troverai le persone e le organizzazioni coinvolte in questo studio.

Investigatori

  • Investigatore principale: Viviana Cordeddu, PhD, Istituto Superiore di Sanità

Pubblicazioni e link utili

La persona responsabile dell'inserimento delle informazioni sullo studio fornisce volontariamente queste pubblicazioni. Questi possono riguardare qualsiasi cosa relativa allo studio.

Studiare le date dei record

Queste date tengono traccia dell'avanzamento della registrazione dello studio e dell'invio dei risultati di sintesi a ClinicalTrials.gov. I record degli studi e i risultati riportati vengono esaminati dalla National Library of Medicine (NLM) per assicurarsi che soddisfino specifici standard di controllo della qualità prima di essere pubblicati sul sito Web pubblico.

Studia le date principali

Inizio studio (Effettivo)

15 novembre 2022

Completamento primario (Effettivo)

2 novembre 2024

Completamento dello studio (Effettivo)

2 novembre 2024

Date di iscrizione allo studio

Primo inviato

20 marzo 2023

Primo inviato che soddisfa i criteri di controllo qualità

30 marzo 2023

Primo Inserito (Effettivo)

31 marzo 2023

Aggiornamenti dei record di studio

Ultimo aggiornamento pubblicato (Effettivo)

18 aprile 2025

Ultimo aggiornamento inviato che soddisfa i criteri QC

15 aprile 2025

Ultimo verificato

1 aprile 2025

Maggiori informazioni

Termini relativi a questo studio

Piano per i dati dei singoli partecipanti (IPD)

Hai intenzione di condividere i dati dei singoli partecipanti (IPD)?

INDECISO

Descrizione del piano IPD

Abbiamo in programma di condividere i dati genomici anonimi tra i tre partner coinvolti nello studio tramite riunioni telefoniche e cartelle cloud condivise.

Informazioni su farmaci e dispositivi, documenti di studio

Studia un prodotto farmaceutico regolamentato dalla FDA degli Stati Uniti

No

Studia un dispositivo regolamentato dalla FDA degli Stati Uniti

No

prodotto fabbricato ed esportato dagli Stati Uniti

No

Queste informazioni sono state recuperate direttamente dal sito web clinicaltrials.gov senza alcuna modifica. In caso di richieste di modifica, rimozione o aggiornamento dei dettagli dello studio, contattare register@clinicaltrials.gov. Non appena verrà implementata una modifica su clinicaltrials.gov, questa verrà aggiornata automaticamente anche sul nostro sito web .

Prove cliniche su sequenziamento dell'intero genoma

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